Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000475165
Subject:
XM_017025084.1
Aligned Length:
1044
Identities:
913
Gaps:
129

Alignment

Query    1  ATGGGCACCGAGAAAGAAAGCCCAGAGCCCGACTGCCAGAAACAGTTCCAGGCTGCAGTGAGCGTCATCCAGAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCACCGAGAAAGAAAGCCCAGAGCCCGACTGCCAGAAACAGTTCCAGGCTGCAGTGAGCGTCATCCAGAA  74

Query   75  CCTGCCCAAGAACGGTTCTTACCGCCCCTCCTATGAAGAGATGCTGCGATTCTACAGTTACTACAAGCAGGCCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTGCCCAAGAACGGTTCTTACCGCCCCTCCTATGAAGAGATGCTGCGATTCTACAGTTACTACAAGCAGGCCA  148

Query  149  CCATGGGGCCCTGCCTGGTCCCCCGGCCCGGGTTCTGGGACCCCATTGGACGATATAAGTGGGACGCCTGGAAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCATGGGGCCCTGCCTGGTCCCCCGGCCCGGGTTCTGGGACCCCATTGGACGATATAAGTGGGACGCCTGGAAC  222

Query  223  AGTCTGGGCAAGATGAGCAGGGAGGAGGCCATGTCTGCCTACATCACTGAAATGAAACTGGTGGCACAGAAGGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGTCTGGGCAAGATGAGCAGGGAGGAGGCCATGTCTGCCTACATCACTGAAATGAAACTGGTGGCACAGAAGGT  296

Query  297  GATCGACACAGTGCCCCTGGGTGAGGTGGCAGAGGACATGTTTGGTTACTTCGAGCCCCTGTACCAGGTGATCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GATCGACACAGTGCCCCTGGGTGAGGTGGCAGAGGACATGTTTGGTTACTTCGAGCCCCTGTACCAGGTGATCC  370

Query  371  CTGACATGCCGAGGCCCCCAGAGACCTTCCTGAGAAGGGTCACAGGTTGGAAAGAGCAGGTTGTGAATGGAGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGACATGCCGAGGCCCCCAGAGACCTTCCTGAGAAGGGTCACAGGTTGGAAAGAGCAGGTTGTGAATGGAGAT  444

Query  445  GTTGGGGCTGTTTCAGAGCCTCCCTGCCTCCCCAAGGAACCGGCACCCCCAAGCC-------------------  499
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   
Sbjct  445  GTTGGGGCTGTTTCAGAGCCTCCCTGCCTCCCCAAGGAACCGGCACCCCCAAGCCCAGCTTCCCTCTGGGCAGT  518

Query  500  -------------------CAGAGTCCCATTCACCCAGGGACCTGGACTCCGAGGTTTTCTGTGATTCCCTGGA  554
                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AACTCTACCAACCCCTCCACAGAGTCCCATTCACCCAGGGACCTGGACTCCGAGGTTTTCTGTGATTCCCTGGA  592

Query  555  GCAGCTGGAGCCTGAGCT---------------------GGTTTGGACAGAGCAGCGGGCAGCATCTGGAGGAA  607
            ||||||||||||||||||                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCAGCTGGAGCCTGAGCTGCTCTCTGACTCATCTCAGCAGGTTTGGACAGAGCAGCGGGCAGCATCTGGAGGAA  666

Query  608  AGCGTGATCCCAGGAACAGCCCCGTGCCCCCCACAAAGAAAGAGGGGTTGCGGGGCAGCCCGCCGGGGCCCCAG  681
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGCGTGATCCCAGGAACAGCCCCGTGCCCCCCACAAAGAAAGAGGGGTTGCGGGGCAGCCCGCCGGGGCCCCAG  740

Query  682  GAGTTGGACGTGTGGCTGCTGGGGACAGTTCGAGCACTACAGGAGAGCATGCAGGAGGTGCAGGCGAGGGTGCA  755
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAGTTGGACGTGTGGCTGCTGGGGACAGTTCGAGCACTACAGGAGAGCATGCAGGAGGTGCAGGCGAGGGTGCA  814

Query  756  GAGCCTGGAGAGCATGCCCCGGCCCCCTGAGCAGAGGCCGCAGCCCAGGCCCAGTGCTCGGCCATGGCCCCTTG  829
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAGCCTGGAGAGCATGCCCCGGCCCCCTGAGCAGAGGCCGCAGCCCAGGCCCAGTGCTCGGCCATGGCCCCTTG  888

Query  830  GGCTCCCGGGGCCCGCGCTGCTCTTCTTCCTCCTGTGGCCCTTCGTCGTCCAGTGGCTCTTCCGAATGTTTCGG  903
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGCTCCCGGGGCCCGCGCTGCTCTTCTTCCTCCTGTGGCCCTTCGTCGTCCAGTGGCTCTTCCGAATGTTTCGG  962

Query  904  ACTCAAAAGAGA--------------------------------------------------------------  915
            ||.||||||||.                                                              
Sbjct  963  ACCCAAAAGAGGTGACTGTCAGTGGAGGGGTCTCTGCAGCCAACTGAGACTATCTTGCTGTGCCCTGAGCCTTC  1036

Query  916  --------  915
                    
Sbjct 1037  CTAGGGTT  1044