Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475259
• Subject: XM_006497402.1
• Aligned Length: 1050
• Identities: 725
• Gaps: 210

Alignment

Query    1  ATGTCTTCCTTAAGTGGAAAAGTCCAAACCGTTTTGGGCCTTGTAGAGCCAAGCAAACTGGGCCGTACCCTGAC  74
            |||||||||||||||||.|||||.|||||.|||.|||||||||||||.||.|||.|||||||.||.||||||||
Sbjct    1  ATGTCTTCCTTAAGTGGGAAAGTACAAACAGTTCTGGGCCTTGTAGAACCCAGCCAACTGGGACGCACCCTGAC  74

Query   75  CCATGAACACCTGGCCATGACCTTTGACTGCTGTTACTGTCCACCTCCCCCGTGCCAGGAAGCTATTTCCAAAG  148
            |||.||.||.|||.|.||||||||||||.|.|.||||||.||||||||.||.|||||.||||..|..|||||.|
Sbjct   75  CCACGAGCATCTGACAATGACCTTTGACAGTTTTTACTGCCCACCTCCTCCATGCCACGAAGTCACCTCCAAGG  148

Query  149  AACCTATCGTGATGAAAAATTTATATTGGATTCAGAAAAACGCCTATTCCCATAAAGAAAACCTTCAATTAAAT  222
            ||||||||.|||||||||||.|||.||||||||||||||||.|||||||||||..|||.||||||||.||.|||
Sbjct  149  AACCTATCATGATGAAAAATCTATTTTGGATTCAGAAAAACCCCTATTCCCATCGAGAGAACCTTCAGTTGAAT  222

Query  223  CAGGAGACAGAAGCCATAAAGGAAGAACTGTTGTATTTTAAAGCTAATGGTGGAGGGGCTTTGGTGGAAAACAC  296
            ||||                                                                      
Sbjct  223  CAGG----------------------------------------------------------------------  226

Query  297  AACCACTGGGATTAGCCGAGACACACAGACGTTGAAGAGGCTTGCAGAAGAGACTGGCGTCCATATCATATCTG  370
                                                                                      
Sbjct  227  --------------------------------------------------------------------------  226

Query  371  GAGCCGGGTTTTATGTGGATGCAACTCACTCCTCAGAGACCAGGGCCATGTCAGTGGAGCAGCTTACCGATGTC  444
                                                                        |||||||.||||||
Sbjct  227  ------------------------------------------------------------AGCTTACAGATGTC  240

Query  445  CTTATGAATGAAATTCTCCATGGAGCTGATGGAACCAGTATCAAGTGTGGCATTATTGGAGAAATTGGTTGCTC  518
            |||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||..||||||||||||||||.|||||
Sbjct  241  CTTATTAATGAAATTCTCCATGGAGCTGATGGCACCAGCATCAAGTGTGGAGTTATTGGAGAAATTGGCTGCTC  314

Query  519  CTGGCCTTTGACTGAGAGTGAAAGAAAGGTTCTCCAGGCCACAGCTCATGCCCAGGCTCAGCTTGGTTGTCCTG  592
            |||||||||||||||.||.||.||||||.|.||..||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  315  CTGGCCTTTGACTGACAGCGAGAGAAAGATACTTGAGGCTACAGCTCACGCCCAGGCTCAGCTTGGCTGTCCTG  388

Query  593  TTATTATCCATCCTGGACGGAGCTCCAGG-GCACCATTTCAGATTATCCGAATATTGCAAGAAGCAGGCGCAGA  665
            |.||.||||||||||||||||.| ||||| ||||||||.|||||.|||||.|||.|||||||||||||.|||||
Sbjct  389  TCATCATCCATCCTGGACGGAAC-CCAGGTGCACCATTCCAGATAATCCGTATACTGCAAGAAGCAGGAGCAGA  461

Query  666  CATCTCCAAAACAGTCATGTCACACCTGGATAGGACTATTCTTGATAAGAAAGAGCTCTTGGAGTTTGCTCAAC  739
            |||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||..||||||||||||||||..|||||||||||||||
Sbjct  462  CATCTCCAAAACAGTCATGTCCCACCTTGACAGGACTATATTTGATAAGAAAGAGCTGCTGGAGTTTGCTCAAC  535

Query  740  TTGGCTGCTACTTGGAATATGATCTCTTTGGTACTGAACTACTTCATTACCAACTCGGCCCAGATATTGACATG  813
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||.|||||||..|..|||||||||||||.|||
Sbjct  536  TTGGCTGCTACTTGGAATACGATCTCTTTGGTACGGAACTCCTTAATTACCAGTTGAGCCCAGATATTGATATG  609

Query  814  CCTGATGATAACAAAAGAATTAGAAGGGTGCGTCTCCTGGTGGAAGAGGGCTGTGAAGATCGAATTCTGGTAGC  887
            |||||||||||||||||||||||||||||.|.|.|.||.|||||.|||||||.|||||||||.|||||..|.||
Sbjct  610  CCTGATGATAACAAAAGAATTAGAAGGGTCCATTTTCTAGTGGATGAGGGCTATGAAGATCGGATTCTCATGGC  683

Query  888  ACATGACATACATACGAAAACC--CGGCTGATGAAATATGGAGGTCACGGCTATTCTCATATACTCACCAATGT  959
            ||||||||||||.||  |||.|  |||.|||||||.||.||||||||||||||.||.||.||.||.|||||..|
Sbjct  684  ACATGACATACACAC--AAAGCATCGGTTGATGAAGTACGGAGGTCACGGCTACTCACACATCCTTACCAACAT  755

Query  960  TGTTCCTAAAATGTTGCTGAGAGGCATAACTGAGAATGTGCTTGATAAGATTCTAATAGAGAACCCTAAGCAAT  1033
            |||||||||.|||.|.||.|||||..|.|||||||..||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||
Sbjct  756  TGTTCCTAAGATGCTCCTTAGAGGTCTGACTGAGAGGGTGCTTGACAAGATACTCATAGAAAACCCTAAACAAT  829

Query 1034  GGCTAACTTTCAAA  1047
            ||||.|||||.|||
Sbjct  830  GGCTGACTTTTAAA  843