Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000475259
- Subject:
- XM_006497401.1
- Aligned Length:
- 1086
- Identities:
- 725
- Gaps:
- 246
Alignment
Query 1 ------------------------------------ATGTCTTCCTTAAGTGGAAAAGTCCAAACCGTTTTGGG 38
|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||.||||
Sbjct 1 ATGAGTTCAAAGAAAATCCCTGAGACACTATCAGGAATGTCTTCCTTAAGTGGGAAAGTACAAACAGTTCTGGG 74
Query 39 CCTTGTAGAGCCAAGCAAACTGGGCCGTACCCTGACCCATGAACACCTGGCCATGACCTTTGACTGCTGTTACT 112
|||||||||.||.|||.|||||||.||.|||||||||||.||.||.|||.|.||||||||||||.|.|.|||||
Sbjct 75 CCTTGTAGAACCCAGCCAACTGGGACGCACCCTGACCCACGAGCATCTGACAATGACCTTTGACAGTTTTTACT 148
Query 113 GTCCACCTCCCCCGTGCCAGGAAGCTATTTCCAAAGAACCTATCGTGATGAAAAATTTATATTGGATTCAGAAA 186
|.||||||||.||.|||||.||||..|..|||||.|||||||||.|||||||||||.|||.|||||||||||||
Sbjct 149 GCCCACCTCCTCCATGCCACGAAGTCACCTCCAAGGAACCTATCATGATGAAAAATCTATTTTGGATTCAGAAA 222
Query 187 AACGCCTATTCCCATAAAGAAAACCTTCAATTAAATCAGGAGACAGAAGCCATAAAGGAAGAACTGTTGTATTT 260
|||.|||||||||||..|||.||||||||.||.|||||||
Sbjct 223 AACCCCTATTCCCATCGAGAGAACCTTCAGTTGAATCAGG---------------------------------- 262
Query 261 TAAAGCTAATGGTGGAGGGGCTTTGGTGGAAAACACAACCACTGGGATTAGCCGAGACACACAGACGTTGAAGA 334
Sbjct 263 -------------------------------------------------------------------------- 262
Query 335 GGCTTGCAGAAGAGACTGGCGTCCATATCATATCTGGAGCCGGGTTTTATGTGGATGCAACTCACTCCTCAGAG 408
Sbjct 263 -------------------------------------------------------------------------- 262
Query 409 ACCAGGGCCATGTCAGTGGAGCAGCTTACCGATGTCCTTATGAATGAAATTCTCCATGGAGCTGATGGAACCAG 482
|||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 263 ----------------------AGCTTACAGATGTCCTTATTAATGAAATTCTCCATGGAGCTGATGGCACCAG 314
Query 483 TATCAAGTGTGGCATTATTGGAGAAATTGGTTGCTCCTGGCCTTTGACTGAGAGTGAAAGAAAGGTTCTCCAGG 556
.|||||||||||..||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||.|.||..|||
Sbjct 315 CATCAAGTGTGGAGTTATTGGAGAAATTGGCTGCTCCTGGCCTTTGACTGACAGCGAGAGAAAGATACTTGAGG 388
Query 557 CCACAGCTCATGCCCAGGCTCAGCTTGGTTGTCCTGTTATTATCCATCCTGGACGGAGCTCCAGG-GCACCATT 629
|.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||.| ||||| ||||||||
Sbjct 389 CTACAGCTCACGCCCAGGCTCAGCTTGGCTGTCCTGTCATCATCCATCCTGGACGGAAC-CCAGGTGCACCATT 461
Query 630 TCAGATTATCCGAATATTGCAAGAAGCAGGCGCAGACATCTCCAAAACAGTCATGTCACACCTGGATAGGACTA 703
.|||||.|||||.|||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||
Sbjct 462 CCAGATAATCCGTATACTGCAAGAAGCAGGAGCAGACATCTCCAAAACAGTCATGTCCCACCTTGACAGGACTA 535
Query 704 TTCTTGATAAGAAAGAGCTCTTGGAGTTTGCTCAACTTGGCTGCTACTTGGAATATGATCTCTTTGGTACTGAA 777
|..||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 536 TATTTGATAAGAAAGAGCTGCTGGAGTTTGCTCAACTTGGCTGCTACTTGGAATACGATCTCTTTGGTACGGAA 609
Query 778 CTACTTCATTACCAACTCGGCCCAGATATTGACATGCCTGATGATAACAAAAGAATTAGAAGGGTGCGTCTCCT 851
||.|||.|||||||..|..|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|.|.||
Sbjct 610 CTCCTTAATTACCAGTTGAGCCCAGATATTGATATGCCTGATGATAACAAAAGAATTAGAAGGGTCCATTTTCT 683
Query 852 GGTGGAAGAGGGCTGTGAAGATCGAATTCTGGTAGCACATGACATACATACGAAAACC--CGGCTGATGAAATA 923
.|||||.|||||||.|||||||||.|||||..|.||||||||||||||.|| |||.| |||.|||||||.||
Sbjct 684 AGTGGATGAGGGCTATGAAGATCGGATTCTCATGGCACATGACATACACAC--AAAGCATCGGTTGATGAAGTA 755
Query 924 TGGAGGTCACGGCTATTCTCATATACTCACCAATGTTGTTCCTAAAATGTTGCTGAGAGGCATAACTGAGAATG 997
.||||||||||||||.||.||.||.||.|||||..||||||||||.|||.|.||.|||||..|.|||||||..|
Sbjct 756 CGGAGGTCACGGCTACTCACACATCCTTACCAACATTGTTCCTAAGATGCTCCTTAGAGGTCTGACTGAGAGGG 829
Query 998 TGCTTGATAAGATTCTAATAGAGAACCCTAAGCAATGGCTAACTTTCAAA 1047
|||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 830 TGCTTGACAAGATACTCATAGAAAACCCTAAACAATGGCTGACTTTTAAA 879