Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475181
• Subject: NM_001102454.1
• Aligned Length: 2166
• Identities: 2159
• Gaps: 6

Alignment

Query    1  ATGGAGGGCTCACGTCCCCGCGCCCCGAGCGGCCACTTAGCGCCGTCGCCGCCGGCTTTCGACGGCGAGCTGGA  74
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Sbjct    1  ATGGAGGGCTCACGTCCCCGCGCCCCGAGCGGCCACTTAGCGCCGTCGCCGCCGGCTTTCGACGGCGAGCTGGA  74

Query   75  TCTGCAGCGATACTCCAACGGGCCAGCCGTGAGCGCAGGGTCGCTCGGGATGGGAGCGGTGAGCTGGTCTGAGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCTGCAGCGATACTCCAACGGGCCAGCCGTGAGCGCAGGGTCGCTCGGGATGGGAGCGGTGAGCTGGTCTGAGA  148

Query  149  GTCGTGCAGGCGAACGGCGCTTCCCCTGCCCTGTATGCGGGAAGCGCTTCCGCTTCAACTCTATCCTTGCTTTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTCGTGCAGGCGAACGGCGCTTCCCCTGCCCTGTATGCGGGAAGCGCTTCCGCTTCAACTCTATCCTTGCTTTG  222

Query  223  CACCTGCGGGCGCACCCAGGAGCCCAGGCCTTCCAGTGCCCTCACTGCGGCCACCGCGCGGCGCAGCGGGCTCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CACCTGCGGGCGCACCCAGGAGCCCAGGCCTTCCAGTGCCCTCACTGCGGCCACCGCGCGGCGCAGCGGGCTCT  296

Query  297  GCTGCGCTCGCACCTGCGCACACACCAGCCCGAGCGCCCACGTAGTCCTGCTGCACGCCTGTTGCTGGAGTTGG  370
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Sbjct  297  GCTGCGCTCGCACCTGCGCACACACCAGCCCGAGCGCCCACGTAGTCCTGCTGCACGCCTGTTGCTGGAGTTGG  370

Query  371  AAGAGCGCGCGCTACTACGCGAGGCCCGACTGGGGAGAGCCCGAAGCTCAGGGGGCATGCAGGCCACCCCTGCC  444
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Sbjct  371  AAGAGCGCGCGCTACTACGCGAGGCCCGACTGGGGAGAGCCCGAAGCTCAGGGGGCATGCAGGCCACCCCTGCC  444

Query  445  ACTGAGGGTCTGGCGCGGCCCCAGGCTCCTTCATCGTCCGCCTTCCGTTGCCCCTACTGCAAAGGCAAGTTTCG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACTGAGGGTCTGGCGCGGCCCCAGGCTCCTTCATCGTCCGCCTTCCGTTGCCCCTACTGCAAAGGCAAGTTTCG  518

Query  519  CACCTCGGCGGAGCGCGAACGCCACCTGCACATCCTGCATAGGCCCTGGAAGTGCGGCCTGTGCAGTTTCGGCT  592
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Sbjct  519  CACCTCGGCGGAGCGCGAACGCCACCTGCACATCCTGCATAGGCCCTGGAAGTGCGGCCTGTGCAGTTTCGGCT  592

Query  593  CCAGCCAGGAGGAGGAGCTGCTGCACCACAGCCTGACGGCCCACGGGGCTCCCGAGCGTCCCCTGGCGGCCACC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCAGCCAGGAGGAGGAGCTGCTGCACCACAGCCTGACGGCCCACGGGGCTCCCGAGCGTCCCCTGGCGGCCACC  666

Query  667  TCCGCTGCGCCTCC------GCCTCAGCCTCAGCCTCCACCCCAGCCCGAACCCAGATCAGTTCCCCAGCCGGA  734
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Sbjct  667  TCCGCTGCGCCTCCGCCTCAGCCTCAGCCTCAGCCTCCACCCCAGCCCGAACCCAGATCAGTCCCCCAGCCGGA  740

Query  735  GCCGGAGCCGGAGCCCGAACGTGAGGCAACCCCGACCCCAGCTCCTGCCGCTCCCGAGGAGCCCCCAGCGCCTC  808
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Sbjct  741  GCCGGAGCCGGAGCCCGAACGTGAGGCAACCCCGACCCCAGCTCCTGCCGCTCCCGAGGAGCCCCCAGCGCCTC  814

Query  809  CGGAGTTCCGCTGCCAAGTGTGCGGCCAGAGCTTTACACAGTCTTGGTTTCTCAAGGGCCACATGCGTAAGCAC  882
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Sbjct  815  CGGAGTTCCGCTGCCAAGTGTGCGGCCAGAGCTTTACACAGTCTTGGTTTCTCAAGGGCCACATGCGTAAGCAC  888

Query  883  AAGGCCTCCTTCGATCATGCGTGTCCGGTGTGCGGCCGCTGCTTCAAGGAGCCCTGGTTCCTTAAGAACCACAT  956
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Sbjct  889  AAGGCCTCCTTCGATCATGCGTGTCCGGTGTGCGGCCGCTGCTTCAAGGAGCCCTGGTTCCTTAAGAACCACAT  962

Query  957  GAAGGTGCACGCCAGCAAGCTGGGCCCACTGCGTGCCCCGGGGCCTGCCTCCGGGCCTGCCCGCGCCCCCCAGC  1030
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Sbjct  963  GAAGGTGCACGCCAGCAAGCTGGGCCCACTGCGTGCCCCGGGGCCTGCCTCCGGGCCTGCCCGCGCCCCCCAGC  1036

Query 1031  CTCCTGACCTCGGCCTGCTGGCCTATGAGCCGTTGGGCCCAGCGCTCCTCTTGGCCCCGGCTCCCACCCCGGCC  1104
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Sbjct 1037  CTCCTGACCTCGGCCTGCTGGCCTATGAGCCGTTGGGCCCAGCGCTCCTCTTGGCCCCGGCTCCCACCCCGGCC  1110

Query 1105  GAGCGCCGTGAGCCCCCGAGCCTCTTGGGCTACCTGAGCCTGCGAGCTGGCGAGGGCCGGCCCAACGGCGAGGG  1178
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Sbjct 1111  GAGCGCCGTGAGCCCCCGAGCCTCTTGGGCTACCTGAGCCTGCGAGCTGGCGAGGGCCGGCCCAACGGCGAGGG  1184

Query 1179  TGCTGAGCCCGGTCCCGGCCGCAGCTTCGGAGGCTTCCGCCCGCTGTCCTCTGCTCTCCCGGCCCGGGCTCGCC  1252
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Sbjct 1185  TGCTGAGCCCGGTCCCGGCCGCAGCTTCGGAGGCTTCCGCCCGCTGTCCTCTGCTCTCCCGGCCCGGGCTCGCC  1258

Query 1253  GGCACCGTGCGGAGGAGCCTGAGGAAGAAGAGGAGGTGGTGGAGGCCGAGGAGGAAACCTGGGCCCGGGGCAGG  1326
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Sbjct 1259  GGCACCGTGCGGAGGAGCCTGAGGAAGAAGAGGAGGTGGTGGAGGCCGAGGAGGAAACCTGGGCCCGGGGCAGG  1332

Query 1327  TCGCTGGGCTCTCTGGCTTCCCTGCACCCGCGCCCGGGTGAGGGACCGGGGCACTCTGCCTCTGCTGCTGGGGC  1400
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Sbjct 1333  TCGCTGGGCTCTCTGGCTTCCCTGCACCCGCGCCCGGGTGAGGGACCGGGGCACTCTGCCTCTGCTGCTGGGGC  1406

Query 1401  CCAGGCAAGATCGACCGCCACGCAGGAAGAGAATGGGCTGTTGGTTGGAGGGACCCGGCCTGAAGGGGGCCGGG  1474
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Sbjct 1407  CCAGGCAAGATCGACCGCCACGCAGGAAGAGAATGGGCTGTTGGTTGGAGGGACCCGGCCTGAAGGGGGCCGGG  1480

Query 1475  GCGCCACCGGCAAGGATTGTCCTTTCTGCGGAAAATCTTTCCGCTCAGCACATCACCTCAAAGTGCATCTGCGA  1548
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Sbjct 1481  GCGCCACCGGCAAGGATTGTCCTTTCTGCGGAAAATCTTTCCGCTCAGCACATCACCTCAAAGTGCATCTGCGA  1554

Query 1549  GTGCACACAGGCGAGCGGCCCTACAAGTGTCCGCACTGCGACTACGCGGGCACCCAGTCCGGCTCGCTCAAGTA  1622
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Sbjct 1555  GTGCACACAGGCGAGCGGCCCTACAAGTGTCCGCACTGCGACTACGCGGGCACCCAGTCCGGCTCGCTCAAGTA  1628

Query 1623  TCACCTACAGCGCCACCACCGGGAGCAGAGGAGCGGGGCCGGCCCCGGGCCACCCCCGGAGCCACCGCCTCCTT  1696
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Sbjct 1629  TCACCTACAGCGCCACCACCGGGAGCAGAGGAGCGGGGCCGGCCCCGGGCCACCCCCGGAGCCACCGCCTCCTT  1702

Query 1697  CCCAGCGGGGTTCGGCCCCGCAATCTGGAGCCAAGCCGTCTCCGCAGCCTGCGACCTGGGTGGAGGGCGCCTCA  1770
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Sbjct 1703  CCCAGCGGGGTTCGGCCCCGCAATCTGGAGCCAAGCCGTCTCCGCAGCCTGCGACCTGGGTGGAGGGCGCCTCA  1776

Query 1771  AGTCCCCGGCCTCCTTCTAGCGGTGCTGGGCCGGGGTCCCGTCGGAAGCCCGCCAGCCCTGGGAGGACCCTGCG  1844
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Sbjct 1777  AGTCCCCGGCCTCCTTCTAGCGGTGCTGGGCCGGGGTCCCGTCGGAAGCCCGCCAGCCCTGGGAGGACCCTGCG  1850

Query 1845  CAACGGGCGAGGCGGTGAGGCCGAACCCCTGGACCTGTCCTTGCGGGCAGGGCCGGGAGGCGAGGCCGGGCCTG  1918
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Sbjct 1851  CAACGGGCGAGGCGGTGAGGCCGAACCCCTGGACCTGTCCTTGCGGGCAGGGCCGGGAGGCGAGGCCGGGCCTG  1924

Query 1919  GGGGTGCCCTCCACCGCTGCCTCTTCTGCCCGTTCGCCACTGGAGCCCCAGAGCTCATGGCCTTGCACCTTCAA  1992
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Sbjct 1925  GGGGTGCCCTCCACCGCTGCCTCTTCTGCCCGTTCGCCACTGGAGCCCCAGAGCTCATGGCCTTGCACCTTCAA  1998

Query 1993  GTGCACCACAGCCGCCGGGCTAGGGGCCGCCGGCCACCCCAGGCTGACGCGTCCCCGCCCTATGCCCGAGTACC  2066
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Sbjct 1999  GTGCACCACAGCCGCCGGGCTAGGGGCCGCCGGCCACCCCAGGCTGACGCGTCCCCGCCCTATGCCCGAGTACC  2072

Query 2067  ATCAGGAGAGACCCCTCCCAGTCCTTCGCAGGAAGGGGAGGAGGGCTCCGGGCTGTCCAGACCCGGAGAGGCAG  2140
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Sbjct 2073  ATCAGGAGAGACCCCTCCCAGTCCTTCGCAGGAAGGGGAGGAGGGCTCCGGGCTGTCCAGACCCGGAGAGGCAG  2146

Query 2141  GGCTGGGGGGGCAAGAACGG  2160
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Sbjct 2147  GGCTGGGGGGGCAAGAACGG  2166