Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000474970
- Subject:
- XM_011545877.3
- Aligned Length:
- 2739
- Identities:
- 2412
- Gaps:
- 327
Alignment
Query 1 ATGAAGAAGCAGTTCAACCGCATGAAGCAGCTGGCTAACCAGACCGTGGGCAGAGCTGAGAAAACAGAAGTCCT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TAGTGAAGATCTATTACAGATTGAGAGACGCCTGGACACGGTGCGGTCAATATGCCACCATTCCCATAAGCGCT 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TGGTGGCATGTTTCCAGGGCCAGCATGGCACCGATGCCGAGAGGAGACACAAAAAACTGCCTCTGACAGCTCTT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GCTCAAAATATGCAAGAAGCATCGACTCAGCTGGAAGACTCTCTCCTGGGGAAGATGCTGGAGACGTGTGGAGA 296
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ---------ATGCAAGAAGCATCGACTCAGCTGGAAGACTCTCTCCTGGGGAAGATGCTGGAGACGTGTGGAGA 65
Query 297 TGCTGAGAATCAGCTGGCTCTCGAGCTCTCCCAGCACGAAGTCTTTGTTGAGAAGGAGATCGTGGACCCTCTGT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 66 TGCTGAGAATCAGCTGGCTCTCGAGCTCTCCCAGCACGAAGTCTTTGTTGAGAAGGAGATCGTGGACCCTCTGT 139
Query 371 ACGGCATAGCTGAGGTGGAGATTCCCAACATCCAGAAGCAGAGGAAGCAGCTTGCAAGATTGGTGTTAGACTGG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 140 ACGGCATAGCTGAGGTGGAGATTCCCAACATCCAGAAGCAGAGGAAGCAGCTTGCAAGATTGGTGTTAGACTGG 213
Query 445 GATTCAGTCAGAGCCAGGTGGAACCAAGCTCACAAATCCTCAGGAACCAACTTTCAGGGGCTTCCATCAAAAAT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 214 GATTCAGTCAGAGCCAGGTGGAACCAAGCTCACAAATCCTCAGGAACCAACTTTCAGGGGCTTCCATCAAAAAT 287
Query 519 AGATACTCTAAAGGAAGAGATGGATGAAGCTGGAAATAAAGTAGAACAGTGCAAGGATCAACTTGCAGCAGACA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 288 AGATACTCTAAAGGAAGAGATGGATGAAGCTGGAAATAAAGTAGAACAGTGCAAGGATCAACTTGCAGCAGACA 361
Query 593 TGTACAACTTTATGGCCAAAGAAGGGGAGTATGGCAAATTCTTTGTTACGTTATTAGAAGCCCAAGCAGATTAC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 362 TGTACAACTTTATGGCCAAAGAAGGGGAGTATGGCAAATTCTTTGTTACGTTATTAGAAGCCCAAGCAGATTAC 435
Query 667 CATAGAAAAGCATTAGCAGTCTTAGAAAAGACCCTCCCCGAAATGCGAGCCCATCA------------------ 722
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 436 CATAGAAAAGCATTAGCAGTCTTAGAAAAGACCCTCCCCGAAATGCGAGCCCATCAAGGCAGCCCACTAAACCC 509
Query 723 -------------------------------------------------------------------------- 722
Sbjct 510 GCTGGCGTGTGTTGATGAAGTGTGGTGCAGGTGCAGCGTGCCACTGCAGCTTCTGGGCAGCCTGAGTTGGTGCC 583
Query 723 ----AGATAAGTGGGCGGAAAAACCAGCCTTTGGGACTCCCCTAGAAGAACACCTGAAGAGGAGCGGGCGCGAG 792
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 584 ATCTAGATAAGTGGGCGGAAAAACCAGCCTTTGGGACTCCCCTAGAAGAACACCTGAAGAGGAGCGGGCGCGAG 657
Query 793 ATTGCGCTGCCCATTGAAGCCTGTGTCATGCTGCTTCTGGAGACAGGCATGAAGGAGGAGGGCCTTTTCCGAAT 866
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 658 ATTGCGCTGCCCATTGAAGCCTGTGTCATGCTGCTTCTGGAGACAGGCATGAAGGAGGAGGGCCTTTTCCGAAT 731
Query 867 TGGGGCTGGGGCCTCCAAGTTAAAGAAGCTGAAAGCTGCTTTGGACTGTTCTACTTCTCACCTGGATGAGTTCT 940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 732 TGGGGCTGGGGCCTCCAAGTTAAAGAAGCTGAAAGCTGCTTTGGACTGTTCTACTTCTCACCTGGATGAGTTCT 805
Query 941 ATTCAGACCCCCATGCTGTAGCAGGTGCTTTAAAATCCTATTTACGGGAATTGCCTGAACCTTTGATGACTTTT 1014
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 806 ATTCAGACCCCCATGCTGTAGCAGGTGCTTTAAAATCCTATTTACGGGAATTGCCTGAACCTTTGATGACTTTT 879
Query 1015 AATCTGTATGAAGAATGGACACAAGTTGCAAGTGTGCAGGATCAAGACAAAAAACTTCAAGACTTGTGGAGAAC 1088
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 880 AATCTGTATGAAGAATGGACACAAGTTGCAAGTGTGCAGGATCAAGACAAAAAACTTCAAGACTTGTGGAGAAC 953
Query 1089 ATGTCAGAAGTTGCCACCACAAAATTTTGTTAACTTTAGATATTTGATCAAGTTCCTTGCAAAGCTTGCTCAGA 1162
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 954 ATGTCAGAAGTTGCCACCACAAAATTTTGTTAACTTTAGATATTTGATCAAGTTCCTTGCAAAGCTTGCTCAGA 1027
Query 1163 CCAGCGATGTGAATAAAATGACTCCCAGCAACATTGCGATTGTGTTAGGCCCTAACTTGTTATGGGCCAGAAAT 1236
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1028 CCAGCGATGTGAATAAAATGACTCCCAGCAACATTGCGATTGTGTTAGGCCCTAACTTGTTATGGGCCAGAAAT 1101
Query 1237 GAAGGAACACTTGCTGAAATGGCAGCAGCCACATCCGTCCATGTGGTTGCAGTGATTGAACCCATCATTCAGCA 1310
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1102 GAAGGAACACTTGCTGAAATGGCAGCAGCCACATCCGTCCATGTGGTTGCAGTGATTGAACCCATCATTCAGCA 1175
Query 1311 TGCCGACTGGTTCTTCCCTGAAGAGGTGGAATTTAATGTATCAGAAGCATTTGTACCTCTCACCACCCCGAGTT 1384
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1176 TGCCGACTGGTTCTTCCCTGAAGAGGTGGAATTTAATGTATCAGAAGCATTTGTACCTCTCACCACCCCGAGTT 1249
Query 1385 CTAATCACTCATTCCACACTGGAAACGACTCTGACTCGGGGACCCTGGAGAGGAAGCGGCCTGCTAGCATGGCG 1458
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1250 CTAATCACTCATTCCACACTGGAAACGACTCTGACTCGGGGACCCTGGAGAGGAAGCGGCCTGCTAGCATGGCG 1323
Query 1459 GTGATGGAAGGAGACTTGGTGAAGAAGGAAAGCTTTGGTGTGAAGCTTATGGACTTCCAGGCCCACCGGCGGGG 1532
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1324 GTGATGGAAGGAGACTTGGTGAAGAAGGAAAGCTTTGGTGTGAAGCTTATGGACTTCCAGGCCCACCGGCGGGG 1397
Query 1533 TGGCACTCTAAATAGAAAGCACATATCCCCCGCTTTCCAGCCGCCACTTCCGCCCACAGATGGCAGCACCGTGG 1606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1398 TGGCACTCTAAATAGAAAGCACATATCCCCCGCTTTCCAGCCGCCACTTCCGCCCACAGATGGCAGCACCGTGG 1471
Query 1607 TGCCCGCTGGCCCAGAGCCCCCTCCCCAGAGCTCTAGGGCTGAAAGCAGCTCTGGGGGTGGGACTGTCCCCTCT 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1472 TGCCCGCTGGCCCAGAGCCCCCTCCCCAGAGCTCTAGGGCTGAAAGCAGCTCTGGGGGTGGGACTGTCCCCTCT 1545
Query 1681 TCCGCGGGCATACTGGAGCAGGGGCCGAGCCCAGGCGACGGCAGTCCTCCCAAACCGAAGGACCCTGTATCTGC 1754
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1546 TCCGCGGGCATACTGGAGCAGGGGCCGAGCCCAGGCGACGGCAGTCCTCCCAAACCGAAGGACCCTGTATCTGC 1619
Query 1755 AGCTGTGCCAGCACCAGGGAGAAACAACAGTCAGATAGCATCTGGCCAAAATCAGCCCCAGGCAGCTGCTGGCT 1828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1620 AGCTGTGCCAGCACCAGGGAGAAACAACAGTCAGATAGCATCTGGCCAAAATCAGCCCCAGGCAGCTGCTGGCT 1693
Query 1829 CCCACCAGCTCTCCATGGGCCAACCTCACAATGCTGCAGGGCCCAGCCCGCATACACTGCGCCGAGCTGTTAAA 1902
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1694 CCCACCAGCTCTCCATGGGCCAACCTCACAATGCTGCAGGGCCCAGCCCGCATACACTGCGCCGAGCTGTTAAA 1767
Query 1903 AAACCCGCTCCAGCACCCCCGAAACCGGGCAACCCACCTCCTGGCCACCCCGGGGGCCAGAGTTCTTCAGGAAC 1976
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1768 AAACCCGCTCCAGCACCCCCGAAACCGGGCAACCCACCTCCTGGCCACCCCGGGGGCCAGAGTTCTTCAGGAAC 1841
Query 1977 ATCTCAGCATCCACCCAGTCTGTCACCAAAGCCACCCACCCGAAGCCCCTCTCCTCCCACCCAGCACACGGGCC 2050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1842 ATCTCAGCATCCACCCAGTCTGTCACCAAAGCCACCCACCCGAAGCCCCTCTCCTCCCACCCAGCACACGGGCC 1915
Query 2051 AGCCTCCAGGCCAGCCCTCCGCCCCCTCCCAGCTCTCAGCACCCCGGAGGTACTCCAGCAGCTTGTCTCCAATC 2124
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1916 AGCCTCCAGGCCAGCCCTCCGCCCCCTCCCAGCTCTCAGCACCCCGGAGGTACTCCAGCAGCTTGTCTCCAATC 1989
Query 2125 CAAGCTCCCAATCACCCACCGCCGCAGCCCCCTACGCAGGCCACGCCACTGATGCACACCAAACCCAATAGCCA 2198
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1990 CAAGCTCCCAATCACCCACCGCCGCAGCCCCCTACGCAGGCCACGCCACTGATGCACACCAAACCCAATAGCCA 2063
Query 2199 GGGCCCTCCCAACCCCATGGCATTGCCCAGTGAGCATGGACTTGAGCAGCCATCTCACACCCCTCCCCAGACTC 2272
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2064 GGGCCCTCCCAACCCCATGGCATTGCCCAGTGAGCATGGACTTGAGCAGCCATCTCACACCCCTCCCCAGACTC 2137
Query 2273 CAACGCCCCCCAGTACTCCGCCCCTAGGAAAACAGAACCCCAGTCTGCCAGCTCCTCAGACCCTGGCAGGGGGT 2346
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2138 CAACGCCCCCCAGTACTCCGCCCCTAGGAAAACAGAACCCCAGTCTGCCAGCTCCTCAGACCCTGGCAGGGGGT 2211
Query 2347 AACCCTGAAACTGCACAGCCACATGCTGGAACCTTACCGAGACCGAGACCAGTACCAAAGCCAAGGAACCGGCC 2420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2212 AACCCTGAAACTGCACAGCCACATGCTGGAACCTTACCGAGACCGAGACCAGTACCAAAGCCAAGGAACCGGCC 2285
Query 2421 CAGCGTGCCCCCACCCCCCCAACCTCCTGGTGTCCACTCAGCTGGGGACAGCAGCCTCACCAACACAGCACCAA 2494
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2286 CAGCGTGCCCCCACCCCCCCAACCTCCTGGTGTCCACTCAGCTGGGGACAGCAGCCTCACCAACACAGCACCAA 2359
Query 2495 CAGCTTCCAAGATAGTAACAGACTCCAATTCCAGGGTTTCAGAACCGCATCGCAGCATCTTTCCTGAAATGCAC 2568
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2360 CAGCTTCCAAGATAGTAACAGACTCCAATTCCAGGGTTTCAGAACCGCATCGCAGCATCTTTCCTGAAATGCAC 2433
Query 2569 TCAGACTCAGCCAGCAAAGACGTGCCTGGCCGCATCCTGCTGGATATAGACAATGATACCGAGAGCACTGCCCT 2642
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2434 TCAGACTCAGCCAGCAAAGACGTGCCTGGCCGCATCCTGCTGGATATAGACAATGATACCGAGAGCACTGCCCT 2507
Query 2643 G 2643
|
Sbjct 2508 G 2508