Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475329
• Subject: NM_001317110.2
• Aligned Length: 653
• Identities: 519
• Gaps: 13

Alignment

Query   1  ATGAGCTTCTTGTTTGGTAGTCGCTCTTCTAAAACTTTTAAACCAAAGAAGAACATTCCAGAGGGTTCTCACCA  74
           |||||||||.|.||   .||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.||
Sbjct   1  ATGAGCTTCCTCTT---CAGCCGCTCTTCTAAAACATTCAAACCAAAGAAGAATATCCCTGAAGGATCTCATCA  71

Query  75  GTATGAGCTCTTAAAACACGCAGAAGCCACACTTGGCAGTGGCAACCTTCGGATG----GCTGTCATGCTTCCT  144
           ||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.||   ||.|| |    |||||.|||.|.|||
Sbjct  72  GTATGAACTCTTAAAACATGCAGAAGCAACTCTAGGAAGTGGGAA---TCTGA-GACAAGCTGTTATGTTGCCT  141

Query 145  GAAGGGGAAGATCTCAATGAATGGGTTGCAGTTAACACTGTGGATTTCTTCAATCAGATCAACATGCTTTATGG  218
           ||.||.||.|||||||||||||||.||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||.|.|||||
Sbjct 142  GAGGGAGAGGATCTCAATGAATGGATTGCTGTGAACACTGTGGATTTCTTTAACCAGATCAACATGTTATATGG  215

Query 219  AACTATCACAGACTTCTGTACAGAAGAGAGTTGTCCAGTGATGTCAGCTGGCCCAAAATATGAGTATCATTGGG  292
           ||||||.|||||.|||||.||.||||..||.||||||||.|||||.||.||.||.|.||||||.|||||.||||
Sbjct 216  AACTATTACAGAATTCTGCACTGAAGCAAGCTGTCCAGTCATGTCTGCAGGTCCGAGATATGAATATCACTGGG  289

Query 293  CAGATGGAACGAACATAAAGAAACCTATTAAGTGCTCTGCACCAAAGTATATTGATTACTTGATGACTTGGGTT  366
           |||||||.||.||.||.||.||.||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 290  CAGATGGTACTAATATTAAAAAGCCAATCAAATGTTCTGCACCAAAATACATTGACTATTTGATGACTTGGGTT  363

Query 367  CAGGACCAGTTGGATGATGAGACGTTATTTCCATCAAAAATTGGTGTCCC-GTTCCCAAAGAATTTCATGTCTG  439
           ||.||.|||.|.||||||||.||..|.|||||.||.||.||||||||||| .|||||||| ||.||.|||||||
Sbjct 364  CAAGATCAGCTTGATGATGAAACTCTTTTTCCTTCTAAGATTGGTGTCCCATTTCCCAAA-AACTTTATGTCTG  436

Query 440  TGGCAAAAACTATACTCAAACGCCTCTTTAGGGTTTATGCTCACATTTATCATCAGCATTTTGACCCTGTGATC  513
           |||||||.|||||.||.||.||.||.||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||..|||||||.
Sbjct 437  TGGCAAAGACTATTCTAAAGCGTCTGTTCAGGGTTTATGCCCATATTTATCACCAGCACTTTGATTCTGTGATG  510

Query 514  CAGCTTCAGGAGGAAGCACATCTAAATACATCTTTCAAGCACTTTATTTTTTTTGTCCAGGAATTCAACCTTAT  587
           |||||.||.|||||.||.||.||.||.||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.||.||
Sbjct 511  CAGCTGCAAGAGGAGGCCCACCTCAACACCTCCTTTAAGCACTTTATTTTCTTTGTTCAGGAGTTTAATCTGAT  584

Query 588  TGATAGAAGAGAACTTGCACCACTCCAAGAACTGATTGAAAAACTCACCTCAAAAGACAGA  648
           ||||||..|.||.||.|||||.||.||||||.|.||.||.|||||....||||||||||||
Sbjct 585  TGATAGGCGTGAGCTGGCACCTCTTCAAGAATTAATAGAGAAACTTGGATCAAAAGACAGA  645