Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475181
• Subject: XM_005267739.1
• Aligned Length: 2304
• Identities: 2159
• Gaps: 144

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTTGGGGCAGAAAGAGCGGCAGAGCCAACTCCTTCCCTGCTCCACAGCACCTGTTGCCTTCATTAGCAGCTT  74

Query    1  --------------------------------------------------ATGG--------------AGGGCT  10
                                                              ||||              ||||||
Sbjct   75  TTCCTCCTCTTCCCTGCACTTCCCAGAACCAAAGAATGTGAAGGGGGTCCATGGAGATCTTTCTCCACAGGGCT  148

Query   11  CACGTCCCCGCGCCCCGAGCGGCCACTTAGCGCCGTCGCCGCCGGCTTTCGACGGCGAGCTGGATCTGCAGCGA  84
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CACGTCCCCGCGCCCCGAGCGGCCACTTAGCGCCGTCGCCGCCGGCTTTCGACGGCGAGCTGGATCTGCAGCGA  222

Query   85  TACTCCAACGGGCCAGCCGTGAGCGCAGGGTCGCTCGGGATGGGAGCGGTGAGCTGGTCTGAGAGTCGTGCAGG  158
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TACTCCAACGGGCCAGCCGTGAGCGCAGGGTCGCTCGGGATGGGAGCGGTGAGCTGGTCTGAGAGTCGTGCAGG  296

Query  159  CGAACGGCGCTTCCCCTGCCCTGTATGCGGGAAGCGCTTCCGCTTCAACTCTATCCTTGCTTTGCACCTGCGGG  232
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGAACGGCGCTTCCCCTGCCCTGTATGCGGGAAGCGCTTCCGCTTCAACTCTATCCTTGCTTTGCACCTGCGGG  370

Query  233  CGCACCCAGGAGCCCAGGCCTTCCAGTGCCCTCACTGCGGCCACCGCGCGGCGCAGCGGGCTCTGCTGCGCTCG  306
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CGCACCCAGGAGCCCAGGCCTTCCAGTGCCCTCACTGCGGCCACCGCGCGGCGCAGCGGGCTCTGCTGCGCTCG  444

Query  307  CACCTGCGCACACACCAGCCCGAGCGCCCACGTAGTCCTGCTGCACGCCTGTTGCTGGAGTTGGAAGAGCGCGC  380
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CACCTGCGCACACACCAGCCCGAGCGCCCACGTAGTCCTGCTGCACGCCTGTTGCTGGAGTTGGAAGAGCGCGC  518

Query  381  GCTACTACGCGAGGCCCGACTGGGGAGAGCCCGAAGCTCAGGGGGCATGCAGGCCACCCCTGCCACTGAGGGTC  454
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTACTACGCGAGGCCCGACTGGGGAGAGCCCGAAGCTCAGGGGGCATGCAGGCCACCCCTGCCACTGAGGGTC  592

Query  455  TGGCGCGGCCCCAGGCTCCTTCATCGTCCGCCTTCCGTTGCCCCTACTGCAAAGGCAAGTTTCGCACCTCGGCG  528
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGCGCGGCCCCAGGCTCCTTCATCGTCCGCCTTCCGTTGCCCCTACTGCAAAGGCAAGTTTCGCACCTCGGCG  666

Query  529  GAGCGCGAACGCCACCTGCACATCCTGCATAGGCCCTGGAAGTGCGGCCTGTGCAGTTTCGGCTCCAGCCAGGA  602
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGCGCGAACGCCACCTGCACATCCTGCATAGGCCCTGGAAGTGCGGCCTGTGCAGTTTCGGCTCCAGCCAGGA  740

Query  603  GGAGGAGCTGCTGCACCACAGCCTGACGGCCCACGGGGCTCCCGAGCGTCCCCTGGCGGCCACCTCCGCTGCGC  676
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGAGGAGCTGCTGCACCACAGCCTGACGGCCCACGGGGCTCCCGAGCGTCCCCTGGCGGCCACCTCCGCTGCGC  814

Query  677  CTCC------GCCTCAGCCTCAGCCTCCACCCCAGCCCGAACCCAGATCAGTTCCCCAGCCGGAGCCGGAGCCG  744
            ||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTCCGCCTCAGCCTCAGCCTCAGCCTCCACCCCAGCCCGAACCCAGATCAGTCCCCCAGCCGGAGCCGGAGCCG  888

Query  745  GAGCCCGAACGTGAGGCAACCCCGACCCCAGCTCCTGCCGCTCCCGAGGAGCCCCCAGCGCCTCCGGAGTTCCG  818
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGCCCGAACGTGAGGCAACCCCGACCCCAGCTCCTGCCGCTCCCGAGGAGCCCCCAGCGCCTCCGGAGTTCCG  962

Query  819  CTGCCAAGTGTGCGGCCAGAGCTTTACACAGTCTTGGTTTCTCAAGGGCCACATGCGTAAGCACAAGGCCTCCT  892
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTGCCAAGTGTGCGGCCAGAGCTTTACACAGTCTTGGTTTCTCAAGGGCCACATGCGTAAGCACAAGGCCTCCT  1036

Query  893  TCGATCATGCGTGTCCGGTGTGCGGCCGCTGCTTCAAGGAGCCCTGGTTCCTTAAGAACCACATGAAGGTGCAC  966
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCGATCATGCGTGTCCGGTGTGCGGCCGCTGCTTCAAGGAGCCCTGGTTCCTTAAGAACCACATGAAGGTGCAC  1110

Query  967  GCCAGCAAGCTGGGCCCACTGCGTGCCCCGGGGCCTGCCTCCGGGCCTGCCCGCGCCCCCCAGCCTCCTGACCT  1040
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCCAGCAAGCTGGGCCCACTGCGTGCCCCGGGGCCTGCCTCCGGGCCTGCCCGCGCCCCCCAGCCTCCTGACCT  1184

Query 1041  CGGCCTGCTGGCCTATGAGCCGTTGGGCCCAGCGCTCCTCTTGGCCCCGGCTCCCACCCCGGCCGAGCGCCGTG  1114
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CGGCCTGCTGGCCTATGAGCCGTTGGGCCCAGCGCTCCTCTTGGCCCCGGCTCCCACCCCGGCCGAGCGCCGTG  1258

Query 1115  AGCCCCCGAGCCTCTTGGGCTACCTGAGCCTGCGAGCTGGCGAGGGCCGGCCCAACGGCGAGGGTGCTGAGCCC  1188
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGCCCCCGAGCCTCTTGGGCTACCTGAGCCTGCGAGCTGGCGAGGGCCGGCCCAACGGCGAGGGTGCTGAGCCC  1332

Query 1189  GGTCCCGGCCGCAGCTTCGGAGGCTTCCGCCCGCTGTCCTCTGCTCTCCCGGCCCGGGCTCGCCGGCACCGTGC  1262
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGTCCCGGCCGCAGCTTCGGAGGCTTCCGCCCGCTGTCCTCTGCTCTCCCGGCCCGGGCTCGCCGGCACCGTGC  1406

Query 1263  GGAGGAGCCTGAGGAAGAAGAGGAGGTGGTGGAGGCCGAGGAGGAAACCTGGGCCCGGGGCAGGTCGCTGGGCT  1336
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGAGGAGCCTGAGGAAGAAGAGGAGGTGGTGGAGGCCGAGGAGGAAACCTGGGCCCGGGGCAGGTCGCTGGGCT  1480

Query 1337  CTCTGGCTTCCCTGCACCCGCGCCCGGGTGAGGGACCGGGGCACTCTGCCTCTGCTGCTGGGGCCCAGGCAAGA  1410
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTCTGGCTTCCCTGCACCCGCGCCCGGGTGAGGGACCGGGGCACTCTGCCTCTGCTGCTGGGGCCCAGGCAAGA  1554

Query 1411  TCGACCGCCACGCAGGAAGAGAATGGGCTGTTGGTTGGAGGGACCCGGCCTGAAGGGGGCCGGGGCGCCACCGG  1484
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TCGACCGCCACGCAGGAAGAGAATGGGCTGTTGGTTGGAGGGACCCGGCCTGAAGGGGGCCGGGGCGCCACCGG  1628

Query 1485  CAAGGATTGTCCTTTCTGCGGAAAATCTTTCCGCTCAGCACATCACCTCAAAGTGCATCTGCGAGTGCACACAG  1558
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CAAGGATTGTCCTTTCTGCGGAAAATCTTTCCGCTCAGCACATCACCTCAAAGTGCATCTGCGAGTGCACACAG  1702

Query 1559  GCGAGCGGCCCTACAAGTGTCCGCACTGCGACTACGCGGGCACCCAGTCCGGCTCGCTCAAGTATCACCTACAG  1632
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GCGAGCGGCCCTACAAGTGTCCGCACTGCGACTACGCGGGCACCCAGTCCGGCTCGCTCAAGTATCACCTACAG  1776

Query 1633  CGCCACCACCGGGAGCAGAGGAGCGGGGCCGGCCCCGGGCCACCCCCGGAGCCACCGCCTCCTTCCCAGCGGGG  1706
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CGCCACCACCGGGAGCAGAGGAGCGGGGCCGGCCCCGGGCCACCCCCGGAGCCACCGCCTCCTTCCCAGCGGGG  1850

Query 1707  TTCGGCCCCGCAATCTGGAGCCAAGCCGTCTCCGCAGCCTGCGACCTGGGTGGAGGGCGCCTCAAGTCCCCGGC  1780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TTCGGCCCCGCAATCTGGAGCCAAGCCGTCTCCGCAGCCTGCGACCTGGGTGGAGGGCGCCTCAAGTCCCCGGC  1924

Query 1781  CTCCTTCTAGCGGTGCTGGGCCGGGGTCCCGTCGGAAGCCCGCCAGCCCTGGGAGGACCCTGCGCAACGGGCGA  1854
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CTCCTTCTAGCGGTGCTGGGCCGGGGTCCCGTCGGAAGCCCGCCAGCCCTGGGAGGACCCTGCGCAACGGGCGA  1998

Query 1855  GGCGGTGAGGCCGAACCCCTGGACCTGTCCTTGCGGGCAGGGCCGGGAGGCGAGGCCGGGCCTGGGGGTGCCCT  1928
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GGCGGTGAGGCCGAACCCCTGGACCTGTCCTTGCGGGCAGGGCCGGGAGGCGAGGCCGGGCCTGGGGGTGCCCT  2072

Query 1929  CCACCGCTGCCTCTTCTGCCCGTTCGCCACTGGAGCCCCAGAGCTCATGGCCTTGCACCTTCAAGTGCACCACA  2002
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CCACCGCTGCCTCTTCTGCCCGTTCGCCACTGGAGCCCCAGAGCTCATGGCCTTGCACCTTCAAGTGCACCACA  2146

Query 2003  GCCGCCGGGCTAGGGGCCGCCGGCCACCCCAGGCTGACGCGTCCCCGCCCTATGCCCGAGTACCATCAGGAGAG  2076
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  GCCGCCGGGCTAGGGGCCGCCGGCCACCCCAGGCTGACGCGTCCCCGCCCTATGCCCGAGTACCATCAGGAGAG  2220

Query 2077  ACCCCTCCCAGTCCTTCGCAGGAAGGGGAGGAGGGCTCCGGGCTGTCCAGACCCGGAGAGGCAGGGCTGGGGGG  2150
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  ACCCCTCCCAGTCCTTCGCAGGAAGGGGAGGAGGGCTCCGGGCTGTCCAGACCCGGAGAGGCAGGGCTGGGGGG  2294

Query 2151  GCAAGAACGG  2160
            ||||||||||
Sbjct 2295  GCAAGAACGG  2304