Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475284
• Subject: XM_011526804.2
• Aligned Length: 2139
• Identities: 1827
• Gaps: 310

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCCCACAGAGGCTACGCCAAGCCTGTGTGCTCCCTCCTGCCTCAGGAGCAGGCCCCCAGCACCCAGCTGCCC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGCTGCCATGCACAAACATTACAAAGTCCACTTCGCCAAGGATGCCCAGAGCCCCAACGGGCACTACTTCTGGG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  ACCCAGAGTTGGGGCACCGAAAAGACATCCTGACAGAGGATGACGTCTACTGCAGCTGCCTGGCCAAGACACTC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  TGCCACGTGCCGGTCCCTGTGACCGTGGGTTTCTATGCCCCTTTCGGCTGCCGCCTGCACATGATGCTGGACAA  296

Query    1  -------------ATGCAGCAGGAGGCCGCGCAGCGCGAGAGCGAGGAGCTGCAGCACGTGCAGTGGCGGCCGC  61
                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GATCACGGCGCTGATGCAGCAGGAGGCCGCGCAGCGCGAGAGCGAGGAGCTGCAGCACGTGCAGTGGCGGCCGC  370

Query   62  GTGCCGTGAGCGGCTGGGGCGTCCCGCAGCTACTGTGGTACCTGGTGTTCCTGCAGCCCATCATCACCGAGGTG  135
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GTGCCGTGAGCGGCTGGGGCGTCCCGCAGCTACTGTGGTACCTGGTGTTCCTGCAGCCCATCATCACCGAGGTG  444

Query  136  CACCTGCGGCGCAGGAACGTGCAGTTCCTTTTCATCCGCTTTAGCGCCTGGCAGTACGCGGGCACCGACAAGCT  209
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CACCTGCGGCGCAGGAACGTGCAGTTCCTTTTCATCCGCTTTAGCGCCTGGCAGTACGCGGGCACCGACAAGCT  518

Query  210  GTGGGCCGGCCTGGTGACCACGTTGTGCGAGGGCATCCGCCGCCACTATGGCGCACTGCCCTTCAGCGTGTACT  283
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTGGGCCGGCCTGGTGACCACGTTGTGCGAGGGCATCCGCCGCCACTATGGCGCACTGCCCTTCAGCGTGTACT  592

Query  284  CGGTGCTGGGCAACAAGCCGGCCACCAGGCAGGACTGCTGCCAGAGCGAGTGGCATTGTCGGCGCCGCGTGTGC  357
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CGGTGCTGGGCAACAAGCCGGCCACCAGGCAGGACTGCTGCCAGAGCGAGTGGCATTGTCGGCGCCGCGTGTGC  666

Query  358  CTGGGGCTGCTGGCGCTGCTGGCGGCGCTGGGCCTGGGTGTGGGGCTGCTCTACTTGTCACTGGGCGGCCACGC  431
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTGGGGCTGCTGGCGCTGCTGGCGGCGCTGGGCCTGGGTGTGGGGCTGCTCTACTTGTCACTGGGCGGCCACGC  740

Query  432  GCTGGGCCACGGCAGCCCGAGCGGCAGCCTGCTCAAGGTGTTTGGCGGCGCGGCCACCACACTGTCGGGCTCGG  505
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCTGGGCCACGGCAGCCCGAGCGGCAGCCTGCTCAAGGTGTTTGGCGGCGCGGCCACCACACTGTCGGGCTCGG  814

Query  506  GGCTGCTCATGGCCGTGTACTCGGTGGGCAAGCACCTGTTCGTAAGCCAGCGCAAGAAGATCGAGCGGCTGGTG  579
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGCTGCTCATGGCCGTGTACTCGGTGGGCAAGCACCTGTTCGTAAGCCAGCGCAAGAAGATCGAGCGGCTGGTG  888

Query  580  TCGCGTGAAAAGTTCGGCAGCCAGCTGGGTTTCATGTGCGAGGTGAAGAAGGAGGTGGAGCTGCTCACCGACTT  653
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCGCGTGAAAAGTTCGGCAGCCAGCTGGGTTTCATGTGCGAGGTGAAGAAGGAGGTGGAGCTGCTCACCGACTT  962

Query  654  CCTGTGCTTCCTGGAGATCTACCAGCGGCGCAGGCTGCGCGTGGTGCTGGAGGTCACCGGGCTGGACACGTGCT  727
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCTGTGCTTCCTGGAGATCTACCAGCGGCGCAGGCTGCGCGTGGTGCTGGAGGTCACCGGGCTGGACACGTGCT  1036

Query  728  ACCCGGAGCGCGTGGTGGGCGTGCTCAACGCCATCAACACGCTGCTGTCCGACAGCCACGCGCCCTTCATCTTC  801
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACCCGGAGCGCGTGGTGGGCGTGCTCAACGCCATCAACACGCTGCTGTCCGACAGCCACGCGCCCTTCATCTTC  1110

Query  802  ATCCTGGTCGTGGACCCCAGCATCCTGGCCGCGTGCCTAGAGAGCGCGGGCAACATGAAGGGCACGGCCGATAA  875
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATCCTGGTCGTGGACCCCAGCATCCTGGCCGCGTGCCTAGAGAGCGCGGGCAACATGAAGGGCACGGCCGATAA  1184

Query  876  CGGCTACCTCTTCCTCAACCGCACTGTCACGCTGCCCTTCTCTGTGCCCATTATGGGCCGCCGCACCAAGCTGC  949
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CGGCTACCTCTTCCTCAACCGCACTGTCACGCTGCCCTTCTCTGTGCCCATTATGGGCCGCCGCACCAAGCTGC  1258

Query  950  AGTTCCTGCACGATGCGGTGCAGAGCCGCGACGACCTGTTGTACCGCGAGATGACGCGCAAGCCGTGGCTGCCG  1023
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGTTCCTGCACGATGCGGTGCAGAGCCGCGACGACCTGTTGTACCGCGAGATGACGCGCAAGCCGTGGCTGCCG  1332

Query 1024  GGGGACGCCGGGGGCGAGAGCGCGCAGCTGCTGGCGGTGCAGGCGCAGGCGGGGACGGAGCGCGGGCAGGGCCG  1097
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGGGACGCCGGGGGCGAGAGCGCGCAGCTGCTGGCGGTGCAGGCGCAGGCGGGGACGGAGCGCGGGCAGGGCCG  1406

Query 1098  CATCGACGACGAGGCGGCGCGGCGAATCCAGGAGGCGCTCTTCTGCCTTCACGACGAGCGCGACTGCCTCTACG  1171
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CATCGACGACGAGGCGGCGCGGCGAATCCAGGAGGCGCTCTTCTGCCTTCACGACGAGCGCGACTGCCTCTACG  1480

Query 1172  AGTACGTGCCCGACAACGTGGTGTCCATGCGGCGCATCGTCAACACCGTGCCCATCACCGTGCGCCTGCT-NNG  1244
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ..|
Sbjct 1481  AGTACGTGCCCGACAACGTGGTGTCCATGCGGCGCATCGTCAACACCGTGCCCATCACCGTGCGCCTGCTGCAG  1554

Query 1245  CAGCAGCAGCAGCAGGGGGACTTTGGGGGCCCCACGCCGCGCCAGGCGGTGGCGTGGGTGGTGCTCGCCAACCA  1318
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CAGCAGCAGCAGCAGGGGGACTTTGGGGGCCCCACGCCGCGCCAGGCGGTGGCGTGGGTGGTGCTCGCCAACCA  1628

Query 1319  GTGGCCGTGCCGCCTGAGCTGGGCGCTGCAGTGCCTGGAGGACCGGCAGCAGACCGGGGGCGCGCCCGAGGGCC  1392
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GTGGCCGTGCCGCCTGAGCTGGGCGCTGCAGTGCCTGGAGGACCGGCAGCAGACCGGGGGCGCGCCCGAGGGCC  1702

Query 1393  GCGCGCGCCTCTGGGACGTTTTCCGCGACAACAGCCGCGAGCTGCACACCATGACCAAGGCGTTGCAGAACGTG  1466
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GCGCGCGCCTCTGGGACGTTTTCCGCGACAACAGCCGCGAGCTGCACACCATGACCAAGGCGTTGCAGAACGTG  1776

Query 1467  CTCGACCTGGACGGCGACCCCGAGCTCTTCGAGCGCTTCCTGGGCGCCGACTTCCCCTTCACCGTGGCCGAGGC  1540
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Sbjct 1777  CTCGACCTGGACGGCGACCCCGAGCTCTTCGAGCGCTTCCTGGGCGCCGACTTCCCCTTCACCGTGGCCGAGGC  1850

Query 1541  GCAGAGCCTGCTGCGCTGCACGGTCAACCTGGACCACTCCATCCGCCGGCGCATGGGTCTCATCCGAGCCGTCA  1614
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GCAGAGCCTGCTGCGCTGCACGGTCAACCTGGACCACTCCATCCGCCGGCGCATGGGTCTCATCCGAGCCGTCA  1924

Query 1615  GCGCGCTCAAGCCGCCCAGCCCGCCCAAGTCCCCTACCCGCGATACCCCCCACGCTGCCCACCGGGCCAACAGC  1688
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Sbjct 1925  GCGCGCTCAAGCCGCCCAGCCCGCCCAAGTCCCCTACCCGCGATACCCCCCACGCTGCCCACCGGGCCAACAGC  1998

Query 1689  GCCTCCAGGGCGCCCCCGTCGGGCCGTGCCTCAGGGCAAGCCGGCGAAGGCCACCACACTGGGGACTTGGCCCA  1762
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GCCTCCAGGGCGCCCCCGTCGGGCCGTGCCTCAGGGCAAGCCGGCGAAGGCCACCACACTGGGGACTTGGCCCA  2072

Query 1763  CAGGGGCAAGCTATGGCCGGTGGCCTGTGCGCTCTTCCGTCCAGGGCAATCCAGCCCAGGTGGGCCT  1829
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CAGGGGCAAGCTATGGCCGGTGGCCTGTGCGCTCTTCCGTCCAGGGCAATCCAGCCCAGGTGGGCCT  2139