Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475311
• Subject: XM_017001729.1
• Aligned Length: 1574
• Identities: 1449
• Gaps: 115

Alignment

Query    1  ATGCTGCCCCGATGGGAACTGGCACTTTACCTACTTGCCTCACTAGGCTTCCACTTCTATTCCTTCTATGAAGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTGCCCCGATGGGAACTGGCACTTTACCTACTTGCCTCACTAGGCTTCCACTTCTATTCCTTCTATGAAGT  74

Query   75  TTACAAAGTCTCCAGAGAACACGAAGAGGAGCTGGACCAGGAATTTGAGCTGGAGACTGACACTTTATTTGGAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTACAAAGTCTCCAGAGAACACGAAGAGGAGCTGGACCAGGAATTTGAGCTGGAGACTGACACTTTATTTGGAG  148

Query  149  GATTAAAGAAGGATGCGACCGACTTTGAGTGGAGCTTCTGGATGGAATGGGGGAAGCAGTGGCTGGTGTGGCTT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GATTAAAGAAGGATGCGACCGACTTTGAGTGGAGCTTCTGGATGGAATGGGGGAAGCAGTGGCTGGTGTGGCTT  222

Query  223  CTCCTTGGCCACATGGTAGTGTCTCAAATGGCCACACTGCTGGCAAGAAAGCACAGACCCTGGATTCTCATGCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTCCTTGGCCACATGGTAGTGTCTCAAATGGCCACACTGCTGGCAAGAAAGCACAGACCCTGGATTCTCATGCT  296

Query  297  CTATGGGATGTGGGCCTGCTGGTGTGTGCTGGGGACCCCTGGTGTGGCTATGGTTTTGCTCCATACCACCATCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTATGGGATGTGGGCCTGCTGGTGTGTGCTGGGGACCCCTGGTGTGGCTATGGTTTTGCTCCATACCACCATCT  370

Query  371  CTTTCTGCGTGGCCCAGTTCCGGTCTCAGCTCCTGACGTGGCTCTGTTCTCTCCTCCTCCTCTCCACACTGAGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTTTCTGCGTGGCCCAGTTCCGGTCTCAGCTCCTGACGTGGCTCTGTTCTCTCCTCCTCCTCTCCACACTGAGG  444

Query  445  CTGCAGGGTGTGGAAGAAGTTAAGAGAAGGTGGTACAAGACAGAAAACGAGTACTACCTGCTGCAGTTCACGCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGCAGGGTGTGGAAGAAGTTAAGAGAAGGTGGTACAAGACAGAAAACGAGTACTACCTGCTGCAGTTCACGCT  518

Query  519  GACCGTTCGCTGCCTCTACTACACCAACTTCAGCCTGGAGCTCTGCTGGCAGCAGCTGCCTGCTGCATCGACCT  592
            |||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GACCGTTCGCTGCCTGTACTACACCAGCTTCAGCCTGGAGCTCTGCTGGCAGCAGCTGCCTGCTGCATCGACCT  592

Query  593  CCTACTCCTTTCCCTGGATGCTGGCCTATGTCTTTTATTATCCAGTCTTACACAATGGGCCCATCCTCAGCTTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCTACTCCTTTCCCTGGATGCTGGCCTATGTCTTTTATTATCCAGTCTTACACAATGGGCCCATCCTCAGCTTC  666

Query  667  TCGGAGTTCATCAAACAGATGCAGCAGCAGGAGCATGACTCCCTGAAGGCCAGCCTGTGTGTCCTGGCCCTGGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCGGAGTTCATCAAACAGATGCAGCAGCAGGAGCATGACTCCCTGAAGGCCAGCCTGTGTGTCCTGGCCCTGGG  740

Query  741  GCTGGGCCGCCTTCTTTGCTGGTGGTGGCTGGCCGAGCTGATGGCTCACCTGATGTACATGCATGCCATCTACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCTGGGCCGCCTTCTTTGCTGGTGGTGGCTGGCCGAGCTGATGGCTCACCTGATGTACATGCATGCCATCTACA  814

Query  815  GCAGCATCCCCCTCCTGGAGACTGTCTCTTGTTGGACCTTAGGAGGACTGGCGTTAGCCCAGGTGCTCTTTTTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCAGCATCCCCCTCCTGGAGACTGTCTCTTGTTGGACCTTAGGAGGACTGGCGTTAGCCCAGGTGCTCTTTTTC  888

Query  889  TACGTGAAGTACTTGGTGCTCTTTGGCGTGCCTGCTCTGCTCATGCGCCTGGATGGACTCACTCCACCCGCCCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TACGTGAAGTACTTGGTGCTCTTTGGCGTGCCTGCTCTGCTCATGCGCCTGGATGGACTCACTCCACCCGCCCT  962

Query  963  CCCCCGCTGCGTGAGCACCATGTTCAGTTTCACCGGGATGTGGAGGTATTTTGATGTTGGACTGCATAATTTCT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCCCCGCTGCGTGAGCACCATGTTCAGTTTCACCGGGATGTGGAGGTATTTTGATGTTGGACTGCATAATTTCT  1036

Query 1037  TAATCAGGTATGTGTACATTCCAGTGGGCGGGTCCCAGCATGGCCTGCTGGGGACACTGTTTTCCACGGCGATG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TAATCAGGTATGTGTACATTCCAGTGGGCGGGTCCCAGCATGGCCTGCTGGGGACACTGTTTTCCACGGCGATG  1110

Query 1111  ACATTTGCATTTGTGAGCTACTGGCATGGCGGCTACGACTACCTCTGGTGCTGGGCAGCGCTCAACTGGCTGGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACATTTGCATTTGTGAGCTACTGGCATGGCGGCTACGACTACCTCTGGTGCTGGGCAGCGCTCAACTGGCTGGG  1184

Query 1185  AGTCACTGTGGAGAATGGAGTCCGGAGGCTGGTGGAGACTCCCTGCATCCAGGACAGTCTGGCCCGATACTTCT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGTCACTGTGGAGAATGGAGTCCGGAGGCTGGTGGAGACTCCCTGCATCCAGGACAGTCTGGCCCGATACTTCT  1258

Query 1259  CCCCACAAGCTCGCCGTCGATTCCACGCTGCCCTTGCTTCTTGTTCCACCTCGATGCTGATCCTGTCCAACCTG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCCCACAAGCTCGCCGTCGATTCCACGCTGCCCTTGCTTCTTGTTCCACCTCGATGCTGATCCTGTCCAACCTG  1332

Query 1333  GTATTTCTTGGGGGCAATGAGGTTGGGAAAACCTACTGGAATAGGATCTTCATACAAGGCTGG-----------  1395
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| .||           
Sbjct 1333  GTATTTCTTGGGGGCAATGAGGTTGGGAAAACCTACTGGAATAGGATCTTCATACAAGG-AGGTTTATTTTTAT  1405

Query 1396  --------------CC---TTGGGTGAC--CCTCT------CTGTCCTG-------GGATTCCT----------  1427
                          ||   |||||.|||  |.| |      ||.|||||       |.|||.||          
Sbjct 1406  TTTTTTTACTCAATCCATGTTGGGAGACAGCAT-TCCAGGGCTTTCCTGTGTTTCTGCATTTCTTACAAACAGA  1478

Query 1428  -GTACT-GCTAC------TCCCACGTGGGCA-----TTGCCTGG-----------------------------G  1459
             ||||| |||||      |||||       |     ||.|||||                             |
Sbjct 1479  GGTACTGGCTACCTTTGTTCCCA-------ACTATTTTTCCTGGAATATTTGTATAGAAAACACCTCCGAATTG  1545

Query 1460  CCCAGACCTACGCCACGGAC  1479
            .||||  ||||         
Sbjct 1546  TCCAG--CTAC---------  1554