Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000475189
- Subject:
- XM_006529359.1
- Aligned Length:
- 1614
- Identities:
- 1073
- Gaps:
- 441
Alignment
Query 1 ATGAACCTCGAGTTGCTGGAGTCCTTTGGGCAGAACTATCCAGAGGAAGCTGATGGAACTTTGGATTGTATCAG 74
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||.||.|||||
Sbjct 1 ATGAACCTCGAGTTGCTGGAGTCCTTTGGACAGAACTACCCAGAGGAAGCTGATGGGACTCTGGACTGCATCAG 74
Query 75 CATGGCTTTGACTTGCACCTTTAACAGGTGGGGCACACTGCTTGCAGTTGGCTGTAATGATGGCCGAATTGTCA 148
||||||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct 75 CATGGCCCTGACCTGCACCTTTAACAGGTGGGGCACACTGCTTGCTGTTGGCTGTAACGATGGCCGGATTGTTA 148
Query 149 TCTGGGATTTCTTGACAAGAGGCATTGCTAAAATAATTAGTGCACACATCCATCCAGTGTGTTCTTTATGCTGG 222
|.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||
Sbjct 149 TTTGGGATTTCTTGACCAGAGGCATTGCTAAAATAATTAGTGCACACATCCATCCAGTCTGTTCTTTGTGTTGG 222
Query 223 AGCCGAGATGGTCATAAACTCGTGAGTGCTTCCACTGATAACATAGTGTCACAGTGGGATGTTCTTTCAGGCGA 296
|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 223 AGCCGAGATGGTCATAAGCTTGTGAGTGCTTCTACAGATAACATAGTGTCACAGTGGGATGTTCTTTCAGGAGA 296
Query 297 CTGTGACCAGAGGTTTCGATTCCCTTCACCCATCTTAAAAGTCCAATATCATCCACGAGATCAGAACAAGGTTC 370
.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 297 TTGCGACCAGAGGTTTCGATTCCCTTCACCCATCTTAAAAGTCCAATATCATCCTCGAGATCAGAACAAGGTTC 370
Query 371 TCGTGTGTCCCATGAAATCTGCTCCTGTCATGTTGACCCTTTCAGATTCCAAACATGTTGTTCTGCCAGTGGAC 444
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 371 TCGTGTGTCCCATGAAATCTGCTCCTGTCATGTTGACCCTTTCAGATTCCAAACATGTTGTTCTGCCGGTAGAC 444
Query 445 GATGACTCCGATTTGAACGTTGTGGCATCTTTTGATAGGCGAGGGGAATATATTTATACGGGAAACGCAAAAGG 518
||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 445 GATGACTCGGATTTGAACGTGGTGGCATCTTTTGATAGGCGAGGGGAATATATTTATACAGGAAATGCAAAAGG 518
Query 519 CAAGATTTTGGTCCTAAAAACAGATTCTCAGGATCTTGTTGCTTCCTTCAGAGTGACAACTGGAACAAGCAATA 592
||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 519 CAAGATCTTGGTCCTAAAAACAGACTCTCAGGATCTTGTTGCTTCCTTCAGAGTAACAACTGGGACAAGCAATA 592
Query 593 CCACAGCCATTAAGTCAATTGAGTTTGCCCGGAAGGGGAGTTGCTTTTTAATTAACACGGCAGATCGAATAATC 666
|.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||..|.||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 593 CTACCGCCATTAAATCAATTGAGTTTGCCCGGAAGGGGAGTTGCTTCCTGATTAACACAGCAGATCGAATAATA 666
Query 667 AGAGTTTATGATGGCAGAGAAATCTTAACATGTGGAAGAGATGGAGAGCCTGAACCTATGCAGAAATTGCAGGA 740
|||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||..|||||||
Sbjct 667 AGAGTCTATGACGGCAGAGAGATTTTAACGTGTGGAAGGGATGGAGAGCCAGAGCCTATGCAGAAGCTGCAGGA 740
Query 741 TTTGGTGAATAGGACCCCATGGAAGAAATGTTGTTTCTCTGGGGATGGGGAATACATCGTGGCAGGTTCTGCCC 814
.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||..
Sbjct 741 CTTGGTGAATAGGACTCCATGGAAAAAATGTTGTTTCTCTGGGGATGGGGAGTACATAGTGGCGGGCTCTGCGA 814
Query 815 GGCAGCATGCCCTGTACATCTGGGAGAAGAGCATTGGCAACCTGGTGAAGATTCTCCATGGGACGAGAGGAGAA 888
||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||..|.||||||||.|||||.|||
Sbjct 815 GGCAGCATGCGCTGTATATCTGGGAAAAGAGCATTGGCAACCTGGTGAAGATCTTACATGGGACCAGAGGGGAA 888
Query 889 CTCCTCTTGGATGTAGCTTGGCATCCTGTTCGACCCATCATAGCATCCATTTCCAGTGGAGTGGTATCTATCTG 962
|||||..||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.||.||
Sbjct 889 CTCCTGCTGGACGTGGCTTGGCATCCAGTCCGACCCATCATAGCTTCTATCTCTAGTGGAGTGGTGTCCATTTG 962
Query 963 GGCACAGAATCAAGTAGAAAACTGGAGTGCATTTGCACCAGACTTCAAAGAATTGGATGAAAATGTAGAATACG 1036
|||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 963 GGCCCAAAATCAAGTAGAAAATTGGAGTGCATTTGCACCAGACTTCAAAGAGTTGGATGAAAATGTAGAATATG 1036
Query 1037 AAGAAAGGGAATCAGAGTTTGATATTGAAGATGAAGATAAGAGTGAGCCTGAGCAGACAGGGGCTGATGCTGCA 1110
|.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1037 AGGAAAGAGAATCAGAATTTGATATTGAGGATGAAGATAAGAGTGAGCCTGAGCAAACAGGGGCTGATGCTGCT 1110
Query 1111 GAAGATGAGGAAGTGGATGTCACCAGCGTGGACCCTATTGCTGCCTTCTGTAGCAGTGATGAAGAGCTGGAAGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||| |||||.|.
Sbjct 1111 GAAGATGAGGAAGTGGATGTCACCAGCGTGGATCCCATCGCTGCCTTCTGTAGCA-----GAAGACCC------ 1173
Query 1185 TTCAAAGGCTCTATTGTATTTACCCATTGCCCCTGAGGTAGAAGACCCAGAAGAAAATCCTTACGGCCCCCCAC 1258
Sbjct 1174 -------------------------------------------------------------------------- 1173
Query 1259 CGGATGCAGTCCAAACCTCCTTGATGGATGAAGGGGCTAGTTCAGAGAAGAAGAGGCAGTCCTCAGCAGATGGG 1332
Sbjct 1174 -------------------------------------------------------------------------- 1173
Query 1333 TCCCAGCCACCTAAGAAGAAACCCAAAACAACCAATATAGAACTTCAAGGAGTACCAAATGATGAAGTCCATCC 1406
Sbjct 1174 -------------------------------------------------------------------------- 1173
Query 1407 ACTACTGGGTGTGAAGGGGGATGGCAAATCCAAGAAGAAGCAAGCAGGCCGGCCTAAAGGATCAAAAGGTAAAG 1480
Sbjct 1174 -------------------------------------------------------------------------- 1173
Query 1481 AGAAAGATTCTCCATTTAAACCGAAACTCTACAAAGGGGACAGAGGTTTACCTCTGGAAGGATCAGCGAAGGGT 1554
Sbjct 1174 -------------------------------------------------------------------------- 1173
Query 1555 AAAGTGCAGGCGGAACTCAGCCAGCCCTTGACAGCAGGAGGAGCAATCTCAGAACTGTTA 1614
Sbjct 1174 ------------------------------------------------------------ 1173