Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000475181
- Subject:
- XM_011536825.1
- Aligned Length:
- 2277
- Identities:
- 2159
- Gaps:
- 117
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAATCCTATACGCTCCACAGCACCTGTTGCCTTCATTAGCAGCTTTTCCTCCTCTTCCCTGCACTTCCCAGA 74
Query 1 -----------------------ATGG--------------AGGGCTCACGTCCCCGCGCCCCGAGCGGCCACT 37
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Sbjct 75 ACCAAAGAATGTGAAGGGGGTCCATGGAGATCTTTCTCCACAGGGCTCACGTCCCCGCGCCCCGAGCGGCCACT 148
Query 38 TAGCGCCGTCGCCGCCGGCTTTCGACGGCGAGCTGGATCTGCAGCGATACTCCAACGGGCCAGCCGTGAGCGCA 111
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Sbjct 149 TAGCGCCGTCGCCGCCGGCTTTCGACGGCGAGCTGGATCTGCAGCGATACTCCAACGGGCCAGCCGTGAGCGCA 222
Query 112 GGGTCGCTCGGGATGGGAGCGGTGAGCTGGTCTGAGAGTCGTGCAGGCGAACGGCGCTTCCCCTGCCCTGTATG 185
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Sbjct 223 GGGTCGCTCGGGATGGGAGCGGTGAGCTGGTCTGAGAGTCGTGCAGGCGAACGGCGCTTCCCCTGCCCTGTATG 296
Query 186 CGGGAAGCGCTTCCGCTTCAACTCTATCCTTGCTTTGCACCTGCGGGCGCACCCAGGAGCCCAGGCCTTCCAGT 259
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Sbjct 297 CGGGAAGCGCTTCCGCTTCAACTCTATCCTTGCTTTGCACCTGCGGGCGCACCCAGGAGCCCAGGCCTTCCAGT 370
Query 260 GCCCTCACTGCGGCCACCGCGCGGCGCAGCGGGCTCTGCTGCGCTCGCACCTGCGCACACACCAGCCCGAGCGC 333
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Sbjct 371 GCCCTCACTGCGGCCACCGCGCGGCGCAGCGGGCTCTGCTGCGCTCGCACCTGCGCACACACCAGCCCGAGCGC 444
Query 334 CCACGTAGTCCTGCTGCACGCCTGTTGCTGGAGTTGGAAGAGCGCGCGCTACTACGCGAGGCCCGACTGGGGAG 407
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Sbjct 445 CCACGTAGTCCTGCTGCACGCCTGTTGCTGGAGTTGGAAGAGCGCGCGCTACTACGCGAGGCCCGACTGGGGAG 518
Query 408 AGCCCGAAGCTCAGGGGGCATGCAGGCCACCCCTGCCACTGAGGGTCTGGCGCGGCCCCAGGCTCCTTCATCGT 481
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Sbjct 519 AGCCCGAAGCTCAGGGGGCATGCAGGCCACCCCTGCCACTGAGGGTCTGGCGCGGCCCCAGGCTCCTTCATCGT 592
Query 482 CCGCCTTCCGTTGCCCCTACTGCAAAGGCAAGTTTCGCACCTCGGCGGAGCGCGAACGCCACCTGCACATCCTG 555
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Sbjct 593 CCGCCTTCCGTTGCCCCTACTGCAAAGGCAAGTTTCGCACCTCGGCGGAGCGCGAACGCCACCTGCACATCCTG 666
Query 556 CATAGGCCCTGGAAGTGCGGCCTGTGCAGTTTCGGCTCCAGCCAGGAGGAGGAGCTGCTGCACCACAGCCTGAC 629
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Sbjct 667 CATAGGCCCTGGAAGTGCGGCCTGTGCAGTTTCGGCTCCAGCCAGGAGGAGGAGCTGCTGCACCACAGCCTGAC 740
Query 630 GGCCCACGGGGCTCCCGAGCGTCCCCTGGCGGCCACCTCCGCTGCGCCTCC------GCCTCAGCCTCAGCCTC 697
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Sbjct 741 GGCCCACGGGGCTCCCGAGCGTCCCCTGGCGGCCACCTCCGCTGCGCCTCCGCCTCAGCCTCAGCCTCAGCCTC 814
Query 698 CACCCCAGCCCGAACCCAGATCAGTTCCCCAGCCGGAGCCGGAGCCGGAGCCCGAACGTGAGGCAACCCCGACC 771
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Sbjct 815 CACCCCAGCCCGAACCCAGATCAGTCCCCCAGCCGGAGCCGGAGCCGGAGCCCGAACGTGAGGCAACCCCGACC 888
Query 772 CCAGCTCCTGCCGCTCCCGAGGAGCCCCCAGCGCCTCCGGAGTTCCGCTGCCAAGTGTGCGGCCAGAGCTTTAC 845
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Sbjct 889 CCAGCTCCTGCCGCTCCCGAGGAGCCCCCAGCGCCTCCGGAGTTCCGCTGCCAAGTGTGCGGCCAGAGCTTTAC 962
Query 846 ACAGTCTTGGTTTCTCAAGGGCCACATGCGTAAGCACAAGGCCTCCTTCGATCATGCGTGTCCGGTGTGCGGCC 919
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Sbjct 963 ACAGTCTTGGTTTCTCAAGGGCCACATGCGTAAGCACAAGGCCTCCTTCGATCATGCGTGTCCGGTGTGCGGCC 1036
Query 920 GCTGCTTCAAGGAGCCCTGGTTCCTTAAGAACCACATGAAGGTGCACGCCAGCAAGCTGGGCCCACTGCGTGCC 993
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Sbjct 1037 GCTGCTTCAAGGAGCCCTGGTTCCTTAAGAACCACATGAAGGTGCACGCCAGCAAGCTGGGCCCACTGCGTGCC 1110
Query 994 CCGGGGCCTGCCTCCGGGCCTGCCCGCGCCCCCCAGCCTCCTGACCTCGGCCTGCTGGCCTATGAGCCGTTGGG 1067
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Sbjct 1111 CCGGGGCCTGCCTCCGGGCCTGCCCGCGCCCCCCAGCCTCCTGACCTCGGCCTGCTGGCCTATGAGCCGTTGGG 1184
Query 1068 CCCAGCGCTCCTCTTGGCCCCGGCTCCCACCCCGGCCGAGCGCCGTGAGCCCCCGAGCCTCTTGGGCTACCTGA 1141
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Sbjct 1185 CCCAGCGCTCCTCTTGGCCCCGGCTCCCACCCCGGCCGAGCGCCGTGAGCCCCCGAGCCTCTTGGGCTACCTGA 1258
Query 1142 GCCTGCGAGCTGGCGAGGGCCGGCCCAACGGCGAGGGTGCTGAGCCCGGTCCCGGCCGCAGCTTCGGAGGCTTC 1215
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Sbjct 1259 GCCTGCGAGCTGGCGAGGGCCGGCCCAACGGCGAGGGTGCTGAGCCCGGTCCCGGCCGCAGCTTCGGAGGCTTC 1332
Query 1216 CGCCCGCTGTCCTCTGCTCTCCCGGCCCGGGCTCGCCGGCACCGTGCGGAGGAGCCTGAGGAAGAAGAGGAGGT 1289
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Sbjct 1333 CGCCCGCTGTCCTCTGCTCTCCCGGCCCGGGCTCGCCGGCACCGTGCGGAGGAGCCTGAGGAAGAAGAGGAGGT 1406
Query 1290 GGTGGAGGCCGAGGAGGAAACCTGGGCCCGGGGCAGGTCGCTGGGCTCTCTGGCTTCCCTGCACCCGCGCCCGG 1363
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Sbjct 1407 GGTGGAGGCCGAGGAGGAAACCTGGGCCCGGGGCAGGTCGCTGGGCTCTCTGGCTTCCCTGCACCCGCGCCCGG 1480
Query 1364 GTGAGGGACCGGGGCACTCTGCCTCTGCTGCTGGGGCCCAGGCAAGATCGACCGCCACGCAGGAAGAGAATGGG 1437
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Sbjct 1481 GTGAGGGACCGGGGCACTCTGCCTCTGCTGCTGGGGCCCAGGCAAGATCGACCGCCACGCAGGAAGAGAATGGG 1554
Query 1438 CTGTTGGTTGGAGGGACCCGGCCTGAAGGGGGCCGGGGCGCCACCGGCAAGGATTGTCCTTTCTGCGGAAAATC 1511
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Sbjct 1555 CTGTTGGTTGGAGGGACCCGGCCTGAAGGGGGCCGGGGCGCCACCGGCAAGGATTGTCCTTTCTGCGGAAAATC 1628
Query 1512 TTTCCGCTCAGCACATCACCTCAAAGTGCATCTGCGAGTGCACACAGGCGAGCGGCCCTACAAGTGTCCGCACT 1585
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Sbjct 1629 TTTCCGCTCAGCACATCACCTCAAAGTGCATCTGCGAGTGCACACAGGCGAGCGGCCCTACAAGTGTCCGCACT 1702
Query 1586 GCGACTACGCGGGCACCCAGTCCGGCTCGCTCAAGTATCACCTACAGCGCCACCACCGGGAGCAGAGGAGCGGG 1659
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Sbjct 1703 GCGACTACGCGGGCACCCAGTCCGGCTCGCTCAAGTATCACCTACAGCGCCACCACCGGGAGCAGAGGAGCGGG 1776
Query 1660 GCCGGCCCCGGGCCACCCCCGGAGCCACCGCCTCCTTCCCAGCGGGGTTCGGCCCCGCAATCTGGAGCCAAGCC 1733
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Sbjct 1777 GCCGGCCCCGGGCCACCCCCGGAGCCACCGCCTCCTTCCCAGCGGGGTTCGGCCCCGCAATCTGGAGCCAAGCC 1850
Query 1734 GTCTCCGCAGCCTGCGACCTGGGTGGAGGGCGCCTCAAGTCCCCGGCCTCCTTCTAGCGGTGCTGGGCCGGGGT 1807
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Sbjct 1851 GTCTCCGCAGCCTGCGACCTGGGTGGAGGGCGCCTCAAGTCCCCGGCCTCCTTCTAGCGGTGCTGGGCCGGGGT 1924
Query 1808 CCCGTCGGAAGCCCGCCAGCCCTGGGAGGACCCTGCGCAACGGGCGAGGCGGTGAGGCCGAACCCCTGGACCTG 1881
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Sbjct 1925 CCCGTCGGAAGCCCGCCAGCCCTGGGAGGACCCTGCGCAACGGGCGAGGCGGTGAGGCCGAACCCCTGGACCTG 1998
Query 1882 TCCTTGCGGGCAGGGCCGGGAGGCGAGGCCGGGCCTGGGGGTGCCCTCCACCGCTGCCTCTTCTGCCCGTTCGC 1955
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Sbjct 1999 TCCTTGCGGGCAGGGCCGGGAGGCGAGGCCGGGCCTGGGGGTGCCCTCCACCGCTGCCTCTTCTGCCCGTTCGC 2072
Query 1956 CACTGGAGCCCCAGAGCTCATGGCCTTGCACCTTCAAGTGCACCACAGCCGCCGGGCTAGGGGCCGCCGGCCAC 2029
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Sbjct 2073 CACTGGAGCCCCAGAGCTCATGGCCTTGCACCTTCAAGTGCACCACAGCCGCCGGGCTAGGGGCCGCCGGCCAC 2146
Query 2030 CCCAGGCTGACGCGTCCCCGCCCTATGCCCGAGTACCATCAGGAGAGACCCCTCCCAGTCCTTCGCAGGAAGGG 2103
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Sbjct 2147 CCCAGGCTGACGCGTCCCCGCCCTATGCCCGAGTACCATCAGGAGAGACCCCTCCCAGTCCTTCGCAGGAAGGG 2220
Query 2104 GAGGAGGGCTCCGGGCTGTCCAGACCCGGAGAGGCAGGGCTGGGGGGGCAAGAACGG 2160
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Sbjct 2221 GAGGAGGGCTCCGGGCTGTCCAGACCCGGAGAGGCAGGGCTGGGGGGGCAAGAACGG 2277
