Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000474970
- Subject:
- XR_950811.2
- Aligned Length:
- 3594
- Identities:
- 2409
- Gaps:
- 1185
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 GGGAGCCACCGCCGCGCCGCCGTTTGGGCCGGGAAGCGATGTAGTAGCTGCCAGGCTGTCCCCCGCCCTGCCCG 74
Query 1 ------------------------------------ATGAAGAAGCAGTTCAACCGCATGAAGCAGCTGGCTAA 38
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GCCCGAGCCCCGCGGGCCGCCGCCGCCACCGCCGCCATGAAGAAGCAGTTCAACCGCATGAAGCAGCTGGCTAA 148
Query 39 CCAGACCGTGGGCAGAGCTGAGAAAACAGAAGTCCTTAGTGAAGATCTATTACAGATTGAGAGACGCCTGGACA 112
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCAGACCGTGGGCAGAGCTGAGAAAACAGAAGTCCTTAGTGAAGATCTATTACAGATTGAGAGACGCCTGGACA 222
Query 113 CGGTGCGGTCAATATGCCACCATTCCCATAAGCGCTTGGTGGCATGTTTCCAGGGCCAGCATGGCACCGATGCC 186
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CGGTGCGGTCAATATGCCACCATTCCCATAAGCGCTTGGTGGCATGTTTCCAGGGCCAGCATGGCACCGATGCC 296
Query 187 GAGAGGAGACACAAAAAACTGCCTCTGACAGCTCTTGCTCAAAATATGCAAGAAGCATCGACTCAGCTGGAAGA 260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GAGAGGAGACACAAAAAACTGCCTCTGACAGCTCTTGCTCAAAATATGCAAGAAGCATCGACTCAGCTGGAAGA 370
Query 261 CTCTCTCCTGGGGAAGATGCTGGAGACGTGTGGAGATGCTGAGAATCAGCTGGCTCTCGAGCTCTCCCAGCACG 334
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CTCTCTCCTGGGGAAGATGCTGGAGACGTGTGGAGATGCTGAGAATCAGCTGGCTCTCGAGCTCTCCCAGCACG 444
Query 335 AAGTCTTTGTTGAGAAGGAGATCGTGGACCCTCTGTACGGCATAGCTGAGGTGGAGATTCCCAACATCCAGAAG 408
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAGTCTTTGTTGAGAAGGAGATCGTGGACCCTCTGTACGGCATAGCTGAGGTGGAGATTCCCAACATCCAGAAG 518
Query 409 CAGAGGAAGCAGCTTGCAAGATTGGTGTTAGACTGGGATTCAGTCAGAGCCAGGTGGAACCAAGCTCACAAATC 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAGAGGAAGCAGCTTGCAAGATTGGTGTTAGACTGGGATTCAGTCAGAGCCAGGTGGAACCAAGCTCACAAATC 592
Query 483 CTCAGGAACCAACTTTCAGGGGCTTCCATCAAAAATAGATACTCTAAAGGAAGAGATGGATGAAGCTGGAAATA 556
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CTCAGGAACCAACTTTCAGGGGCTTCCATCAAAAATAGATACTCTAAAGGAAGAGATGGATGAAGCTGGAAATA 666
Query 557 AAGTAGAACAGTGCAAGGATCAACTTGCAGCAGACATGTACAACTTTATGGCCAAAGAAGGGGAGTATGGCAAA 630
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAGTAGAACAGTGCAAGGATCAACTTGCAGCAGACATGTACAACTTTATGGCCAAAGAAGGGGAGTATGGCAAA 740
Query 631 TTCTTTGTTACGTTATTAGAAGCCCAAGCAGATTACCATAGAAAAGCATTAGCAGTCTTAGAAAAGACCCTCCC 704
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TTCTTTGTTACGTTATTAGAAGCCCAAGCAGATTACCATAGAAAAGCATTAGCAGTCTTAGAAAAGACCCTCCC 814
Query 705 CGAAATGCGAGCCCATCAAGATAAGTGGGCGGAAAAACCAGCCTTTGGGACTCCCCTAGAAGAACACCTGAAGA 778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CGAAATGCGAGCCCATCAAGATAAGTGGGCGGAAAAACCAGCCTTTGGGACTCCCCTAGAAGAACACCTGAAGA 888
Query 779 GGAGCGGGCGCGAGATTGCGCTGCCCATTGAAGCCTGTGTCATGCTGCTTCTGGAGACAGGCATGAAGGAGGAG 852
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGAGCGGGCGCGAGATTGCGCTGCCCATTGAAGCCTGTGTCATGCTGCTTCTGGAGACAGGCATGAAGGAGGAG 962
Query 853 GGCCTTTTCCGAATTGGGGCTGGGGCCTCCAAGTTAAAGAAGCTGAAAGCTGCTTTGGACTGTTCTACTTCTCA 926
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGCCTTTTCCGAATTGGGGCTGGGGCCTCCAAGTTAAAGAAGCTGAAAGCTGCTTTGGACTGTTCTACTTCTCA 1036
Query 927 CCTGGATGAGTTCTATTCAGACCCCCATGCTGTAGCAGGTGCTTTAAAATCCTATTTACGGGAATTGCCTGAAC 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCTGGATGAGTTCTATTCAGACCCCCATGCTGTAGCAGGTGCTTTAAAATCCTATTTACGGGAATTGCCTGAAC 1110
Query 1001 CTTTGATGACTTTTAATCTGTATGAAGAATGGACACAAGTTGCAAGTGTGCAGGATCAAGACAAAAAACTTCAA 1074
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CTTTGATGACTTTTAATCTGTATGAAGAATGGACACAAGTTGCAAGTGTGCAGGATCAAGACAAAAAACTTCAA 1184
Query 1075 GACTTGTGGAGAACATGTCAGAAGTTGCCACCACAAAATTTTGTTAACTTTAGATATTTGATCAAGTTCCTTGC 1148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GACTTGTGGAGAACATGTCAGAAGTTGCCACCACAAAATTTTGTTAACTTTAGATATTTGATCAAGTTCCTTGC 1258
Query 1149 AAAGCTTGCTCAGACCAGCGATGTGAATAAAATGACTCCCAGCAACATTGCGATTGTGTTAGGCCCTAACTTGT 1222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AAAGCTTGCTCAGACCAGCGATGTGAATAAAATGACTCCCAGCAACATTGCGATTGTGTTAGGCCCTAACTTGT 1332
Query 1223 TATGGGCCAGAAATGAAGGAACACTTGCTGAAATGGCAGCAGCCACATCCGTCCATGTGGTTGCAGTGATTGAA 1296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TATGGGCCAGAAATGAAGGAACACTTGCTGAAATGGCAGCAGCCACATCCGTCCATGTGGTTGCAGTGATTGAA 1406
Query 1297 CCCATCATTCAGCATGCCGACTGGTTCTTCCCTGAAGAGGTGGAATTTAATGTATCAGAAGCATTTGTACCTCT 1370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CCCATCATTCAGCATGCCGACTGGTTCTTCCCTGAAGAGGTGGAATTTAATGTATCAGAAGCATTTGTACCTCT 1480
Query 1371 CACCACCCCGAGTTCTAATCACTCATTCCACACTGGAAACGACTCTGACTCGGGGACCCTGGAGAGGAAGCGGC 1444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CACCACCCCGAGTTCTAATCACTCATTCCACACTGGAAACGACTCTGACTCGGGGACCCTGGAGAGGAAGCGGC 1554
Query 1445 CTGCTAGCATGGCGGTGATGGAAGGAGACTTGGTGAAGAAGGAAAGCTTTGGTGTGAAGCTTATGGACTTCCAG 1518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CTGCTAGCATGGCGGTGATGGAAGGAGACTTGGTGAAGAAGGAA------------------------------ 1598
Query 1519 GCCCACCGGCGGGGTGGCACTCTAAATAGAAAGCACATATCCCCCGCTTTCCAGCCGCCACTTCCGCCCACAGA 1592
Sbjct 1599 -------------------------------------------------------------------------- 1598
Query 1593 TGGCAGCACCGTGGTGCCCGCTGGCCCAGAGCCCCCTCCCCAGAGCTCTAGGGCTGAAAGCAGCTCTGGGGGTG 1666
Sbjct 1599 -------------------------------------------------------------------------- 1598
Query 1667 GGACTGTCCCCTCTTCCGCGGGCATACTGGAGCAGGGGCCGAGCCCAGGCGACGGCAGTCCTCCCAAACCGAAG 1740
||||||||||||||||||
Sbjct 1599 --------------------------------------------------------AGTCCTCCCAAACCGAAG 1616
Query 1741 GACCCTGTATCTGCAGCTGTGCCAGCACCAGGGAGAAACAACAGTCAGATAGCATCTGGCCAAAATCAGCCCCA 1814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1617 GACCCTGTATCTGCAGCTGTGCCAGCACCAGGGAGAAACAACAGTCAGATAGCATCTGGCCAAAATCAGCCCCA 1690
Query 1815 GGCAGCTGCTGGCTCCCACCAGCTCTCCATGGGCCAACCTCACAATGCTGCAGGGCCCAGCCCGCATACACTGC 1888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1691 GGCAGCTGCTGGCTCCCACCAGCTCTCCATGGGCCAACCTCACAATGCTGCAGGGCCCAGCCCGCATACACTGC 1764
Query 1889 GCCGAGCTGTTAAAAAACCCGCTCCAGCACCCCCGAAACCGGGCAACCCACCTCCTGGCCACCCCGGGGGCCAG 1962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1765 GCCGAGCTGTTAAAAAACCCGCTCCAGCACCCCCGAAACCGGGCAACCCACCTCCTGGCCACCCCGGGGGCCAG 1838
Query 1963 AGTTCTTCAGGAACATCTCAGCATCCACCCAGTCTGTCACCAAAGCCACCCACCCGAAGCCCCTCTCCTCCCAC 2036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1839 AGTTCTTCAGGAACATCTCAGCATCCACCCAGTCTGTCACCAAAGCCACCCACCCGAAGCCCCTCTCCTCCCAC 1912
Query 2037 CCAGCACACGGGCCAGCCTCCAGGCCAGCCCTCCGCCCCCTCCCAGCTCTCAGCACCCCGGAGGTACTCCAGCA 2110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1913 CCAGCACACGGGCCAGCCTCCAGGCCAGCCCTCCGCCCCCTCCCAGCTCTCAGCACCCCGGAGGTACTCCAGCA 1986
Query 2111 GCTTGTCTCCAATCCAAGCTCCCAATCACCCACCGCCGCAGCCCCCTACGCAGGCCACGCCACTGATGCACACC 2184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1987 GCTTGTCTCCAATCCAAGCTCCCAATCACCCACCGCCGCAGCCCCCTACGCAGGCCACGCCACTGATGCACACC 2060
Query 2185 AAACCCAATAGCCAGGGCCCTCCCAACCCCATGGCATTGCCCAGTGAGCATGGACTTGAGCAGCCATCTCACAC 2258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2061 AAACCCAATAGCCAGGGCCCTCCCAACCCCATGGCATTGCCCAGTGAGCATGGACTTGAGCAGCCATCTCACAC 2134
Query 2259 CCCTCCCCAGACTCCAACGCCCCCCAGTACTCCGCCCCTAGGAAAACAGAACCCCAGTCTGCCAGCTCCTCAGA 2332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2135 CCCTCCCCAGACTCCAACGCCCCCCAGTACTCCGCCCCTAGGAAAACAGAACCCCAGTCTGCCAGCTCCTCAGA 2208
Query 2333 CCCTGGCAGGGGGTAACCCTGAAACTGCACAGCCACATGCTGGAACCTTACCGAGACCGAGACCAGTACCAAAG 2406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2209 CCCTGGCAGGGGGTAACCCTGAAACTGCACAGCCACATGCTGGAACCTTACCGAGACCGAGACCAGTACCAAAG 2282
Query 2407 CCAAGGAACCGGCCCAGCGTGCCCCCACCCCCCCAACCTCCTGGTGTCCACTCAGCTGGGGACAGCAGCCTCAC 2480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2283 CCAAGGAACCGGCCCAGCGTGCCCCCACCCCCCCAACCTCCTGGTGTCCACTCAGCTGGGGACAGCAGCCTCAC 2356
Query 2481 CAACACAGCACCAACAGCTTCCAAGATAGTAACA---------------------------------------- 2514
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2357 CAACACAGCACCAACAGCTTCCAAGATAGTAACAGATGCCCTTCCTAGTGCCCTCACAGGTGGGGAAGGTTTCC 2430
Query 2515 ---------------------------------------------------------GACTCCAATTCCAGGGT 2531
|||||||||||||||||
Sbjct 2431 AGGACTAAGATGTATGACCTGCCATATTCAGTAAGAACTGAGATTGGAATATTTAATGACTCCAATTCCAGGGT 2504
Query 2532 TTCAGAACCGCATCGCAGCATCTTTCCTGAAATGCACTCAGACTCAGCCAGCAAAGACGTGCCTGGCCGCATCC 2605
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2505 TTCAGAACCGCATCGCAGCATCTTTCCTGAAATGCACTCAGACTCAGCCAGCAAAGACGTGCCTGGCCGCATCC 2578
Query 2606 TGCTGGATATAGACAATGATACCGAGAGCACTGCCCTG------------------------------------ 2643
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2579 TGCTGGATATAGACAATGATACCGAGAGCACTGCCCTGTGAAGAAAGCCCTTTCCCAGCCCTCCACCACTTCCA 2652
Query 2644 -------------------------------------------------------------------------- 2643
Sbjct 2653 CCCTGGCGAGTGGAGCAGGGGCAGGCGAACCTCTTTCTTTGCAGACCGAACAGTGAAAAGCTTTCAGTGGAGGA 2726
Query 2644 -------------------------------------------------------------------------- 2643
Sbjct 2727 CAAAGGAGGGCCTCACTGTGCGGGACCTGGCCTTCTGCACGGCCCAAGGAGAACCTGGAGGCCACCACTAAAGC 2800
Query 2644 -------------------------------------------------------------------------- 2643
Sbjct 2801 TGAATGACCTGTGTCTTGAAGAAGTTGGCTTTCTTTACATGGGAAGGAAATCATGCCAAAAAAATCCAAAACAA 2874
Query 2644 -------------------------------------------------------------------------- 2643
Sbjct 2875 AGAAGTACCTGGAGTGGAGAGAGTATTCCTGCTGAAACGCGCATAGGAAGCTTTTGTCCCTGCTGTTAATGCGG 2948
Query 2644 -------------------------------------------------------------------------- 2643
Sbjct 2949 GCAGCACCTACAGCAACTTGGAATGAGTAAGAAGCAGTGCGTTAACTATCTATTTAATAAAATGCGCTCATTAT 3022
Query 2644 -------------------------------------------------------------------------- 2643
Sbjct 3023 GCAAGTCGCCTACTCTCTGCTACCTGGACGTTCATTCTTATGTATTAGGAGGGAGGCTGCGCTCCTTCAGACTT 3096
Query 2644 -------------------------------------------------------------------------- 2643
Sbjct 3097 GCTGCAGAATCATTTTGTATCATGTATGGTCTGTGTCTCCCCAGTCCCCTCAGAACCATGCCCATGGATGGTGA 3170
Query 2644 -------------------------------------------------------------------------- 2643
Sbjct 3171 CTGCTGGCTCTGTCACCTCATCAAACTGGATGTGACCCATGCCGCCTCGTTGGATTGTCGGAATGTAGACAGAA 3244
Query 2644 -------------------------------------------------------------------------- 2643
Sbjct 3245 ATGTACTGTTCTTTTTTTTTTTTTTAAACAATGTAATTGCTACTTGATAAGGACCGAACATTATTCTAGTTTCA 3318
Query 2644 ------------------------------------------ 2643
Sbjct 3319 TGTTTAATTTGAATTAAATATATTCTGTGGTTTATATGAAAA 3360