Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475047
• Subject: NM_001282589.1
• Aligned Length: 901
• Identities: 579
• Gaps: 302

Alignment

Query   1  ATGGCTGGTTCCCCAACATGCCTCACCCTCATCTATATCCTTTGGCAGCTCACAGGGTCAGCAGCCTCTGGACC  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGCTGGTTCCCCAACATGCCTCACCCTCATCTATATCCTTTGGCAGCTCACAGGGTCAGCAGCCTCTGGACC  74

Query  75  CGTGAAAGAGCTGGTCGGTTCCGTTGGTGGGGCCGTGACTTTCCCCCTGAAGTCCAAAGTAAAGCAAGTTGACT  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  CGTGAAAGAGCTGGTCGGTTCCGTTGGTGGGGCCGTGACTTTCCCCCTGAAGTCCAAAGTAAAGCAAGTTGACT  148

Query 149  CTATTGTCTGGACCTTCAACACAACCCCTCTTGTCACCATACAGCCAGAAGGGGGCACTATCATAGTGACCCAA  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  CTATTGTCTGGACCTTCAACACAACCCCTCTTGTCACCATACAGCCAGAAGGGGGCACTATCATAGTGACCCAA  222

Query 223  AATCGTAATAGGGAGAGAGTAGACTTCCCAGATGGAGGCTACTCCCTGAAGCTCAGCAAACTGAAGAAGAATGA  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  AATCGTAATAGGGAGAGAGTAGACTTCCCAGATGGAGGCTACTCCCTGAAGCTCAGCAAACTGAAGAAGAATGA  296

Query 297  CTCAGGGATCTACTATGTGGGGATATACAGCTCATCACTCCAGCAGCCCTCCACCCAGGAGTACGTGCTGCATG  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  CTCAGGGATCTACTATGTGGGGATATACAGCTCATCACTCCAGCAGCCCTCCACCCAGGAGTACGTGCTGCATG  370

Query 371  TCTACGAGCACCTGTCAAAGCCTAAAGTCACCATGGGTCTGCAGAGCAATAAGAATGGCACCTGTGTGACCAAT  444
           ||||||||.||.|                          ||.|||| ||.||||         |.|||      
Sbjct 371  TCTACGAGTACAT--------------------------TGAAGAG-AAGAAGA---------GAGTG------  402

Query 445  CTGACATGCTGCATGGAACATGGGGAAGAGGATGTGATTTATACCTGGAAGGCCCTGGGGCAAGCAGCCAATGA  518
             ||||| .||         |.|||||                                              |
Sbjct 403  --GACAT-TTG---------TCGGGAA----------------------------------------------A  418

Query 519  GTCCCATAATGGGTCCATCCTCCCCATCTCCTGGAGATGGGGAGAAAGTGATATGACCTTCATCTGCGTTGCCA  592
           .|||.|..||      ||.| |||||  |.|||||||                                     
Sbjct 419  CTCCTAACAT------ATGC-CCCCA--TTCTGGAGA-------------------------------------  446

Query 593  GGAACCCTGTCAGCAGAAACTTCTCAAGCCCCATCCTTGCCAGGAAGCTCTGTGAAGGTGCTGCTGATGACCCA  666
            ||||       .||||                                  ||             |.|||.||
Sbjct 447  -GAAC-------ACAGA----------------------------------GT-------------ACGACACA  465

Query 667  GATTCCTCCATGGTCCTCCTGTGTCTCCTGTTGGTGCCCCTCCTGCTCAGTCTCTTTGTACTGGGGCTATTTCT  740
            ||.||||                                                                  
Sbjct 466  -ATCCCTC------------------------------------------------------------------  472

Query 741  TTGGTTTCTGAAGAGAGAGAGACAAGAAGAGAACAATCCTAAAGGAAGATCCAGCAAATACGGTTTACTCCACT  814
                                |||..||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 473  ---------------------ACACTAATAGAACAATCCTAAAGGAAGATCCAGCAAATACGGTTTACTCCACT  525

Query 815  GTGGAAATACCGAAAAAGATGGAAAATCCCCACTCACTGCTCACGATGCCAGACACACCAAGGCTATTTGCCTA  888
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 526  GTGGAAATACCGAAAAAGATGGAAAATCCCCACTCACTGCTCACGATGCCAGACACACCAAGGCTATTTGCCTA  599

Query 889  -------------  888
                        
Sbjct 600  TGAGAATGTTATC  612