Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474970
• Subject: XM_024450336.1
• Aligned Length: 2643
• Identities: 2412
• Gaps: 231

Alignment

Query    1  ATGAAGAAGCAGTTCAACCGCATGAAGCAGCTGGCTAACCAGACCGTGGGCAGAGCTGAGAAAACAGAAGTCCT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TAGTGAAGATCTATTACAGATTGAGAGACGCCTGGACACGGTGCGGTCAATATGCCACCATTCCCATAAGCGCT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGGTGGCATGTTTCCAGGGCCAGCATGGCACCGATGCCGAGAGGAGACACAAAAAACTGCCTCTGACAGCTCTT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GCTCAAAATATGCAAGAAGCATCGACTCAGCTGGAAGACTCTCTCCTGGGGAAGATGCTGGAGACGTGTGGAGA  296
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------ATGCAAGAAGCATCGACTCAGCTGGAAGACTCTCTCCTGGGGAAGATGCTGGAGACGTGTGGAGA  65

Query  297  TGCTGAGAATCAGCTGGCTCTCGAGCTCTCCCAGCACGAAGTCTTTGTTGAGAAGGAGATCGTGGACCCTCTGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   66  TGCTGAGAATCAGCTGGCTCTCGAGCTCTCCCAGCACGAAGTCTTTGTTGAGAAGGAGATCGTGGACCCTCTGT  139

Query  371  ACGGCATAGCTGAGGTGGAGATTCCCAACATCCAGAAGCAGAGGAAGCAGCTTGCAAGATTGGTGTTAGACTGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  140  ACGGCATAGCTGAGGTGGAGATTCCCAACATCCAGAAGCAGAGGAAGCAGCTTGCAAGATTGGTGTTAGACTGG  213

Query  445  GATTCAGTCAGAGCCAGGTGGAACCAAGCTCACAAATCCTCAGGAACCAACTTTCAGGGGCTTCCATCAAAAAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  214  GATTCAGTCAGAGCCAGGTGGAACCAAGCTCACAAATCCTCAGGAACCAACTTTCAGGGGCTTCCATCAAAAAT  287

Query  519  AGATACTCTAAAGGAAGAGATGGATGAAGCTGGAAATAAAGTAGAACAGTGCAAGGATCAACTTGCAGCAGACA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  288  AGATACTCTAAAGGAAGAGATGGATGAAGCTGGAAATAAAGTAGAACAGTGCAAGGATCAACTTGCAGCAGACA  361

Query  593  TGTACAACTTTATGGCCAAAGAAGGGGAGTATGGCAAATTCTTTGTTACGTTATTAGAAGCCCAAGCAGATTAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  362  TGTACAACTTTATGGCCAAAGAAGGGGAGTATGGCAAATTCTTTGTTACGTTATTAGAAGCCCAAGCAGATTAC  435

Query  667  CATAGAAAAGCATTAGCAGTCTTAGAAAAGACCCTCCCCGAAATGCGAGCCCATCAAGATAAGTGGGCGGAAAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  436  CATAGAAAAGCATTAGCAGTCTTAGAAAAGACCCTCCCCGAAATGCGAGCCCATCAAGATAAGTGGGCGGAAAA  509

Query  741  ACCAGCCTTTGGGACTCCCCTAGAAGAACACCTGAAGAGGAGCGGGCGCGAGATTGCGCTGCCCATTGAAGCCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  510  ACCAGCCTTTGGGACTCCCCTAGAAGAACACCTGAAGAGGAGCGGGCGCGAGATTGCGCTGCCCATTGAAGCCT  583

Query  815  GTGTCATGCTGCTTCTGGAGACAGGCATGAAGGAGGAGGGCCTTTTCCGAATTGGGGCTGGGGCCTCCAAGTTA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  584  GTGTCATGCTGCTTCTGGAGACAGGCATGAAGGAGGAGGGCCTTTTCCGAATTGGGGCTGGGGCCTCCAAGTTA  657

Query  889  AAGAAGCTGAAAGCTGCTTTGGACTGTTCTACTTCTCACCTGGATGAGTTCTATTCAGACCCCCATGCTGTAGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  658  AAGAAGCTGAAAGCTGCTTTGGACTGTTCTACTTCTCACCTGGATGAGTTCTATTCAGACCCCCATGCTGTAGC  731

Query  963  AGGTGCTTTAAAATCCTATTTACGGGAATTGCCTGAACCTTTGATGACTTTTAATCTGTATGAAGAATGGACAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  732  AGGTGCTTTAAAATCCTATTTACGGGAATTGCCTGAACCTTTGATGACTTTTAATCTGTATGAAGAATGGACAC  805

Query 1037  AAGTTGCAAGTGTGCAGGATCAAGACAAAAAACTTCAAGACTTGTGGAGAACATGTCAGAAGTTGCCACCACAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  806  AAGTTGCAAGTGTGCAGGATCAAGACAAAAAACTTCAAGACTTGTGGAGAACATGTCAGAAGTTGCCACCACAA  879

Query 1111  AATTTTGTTAACTTTAGATATTTGATCAAGTTCCTTGCAAAGCTTGCTCAGACCAGCGATGTGAATAAAATGAC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  880  AATTTTGTTAACTTTAGATATTTGATCAAGTTCCTTGCAAAGCTTGCTCAGACCAGCGATGTGAATAAAATGAC  953

Query 1185  TCCCAGCAACATTGCGATTGTGTTAGGCCCTAACTTGTTATGGGCCAGAAATGAAGGAACACTTGCTGAAATGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  954  TCCCAGCAACATTGCGATTGTGTTAGGCCCTAACTTGTTATGGGCCAGAAATGAAGGAACACTTGCTGAAATGG  1027

Query 1259  CAGCAGCCACATCCGTCCATGTGGTTGCAGTGATTGAACCCATCATTCAGCATGCCGACTGGTTCTTCCCTGAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1028  CAGCAGCCACATCCGTCCATGTGGTTGCAGTGATTGAACCCATCATTCAGCATGCCGACTGGTTCTTCCCTGAA  1101

Query 1333  GAGGTGGAATTTAATGTATCAGAAGCATTTGTACCTCTCACCACCCCGAGTTCTAATCACTCATTCCACACTGG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1102  GAGGTGGAATTTAATGTATCAGAAGCATTTGTACCTCTCACCACCCCGAGTTCTAATCACTCATTCCACACTGG  1175

Query 1407  AAACGACTCTGACTCGGGGACCCTGGAGAGGAAGCGGCCTGCTAGCATGGCGGTGATGGAAGGAGACTTGGTGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1176  AAACGACTCTGACTCGGGGACCCTGGAGAGGAAGCGGCCTGCTAGCATGGCGGTGATGGAAGGAGACTTGGTGA  1249

Query 1481  AGAAGGAAAGCTTTGGTGTGAAGCTTATGGACTTCCAGGCCCACCGGCGGGGTGGCACTCTAAATAGAAAGCAC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1250  AGAAGGAAAGCTTTGGTGTGAAGCTTATGGACTTCCAGGCCCACCGGCGGGGTGGCACTCTAAATAGAAAGCAC  1323

Query 1555  ATATCCCCCGCTTTCCAGCCGCCACTTCCGCCCACAGATGGCAGCACCGTGGTGCCCGCTGGCCCAGAGCCCCC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1324  ATATCCCCCGCTTTCCAGCCGCCACTTCCGCCCACAGATGGCAGCACCGTGGTGCCCGCTGGCCCAGAGCCCCC  1397

Query 1629  TCCCCAGAGCTCTAGGGCTGAAAGCAGCTCTGGGGGTGGGACTGTCCCCTCTTCCGCGGGCATACTGGAGCAGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1398  TCCCCAGAGCTCTAGGGCTGAAAGCAGCTCTGGGGGTGGGACTGTCCCCTCTTCCGCGGGCATACTGGAGCAGG  1471

Query 1703  GGCCGAGCCCAGGCGACGGCAGTCCTCCCAAACCGAAGGACCCTGTATCTGCAGCTGTGCCAGCACCAGGGAGA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1472  GGCCGAGCCCAGGCGACGGCAGTCCTCCCAAACCGAAGGACCCTGTATCTGCAGCTGTGCCAGCACCAGGGAGA  1545

Query 1777  AACAACAGTCAGATAGCATCTGGCCAAAATCAGCCCCAGGCAGCTGCTGGCTCCCACCAGCTCTCCATGGGCCA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1546  AACAACAGTCAGATAGCATCTGGCCAAAATCAGCCCCAGGCAGCTGCTGGCTCCCACCAGCTCTCCATGGGCCA  1619

Query 1851  ACCTCACAATGCTGCAGGGCCCAGCCCGCATACACTGCGCCGAGCTGTTAAAAAACCCGCTCCAGCACCCCCGA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1620  ACCTCACAATGCTGCAGGGCCCAGCCCGCATACACTGCGCCGAGCTGTTAAAAAACCCGCTCCAGCACCCCCGA  1693

Query 1925  AACCGGGCAACCCACCTCCTGGCCACCCCGGGGGCCAGAGTTCTTCAGGAACATCTCAGCATCCACCCAGTCTG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1694  AACCGGGCAACCCACCTCCTGGCCACCCCGGGGGCCAGAGTTCTTCAGGAACATCTCAGCATCCACCCAGTCTG  1767

Query 1999  TCACCAAAGCCACCCACCCGAAGCCCCTCTCCTCCCACCCAGCACACGGGCCAGCCTCCAGGCCAGCCCTCCGC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1768  TCACCAAAGCCACCCACCCGAAGCCCCTCTCCTCCCACCCAGCACACGGGCCAGCCTCCAGGCCAGCCCTCCGC  1841

Query 2073  CCCCTCCCAGCTCTCAGCACCCCGGAGGTACTCCAGCAGCTTGTCTCCAATCCAAGCTCCCAATCACCCACCGC  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1842  CCCCTCCCAGCTCTCAGCACCCCGGAGGTACTCCAGCAGCTTGTCTCCAATCCAAGCTCCCAATCACCCACCGC  1915

Query 2147  CGCAGCCCCCTACGCAGGCCACGCCACTGATGCACACCAAACCCAATAGCCAGGGCCCTCCCAACCCCATGGCA  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1916  CGCAGCCCCCTACGCAGGCCACGCCACTGATGCACACCAAACCCAATAGCCAGGGCCCTCCCAACCCCATGGCA  1989

Query 2221  TTGCCCAGTGAGCATGGACTTGAGCAGCCATCTCACACCCCTCCCCAGACTCCAACGCCCCCCAGTACTCCGCC  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1990  TTGCCCAGTGAGCATGGACTTGAGCAGCCATCTCACACCCCTCCCCAGACTCCAACGCCCCCCAGTACTCCGCC  2063

Query 2295  CCTAGGAAAACAGAACCCCAGTCTGCCAGCTCCTCAGACCCTGGCAGGGGGTAACCCTGAAACTGCACAGCCAC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2064  CCTAGGAAAACAGAACCCCAGTCTGCCAGCTCCTCAGACCCTGGCAGGGGGTAACCCTGAAACTGCACAGCCAC  2137

Query 2369  ATGCTGGAACCTTACCGAGACCGAGACCAGTACCAAAGCCAAGGAACCGGCCCAGCGTGCCCCCACCCCCCCAA  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2138  ATGCTGGAACCTTACCGAGACCGAGACCAGTACCAAAGCCAAGGAACCGGCCCAGCGTGCCCCCACCCCCCCAA  2211

Query 2443  CCTCCTGGTGTCCACTCAGCTGGGGACAGCAGCCTCACCAACACAGCACCAACAGCTTCCAAGATAGTAACAGA  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2212  CCTCCTGGTGTCCACTCAGCTGGGGACAGCAGCCTCACCAACACAGCACCAACAGCTTCCAAGATAGTAACAGA  2285

Query 2517  CTCCAATTCCAGGGTTTCAGAACCGCATCGCAGCATCTTTCCTGAAATGCACTCAGACTCAGCCAGCAAAGACG  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2286  CTCCAATTCCAGGGTTTCAGAACCGCATCGCAGCATCTTTCCTGAAATGCACTCAGACTCAGCCAGCAAAGACG  2359

Query 2591  TGCCTGGCCGCATCCTGCTGGATATAGACAATGATACCGAGAGCACTGCCCTG  2643
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2360  TGCCTGGCCGCATCCTGCTGGATATAGACAATGATACCGAGAGCACTGCCCTG  2412