Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000474970
- Subject:
- XR_950810.2
- Aligned Length:
- 3594
- Identities:
- 2643
- Gaps:
- 951
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 GGGAGCCACCGCCGCGCCGCCGTTTGGGCCGGGAAGCGATGTAGTAGCTGCCAGGCTGTCCCCCGCCCTGCCCG 74
Query 1 ------------------------------------ATGAAGAAGCAGTTCAACCGCATGAAGCAGCTGGCTAA 38
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GCCCGAGCCCCGCGGGCCGCCGCCGCCACCGCCGCCATGAAGAAGCAGTTCAACCGCATGAAGCAGCTGGCTAA 148
Query 39 CCAGACCGTGGGCAGAGCTGAGAAAACAGAAGTCCTTAGTGAAGATCTATTACAGATTGAGAGACGCCTGGACA 112
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCAGACCGTGGGCAGAGCTGAGAAAACAGAAGTCCTTAGTGAAGATCTATTACAGATTGAGAGACGCCTGGACA 222
Query 113 CGGTGCGGTCAATATGCCACCATTCCCATAAGCGCTTGGTGGCATGTTTCCAGGGCCAGCATGGCACCGATGCC 186
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CGGTGCGGTCAATATGCCACCATTCCCATAAGCGCTTGGTGGCATGTTTCCAGGGCCAGCATGGCACCGATGCC 296
Query 187 GAGAGGAGACACAAAAAACTGCCTCTGACAGCTCTTGCTCAAAATATGCAAGAAGCATCGACTCAGCTGGAAGA 260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GAGAGGAGACACAAAAAACTGCCTCTGACAGCTCTTGCTCAAAATATGCAAGAAGCATCGACTCAGCTGGAAGA 370
Query 261 CTCTCTCCTGGGGAAGATGCTGGAGACGTGTGGAGATGCTGAGAATCAGCTGGCTCTCGAGCTCTCCCAGCACG 334
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CTCTCTCCTGGGGAAGATGCTGGAGACGTGTGGAGATGCTGAGAATCAGCTGGCTCTCGAGCTCTCCCAGCACG 444
Query 335 AAGTCTTTGTTGAGAAGGAGATCGTGGACCCTCTGTACGGCATAGCTGAGGTGGAGATTCCCAACATCCAGAAG 408
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAGTCTTTGTTGAGAAGGAGATCGTGGACCCTCTGTACGGCATAGCTGAGGTGGAGATTCCCAACATCCAGAAG 518
Query 409 CAGAGGAAGCAGCTTGCAAGATTGGTGTTAGACTGGGATTCAGTCAGAGCCAGGTGGAACCAAGCTCACAAATC 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAGAGGAAGCAGCTTGCAAGATTGGTGTTAGACTGGGATTCAGTCAGAGCCAGGTGGAACCAAGCTCACAAATC 592
Query 483 CTCAGGAACCAACTTTCAGGGGCTTCCATCAAAAATAGATACTCTAAAGGAAGAGATGGATGAAGCTGGAAATA 556
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CTCAGGAACCAACTTTCAGGGGCTTCCATCAAAAATAGATACTCTAAAGGAAGAGATGGATGAAGCTGGAAATA 666
Query 557 AAGTAGAACAGTGCAAGGATCAACTTGCAGCAGACATGTACAACTTTATGGCCAAAGAAGGGGAGTATGGCAAA 630
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAGTAGAACAGTGCAAGGATCAACTTGCAGCAGACATGTACAACTTTATGGCCAAAGAAGGGGAGTATGGCAAA 740
Query 631 TTCTTTGTTACGTTATTAGAAGCCCAAGCAGATTACCATAGAAAAGCATTAGCAGTCTTAGAAAAGACCCTCCC 704
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TTCTTTGTTACGTTATTAGAAGCCCAAGCAGATTACCATAGAAAAGCATTAGCAGTCTTAGAAAAGACCCTCCC 814
Query 705 CGAAATGCGAGCCCATCAAGATAAGTGGGCGGAAAAACCAGCCTTTGGGACTCCCCTAGAAGAACACCTGAAGA 778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CGAAATGCGAGCCCATCAAGATAAGTGGGCGGAAAAACCAGCCTTTGGGACTCCCCTAGAAGAACACCTGAAGA 888
Query 779 GGAGCGGGCGCGAGATTGCGCTGCCCATTGAAGCCTGTGTCATGCTGCTTCTGGAGACAGGCATGAAGGAGGAG 852
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGAGCGGGCGCGAGATTGCGCTGCCCATTGAAGCCTGTGTCATGCTGCTTCTGGAGACAGGCATGAAGGAGGAG 962
Query 853 GGCCTTTTCCGAATTGGGGCTGGGGCCTCCAAGTTAAAGAAGCTGAAAGCTGCTTTGGACTGTTCTACTTCTCA 926
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGCCTTTTCCGAATTGGGGCTGGGGCCTCCAAGTTAAAGAAGCTGAAAGCTGCTTTGGACTGTTCTACTTCTCA 1036
Query 927 CCTGGATGAGTTCTATTCAGACCCCCATGCTGTAGCAGGTGCTTTAAAATCCTATTTACGGGAATTGCCTGAAC 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCTGGATGAGTTCTATTCAGACCCCCATGCTGTAGCAGGTGCTTTAAAATCCTATTTACGGGAATTGCCTGAAC 1110
Query 1001 CTTTGATGACTTTTAATCTGTATGAAGAATGGACACAAGTTGCAAGTGTGCAGGATCAAGACAAAAAACTTCAA 1074
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CTTTGATGACTTTTAATCTGTATGAAGAATGGACACAAGTTGCAAGTGTGCAGGATCAAGACAAAAAACTTCAA 1184
Query 1075 GACTTGTGGAGAACATGTCAGAAGTTGCCACCACAAAATTTTGTTAACTTTAGATATTTGATCAAGTTCCTTGC 1148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GACTTGTGGAGAACATGTCAGAAGTTGCCACCACAAAATTTTGTTAACTTTAGATATTTGATCAAGTTCCTTGC 1258
Query 1149 AAAGCTTGCTCAGACCAGCGATGTGAATAAAATGACTCCCAGCAACATTGCGATTGTGTTAGGCCCTAACTTGT 1222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AAAGCTTGCTCAGACCAGCGATGTGAATAAAATGACTCCCAGCAACATTGCGATTGTGTTAGGCCCTAACTTGT 1332
Query 1223 TATGGGCCAGAAATGAAGGAACACTTGCTGAAATGGCAGCAGCCACATCCGTCCATGTGGTTGCAGTGATTGAA 1296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TATGGGCCAGAAATGAAGGAACACTTGCTGAAATGGCAGCAGCCACATCCGTCCATGTGGTTGCAGTGATTGAA 1406
Query 1297 CCCATCATTCAGCATGCCGACTGGTTCTTCCCTGAAGAGGTGGAATTTAATGTATCAGAAGCATTTGTACCTCT 1370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CCCATCATTCAGCATGCCGACTGGTTCTTCCCTGAAGAGGTGGAATTTAATGTATCAGAAGCATTTGTACCTCT 1480
Query 1371 CACCACCCCGAGTTCTAATCACTCATTCCACACTGGAAACGACTCTGACTCGGGGACCCTGGAGAGGAAGCGGC 1444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CACCACCCCGAGTTCTAATCACTCATTCCACACTGGAAACGACTCTGACTCGGGGACCCTGGAGAGGAAGCGGC 1554
Query 1445 CTGCTAGCATGGCGGTGATGGAAGGAGACTTGGTGAAGAAGGAAAGCTTTGGTGTGAAGCTTATGGACTTCCAG 1518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CTGCTAGCATGGCGGTGATGGAAGGAGACTTGGTGAAGAAGGAAAGCTTTGGTGTGAAGCTTATGGACTTCCAG 1628
Query 1519 GCCCACCGGCGGGGTGGCACTCTAAATAGAAAGCACATATCCCCCGCTTTCCAGCCGCCACTTCCGCCCACAGA 1592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GCCCACCGGCGGGGTGGCACTCTAAATAGAAAGCACATATCCCCCGCTTTCCAGCCGCCACTTCCGCCCACAGA 1702
Query 1593 TGGCAGCACCGTGGTGCCCGCTGGCCCAGAGCCCCCTCCCCAGAGCTCTAGGGCTGAAAGCAGCTCTGGGGGTG 1666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TGGCAGCACCGTGGTGCCCGCTGGCCCAGAGCCCCCTCCCCAGAGCTCTAGGGCTGAAAGCAGCTCTGGGGGTG 1776
Query 1667 GGACTGTCCCCTCTTCCGCGGGCATACTGGAGCAGGGGCCGAGCCCAGGCGACGGCAGTCCTCCCAAACCGAAG 1740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GGACTGTCCCCTCTTCCGCGGGCATACTGGAGCAGGGGCCGAGCCCAGGCGACGGCAGTCCTCCCAAACCGAAG 1850
Query 1741 GACCCTGTATCTGCAGCTGTGCCAGCACCAGGGAGAAACAACAGTCAGATAGCATCTGGCCAAAATCAGCCCCA 1814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GACCCTGTATCTGCAGCTGTGCCAGCACCAGGGAGAAACAACAGTCAGATAGCATCTGGCCAAAATCAGCCCCA 1924
Query 1815 GGCAGCTGCTGGCTCCCACCAGCTCTCCATGGGCCAACCTCACAATGCTGCAGGGCCCAGCCCGCATACACTGC 1888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 GGCAGCTGCTGGCTCCCACCAGCTCTCCATGGGCCAACCTCACAATGCTGCAGGGCCCAGCCCGCATACACTGC 1998
Query 1889 GCCGAGCTGTTAAAAAACCCGCTCCAGCACCCCCGAAACCGGGCAACCCACCTCCTGGCCACCCCGGGGGCCAG 1962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GCCGAGCTGTTAAAAAACCCGCTCCAGCACCCCCGAAACCGGGCAACCCACCTCCTGGCCACCCCGGGGGCCAG 2072
Query 1963 AGTTCTTCAGGAACATCTCAGCATCCACCCAGTCTGTCACCAAAGCCACCCACCCGAAGCCCCTCTCCTCCCAC 2036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 AGTTCTTCAGGAACATCTCAGCATCCACCCAGTCTGTCACCAAAGCCACCCACCCGAAGCCCCTCTCCTCCCAC 2146
Query 2037 CCAGCACACGGGCCAGCCTCCAGGCCAGCCCTCCGCCCCCTCCCAGCTCTCAGCACCCCGGAGGTACTCCAGCA 2110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CCAGCACACGGGCCAGCCTCCAGGCCAGCCCTCCGCCCCCTCCCAGCTCTCAGCACCCCGGAGGTACTCCAGCA 2220
Query 2111 GCTTGTCTCCAATCCAAGCTCCCAATCACCCACCGCCGCAGCCCCCTACGCAGGCCACGCCACTGATGCACACC 2184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GCTTGTCTCCAATCCAAGCTCCCAATCACCCACCGCCGCAGCCCCCTACGCAGGCCACGCCACTGATGCACACC 2294
Query 2185 AAACCCAATAGCCAGGGCCCTCCCAACCCCATGGCATTGCCCAGTGAGCATGGACTTGAGCAGCCATCTCACAC 2258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 AAACCCAATAGCCAGGGCCCTCCCAACCCCATGGCATTGCCCAGTGAGCATGGACTTGAGCAGCCATCTCACAC 2368
Query 2259 CCCTCCCCAGACTCCAACGCCCCCCAGTACTCCGCCCCTAGGAAAACAGAACCCCAGTCTGCCAGCTCCTCAGA 2332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 CCCTCCCCAGACTCCAACGCCCCCCAGTACTCCGCCCCTAGGAAAACAGAACCCCAGTCTGCCAGCTCCTCAGA 2442
Query 2333 CCCTGGCAGGGGGTAACCCTGAAACTGCACAGCCACATGCTGGAACCTTACCGAGACCGAGACCAGTACCAAAG 2406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 CCCTGGCAGGGGGTAACCCTGAAACTGCACAGCCACATGCTGGAACCTTACCGAGACCGAGACCAGTACCAAAG 2516
Query 2407 CCAAGGAACCGGCCCAGCGTGCCCCCACCCCCCCAACCTCCTGGTGTCCACTCAGCTGGGGACAGCAGCCTCAC 2480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 CCAAGGAACCGGCCCAGCGTGCCCCCACCCCCCCAACCTCCTGGTGTCCACTCAGCTGGGGACAGCAGCCTCAC 2590
Query 2481 CAACACAGCACCAACAGCTTCCAAGATAGTAACA---------------------------------------- 2514
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 CAACACAGCACCAACAGCTTCCAAGATAGTAACAGATGCCCTTCCTAGTGCCCTCACAGGTGGGGAAGGTTTCC 2664
Query 2515 ---------------------------------------------------------GACTCCAATTCCAGGGT 2531
|||||||||||||||||
Sbjct 2665 AGGACTAAGATGTATGACCTGCCATATTCAGTAAGAACTGAGATTGGAATATTTAATGACTCCAATTCCAGGGT 2738
Query 2532 TTCAGAACCGCATCGCAGCATCTTTCCTGAAATGCACTCAGACTCAGCCAGCAAAGACGTGCCTGGCCGCATCC 2605
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 TTCAGAACCGCATCGCAGCATCTTTCCTGAAATGCACTCAGACTCAGCCAGCAAAGACGTGCCTGGCCGCATCC 2812
Query 2606 TGCTGGATATAGACAATGATACCGAGAGCACTGCCCTG------------------------------------ 2643
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 TGCTGGATATAGACAATGATACCGAGAGCACTGCCCTGTGAAGAAAGCCCTTTCCCAGCCCTCCACCACTTCCA 2886
Query 2644 -------------------------------------------------------------------------- 2643
Sbjct 2887 CCCTGGCGAGTGGAGCAGGGGCAGGCGAACCTCTTTCTTTGCAGACCGAACAGTGAAAAGCTTTCAGTGGAGGA 2960
Query 2644 -------------------------------------------------------------------------- 2643
Sbjct 2961 CAAAGGAGGGCCTCACTGTGCGGGACCTGGCCTTCTGCACGGCCCAAGGAGAACCTGGAGGCCACCACTAAAGC 3034
Query 2644 -------------------------------------------------------------------------- 2643
Sbjct 3035 TGAATGACCTGTGTCTTGAAGAAGTTGGCTTTCTTTACATGGGAAGGAAATCATGCCAAAAAAATCCAAAACAA 3108
Query 2644 -------------------------------------------------------------------------- 2643
Sbjct 3109 AGAAGTACCTGGAGTGGAGAGAGTATTCCTGCTGAAACGCGCATAGGAAGCTTTTGTCCCTGCTGTTAATGCGG 3182
Query 2644 -------------------------------------------------------------------------- 2643
Sbjct 3183 GCAGCACCTACAGCAACTTGGAATGAGTAAGAAGCAGTGCGTTAACTATCTATTTAATAAAATGCGCTCATTAT 3256
Query 2644 -------------------------------------------------------------------------- 2643
Sbjct 3257 GCAAGTCGCCTACTCTCTGCTACCTGGACGTTCATTCTTATGTATTAGGAGGGAGGCTGCGCTCCTTCAGACTT 3330
Query 2644 -------------------------------------------------------------------------- 2643
Sbjct 3331 GCTGCAGAATCATTTTGTATCATGTATGGTCTGTGTCTCCCCAGTCCCCTCAGAACCATGCCCATGGATGGTGA 3404
Query 2644 -------------------------------------------------------------------------- 2643
Sbjct 3405 CTGCTGGCTCTGTCACCTCATCAAACTGGATGTGACCCATGCCGCCTCGTTGGATTGTCGGAATGTAGACAGAA 3478
Query 2644 -------------------------------------------------------------------------- 2643
Sbjct 3479 ATGTACTGTTCTTTTTTTTTTTTTTAAACAATGTAATTGCTACTTGATAAGGACCGAACATTATTCTAGTTTCA 3552
Query 2644 ------------------------------------------ 2643
Sbjct 3553 TGTTTAATTTGAATTAAATATATTCTGTGGTTTATATGAAAA 3594