Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474970
• Subject: XR_950809.2
• Aligned Length: 3690
• Identities: 2643
• Gaps: 1047

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  GGGAGCCACCGCCGCGCCGCCGTTTGGGCCGGGAAGCGATGTAGTAGCTGCCAGGCTGTCCCCCGCCCTGCCCG  74

Query    1  ------------------------------------ATGAAGAAGCAGTTCAACCGCATGAAGCAGCTGGCTAA  38
                                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCCCGAGCCCCGCGGGCCGCCGCCGCCACCGCCGCCATGAAGAAGCAGTTCAACCGCATGAAGCAGCTGGCTAA  148

Query   39  CCAGACCGTGGGCAGAGCTGAGAAAACAGAAGTCCTTAGTGAAGATCTATTACAGATTGAGAGACGCCTGGACA  112
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCAGACCGTGGGCAGAGCTGAGAAAACAGAAGTCCTTAGTGAAGATCTATTACAGATTGAGAGACGCCTGGACA  222

Query  113  CGGTGCGGTCAATATGCCACCATTCCCATAAGCGCTTGGTGGCATGTTTCCAGGGCCAGCATGGCACCGATGCC  186
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGGTGCGGTCAATATGCCACCATTCCCATAAGCGCTTGGTGGCATGTTTCCAGGGCCAGCATGGCACCGATGCC  296

Query  187  GAGAGGAGACACAAAAAACTGCCTCTGACAGCTCTTGCTCAAAATATGCAAGAAGCATCGACTCAGCTGGAAGA  260
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAGAGGAGACACAAAAAACTGCCTCTGACAGCTCTTGCTCAAAATATGCAAGAAGCATCGACTCAGCTGGAAGA  370

Query  261  CTCTCTCCTGGGGAAGATGCTGGAGACGTGTGGAGATGCTGAGAATCAGCTGGCTCTCGAGCTCTCCCAGCACG  334
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTCTCTCCTGGGGAAGATGCTGGAGACGTGTGGAGATGCTGAGAATCAGCTGGCTCTCGAGCTCTCCCAGCACG  444

Query  335  AAGTCTTTGTTGAGAAGGAGATCGTGGACCCTCTGTACGGCATAGCTGAGGTGGAGATTCCCAACATCCAGAAG  408
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGTCTTTGTTGAGAAGGAGATCGTGGACCCTCTGTACGGCATAGCTGAGGTGGAGATTCCCAACATCCAGAAG  518

Query  409  CAGAGGAAGCAGCTTGCAAGATTGGTGTTAGACTGGGATTCAGTCAGAGCCAGGTGGAACCAAGCTCACAAATC  482
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAGAGGAAGCAGCTTGCAAGATTGGTGTTAGACTGGGATTCAGTCAGAGCCAGGTGGAACCAAGCTCACAAATC  592

Query  483  CTCAGGAACCAACTTTCAGGGGCTTCCATCAAAAATAGATACTCTAAAGGAAGAGATGGATGAAGCTGGAAATA  556
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTCAGGAACCAACTTTCAGGGGCTTCCATCAAAAATAGATACTCTAAAGGAAGAGATGGATGAAGCTGGAAATA  666

Query  557  AAGTAGAACAGTGCAAGGATCAACTTGCAGCAGACATGTACAACTTTATGGCCAAAGAAGGGGAGTATGGCAAA  630
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGTAGAACAGTGCAAGGATCAACTTGCAGCAGACATGTACAACTTTATGGCCAAAGAAGGGGAGTATGGCAAA  740

Query  631  TTCTTTGTTACGTTATTAGAAGCCCAAGCAGATTACCATAGAAAAGCATTAGCAGTCTTAGAAAAGACCCTCCC  704
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTCTTTGTTACGTTATTAGAAGCCCAAGCAGATTACCATAGAAAAGCATTAGCAGTCTTAGAAAAGACCCTCCC  814

Query  705  CGAAATGCGAGCCCATCA--------------------------------------------------------  722
            ||||||||||||||||||                                                        
Sbjct  815  CGAAATGCGAGCCCATCAAGGCAGCCCACTAAACCCGCTGGCGTGTGTTGATGAAGTGTGGTGCAGGTGCAGCG  888

Query  723  ----------------------------------------AGATAAGTGGGCGGAAAAACCAGCCTTTGGGACT  756
                                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGCCACTGCAGCTTCTGGGCAGCCTGAGTTGGTGCCATCTAGATAAGTGGGCGGAAAAACCAGCCTTTGGGACT  962

Query  757  CCCCTAGAAGAACACCTGAAGAGGAGCGGGCGCGAGATTGCGCTGCCCATTGAAGCCTGTGTCATGCTGCTTCT  830
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCCCTAGAAGAACACCTGAAGAGGAGCGGGCGCGAGATTGCGCTGCCCATTGAAGCCTGTGTCATGCTGCTTCT  1036

Query  831  GGAGACAGGCATGAAGGAGGAGGGCCTTTTCCGAATTGGGGCTGGGGCCTCCAAGTTAAAGAAGCTGAAAGCTG  904
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGAGACAGGCATGAAGGAGGAGGGCCTTTTCCGAATTGGGGCTGGGGCCTCCAAGTTAAAGAAGCTGAAAGCTG  1110

Query  905  CTTTGGACTGTTCTACTTCTCACCTGGATGAGTTCTATTCAGACCCCCATGCTGTAGCAGGTGCTTTAAAATCC  978
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTTTGGACTGTTCTACTTCTCACCTGGATGAGTTCTATTCAGACCCCCATGCTGTAGCAGGTGCTTTAAAATCC  1184

Query  979  TATTTACGGGAATTGCCTGAACCTTTGATGACTTTTAATCTGTATGAAGAATGGACACAAGTTGCAAGTGTGCA  1052
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TATTTACGGGAATTGCCTGAACCTTTGATGACTTTTAATCTGTATGAAGAATGGACACAAGTTGCAAGTGTGCA  1258

Query 1053  GGATCAAGACAAAAAACTTCAAGACTTGTGGAGAACATGTCAGAAGTTGCCACCACAAAATTTTGTTAACTTTA  1126
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGATCAAGACAAAAAACTTCAAGACTTGTGGAGAACATGTCAGAAGTTGCCACCACAAAATTTTGTTAACTTTA  1332

Query 1127  GATATTTGATCAAGTTCCTTGCAAAGCTTGCTCAGACCAGCGATGTGAATAAAATGACTCCCAGCAACATTGCG  1200
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GATATTTGATCAAGTTCCTTGCAAAGCTTGCTCAGACCAGCGATGTGAATAAAATGACTCCCAGCAACATTGCG  1406

Query 1201  ATTGTGTTAGGCCCTAACTTGTTATGGGCCAGAAATGAAGGAACACTTGCTGAAATGGCAGCAGCCACATCCGT  1274
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ATTGTGTTAGGCCCTAACTTGTTATGGGCCAGAAATGAAGGAACACTTGCTGAAATGGCAGCAGCCACATCCGT  1480

Query 1275  CCATGTGGTTGCAGTGATTGAACCCATCATTCAGCATGCCGACTGGTTCTTCCCTGAAGAGGTGGAATTTAATG  1348
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCATGTGGTTGCAGTGATTGAACCCATCATTCAGCATGCCGACTGGTTCTTCCCTGAAGAGGTGGAATTTAATG  1554

Query 1349  TATCAGAAGCATTTGTACCTCTCACCACCCCGAGTTCTAATCACTCATTCCACACTGGAAACGACTCTGACTCG  1422
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TATCAGAAGCATTTGTACCTCTCACCACCCCGAGTTCTAATCACTCATTCCACACTGGAAACGACTCTGACTCG  1628

Query 1423  GGGACCCTGGAGAGGAAGCGGCCTGCTAGCATGGCGGTGATGGAAGGAGACTTGGTGAAGAAGGAAAGCTTTGG  1496
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GGGACCCTGGAGAGGAAGCGGCCTGCTAGCATGGCGGTGATGGAAGGAGACTTGGTGAAGAAGGAAAGCTTTGG  1702

Query 1497  TGTGAAGCTTATGGACTTCCAGGCCCACCGGCGGGGTGGCACTCTAAATAGAAAGCACATATCCCCCGCTTTCC  1570
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TGTGAAGCTTATGGACTTCCAGGCCCACCGGCGGGGTGGCACTCTAAATAGAAAGCACATATCCCCCGCTTTCC  1776

Query 1571  AGCCGCCACTTCCGCCCACAGATGGCAGCACCGTGGTGCCCGCTGGCCCAGAGCCCCCTCCCCAGAGCTCTAGG  1644
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AGCCGCCACTTCCGCCCACAGATGGCAGCACCGTGGTGCCCGCTGGCCCAGAGCCCCCTCCCCAGAGCTCTAGG  1850

Query 1645  GCTGAAAGCAGCTCTGGGGGTGGGACTGTCCCCTCTTCCGCGGGCATACTGGAGCAGGGGCCGAGCCCAGGCGA  1718
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GCTGAAAGCAGCTCTGGGGGTGGGACTGTCCCCTCTTCCGCGGGCATACTGGAGCAGGGGCCGAGCCCAGGCGA  1924

Query 1719  CGGCAGTCCTCCCAAACCGAAGGACCCTGTATCTGCAGCTGTGCCAGCACCAGGGAGAAACAACAGTCAGATAG  1792
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CGGCAGTCCTCCCAAACCGAAGGACCCTGTATCTGCAGCTGTGCCAGCACCAGGGAGAAACAACAGTCAGATAG  1998

Query 1793  CATCTGGCCAAAATCAGCCCCAGGCAGCTGCTGGCTCCCACCAGCTCTCCATGGGCCAACCTCACAATGCTGCA  1866
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CATCTGGCCAAAATCAGCCCCAGGCAGCTGCTGGCTCCCACCAGCTCTCCATGGGCCAACCTCACAATGCTGCA  2072

Query 1867  GGGCCCAGCCCGCATACACTGCGCCGAGCTGTTAAAAAACCCGCTCCAGCACCCCCGAAACCGGGCAACCCACC  1940
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GGGCCCAGCCCGCATACACTGCGCCGAGCTGTTAAAAAACCCGCTCCAGCACCCCCGAAACCGGGCAACCCACC  2146

Query 1941  TCCTGGCCACCCCGGGGGCCAGAGTTCTTCAGGAACATCTCAGCATCCACCCAGTCTGTCACCAAAGCCACCCA  2014
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TCCTGGCCACCCCGGGGGCCAGAGTTCTTCAGGAACATCTCAGCATCCACCCAGTCTGTCACCAAAGCCACCCA  2220

Query 2015  CCCGAAGCCCCTCTCCTCCCACCCAGCACACGGGCCAGCCTCCAGGCCAGCCCTCCGCCCCCTCCCAGCTCTCA  2088
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CCCGAAGCCCCTCTCCTCCCACCCAGCACACGGGCCAGCCTCCAGGCCAGCCCTCCGCCCCCTCCCAGCTCTCA  2294

Query 2089  GCACCCCGGAGGTACTCCAGCAGCTTGTCTCCAATCCAAGCTCCCAATCACCCACCGCCGCAGCCCCCTACGCA  2162
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GCACCCCGGAGGTACTCCAGCAGCTTGTCTCCAATCCAAGCTCCCAATCACCCACCGCCGCAGCCCCCTACGCA  2368

Query 2163  GGCCACGCCACTGATGCACACCAAACCCAATAGCCAGGGCCCTCCCAACCCCATGGCATTGCCCAGTGAGCATG  2236
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  GGCCACGCCACTGATGCACACCAAACCCAATAGCCAGGGCCCTCCCAACCCCATGGCATTGCCCAGTGAGCATG  2442

Query 2237  GACTTGAGCAGCCATCTCACACCCCTCCCCAGACTCCAACGCCCCCCAGTACTCCGCCCCTAGGAAAACAGAAC  2310
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  GACTTGAGCAGCCATCTCACACCCCTCCCCAGACTCCAACGCCCCCCAGTACTCCGCCCCTAGGAAAACAGAAC  2516

Query 2311  CCCAGTCTGCCAGCTCCTCAGACCCTGGCAGGGGGTAACCCTGAAACTGCACAGCCACATGCTGGAACCTTACC  2384
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  CCCAGTCTGCCAGCTCCTCAGACCCTGGCAGGGGGTAACCCTGAAACTGCACAGCCACATGCTGGAACCTTACC  2590

Query 2385  GAGACCGAGACCAGTACCAAAGCCAAGGAACCGGCCCAGCGTGCCCCCACCCCCCCAACCTCCTGGTGTCCACT  2458
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  GAGACCGAGACCAGTACCAAAGCCAAGGAACCGGCCCAGCGTGCCCCCACCCCCCCAACCTCCTGGTGTCCACT  2664

Query 2459  CAGCTGGGGACAGCAGCCTCACCAACACAGCACCAACAGCTTCCAAGATAGTAACA------------------  2514
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  
Sbjct 2665  CAGCTGGGGACAGCAGCCTCACCAACACAGCACCAACAGCTTCCAAGATAGTAACAGATGCCCTTCCTAGTGCC  2738

Query 2515  --------------------------------------------------------------------------  2514
                                                                                      
Sbjct 2739  CTCACAGGTGGGGAAGGTTTCCAGGACTAAGATGTATGACCTGCCATATTCAGTAAGAACTGAGATTGGAATAT  2812

Query 2515  -----GACTCCAATTCCAGGGTTTCAGAACCGCATCGCAGCATCTTTCCTGAAATGCACTCAGACTCAGCCAGC  2583
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  TTAATGACTCCAATTCCAGGGTTTCAGAACCGCATCGCAGCATCTTTCCTGAAATGCACTCAGACTCAGCCAGC  2886

Query 2584  AAAGACGTGCCTGGCCGCATCCTGCTGGATATAGACAATGATACCGAGAGCACTGCCCTG--------------  2643
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
Sbjct 2887  AAAGACGTGCCTGGCCGCATCCTGCTGGATATAGACAATGATACCGAGAGCACTGCCCTGTGAAGAAAGCCCTT  2960

Query 2644  --------------------------------------------------------------------------  2643
                                                                                      
Sbjct 2961  TCCCAGCCCTCCACCACTTCCACCCTGGCGAGTGGAGCAGGGGCAGGCGAACCTCTTTCTTTGCAGACCGAACA  3034

Query 2644  --------------------------------------------------------------------------  2643
                                                                                      
Sbjct 3035  GTGAAAAGCTTTCAGTGGAGGACAAAGGAGGGCCTCACTGTGCGGGACCTGGCCTTCTGCACGGCCCAAGGAGA  3108

Query 2644  --------------------------------------------------------------------------  2643
                                                                                      
Sbjct 3109  ACCTGGAGGCCACCACTAAAGCTGAATGACCTGTGTCTTGAAGAAGTTGGCTTTCTTTACATGGGAAGGAAATC  3182

Query 2644  --------------------------------------------------------------------------  2643
                                                                                      
Sbjct 3183  ATGCCAAAAAAATCCAAAACAAAGAAGTACCTGGAGTGGAGAGAGTATTCCTGCTGAAACGCGCATAGGAAGCT  3256

Query 2644  --------------------------------------------------------------------------  2643
                                                                                      
Sbjct 3257  TTTGTCCCTGCTGTTAATGCGGGCAGCACCTACAGCAACTTGGAATGAGTAAGAAGCAGTGCGTTAACTATCTA  3330

Query 2644  --------------------------------------------------------------------------  2643
                                                                                      
Sbjct 3331  TTTAATAAAATGCGCTCATTATGCAAGTCGCCTACTCTCTGCTACCTGGACGTTCATTCTTATGTATTAGGAGG  3404

Query 2644  --------------------------------------------------------------------------  2643
                                                                                      
Sbjct 3405  GAGGCTGCGCTCCTTCAGACTTGCTGCAGAATCATTTTGTATCATGTATGGTCTGTGTCTCCCCAGTCCCCTCA  3478

Query 2644  --------------------------------------------------------------------------  2643
                                                                                      
Sbjct 3479  GAACCATGCCCATGGATGGTGACTGCTGGCTCTGTCACCTCATCAAACTGGATGTGACCCATGCCGCCTCGTTG  3552

Query 2644  --------------------------------------------------------------------------  2643
                                                                                      
Sbjct 3553  GATTGTCGGAATGTAGACAGAAATGTACTGTTCTTTTTTTTTTTTTTAAACAATGTAATTGCTACTTGATAAGG  3626

Query 2644  ----------------------------------------------------------------  2643
                                                                            
Sbjct 3627  ACCGAACATTATTCTAGTTTCATGTTTAATTTGAATTAAATATATTCTGTGGTTTATATGAAAA  3690