Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475181
• Subject: XM_024449624.1
• Aligned Length: 2166
• Identities: 2036
• Gaps: 129

Alignment

Query    1  ATGGAGGGCTCACGTCCCCGCGCCCCGAGCGGCCACTTAGCGCCGTCGCCGCCGGCTTTCGACGGCGAGCTGGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TCTGCAGCGATACTCCAACGGGCCAGCCGTGAGCGCAGGGTCGCTCGGGATGGGAGCGGTGAGCTGGTCTGAGA  148
                                                             |||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------------------------------ATGGGAGCGGTGAGCTGGTCTGAGA  25

Query  149  GTCGTGCAGGCGAACGGCGCTTCCCCTGCCCTGTATGCGGGAAGCGCTTCCGCTTCAACTCTATCCTTGCTTTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   26  GTCGTGCAGGCGAACGGCGCTTCCCCTGCCCTGTATGCGGGAAGCGCTTCCGCTTCAACTCTATCCTTGCTTTG  99

Query  223  CACCTGCGGGCGCACCCAGGAGCCCAGGCCTTCCAGTGCCCTCACTGCGGCCACCGCGCGGCGCAGCGGGCTCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  100  CACCTGCGGGCGCACCCAGGAGCCCAGGCCTTCCAGTGCCCTCACTGCGGCCACCGCGCGGCGCAGCGGGCTCT  173

Query  297  GCTGCGCTCGCACCTGCGCACACACCAGCCCGAGCGCCCACGTAGTCCTGCTGCACGCCTGTTGCTGGAGTTGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  174  GCTGCGCTCGCACCTGCGCACACACCAGCCCGAGCGCCCACGTAGTCCTGCTGCACGCCTGTTGCTGGAGTTGG  247

Query  371  AAGAGCGCGCGCTACTACGCGAGGCCCGACTGGGGAGAGCCCGAAGCTCAGGGGGCATGCAGGCCACCCCTGCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  248  AAGAGCGCGCGCTACTACGCGAGGCCCGACTGGGGAGAGCCCGAAGCTCAGGGGGCATGCAGGCCACCCCTGCC  321

Query  445  ACTGAGGGTCTGGCGCGGCCCCAGGCTCCTTCATCGTCCGCCTTCCGTTGCCCCTACTGCAAAGGCAAGTTTCG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  322  ACTGAGGGTCTGGCGCGGCCCCAGGCTCCTTCATCGTCCGCCTTCCGTTGCCCCTACTGCAAAGGCAAGTTTCG  395

Query  519  CACCTCGGCGGAGCGCGAACGCCACCTGCACATCCTGCATAGGCCCTGGAAGTGCGGCCTGTGCAGTTTCGGCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  396  CACCTCGGCGGAGCGCGAACGCCACCTGCACATCCTGCATAGGCCCTGGAAGTGCGGCCTGTGCAGTTTCGGCT  469

Query  593  CCAGCCAGGAGGAGGAGCTGCTGCACCACAGCCTGACGGCCCACGGGGCTCCCGAGCGTCCCCTGGCGGCCACC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  470  CCAGCCAGGAGGAGGAGCTGCTGCACCACAGCCTGACGGCCCACGGGGCTCCCGAGCGTCCCCTGGCGGCCACC  543

Query  667  TCCGCTGCGCCTCC------GCCTCAGCCTCAGCCTCCACCCCAGCCCGAACCCAGATCAGTTCCCCAGCCGGA  734
            ||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  544  TCCGCTGCGCCTCCGCCTCAGCCTCAGCCTCAGCCTCCACCCCAGCCCGAACCCAGATCAGTCCCCCAGCCGGA  617

Query  735  GCCGGAGCCGGAGCCCGAACGTGAGGCAACCCCGACCCCAGCTCCTGCCGCTCCCGAGGAGCCCCCAGCGCCTC  808
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  618  GCCGGAGCCGGAGCCCGAACGTGAGGCAACCCCGACCCCAGCTCCTGCCGCTCCCGAGGAGCCCCCAGCGCCTC  691

Query  809  CGGAGTTCCGCTGCCAAGTGTGCGGCCAGAGCTTTACACAGTCTTGGTTTCTCAAGGGCCACATGCGTAAGCAC  882
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  692  CGGAGTTCCGCTGCCAAGTGTGCGGCCAGAGCTTTACACAGTCTTGGTTTCTCAAGGGCCACATGCGTAAGCAC  765

Query  883  AAGGCCTCCTTCGATCATGCGTGTCCGGTGTGCGGCCGCTGCTTCAAGGAGCCCTGGTTCCTTAAGAACCACAT  956
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  766  AAGGCCTCCTTCGATCATGCGTGTCCGGTGTGCGGCCGCTGCTTCAAGGAGCCCTGGTTCCTTAAGAACCACAT  839

Query  957  GAAGGTGCACGCCAGCAAGCTGGGCCCACTGCGTGCCCCGGGGCCTGCCTCCGGGCCTGCCCGCGCCCCCCAGC  1030
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  840  GAAGGTGCACGCCAGCAAGCTGGGCCCACTGCGTGCCCCGGGGCCTGCCTCCGGGCCTGCCCGCGCCCCCCAGC  913

Query 1031  CTCCTGACCTCGGCCTGCTGGCCTATGAGCCGTTGGGCCCAGCGCTCCTCTTGGCCCCGGCTCCCACCCCGGCC  1104
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  914  CTCCTGACCTCGGCCTGCTGGCCTATGAGCCGTTGGGCCCAGCGCTCCTCTTGGCCCCGGCTCCCACCCCGGCC  987

Query 1105  GAGCGCCGTGAGCCCCCGAGCCTCTTGGGCTACCTGAGCCTGCGAGCTGGCGAGGGCCGGCCCAACGGCGAGGG  1178
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  988  GAGCGCCGTGAGCCCCCGAGCCTCTTGGGCTACCTGAGCCTGCGAGCTGGCGAGGGCCGGCCCAACGGCGAGGG  1061

Query 1179  TGCTGAGCCCGGTCCCGGCCGCAGCTTCGGAGGCTTCCGCCCGCTGTCCTCTGCTCTCCCGGCCCGGGCTCGCC  1252
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1062  TGCTGAGCCCGGTCCCGGCCGCAGCTTCGGAGGCTTCCGCCCGCTGTCCTCTGCTCTCCCGGCCCGGGCTCGCC  1135

Query 1253  GGCACCGTGCGGAGGAGCCTGAGGAAGAAGAGGAGGTGGTGGAGGCCGAGGAGGAAACCTGGGCCCGGGGCAGG  1326
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1136  GGCACCGTGCGGAGGAGCCTGAGGAAGAAGAGGAGGTGGTGGAGGCCGAGGAGGAAACCTGGGCCCGGGGCAGG  1209

Query 1327  TCGCTGGGCTCTCTGGCTTCCCTGCACCCGCGCCCGGGTGAGGGACCGGGGCACTCTGCCTCTGCTGCTGGGGC  1400
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1210  TCGCTGGGCTCTCTGGCTTCCCTGCACCCGCGCCCGGGTGAGGGACCGGGGCACTCTGCCTCTGCTGCTGGGGC  1283

Query 1401  CCAGGCAAGATCGACCGCCACGCAGGAAGAGAATGGGCTGTTGGTTGGAGGGACCCGGCCTGAAGGGGGCCGGG  1474
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1284  CCAGGCAAGATCGACCGCCACGCAGGAAGAGAATGGGCTGTTGGTTGGAGGGACCCGGCCTGAAGGGGGCCGGG  1357

Query 1475  GCGCCACCGGCAAGGATTGTCCTTTCTGCGGAAAATCTTTCCGCTCAGCACATCACCTCAAAGTGCATCTGCGA  1548
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1358  GCGCCACCGGCAAGGATTGTCCTTTCTGCGGAAAATCTTTCCGCTCAGCACATCACCTCAAAGTGCATCTGCGA  1431

Query 1549  GTGCACACAGGCGAGCGGCCCTACAAGTGTCCGCACTGCGACTACGCGGGCACCCAGTCCGGCTCGCTCAAGTA  1622
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1432  GTGCACACAGGCGAGCGGCCCTACAAGTGTCCGCACTGCGACTACGCGGGCACCCAGTCCGGCTCGCTCAAGTA  1505

Query 1623  TCACCTACAGCGCCACCACCGGGAGCAGAGGAGCGGGGCCGGCCCCGGGCCACCCCCGGAGCCACCGCCTCCTT  1696
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1506  TCACCTACAGCGCCACCACCGGGAGCAGAGGAGCGGGGCCGGCCCCGGGCCACCCCCGGAGCCACCGCCTCCTT  1579

Query 1697  CCCAGCGGGGTTCGGCCCCGCAATCTGGAGCCAAGCCGTCTCCGCAGCCTGCGACCTGGGTGGAGGGCGCCTCA  1770
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1580  CCCAGCGGGGTTCGGCCCCGCAATCTGGAGCCAAGCCGTCTCCGCAGCCTGCGACCTGGGTGGAGGGCGCCTCA  1653

Query 1771  AGTCCCCGGCCTCCTTCTAGCGGTGCTGGGCCGGGGTCCCGTCGGAAGCCCGCCAGCCCTGGGAGGACCCTGCG  1844
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1654  AGTCCCCGGCCTCCTTCTAGCGGTGCTGGGCCGGGGTCCCGTCGGAAGCCCGCCAGCCCTGGGAGGACCCTGCG  1727

Query 1845  CAACGGGCGAGGCGGTGAGGCCGAACCCCTGGACCTGTCCTTGCGGGCAGGGCCGGGAGGCGAGGCCGGGCCTG  1918
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1728  CAACGGGCGAGGCGGTGAGGCCGAACCCCTGGACCTGTCCTTGCGGGCAGGGCCGGGAGGCGAGGCCGGGCCTG  1801

Query 1919  GGGGTGCCCTCCACCGCTGCCTCTTCTGCCCGTTCGCCACTGGAGCCCCAGAGCTCATGGCCTTGCACCTTCAA  1992
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1802  GGGGTGCCCTCCACCGCTGCCTCTTCTGCCCGTTCGCCACTGGAGCCCCAGAGCTCATGGCCTTGCACCTTCAA  1875

Query 1993  GTGCACCACAGCCGCCGGGCTAGGGGCCGCCGGCCACCCCAGGCTGACGCGTCCCCGCCCTATGCCCGAGTACC  2066
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1876  GTGCACCACAGCCGCCGGGCTAGGGGCCGCCGGCCACCCCAGGCTGACGCGTCCCCGCCCTATGCCCGAGTACC  1949

Query 2067  ATCAGGAGAGACCCCTCCCAGTCCTTCGCAGGAAGGGGAGGAGGGCTCCGGGCTGTCCAGACCCGGAGAGGCAG  2140
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1950  ATCAGGAGAGACCCCTCCCAGTCCTTCGCAGGAAGGGGAGGAGGGCTCCGGGCTGTCCAGACCCGGAGAGGCAG  2023

Query 2141  GGCTGGGGGGGCAAGAACGG  2160
            ||||||||||||||||||||
Sbjct 2024  GGCTGGGGGGGCAAGAACGG  2043