Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000475115
- Subject:
- XM_011514718.1
- Aligned Length:
- 1737
- Identities:
- 1674
- Gaps:
- 63
Alignment
Query 1 ATGCCTTCTGCATCCTGTGATACACTACTGGATGACATCGAAGATATCGTGTCTCAGGAAGATTCAAAACCACA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCCTTCTGCATCCTGTGATACACTACTGGATGACATCGAAGATATCGTGTCTCAGGAAGATTCAAAACCACA 74
Query 75 AGATAGGCATTTTGTAAGAAAGGATGTTGTCCCGAAGGTACGAAGGCGAAATACCCAAAAATATTTGCAAGAGG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGATAGGCATTTTGTAAGAAAGGATGTTGTCCCGAAGGTACGAAGGCGAAATACCCAAAAATATTTGCAAGAGG 148
Query 149 AAGAAAACAGTCCACCAAGTGACAGCACTATTCCAGGCATACAGAAAATTTGGATACGAACATGGGGTTGTTCT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AAGAAAACAGTCCACCAAGTGACAGCACTATTCCAGGCATACAGAAAATTTGGATACGAACATGGGGTTGTTCT 222
Query 223 CATAATAATTCAGATGGAGAATATATGGCTGGACAGCTAGCTGCTTATGGCTATAAAATTACAGAAAATGCATC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CATAATAATTCAGATGGAGAATATATGGCTGGACAGCTAGCTGCTTATGGCTATAAAATTACAGAAAATGCATC 296
Query 297 CGATGCAGATTTATGGCTCCTGAACAGTTGCACTGTAAAAAACCCAGCTGAAGACCACTTTAGAAACTCAATTA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CGATGCAGATTTATGGCTCCTGAACAGTTGCACTGTAAAAAACCCAGCTGAAGACCACTTTAGAAACTCAATTA 370
Query 371 AAAAAGCTCAAGAGGAGAACAAGAAAATCGTACTGGCTGGATGCGTTCCTCAAGCCCAGCCTCGCCAGGACTAC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAAAAGCTCAAGAGGAGAACAAGAAAATCGTACTGGCTGGATGCGTTCCTCAAGCCCAGCCTCGCCAGGACTAC 444
Query 445 CTTAAGGGACTGAGTATCATTGGGGTTCAGCAGATAGATCGTGTGGTAGAAGTTGTGGAGGAGACAATTAAAGG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTTAAGGGACTGAGTATCATTGGGGTTCAGCAGATAGATCGTGTGGTAGAAGTTGTGGAGGAGACAATTAAAGG 518
Query 519 TCACTCTGTGAGACTGCTGGGTCAGAAAAAGGATAATGGAAGGCGGCTTGGGGGAGCACGATTGGATTTGCCGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TCACTCTGTGAGACTGCTGGGTCAGAAAAAGGATAATGGAAGGCGGCTTGGGGGAGCACGATTGGATTTGCCGA 592
Query 593 AGATTAGGAAGAATCCACTGATAGAAATCATTTCCATCAATACCGGGTGTCTCAATGCTTGTACCTACTGCAAA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGATTAGGAAGAATCCACTGATAGAAATCATTTCCATCAATACCGGGTGTCTCAATGCTTGTACCTACTGCAAA 666
Query 667 ACTAAACACGCCAGAGGAAATTTGGCCAGTTATCCAATTGATGAACTAGTAGATAGAGCCAAACAATCTTTTCA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ACTAAACACGCCAGAGGAAATTTGGCCAGTTATCCAATTGATGAACTAGTAGATAGAGCCAAACAATCTTTTCA 740
Query 741 AGAGGGTGTTTGTGAGATATGGTTGACCAGTGAAGACACGGGGGCTTATGGCAGAGATATTGGCACCAATCTCC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGAGGGTGTTTGTGAGATATGGTTGACCAGTGAAGACACGGGGGCTTATGGCAGAGATATTGGCACCAATCTCC 814
Query 815 CCACACTCCTGTGGAAACTGGTTGAAGTGATTCCTGAGGGAGCAATGCTGAGGCTTGGCATGACAAATCCGCCC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCACACTCCTGTGGAAACTGGTTGAAGTGATTCCTGAGGGAGCAATGCTGAGGCTTGGCATGACAAATCCGCCC 888
Query 889 TATATTTTAGAGCATCTGGAGGAAATGGCAAAAATCCTTAATCACCCCAGAGTCTACGCTTTTCTGCACATACC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TATATTTTAGAGCATCTGGAGGAAATGGCAAAAATCCTTAATCACCCCAGAGTCTACGCTTTTCTGCACATACC 962
Query 963 AGTCCAGTCTGCCTCCGACAGCGTACTCATGGAAATGAAAAGAGAATACTGTGTGGCTGACTTCAAAAGAGTAG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGTCCAGTCTGCCTCCGACAGCGTACTCATGGAAATGAAAAGAGAATACTGTGTGGCTGACTTCAAAAGAGTAG 1036
Query 1037 TGGATTTTCTGAAAGAGAAAGTTCCTGGAATAACTATTGCTACAGATATTATCTGTGGTTTTCCTGGAGAAACA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGGATTTTCTGAAAGAGAAAGTTCCTGGAATAACTATTGCTACAGATATTATCTGTGGTTTTCCTGGAGAAACA 1110
Query 1111 GATCAGGATTTTCAAGAAACAGTGAAACTTGTTGAAGAGTACAAATTCCCAAGCCTGTTTATTAACCAATTTTA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GATCAGGATTTTCAAGAAACAGTGAAACTTGTTGAAGAGTACAAATTCCCAAGCCTGTTTATTAACCAATTTTA 1184
Query 1185 CCCAAGACCAGGAACTCCTGCTGCAAAAATGGAACAAGTTCCAGCACAAGTGAAAAAGCAAAGGACAAAAGATC 1258
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CCCAAGACCAGGAACTCCTGCTGCAAAAATGGAACAAGTTCCAGCACAAGT----------------------- 1235
Query 1259 TTTCTCGGGTGTTTCATTCTTACAGTCCATATGATCACAAGATTGGTGAAAGACAACAAGTGTTAGTAACAGAA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1236 ----------------------------------------GATTGGTGAAAGACAACAAGTGTTAGTAACAGAA 1269
Query 1333 GAATCTTTTGATTCCAAGTTTTATGTTGCACACAATCAATTCTATGAGCAGGTTTTAGTGCCAAAGAACCCTGC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1270 GAATCTTTTGATTCCAAGTTTTATGTTGCACACAATCAATTCTATGAGCAGGTTTTAGTGCCAAAGAACCCTGC 1343
Query 1407 GTTCATGGGGAAGATGGTTGAAGTGGACATCTATGAATCAGGCAAACATTTTATGAAAGGGCAGCCAGTATCTG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1344 GTTCATGGGGAAGATGGTTGAAGTGGACATCTATGAATCAGGCAAACATTTTATGAAAGGGCAGCCAGTATCTG 1417
Query 1481 ATGCCAAAGTGTACACGCCCTCCATCAGCAAACCGCTAGCAAAGGGAGAAGTCTCGGGTTTGACAAAGGACTTC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1418 ATGCCAAAGTGTACACGCCCTCCATCAGCAAACCGCTAGCAAAGGGAGAAGTCTCGGGTTTGACAAAGGACTTC 1491
Query 1555 AGAAATGGGCTTGGGAACCAGCTGAGTTCAGGATCCCACACCTCTGCTGCATCTCAGTGTGACTCAGCGAGTTC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1492 AGAAATGGGCTTGGGAACCAGCTGAGTTCAGGATCCCACACCTCTGCTGCATCTCAGTGTGACTCAGCGAGTTC 1565
Query 1629 CAGAATGGTGCTGCCCATGCCAAGGCTACATCAAGACTGTGCGCTGAGGATGTCCGTGGGCTTGGCTCTGCTGG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1566 CAGAATGGTGCTGCCCATGCCAAGGCTACATCAAGACTGTGCGCTGAGGATGTCCGTGGGCTTGGCTCTGCTGG 1639
Query 1703 GTCTTCTTTTTGCTTTTTTTGTCAAGGTCTATAAT 1737
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1640 GTCTTCTTTTTGCTTTTTTTGTCAAGGTCTATAAT 1674