Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475326
• Subject: XM_011519220.1
• Aligned Length: 1413
• Identities: 1235
• Gaps: 177

Alignment

Query    1  ATGTGTGCCGCTCAGATGCCGCCCCTGGCGCACATCTTCCGAGGGACGTTCGTCCACTCCACCTGGACCTGCCC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CATGGAGGTGCTGCGGGATCACCTCCTCGGCGTGAGCGACAGCGGCAAAATAGTGTTTTTAGAAGAAGCATCTC  148
                                                                .|||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------------------------------ATGTTTTTAGAAGAAGCATCTC  22

Query  149  AACAGGAAAAACTGGCCAAAGAATGGTGCTTCAAGCCGTGTGAAATAAGAGAACTGAGCCACCATGAGTTCTTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   23  AACAGGAAAAACTGGCCAAAGAATGGTGCTTCAAGCCGTGTGAAATAAGAGAACTGAGCCACCATGAGTTCTTC  96

Query  223  ATGCCTGGGCTGGTTGATACACACATCCATGCCTCTCAGTATTCCTTTGCTGGAAGTAGCATAGACCTGCCACT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   97  ATGCCTGGGCTGGTTGATACACACATCCATGCCTCTCAGTATTCCTTTGCTGGAAGTAGCATAGACCTGCCACT  170

Query  297  CTTGGAGTGGCTGACCAAGTACACATTTCCTGCAGAACACAGATTCCAGAACATCGACTTTGCAGAAGAAGTAT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  171  CTTGGAGTGGCTGACCAAGTACACATTTCCTGCAGAACACAGATTCCAGAACATCGACTTTGCAGAAGAAGTAT  244

Query  371  ATACCAGAGTTGTCAGGAGAACACTAAAGAATGGAACAACCACAGCTTGTTACTTTGCAACAATTCACACTGAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  245  ATACCAGAGTTGTCAGGAGAACACTAAAGAATGGAACAACCACAGCTTGTTACTTTGCAACAATTCACACTGAC  318

Query  445  TCATCTCTGCTCCTTGCCGACATTACAGATAAATTTGGACAGCGGGCATTTGTGGGCAAAGTTTGCATGGATTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  319  TCATCTCTGCTCCTTGCCGACATTACAGATAAATTTGGACAGCGGGCATTTGTGGGCAAAGTTTGCATGGATTT  392

Query  519  GAATGACACTTTTCCAGAATACAAGGAGACCACTGAGGAATCGATCAAGGAAACTGAGAGATTTGTGTCAGAAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  393  GAATGACACTTTTCCAGAATACAAGGAGACCACTGAGGAATCGATCAAGGAAACTGAGAGATTTGTGTCAGAAA  466

Query  593  TGCTCCAAAAGAACTATTCTAGAGTGAAGCCCATAGTGACACCACGTTTTTCCCTCTCCTGCTCTGAGACTTTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  467  TGCTCCAAAAGAACTATTCTAGAGTGAAGCCCATAGTGACACCACGTTTTTCCCTCTCCTGCTCTGAGACTTTG  540

Query  667  ATGGGTGAACTGGGCAACATTGCTAAAACCCGTGATTTGCACATTCAGAGCCATATAAGTGAAAATCGTGATGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  ATGGGTGAACTGGGCAACATTGCTAAAACCCGTGATTTGCACATTCAGAGCCATATAAGTGAAAATCGTGATGA  614

Query  741  AGTTGAAGCTGTGAAAAACTTATACCCCAGTTATAAAAACTACACATCTGTGTATGATAAAAACAATCTTTTGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  615  AGTTGAAGCTGTGAAAAACTTATACCCCAGTTATAAAAACTACACATCTGTGTATGATAAAAACAATCTTTTGA  688

Query  815  CAAATAAGACAGTGATGGCACACGGCTGCTACCTCTCTGCAGAAGAACTGAACGTATTCCATGAACGAGGAGCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  689  CAAATAAGACAGTGATGGCACACGGCTGCTACCTCTCTGCAGAAGAACTGAACGTATTCCATGAACGAGGAGCA  762

Query  889  TCCATCGCACACTGTCCCAATTCTAATTTATCGCTCAGCAGTGGATTTCTAAATGTGCTAGAAGTCCTGAAACA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  763  TCCATCGCACACTGTCCCAATTCTAATTTATCGCTCAGCAGTGGATTTCTAAATGTGCTAGAAGTCCTGAAACA  836

Query  963  TGAAGTCAAGATAGGGCTGGGTACAGACGTGGCTGGTGGCTATTCATATTCCATGCTTGATGCAATCAGAAGAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  837  TGAAGTCAAGATAGGGCTGGGTACAGACGTGGCTGGTGGCTATTCATATTCCATGCTTGATGCAATCAGAAGAG  910

Query 1037  CAGTGATGGTTTCCAATATCCTTTTAATTAATAAGGTAAATGAGAAAAGCCTCACCCTCAAAGAAGTCTTCAGA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  911  CAGTGATGGTTTCCAATATCCTTTTAATTAATAAGGTAAATGAGAAAAGCCTCACCCTCAAAGAAGTCTTCAGA  984

Query 1111  CTAGCTACTCTTGGAGGAAGCCAAGCCCTGGGGCTGGATGGTGAGATTGGAAACTTTGAAGTGGGCAAGGAATT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  985  CTAGCTACTCTTGGAGGAAGCCAAGCCCTGGGGCTGGATGGTGAGATTGGAAACTTTGAAGTGGGCAAGGAATT  1058

Query 1185  TGATGCCATCCTGATCAACCCCAAAGCATCCGACTCTCCCATTGACCTGTTTTATGGGGACTTTTTTGGTGATA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1059  TGATGCCATCCTGATCAACCCCAAAGCATCCGACTCTCCCATTGACCTGTTTTATGGGGACTTTTTTGGTGATA  1132

Query 1259  TTTCTGAGGCTGTTATCCAGAAGTTCCTCTATCTAGGAGATGATCGAAATATTGAAGAGGTTTATGTGGGCGGA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1133  TTTCTGAGGCTGTTATCCAGAAGTTCCTCTATCTAGGAGATGATCGAAATATTGAAGAGGTTTATGTGGGCGGA  1206

Query 1333  AAGCAGGTGGTTCCGTTTTCCAGCTCAGTG--------------------------------------------  1362
            ||||||||||||||||||||||||||||||                                            
Sbjct 1207  AAGCAGGTGGTTCCGTTTTCCAGCTCAGTGAAAGAAACAATTCACTTACCAGCCTCCTCACCCCATCCTCCACC  1280

Query 1363  -------  1362
                   
Sbjct 1281  ATTTCCT  1287