Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474970
• Subject: NM_018054.6
• Aligned Length: 2643
• Identities: 2409
• Gaps: 234

Alignment

Query    1  ATGAAGAAGCAGTTCAACCGCATGAAGCAGCTGGCTAACCAGACCGTGGGCAGAGCTGAGAAAACAGAAGTCCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGAAGCAGTTCAACCGCATGAAGCAGCTGGCTAACCAGACCGTGGGCAGAGCTGAGAAAACAGAAGTCCT  74

Query   75  TAGTGAAGATCTATTACAGATTGAGAGACGCCTGGACACGGTGCGGTCAATATGCCACCATTCCCATAAGCGCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TAGTGAAGATCTATTACAGATTGAGAGACGCCTGGACACGGTGCGGTCAATATGCCACCATTCCCATAAGCGCT  148

Query  149  TGGTGGCATGTTTCCAGGGCCAGCATGGCACCGATGCCGAGAGGAGACACAAAAAACTGCCTCTGACAGCTCTT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGTGGCATGTTTCCAGGGCCAGCATGGCACCGATGCCGAGAGGAGACACAAAAAACTGCCTCTGACAGCTCTT  222

Query  223  GCTCAAAATATGCAAGAAGCATCGACTCAGCTGGAAGACTCTCTCCTGGGGAAGATGCTGGAGACGTGTGGAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCTCAAAATATGCAAGAAGCATCGACTCAGCTGGAAGACTCTCTCCTGGGGAAGATGCTGGAGACGTGTGGAGA  296

Query  297  TGCTGAGAATCAGCTGGCTCTCGAGCTCTCCCAGCACGAAGTCTTTGTTGAGAAGGAGATCGTGGACCCTCTGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGCTGAGAATCAGCTGGCTCTCGAGCTCTCCCAGCACGAAGTCTTTGTTGAGAAGGAGATCGTGGACCCTCTGT  370

Query  371  ACGGCATAGCTGAGGTGGAGATTCCCAACATCCAGAAGCAGAGGAAGCAGCTTGCAAGATTGGTGTTAGACTGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACGGCATAGCTGAGGTGGAGATTCCCAACATCCAGAAGCAGAGGAAGCAGCTTGCAAGATTGGTGTTAGACTGG  444

Query  445  GATTCAGTCAGAGCCAGGTGGAACCAAGCTCACAAATCCTCAGGAACCAACTTTCAGGGGCTTCCATCAAAAAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATTCAGTCAGAGCCAGGTGGAACCAAGCTCACAAATCCTCAGGAACCAACTTTCAGGGGCTTCCATCAAAAAT  518

Query  519  AGATACTCTAAAGGAAGAGATGGATGAAGCTGGAAATAAAGTAGAACAGTGCAAGGATCAACTTGCAGCAGACA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGATACTCTAAAGGAAGAGATGGATGAAGCTGGAAATAAAGTAGAACAGTGCAAGGATCAACTTGCAGCAGACA  592

Query  593  TGTACAACTTTATGGCCAAAGAAGGGGAGTATGGCAAATTCTTTGTTACGTTATTAGAAGCCCAAGCAGATTAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGTACAACTTTATGGCCAAAGAAGGGGAGTATGGCAAATTCTTTGTTACGTTATTAGAAGCCCAAGCAGATTAC  666

Query  667  CATAGAAAAGCATTAGCAGTCTTAGAAAAGACCCTCCCCGAAATGCGAGCCCATCAAGATAAGTGGGCGGAAAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CATAGAAAAGCATTAGCAGTCTTAGAAAAGACCCTCCCCGAAATGCGAGCCCATCAAGATAAGTGGGCGGAAAA  740

Query  741  ACCAGCCTTTGGGACTCCCCTAGAAGAACACCTGAAGAGGAGCGGGCGCGAGATTGCGCTGCCCATTGAAGCCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACCAGCCTTTGGGACTCCCCTAGAAGAACACCTGAAGAGGAGCGGGCGCGAGATTGCGCTGCCCATTGAAGCCT  814

Query  815  GTGTCATGCTGCTTCTGGAGACAGGCATGAAGGAGGAGGGCCTTTTCCGAATTGGGGCTGGGGCCTCCAAGTTA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTGTCATGCTGCTTCTGGAGACAGGCATGAAGGAGGAGGGCCTTTTCCGAATTGGGGCTGGGGCCTCCAAGTTA  888

Query  889  AAGAAGCTGAAAGCTGCTTTGGACTGTTCTACTTCTCACCTGGATGAGTTCTATTCAGACCCCCATGCTGTAGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGAAGCTGAAAGCTGCTTTGGACTGTTCTACTTCTCACCTGGATGAGTTCTATTCAGACCCCCATGCTGTAGC  962

Query  963  AGGTGCTTTAAAATCCTATTTACGGGAATTGCCTGAACCTTTGATGACTTTTAATCTGTATGAAGAATGGACAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGGTGCTTTAAAATCCTATTTACGGGAATTGCCTGAACCTTTGATGACTTTTAATCTGTATGAAGAATGGACAC  1036

Query 1037  AAGTTGCAAGTGTGCAGGATCAAGACAAAAAACTTCAAGACTTGTGGAGAACATGTCAGAAGTTGCCACCACAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AAGTTGCAAGTGTGCAGGATCAAGACAAAAAACTTCAAGACTTGTGGAGAACATGTCAGAAGTTGCCACCACAA  1110

Query 1111  AATTTTGTTAACTTTAGATATTTGATCAAGTTCCTTGCAAAGCTTGCTCAGACCAGCGATGTGAATAAAATGAC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AATTTTGTTAACTTTAGATATTTGATCAAGTTCCTTGCAAAGCTTGCTCAGACCAGCGATGTGAATAAAATGAC  1184

Query 1185  TCCCAGCAACATTGCGATTGTGTTAGGCCCTAACTTGTTATGGGCCAGAAATGAAGGAACACTTGCTGAAATGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCCCAGCAACATTGCGATTGTGTTAGGCCCTAACTTGTTATGGGCCAGAAATGAAGGAACACTTGCTGAAATGG  1258

Query 1259  CAGCAGCCACATCCGTCCATGTGGTTGCAGTGATTGAACCCATCATTCAGCATGCCGACTGGTTCTTCCCTGAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CAGCAGCCACATCCGTCCATGTGGTTGCAGTGATTGAACCCATCATTCAGCATGCCGACTGGTTCTTCCCTGAA  1332

Query 1333  GAGGTGGAATTTAATGTATCAGAAGCATTTGTACCTCTCACCACCCCGAGTTCTAATCACTCATTCCACACTGG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAGGTGGAATTTAATGTATCAGAAGCATTTGTACCTCTCACCACCCCGAGTTCTAATCACTCATTCCACACTGG  1406

Query 1407  AAACGACTCTGACTCGGGGACCCTGGAGAGGAAGCGGCCTGCTAGCATGGCGGTGATGGAAGGAGACTTGGTGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AAACGACTCTGACTCGGGGACCCTGGAGAGGAAGCGGCCTGCTAGCATGGCGGTGATGGAAGGAGACTTGGTGA  1480

Query 1481  AGAAGGAAAGCTTTGGTGTGAAGCTTATGGACTTCCAGGCCCACCGGCGGGGTGGCACTCTAAATAGAAAGCAC  1554
            ||||||||                                                                  
Sbjct 1481  AGAAGGAA------------------------------------------------------------------  1488

Query 1555  ATATCCCCCGCTTTCCAGCCGCCACTTCCGCCCACAGATGGCAGCACCGTGGTGCCCGCTGGCCCAGAGCCCCC  1628
                                                                                      
Sbjct 1489  --------------------------------------------------------------------------  1488

Query 1629  TCCCCAGAGCTCTAGGGCTGAAAGCAGCTCTGGGGGTGGGACTGTCCCCTCTTCCGCGGGCATACTGGAGCAGG  1702
                                                                                      
Sbjct 1489  --------------------------------------------------------------------------  1488

Query 1703  GGCCGAGCCCAGGCGACGGCAGTCCTCCCAAACCGAAGGACCCTGTATCTGCAGCTGTGCCAGCACCAGGGAGA  1776
                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1489  --------------------AGTCCTCCCAAACCGAAGGACCCTGTATCTGCAGCTGTGCCAGCACCAGGGAGA  1542

Query 1777  AACAACAGTCAGATAGCATCTGGCCAAAATCAGCCCCAGGCAGCTGCTGGCTCCCACCAGCTCTCCATGGGCCA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1543  AACAACAGTCAGATAGCATCTGGCCAAAATCAGCCCCAGGCAGCTGCTGGCTCCCACCAGCTCTCCATGGGCCA  1616

Query 1851  ACCTCACAATGCTGCAGGGCCCAGCCCGCATACACTGCGCCGAGCTGTTAAAAAACCCGCTCCAGCACCCCCGA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1617  ACCTCACAATGCTGCAGGGCCCAGCCCGCATACACTGCGCCGAGCTGTTAAAAAACCCGCTCCAGCACCCCCGA  1690

Query 1925  AACCGGGCAACCCACCTCCTGGCCACCCCGGGGGCCAGAGTTCTTCAGGAACATCTCAGCATCCACCCAGTCTG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1691  AACCGGGCAACCCACCTCCTGGCCACCCCGGGGGCCAGAGTTCTTCAGGAACATCTCAGCATCCACCCAGTCTG  1764

Query 1999  TCACCAAAGCCACCCACCCGAAGCCCCTCTCCTCCCACCCAGCACACGGGCCAGCCTCCAGGCCAGCCCTCCGC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1765  TCACCAAAGCCACCCACCCGAAGCCCCTCTCCTCCCACCCAGCACACGGGCCAGCCTCCAGGCCAGCCCTCCGC  1838

Query 2073  CCCCTCCCAGCTCTCAGCACCCCGGAGGTACTCCAGCAGCTTGTCTCCAATCCAAGCTCCCAATCACCCACCGC  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1839  CCCCTCCCAGCTCTCAGCACCCCGGAGGTACTCCAGCAGCTTGTCTCCAATCCAAGCTCCCAATCACCCACCGC  1912

Query 2147  CGCAGCCCCCTACGCAGGCCACGCCACTGATGCACACCAAACCCAATAGCCAGGGCCCTCCCAACCCCATGGCA  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1913  CGCAGCCCCCTACGCAGGCCACGCCACTGATGCACACCAAACCCAATAGCCAGGGCCCTCCCAACCCCATGGCA  1986

Query 2221  TTGCCCAGTGAGCATGGACTTGAGCAGCCATCTCACACCCCTCCCCAGACTCCAACGCCCCCCAGTACTCCGCC  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1987  TTGCCCAGTGAGCATGGACTTGAGCAGCCATCTCACACCCCTCCCCAGACTCCAACGCCCCCCAGTACTCCGCC  2060

Query 2295  CCTAGGAAAACAGAACCCCAGTCTGCCAGCTCCTCAGACCCTGGCAGGGGGTAACCCTGAAACTGCACAGCCAC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2061  CCTAGGAAAACAGAACCCCAGTCTGCCAGCTCCTCAGACCCTGGCAGGGGGTAACCCTGAAACTGCACAGCCAC  2134

Query 2369  ATGCTGGAACCTTACCGAGACCGAGACCAGTACCAAAGCCAAGGAACCGGCCCAGCGTGCCCCCACCCCCCCAA  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2135  ATGCTGGAACCTTACCGAGACCGAGACCAGTACCAAAGCCAAGGAACCGGCCCAGCGTGCCCCCACCCCCCCAA  2208

Query 2443  CCTCCTGGTGTCCACTCAGCTGGGGACAGCAGCCTCACCAACACAGCACCAACAGCTTCCAAGATAGTAACAGA  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2209  CCTCCTGGTGTCCACTCAGCTGGGGACAGCAGCCTCACCAACACAGCACCAACAGCTTCCAAGATAGTAACAGA  2282

Query 2517  CTCCAATTCCAGGGTTTCAGAACCGCATCGCAGCATCTTTCCTGAAATGCACTCAGACTCAGCCAGCAAAGACG  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2283  CTCCAATTCCAGGGTTTCAGAACCGCATCGCAGCATCTTTCCTGAAATGCACTCAGACTCAGCCAGCAAAGACG  2356

Query 2591  TGCCTGGCCGCATCCTGCTGGATATAGACAATGATACCGAGAGCACTGCCCTG  2643
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2357  TGCCTGGCCGCATCCTGCTGGATATAGACAATGATACCGAGAGCACTGCCCTG  2409