Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475150
• Subject: XM_017314099.1
• Aligned Length: 1023
• Identities: 934
• Gaps: 42

Alignment

Query    1  ATGACCATGGAATCTGGAGCCGAGAACCAGCAGAGTGGAGATGCAGCTGTAACAGAAGCTGAAAACCAACAAAT  74
            ||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGACCATGGAATCTGGAGCAGACAACCAGCAGAGTGGAGATGCTGCTGTAACAGAAGCTGAAAATCAACAAAT  74

Query   75  GACAGTTCAAGCCCAGCCACAGATTGCCACATTAGCCCAGGTATCTATGCCAGCAGCTCATGCAACATCATCTG  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GACAGTTCAAGCCCAGCCACAGATTGCCACATTAGCCCAGGTATCCATGCCAGCAGCTCATGCAACATCATCTG  148

Query  149  CTCCCACCGTAACTCTAGTACAGCTGCCCAATGGGCAGACAGTTCAAGTCCATGGAGTCATTCAGGCGGCCCAG  222
            |||||||.|||||..||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||||||||||||
Sbjct  149  CTCCCACTGTAACCTTAGTGCAGCTGCCCAATGGGCAGACAGTCCAGGTCCATGGCGTTATCCAGGCGGCCCAG  222

Query  223  CCATCAGTTATTCAGTCTCCACAAGTCCAAACAGTTCAGTCTTCCTGTAAGGACTTAAAAAGACTTTTCTCCGG  296
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||                                      
Sbjct  223  CCATCAGTTATCCAGTCTCCACAAGTCCAAACAGTT--------------------------------------  258

Query  297  AACACAGATTTCAACTATTGCAGAAAGTGAAGATTCACAGGAGTCAGTGGATAGTGTAACTGATTCCCAAAAGC  370
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  259  ----CAGATTTCAACTATTGCAGAAAGTGAAGATTCACAGGAGTCTGTGGATAGTGTAACTGATTCCCAAAAAC  328

Query  371  GAAGGGAAATTCTTTCAAGGAGGCCTTCCTACAGGAAAATTTTGAATGACTTATCTTCTGATGCACCAGGAGTG  444
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  329  GAAGGGAAATCCTTTCAAGGAGGCCTTCCTACAGGAAAATTTTGAATGACTTATCTTCTGATGCACCAGGGGTG  402

Query  445  CCAAGGATTGAAGAAGAGAAGTCTGAAGAGGAGACTTCAGCACCTGCCATCACCACTGTAACGGTGCCAACTCC  518
            |||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  403  CCAAGGATTGAAGAAGAAAAGTCAGAAGAGGAGACTTCAGCCCCTGCCATCACCACTGTAACAGTGCCAACCCC  476

Query  519  AATTTACCAAACTAGCAGTGGACAGTATATTGCCATTACCCAGGGAGGAGCAATACAGCTGGCTAACAATGGTA  592
            .||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  477  CATTTACCAAACTAGCAGTGGGCAGTACATTGCCATTACCCAGGGAGGAGCAATACAGCTGGCTAACAATGGTA  550

Query  593  CCGATGGGGTACAGGGCCTGCAAACATTAACCATGACCAATGCAGCAGCCACTCAGCCGGGTACTACCATTCTA  666
            |.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  551  CGGATGGGGTACAGGGCCTGCAGACATTAACCATGACCAATGCAGCTGCCACTCAGCCGGGTACTACCATTCTA  624

Query  667  CAGTATGCACAGACCACTGATGGACAGCAGATCTTAGTGCCCAGCAACCAAGTTGTTGTTCAAGCTGCCTCTGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  625  CAGTATGCACAGACCACTGATGGACAGCAGATTCTAGTGCCCAGCAACCAAGTTGTTGTTCAAGCTGCCTCAGG  698

Query  741  AGACGTACAAACATACCAGATTCGCACAGCACCCACTAGCACTATTGCCCCTGGAGTTGTTATGGCATCCTCCC  814
            .||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  699  CGATGTACAAACATACCAGATCCGCACAGCACCCACGAGCACCATTGCCCCTGGAGTTGTTATGGCGTCCTCCC  772

Query  815  CAGCACTTCCTACACAGCCTGCTGAAGAAGCAGCACGAAAGAGAGAGGTCCGTCTAATGAAGAACAGGGAAGCA  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  773  CAGCACTTCCTACACAGCCTGCTGAAGAAGCAGCACGGAAGAGAGAGGTCCGTCTAATGAAGAACAGGGAGGCA  846

Query  889  GCTCGAGAGTGTCGTAGAAAGAAGAAAGAATATGTGAAATGTTTAGAAAACAGAGTGGCAGTGCTTGAAAATCA  962
            ||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  847  GCAAGAGAATGTCGTAGAAAGAAGAAAGAATATGTGAAATGTTTAGAGAACAGAGTGGCAGTGCTTGAAAACCA  920

Query  963  AAACAAGACATTGATTGAGGAGCTAAAAGCACTTAAGGACCTTTACTGCCACAAATCAGAT  1023
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  921  AAACAAAACATTGATTGAGGAGCTAAAAGCACTTAAGGACCTTTACTGCCACAAATCAGAT  981