Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475189
• Subject: XM_006529358.3
• Aligned Length: 1614
• Identities: 1385
• Gaps: 117

Alignment

Query    1  ATGAACCTCGAGTTGCTGGAGTCCTTTGGGCAGAACTATCCAGAGGAAGCTGATGGAACTTTGGATTGTATCAG  74
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||.||.|||||
Sbjct    1  ATGAACCTCGAGTTGCTGGAGTCCTTTGGACAGAACTACCCAGAGGAAGCTGATGGGACTCTGGACTGCATCAG  74

Query   75  CATGGCTTTGACTTGCACCTTTAACAGGTGGGGCACACTGCTTGCAGTTGGCTGTAATGATGGCCGAATTGTCA  148
            ||||||..||||.|||||||||||||                                                
Sbjct   75  CATGGCCCTGACCTGCACCTTTAACA------------------------------------------------  100

Query  149  TCTGGGATTTCTTGACAAGAGGCATTGCTAAAATAATTAGTGCACACATCCATCCAGTGTGTTCTTTATGCTGG  222
                                                                                 |.|||
Sbjct  101  ---------------------------------------------------------------------GTTGG  105

Query  223  AGCCGAGATGGTCATAAACTCGTGAGTGCTTCCACTGATAACATAGTGTCACAGTGGGATGTTCTTTCAGGCGA  296
            |||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  106  AGCCGAGATGGTCATAAGCTTGTGAGTGCTTCTACAGATAACATAGTGTCACAGTGGGATGTTCTTTCAGGAGA  179

Query  297  CTGTGACCAGAGGTTTCGATTCCCTTCACCCATCTTAAAAGTCCAATATCATCCACGAGATCAGAACAAGGTTC  370
            .||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  180  TTGCGACCAGAGGTTTCGATTCCCTTCACCCATCTTAAAAGTCCAATATCATCCTCGAGATCAGAACAAGGTTC  253

Query  371  TCGTGTGTCCCATGAAATCTGCTCCTGTCATGTTGACCCTTTCAGATTCCAAACATGTTGTTCTGCCAGTGGAC  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct  254  TCGTGTGTCCCATGAAATCTGCTCCTGTCATGTTGACCCTTTCAGATTCCAAACATGTTGTTCTGCCGGTAGAC  327

Query  445  GATGACTCCGATTTGAACGTTGTGGCATCTTTTGATAGGCGAGGGGAATATATTTATACGGGAAACGCAAAAGG  518
            ||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  328  GATGACTCGGATTTGAACGTGGTGGCATCTTTTGATAGGCGAGGGGAATATATTTATACAGGAAATGCAAAAGG  401

Query  519  CAAGATTTTGGTCCTAAAAACAGATTCTCAGGATCTTGTTGCTTCCTTCAGAGTGACAACTGGAACAAGCAATA  592
            ||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct  402  CAAGATCTTGGTCCTAAAAACAGACTCTCAGGATCTTGTTGCTTCCTTCAGAGTAACAACTGGGACAAGCAATA  475

Query  593  CCACAGCCATTAAGTCAATTGAGTTTGCCCGGAAGGGGAGTTGCTTTTTAATTAACACGGCAGATCGAATAATC  666
            |.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||..|.||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  476  CTACCGCCATTAAATCAATTGAGTTTGCCCGGAAGGGGAGTTGCTTCCTGATTAACACAGCAGATCGAATAATA  549

Query  667  AGAGTTTATGATGGCAGAGAAATCTTAACATGTGGAAGAGATGGAGAGCCTGAACCTATGCAGAAATTGCAGGA  740
            |||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||..|||||||
Sbjct  550  AGAGTCTATGACGGCAGAGAGATTTTAACGTGTGGAAGGGATGGAGAGCCAGAGCCTATGCAGAAGCTGCAGGA  623

Query  741  TTTGGTGAATAGGACCCCATGGAAGAAATGTTGTTTCTCTGGGGATGGGGAATACATCGTGGCAGGTTCTGCCC  814
            .||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||..
Sbjct  624  CTTGGTGAATAGGACTCCATGGAAAAAATGTTGTTTCTCTGGGGATGGGGAGTACATAGTGGCGGGCTCTGCGA  697

Query  815  GGCAGCATGCCCTGTACATCTGGGAGAAGAGCATTGGCAACCTGGTGAAGATTCTCCATGGGACGAGAGGAGAA  888
            ||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||..|.||||||||.|||||.|||
Sbjct  698  GGCAGCATGCGCTGTATATCTGGGAAAAGAGCATTGGCAACCTGGTGAAGATCTTACATGGGACCAGAGGGGAA  771

Query  889  CTCCTCTTGGATGTAGCTTGGCATCCTGTTCGACCCATCATAGCATCCATTTCCAGTGGAGTGGTATCTATCTG  962
            |||||..||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.||.||
Sbjct  772  CTCCTGCTGGACGTGGCTTGGCATCCAGTCCGACCCATCATAGCTTCTATCTCTAGTGGAGTGGTGTCCATTTG  845

Query  963  GGCACAGAATCAAGTAGAAAACTGGAGTGCATTTGCACCAGACTTCAAAGAATTGGATGAAAATGTAGAATACG  1036
            |||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct  846  GGCCCAAAATCAAGTAGAAAATTGGAGTGCATTTGCACCAGACTTCAAAGAGTTGGATGAAAATGTAGAATATG  919

Query 1037  AAGAAAGGGAATCAGAGTTTGATATTGAAGATGAAGATAAGAGTGAGCCTGAGCAGACAGGGGCTGATGCTGCA  1110
            |.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  920  AGGAAAGAGAATCAGAATTTGATATTGAGGATGAAGATAAGAGTGAGCCTGAGCAAACAGGGGCTGATGCTGCT  993

Query 1111  GAAGATGAGGAAGTGGATGTCACCAGCGTGGACCCTATTGCTGCCTTCTGTAGCAGTGATGAAGAGCTGGAAGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  994  GAAGATGAGGAAGTGGATGTCACCAGCGTGGATCCCATCGCTGCCTTCTGTAGCAGTGATGAAGAGCTGGAAGA  1067

Query 1185  TTCAAAGGCTCTATTGTATTTACCCATTGCCCCTGAGGTAGAAGACCCAGAAGAAAATCCTTACGGCCCCCCAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||
Sbjct 1068  TTCAAAGGCTCTATTGTATTTACCCATTGCCCCTGAGGTAGAAGACCCTGAAGAAAACCCGTATGGCCCTCCAC  1141

Query 1259  CGGATGCAGTCCAAACCTCCTTGATGGATGAAGGGGCTAGTTCAGAGAAGAAGAGGCAGTCCTCAGCAGATGGG  1332
            ||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1142  CGGATGCAGTCCCAAGCTCCTTGATGGATGAAGGGGCTAGTTCAGAGAAGAAGAGGCAGTCTTCAGCAGATGGA  1215

Query 1333  TCCCAGCCACCTAAGAAGAAACCCAAAACAACCAATATAGAACTTCAAGGAGTACCAAATGATGAAGTCCATCC  1406
            |||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1216  TCCCAGCCACCAAAGAAGAAACCTAAAACCACCAATATAGAGCTCCAAGGAGTGCCGAATGATGAAGTCCATCC  1289

Query 1407  ACTACTGGGTGTGAAGGGGGATGGCAAATCCAAGAAGAAGCAAGCAGGCCGGCCTAAAGGATCAAAAGGTAAAG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1290  ACTACTGGGTGTGAAGGGGGATGGCAAATCCAAGAAGAAGCAAGCAGGCCGGCCTAAAGGATCAAAAGGTAAAG  1363

Query 1481  AGAAAGATTCTCCATTTAAACCGAAACTCTACAAAGGGGACAGAGGTTTACCTCTGGAAGGATCAGCGAAGGGT  1554
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1364  AGAAAGATTCTCCATTTAAACCGAAACTCTACAAAGGGGACAGAGGTTTACCTCTGGAAGGATCAACGAAGGGT  1437

Query 1555  AAAGTGCAGGCGGAACTCAGCCAGCCCTTGACAGCAGGAGGAGCAATCTCAGAACTGTTA  1614
            ||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||.||||||||||||.|.
Sbjct 1438  AAAGTGCAGGCGGAACTCAGCCAGTCCTTGGCAGCAGGAGGAGCCATCTCAGAACTGCTG  1497