Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475058
• Subject: XM_011242227.2
• Aligned Length: 1334
• Identities: 965
• Gaps: 208

Alignment

Query    1  ATGGCAGTGAAGCTTGGGACCCTCCTGCTGGCCCTTGCCCTGGGCCTGGCCCAGCCAGCCTCTGCCCGCCGGAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GCTGCTGGTGTTTCTGCTGGATGGTTTTCGCTCAGA-----CTACATCAGTGATGAGGCGCTGGAGTCATTGCC  143
                                ||||         |||     |||.|.||.|  |..|||               
Sbjct    1  --------------------ATGG---------AGAGTCCTCTAAACCACT--TCCGGC---------------  28

Query  144  TGGTTTCAAAGAG-ATTGTGAGCAGGG-GAGTAAAAGTGGATTACTTGACTCCAGACTTCCCTAGTCTCTCGTA  215
                    ||.|| |       ||||| |     .|||.|         ||.|||           ||||.|  
Sbjct   29  --------AACAGCA-------CAGGGCG-----CAGTCG---------CTACAG-----------CTCTGG--  60

Query  216  TCCCAATTATTATACCCTAATGACTGGCCGCCATTGTGAAGTCCATCAGATGATCGGGAACTACATGTGGGACC  289
                                     ||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct   61  -------------------------GGCCGCCACTGTGAGGTCCACCAGATGATCGGCAACTACATGTGGGATC  109

Query  290  CCACCACCAACAAGTCCTTTGACATTGGCGTCAACAAAGACAGCCTAATGCCTCTCTGGTGGAATGGATCAGAA  363
            |||..|||||||||||.||||||||.||.||||||..|||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||||
Sbjct  110  CCAGAACCAACAAGTCATTTGACATCGGGGTCAACCGAGACAGCCTGATGCCCCTGTGGTGGAACGGGTCAGAA  183

Query  364  CCTCTGTGGGTCACTCTGACCAAGGCCAAAAGGAAGGTCTACATGTACTACTGGCCAGGCTGTGAGGTTGAGAT  437
            ||.||||||.|||||||||..||.||||..|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct  184  CCGCTGTGGATCACTCTGATGAAAGCCAGGAGGAAAGTCTACATGTATTACTGGCCCGGCTGTGAAGTTGAGAT  257

Query  438  TCTGGGTGTCAGACCCACCTACTGCCTAGAATATAAAAATGTCCCAACGGATATCAATTTTGCCAATGCAGTCA  511
            |||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|
Sbjct  258  TCTTGGTGTCAGACCAACTTACTGCCTAGAATATAAAACTGTCCCAACAGATATCAACTTTGCGAATGCAGTTA  331

Query  512  GCGATGCTCTTGACTCCTTCAAGAGTGGCCGGGCCGACCTGGCAGCCATATACCATGAGCGCATTGACGTGGAA  585
            ||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct  332  GCGATGCTCTCGACTCATTAAAGAGTGGCCGAGCGGATCTAGCAGCCATATACCATGAGCGCATCGATGTAGAA  405

Query  586  GGCCACCACTACGGGCCTGCATCTCCGCAGAGGAAAGATGCCCTCAAGGCTGTAGACACTGTCCTGAAGTACAT  659
            ||.|||||||||||.|||.||||.||.|||||.|||||||||||||..|||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct  406  GGTCACCACTACGGCCCTTCATCACCTCAGAGAAAAGATGCCCTCAGAGCTGTGGACACTGTCCTGAAGTATAT  479

Query  660  GACCAAGTGGATCCAGGAGCGGGGCCTGCAGGACCGCCTGAACGTCATTATTTTCTCGGATCACGGAATGACCG  733
            ||.|.|||||||.|||||.||.|||||||||.|...|||.||||||||..|.|||||.||.||.||.|||||.|
Sbjct  480  GATCCAGTGGATTCAGGACCGAGGCCTGCAGCAGGACCTAAACGTCATCCTCTTCTCAGACCATGGGATGACTG  553

Query  734  ACATTTTCTGGATGGACAAAGTGATTGAGCTGAATAAGTACATCAGCCTGAATGACCTGCAGCAAGTGAAGGAC  807
            ||||.|||||||||||.||||||||||||||||..||.||||||||||||.|.|||||||||||||||||.|||
Sbjct  554  ACATCTTCTGGATGGATAAAGTGATTGAGCTGAGCAACTACATCAGCCTGGACGACCTGCAGCAAGTGAAAGAC  627

Query  808  CGCGGGCCTGTTGTGAGCCTTTGGCCGGCCCCTGGGAAACACTCTGAGATATATAACAAACTGAGCACAGTGGA  881
            ||.|||||.|||||||||||.|||||.|..|||||.||||||||||||||||||.|||||||..||||||||||
Sbjct  628  CGAGGGCCCGTTGTGAGCCTGTGGCCAGTTCCTGGAAAACACTCTGAGATATATCACAAACTCCGCACAGTGGA  701

Query  882  ACACATGACTGTCTACGAGAAAGAAGCCAT-CCCAAGCAGGTTCTATTACAAGAAAGGAAAGTTTGTCTCTCCT  954
            |||||||||.||.||.|||||||||.|.|| ||||| ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  702  ACACATGACCGTGTATGAGAAAGAATCAATACCCAA-CAGGTTCTATTACAAGAAAGGAAAATTTGTCTCTCCT  774

Query  955  TTGACTTTAGTGGCTGATGAAGGCTGGTTCATAACTGAGAATCGAGAGATGCTTCCGTTTTGGATGAACAGCAC  1028
            |||||..|.||||||||||||||.|||||||||.|.||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  775  TTGACCCTGGTGGCTGATGAAGGATGGTTCATAGCAGAGAGTCGAGAGATGCTTCCATTTTGGATGAACAGCAC  848

Query 1029  CGGCAGGCGGGAAGGTTGGCAGCGTGGATGGCACGGCTACGACAACGAGCTCATGGACATGCGGGGCATCTTCC  1102
            .||||.|||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||.|.||||||||||
Sbjct  849  GGGCAAGCGTGAAGGCTGGCAGCGAGGATGGCACGGATATGACAACGAACTCATGGACATGAGAGGCATCTTCC  922

Query 1103  TGGCCTTCGGACCTGATTTCAAATCCAACTTCAGAGCTGCTCCTATCAGGTCGGTGGACGTCTACAATGTCATG  1176
            |||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||..|||||
Sbjct  923  TGGCCATCGGACCTGATTTCAAGTCCAACTTCAGAGCTGCTCCAATCAGATCCGTGGATGTCTACAACATCATG  996

Query 1177  TGCAATGTGGTGGGCATCACCCCGCTGCCCAACAACGGATCCTGGTCCAGGGTGATGTGCATGCTGAAGGGCCG  1250
            |||.|.||.|..|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||||.
Sbjct  997  TGCCACGTCGCAGGCATCACCCCACTGCCCAACAACGGGTCCTGGTCCAGGGTGGTATGCATGCTGAAGGGCCA  1070

Query 1251  CGCCAGCACTGC----CCCGCCTGTCTGGCCCAGCCACTGTGCCCTGGCACTGATTCTTCTCT--TCCTGCTTG  1318
            ..|||||.||||    |||.||...|||    |.|..||||||.||||...|||||||.||||  |.||  |||
Sbjct 1071  GACCAGCTCTGCTCCACCCACCCCACTG----AACAGCTGTGCACTGGTCTTGATTCTCCTCTTATACT--TTG  1138

Query 1319  CA  1320
            .|
Sbjct 1139  TA  1140