Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475326
• Subject: NM_001242506.3
• Aligned Length: 1362
• Identities: 1140
• Gaps: 222

Alignment

Query    1  ATGTGTGCCGCTCAGATGCCGCCCCTGGCGCACATCTTCCGAGGGACGTTCGTCCACTCCACCTGGACCTGCCC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CATGGAGGTGCTGCGGGATCACCTCCTCGGCGTGAGCGACAGCGGCAAAATAGTGTTTTTAGAAGAAGCATCTC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AACAGGAAAAACTGGCCAAAGAATGGTGCTTCAAGCCGTGTGAAATAAGAGAACTGAGCCACCATGAGTTCTTC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  ATGCCTGGGCTGGTTGATACACACATCCATGCCTCTCAGTATTCCTTTGCTGGAAGTAGCATAGACCTGCCACT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCTGGGCTGGTTGATACACACATCCATGCCTCTCAGTATTCCTTTGCTGGAAGTAGCATAGACCTGCCACT  74

Query  297  CTTGGAGTGGCTGACCAAGTACACATTTCCTGCAGAACACAGATTCCAGAACATCGACTTTGCAGAAGAAGTAT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTTGGAGTGGCTGACCAAGTACACATTTCCTGCAGAACACAGATTCCAGAACATCGACTTTGCAGAAGAAGTAT  148

Query  371  ATACCAGAGTTGTCAGGAGAACACTAAAGAATGGAACAACCACAGCTTGTTACTTTGCAACAATTCACACTGAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATACCAGAGTTGTCAGGAGAACACTAAAGAATGGAACAACCACAGCTTGTTACTTTGCAACAATTCACACTGAC  222

Query  445  TCATCTCTGCTCCTTGCCGACATTACAGATAAATTTGGACAGCGGGCATTTGTGGGCAAAGTTTGCATGGATTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCATCTCTGCTCCTTGCCGACATTACAGATAAATTTGGACAGCGGGCATTTGTGGGCAAAGTTTGCATGGATTT  296

Query  519  GAATGACACTTTTCCAGAATACAAGGAGACCACTGAGGAATCGATCAAGGAAACTGAGAGATTTGTGTCAGAAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAATGACACTTTTCCAGAATACAAGGAGACCACTGAGGAATCGATCAAGGAAACTGAGAGATTTGTGTCAGAAA  370

Query  593  TGCTCCAAAAGAACTATTCTAGAGTGAAGCCCATAGTGACACCACGTTTTTCCCTCTCCTGCTCTGAGACTTTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGCTCCAAAAGAACTATTCTAGAGTGAAGCCCATAGTGACACCACGTTTTTCCCTCTCCTGCTCTGAGACTTTG  444

Query  667  ATGGGTGAACTGGGCAACATTGCTAAAACCCGTGATTTGCACATTCAGAGCCATATAAGTGAAAATCGTGATGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATGGGTGAACTGGGCAACATTGCTAAAACCCGTGATTTGCACATTCAGAGCCATATAAGTGAAAATCGTGATGA  518

Query  741  AGTTGAAGCTGTGAAAAACTTATACCCCAGTTATAAAAACTACACATCTGTGTATGATAAAAACAATCTTTTGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGTTGAAGCTGTGAAAAACTTATACCCCAGTTATAAAAACTACACATCTGTGTATGATAAAAACAATCTTTTGA  592

Query  815  CAAATAAGACAGTGATGGCACACGGCTGCTACCTCTCTGCAGAAGAACTGAACGTATTCCATGAACGAGGAGCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAAATAAGACAGTGATGGCACACGGCTGCTACCTCTCTGCAGAAGAACTGAACGTATTCCATGAACGAGGAGCA  666

Query  889  TCCATCGCACACTGTCCCAATTCTAATTTATCGCTCAGCAGTGGATTTCTAAATGTGCTAGAAGTCCTGAAACA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCCATCGCACACTGTCCCAATTCTAATTTATCGCTCAGCAGTGGATTTCTAAATGTGCTAGAAGTCCTGAAACA  740

Query  963  TGAAGTCAAGATAGGGCTGGGTACAGACGTGGCTGGTGGCTATTCATATTCCATGCTTGATGCAATCAGAAGAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGAAGTCAAGATAGGGCTGGGTACAGACGTGGCTGGTGGCTATTCATATTCCATGCTTGATGCAATCAGAAGAG  814

Query 1037  CAGTGATGGTTTCCAATATCCTTTTAATTAATAAGGTAAATGAGAAAAGCCTCACCCTCAAAGAAGTCTTCAGA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAGTGATGGTTTCCAATATCCTTTTAATTAATAAGGTAAATGAGAAAAGCCTCACCCTCAAAGAAGTCTTCAGA  888

Query 1111  CTAGCTACTCTTGGAGGAAGCCAAGCCCTGGGGCTGGATGGTGAGATTGGAAACTTTGAAGTGGGCAAGGAATT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTAGCTACTCTTGGAGGAAGCCAAGCCCTGGGGCTGGATGGTGAGATTGGAAACTTTGAAGTGGGCAAGGAATT  962

Query 1185  TGATGCCATCCTGATCAACCCCAAAGCATCCGACTCTCCCATTGACCTGTTTTATGGGGACTTTTTTGGTGATA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGATGCCATCCTGATCAACCCCAAAGCATCCGACTCTCCCATTGACCTGTTTTATGGGGACTTTTTTGGTGATA  1036

Query 1259  TTTCTGAGGCTGTTATCCAGAAGTTCCTCTATCTAGGAGATGATCGAAATATTGAAGAGGTTTATGTGGGCGGA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTTCTGAGGCTGTTATCCAGAAGTTCCTCTATCTAGGAGATGATCGAAATATTGAAGAGGTTTATGTGGGCGGA  1110

Query 1333  AAGCAGGTGGTTCCGTTTTCCAGCTCAGTG  1362
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAGCAGGTGGTTCCGTTTTCCAGCTCAGTG  1140