Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474970
• Subject: XM_011545878.3
• Aligned Length: 2739
• Identities: 2409
• Gaps: 330

Alignment

Query    1  ATGAAGAAGCAGTTCAACCGCATGAAGCAGCTGGCTAACCAGACCGTGGGCAGAGCTGAGAAAACAGAAGTCCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGAAGCAGTTCAACCGCATGAAGCAGCTGGCTAACCAGACCGTGGGCAGAGCTGAGAAAACAGAAGTCCT  74

Query   75  TAGTGAAGATCTATTACAGATTGAGAGACGCCTGGACACGGTGCGGTCAATATGCCACCATTCCCATAAGCGCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TAGTGAAGATCTATTACAGATTGAGAGACGCCTGGACACGGTGCGGTCAATATGCCACCATTCCCATAAGCGCT  148

Query  149  TGGTGGCATGTTTCCAGGGCCAGCATGGCACCGATGCCGAGAGGAGACACAAAAAACTGCCTCTGACAGCTCTT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGTGGCATGTTTCCAGGGCCAGCATGGCACCGATGCCGAGAGGAGACACAAAAAACTGCCTCTGACAGCTCTT  222

Query  223  GCTCAAAATATGCAAGAAGCATCGACTCAGCTGGAAGACTCTCTCCTGGGGAAGATGCTGGAGACGTGTGGAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCTCAAAATATGCAAGAAGCATCGACTCAGCTGGAAGACTCTCTCCTGGGGAAGATGCTGGAGACGTGTGGAGA  296

Query  297  TGCTGAGAATCAGCTGGCTCTCGAGCTCTCCCAGCACGAAGTCTTTGTTGAGAAGGAGATCGTGGACCCTCTGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGCTGAGAATCAGCTGGCTCTCGAGCTCTCCCAGCACGAAGTCTTTGTTGAGAAGGAGATCGTGGACCCTCTGT  370

Query  371  ACGGCATAGCTGAGGTGGAGATTCCCAACATCCAGAAGCAGAGGAAGCAGCTTGCAAGATTGGTGTTAGACTGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACGGCATAGCTGAGGTGGAGATTCCCAACATCCAGAAGCAGAGGAAGCAGCTTGCAAGATTGGTGTTAGACTGG  444

Query  445  GATTCAGTCAGAGCCAGGTGGAACCAAGCTCACAAATCCTCAGGAACCAACTTTCAGGGGCTTCCATCAAAAAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATTCAGTCAGAGCCAGGTGGAACCAAGCTCACAAATCCTCAGGAACCAACTTTCAGGGGCTTCCATCAAAAAT  518

Query  519  AGATACTCTAAAGGAAGAGATGGATGAAGCTGGAAATAAAGTAGAACAGTGCAAGGATCAACTTGCAGCAGACA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGATACTCTAAAGGAAGAGATGGATGAAGCTGGAAATAAAGTAGAACAGTGCAAGGATCAACTTGCAGCAGACA  592

Query  593  TGTACAACTTTATGGCCAAAGAAGGGGAGTATGGCAAATTCTTTGTTACGTTATTAGAAGCCCAAGCAGATTAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGTACAACTTTATGGCCAAAGAAGGGGAGTATGGCAAATTCTTTGTTACGTTATTAGAAGCCCAAGCAGATTAC  666

Query  667  CATAGAAAAGCATTAGCAGTCTTAGAAAAGACCCTCCCCGAAATGCGAGCCCATCA------------------  722
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  
Sbjct  667  CATAGAAAAGCATTAGCAGTCTTAGAAAAGACCCTCCCCGAAATGCGAGCCCATCAAGGCAGCCCACTAAACCC  740

Query  723  --------------------------------------------------------------------------  722
                                                                                      
Sbjct  741  GCTGGCGTGTGTTGATGAAGTGTGGTGCAGGTGCAGCGTGCCACTGCAGCTTCTGGGCAGCCTGAGTTGGTGCC  814

Query  723  ----AGATAAGTGGGCGGAAAAACCAGCCTTTGGGACTCCCCTAGAAGAACACCTGAAGAGGAGCGGGCGCGAG  792
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATCTAGATAAGTGGGCGGAAAAACCAGCCTTTGGGACTCCCCTAGAAGAACACCTGAAGAGGAGCGGGCGCGAG  888

Query  793  ATTGCGCTGCCCATTGAAGCCTGTGTCATGCTGCTTCTGGAGACAGGCATGAAGGAGGAGGGCCTTTTCCGAAT  866
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATTGCGCTGCCCATTGAAGCCTGTGTCATGCTGCTTCTGGAGACAGGCATGAAGGAGGAGGGCCTTTTCCGAAT  962

Query  867  TGGGGCTGGGGCCTCCAAGTTAAAGAAGCTGAAAGCTGCTTTGGACTGTTCTACTTCTCACCTGGATGAGTTCT  940
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGGGGCTGGGGCCTCCAAGTTAAAGAAGCTGAAAGCTGCTTTGGACTGTTCTACTTCTCACCTGGATGAGTTCT  1036

Query  941  ATTCAGACCCCCATGCTGTAGCAGGTGCTTTAAAATCCTATTTACGGGAATTGCCTGAACCTTTGATGACTTTT  1014
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATTCAGACCCCCATGCTGTAGCAGGTGCTTTAAAATCCTATTTACGGGAATTGCCTGAACCTTTGATGACTTTT  1110

Query 1015  AATCTGTATGAAGAATGGACACAAGTTGCAAGTGTGCAGGATCAAGACAAAAAACTTCAAGACTTGTGGAGAAC  1088
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AATCTGTATGAAGAATGGACACAAGTTGCAAGTGTGCAGGATCAAGACAAAAAACTTCAAGACTTGTGGAGAAC  1184

Query 1089  ATGTCAGAAGTTGCCACCACAAAATTTTGTTAACTTTAGATATTTGATCAAGTTCCTTGCAAAGCTTGCTCAGA  1162
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ATGTCAGAAGTTGCCACCACAAAATTTTGTTAACTTTAGATATTTGATCAAGTTCCTTGCAAAGCTTGCTCAGA  1258

Query 1163  CCAGCGATGTGAATAAAATGACTCCCAGCAACATTGCGATTGTGTTAGGCCCTAACTTGTTATGGGCCAGAAAT  1236
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCAGCGATGTGAATAAAATGACTCCCAGCAACATTGCGATTGTGTTAGGCCCTAACTTGTTATGGGCCAGAAAT  1332

Query 1237  GAAGGAACACTTGCTGAAATGGCAGCAGCCACATCCGTCCATGTGGTTGCAGTGATTGAACCCATCATTCAGCA  1310
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAAGGAACACTTGCTGAAATGGCAGCAGCCACATCCGTCCATGTGGTTGCAGTGATTGAACCCATCATTCAGCA  1406

Query 1311  TGCCGACTGGTTCTTCCCTGAAGAGGTGGAATTTAATGTATCAGAAGCATTTGTACCTCTCACCACCCCGAGTT  1384
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGCCGACTGGTTCTTCCCTGAAGAGGTGGAATTTAATGTATCAGAAGCATTTGTACCTCTCACCACCCCGAGTT  1480

Query 1385  CTAATCACTCATTCCACACTGGAAACGACTCTGACTCGGGGACCCTGGAGAGGAAGCGGCCTGCTAGCATGGCG  1458
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTAATCACTCATTCCACACTGGAAACGACTCTGACTCGGGGACCCTGGAGAGGAAGCGGCCTGCTAGCATGGCG  1554

Query 1459  GTGATGGAAGGAGACTTGGTGAAGAAGGAAAGCTTTGGTGTGAAGCTTATGGACTTCCAGGCCCACCGGCGGGG  1532
            ||||||||||||||||||||||||||||||                                            
Sbjct 1555  GTGATGGAAGGAGACTTGGTGAAGAAGGAA--------------------------------------------  1584

Query 1533  TGGCACTCTAAATAGAAAGCACATATCCCCCGCTTTCCAGCCGCCACTTCCGCCCACAGATGGCAGCACCGTGG  1606
                                                                                      
Sbjct 1585  --------------------------------------------------------------------------  1584

Query 1607  TGCCCGCTGGCCCAGAGCCCCCTCCCCAGAGCTCTAGGGCTGAAAGCAGCTCTGGGGGTGGGACTGTCCCCTCT  1680
                                                                                      
Sbjct 1585  --------------------------------------------------------------------------  1584

Query 1681  TCCGCGGGCATACTGGAGCAGGGGCCGAGCCCAGGCGACGGCAGTCCTCCCAAACCGAAGGACCCTGTATCTGC  1754
                                                      ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1585  ------------------------------------------AGTCCTCCCAAACCGAAGGACCCTGTATCTGC  1616

Query 1755  AGCTGTGCCAGCACCAGGGAGAAACAACAGTCAGATAGCATCTGGCCAAAATCAGCCCCAGGCAGCTGCTGGCT  1828
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1617  AGCTGTGCCAGCACCAGGGAGAAACAACAGTCAGATAGCATCTGGCCAAAATCAGCCCCAGGCAGCTGCTGGCT  1690

Query 1829  CCCACCAGCTCTCCATGGGCCAACCTCACAATGCTGCAGGGCCCAGCCCGCATACACTGCGCCGAGCTGTTAAA  1902
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1691  CCCACCAGCTCTCCATGGGCCAACCTCACAATGCTGCAGGGCCCAGCCCGCATACACTGCGCCGAGCTGTTAAA  1764

Query 1903  AAACCCGCTCCAGCACCCCCGAAACCGGGCAACCCACCTCCTGGCCACCCCGGGGGCCAGAGTTCTTCAGGAAC  1976
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1765  AAACCCGCTCCAGCACCCCCGAAACCGGGCAACCCACCTCCTGGCCACCCCGGGGGCCAGAGTTCTTCAGGAAC  1838

Query 1977  ATCTCAGCATCCACCCAGTCTGTCACCAAAGCCACCCACCCGAAGCCCCTCTCCTCCCACCCAGCACACGGGCC  2050
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1839  ATCTCAGCATCCACCCAGTCTGTCACCAAAGCCACCCACCCGAAGCCCCTCTCCTCCCACCCAGCACACGGGCC  1912

Query 2051  AGCCTCCAGGCCAGCCCTCCGCCCCCTCCCAGCTCTCAGCACCCCGGAGGTACTCCAGCAGCTTGTCTCCAATC  2124
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1913  AGCCTCCAGGCCAGCCCTCCGCCCCCTCCCAGCTCTCAGCACCCCGGAGGTACTCCAGCAGCTTGTCTCCAATC  1986

Query 2125  CAAGCTCCCAATCACCCACCGCCGCAGCCCCCTACGCAGGCCACGCCACTGATGCACACCAAACCCAATAGCCA  2198
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1987  CAAGCTCCCAATCACCCACCGCCGCAGCCCCCTACGCAGGCCACGCCACTGATGCACACCAAACCCAATAGCCA  2060

Query 2199  GGGCCCTCCCAACCCCATGGCATTGCCCAGTGAGCATGGACTTGAGCAGCCATCTCACACCCCTCCCCAGACTC  2272
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2061  GGGCCCTCCCAACCCCATGGCATTGCCCAGTGAGCATGGACTTGAGCAGCCATCTCACACCCCTCCCCAGACTC  2134

Query 2273  CAACGCCCCCCAGTACTCCGCCCCTAGGAAAACAGAACCCCAGTCTGCCAGCTCCTCAGACCCTGGCAGGGGGT  2346
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2135  CAACGCCCCCCAGTACTCCGCCCCTAGGAAAACAGAACCCCAGTCTGCCAGCTCCTCAGACCCTGGCAGGGGGT  2208

Query 2347  AACCCTGAAACTGCACAGCCACATGCTGGAACCTTACCGAGACCGAGACCAGTACCAAAGCCAAGGAACCGGCC  2420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2209  AACCCTGAAACTGCACAGCCACATGCTGGAACCTTACCGAGACCGAGACCAGTACCAAAGCCAAGGAACCGGCC  2282

Query 2421  CAGCGTGCCCCCACCCCCCCAACCTCCTGGTGTCCACTCAGCTGGGGACAGCAGCCTCACCAACACAGCACCAA  2494
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2283  CAGCGTGCCCCCACCCCCCCAACCTCCTGGTGTCCACTCAGCTGGGGACAGCAGCCTCACCAACACAGCACCAA  2356

Query 2495  CAGCTTCCAAGATAGTAACAGACTCCAATTCCAGGGTTTCAGAACCGCATCGCAGCATCTTTCCTGAAATGCAC  2568
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2357  CAGCTTCCAAGATAGTAACAGACTCCAATTCCAGGGTTTCAGAACCGCATCGCAGCATCTTTCCTGAAATGCAC  2430

Query 2569  TCAGACTCAGCCAGCAAAGACGTGCCTGGCCGCATCCTGCTGGATATAGACAATGATACCGAGAGCACTGCCCT  2642
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2431  TCAGACTCAGCCAGCAAAGACGTGCCTGGCCGCATCCTGCTGGATATAGACAATGATACCGAGAGCACTGCCCT  2504

Query 2643  G  2643
            |
Sbjct 2505  G  2505