Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000475378
- Subject:
- XM_011542244.1
- Aligned Length:
- 2088
- Identities:
- 1943
- Gaps:
- 144
Alignment
Query 1 ATGTCGTGGCTCTTCGGCGTTAACAAGGGCCCCAAGGGTGAAGGCGCGGGGCCGCCGCCGCCTTTGCCGCCCGC 74
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Sbjct 1 ATGTCGTGGCTCTTCGGCGTTAACAAGGGCCCCAAGGGTGAAGGCGCGGGGCCGCCGCCGCCTTTGCCGCCCGC 74
Query 75 GCAGCCCGGGGCCGAGGGCGGCGGGGACCGCGGTTTGGGAGACCGGCCGGCGCCCAAGGACAAATGGAGCAACT 148
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Sbjct 75 GCAGCCCGGGGCCGAGGGCGGCGGGGACCGCGGTTTGGGAGACCGGCCGGCGCCCAAGGACAAATGGAGCAACT 148
Query 149 TCGACCCCACCGGCCTGGAGCGCGCCGCCAAGGCGGCGCGCGAGCTGGAGCACTCGCGTTACGCCAAGGAGGCC 222
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Sbjct 149 TCGACCCCACCGGCCTGGAGCGCGCCGCCAAGGCGGCGCGCGAGCTGGAGCACTCGCGTTACGCCAAGGAGGCC 222
Query 223 CTGAATCTGGCGCAGATGCAGGAGCAGACGCTGCAGTTGGAGCAACAGTCCAAGCTCAAA-------------- 282
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Sbjct 223 CTGAATCTGGCGCAGATGCAGGAGCAGACGCTGCAGTTGGAGCAACAGTCCAAGCTCAAAATGCAGCTGGAAGC 296
Query 283 -------------------------------------------------------------------------- 282
Sbjct 297 CCTGAACCTGCTGCACACACTAGTCTGGGCACGGAGTCTCTGCCGTGCCGGAGCTGTGCAGACACAGGAGCGGC 370
Query 283 --------------------------------------------------------GAGTATGAGGCCGCCGTG 300
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Sbjct 371 TGTCAGGCAGTGCCAGCCCTGAGCAAGTGCCAGCTGGTGAGTGCTGTGCTCTGCAGGAGTATGAGGCCGCCGTG 444
Query 301 GAGCAGCTCAAGAGCGAGCAGATCCGGGCGCAGGCTGAGGAGAGGAGGAAGACCCTGAGCGAGGAGACCCGGCA 374
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Sbjct 445 GAGCAGCTCAAGAGCGAGCAGATCCGGGCGCAGGCTGAGGAGAGGAGGAAGACCCTGAGCGAGGAGACCCGGCA 518
Query 375 GCACCAGGCCAGGGCCCAGTATCAAGACAAGCTGGCCCGGCAGCGCTACGAGGACCAACTGAAGCAGCAGCGAC 448
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Sbjct 519 GCACCAGGCCAGGGCCCAGTATCAAGACAAGCTGGCCCGGCAGCGCTACGAGGACCAACTGAAGCAGCAGCAAC 592
Query 449 TTCTCAATGAGGAGAATTTACGGAAGCAGGAGGAGTCCGTGCAGAAGCAGGAAGCCATGCGGCGAGCCACCGTG 522
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Sbjct 593 TTCTCAATGAGGAGAATTTACGGAAGCAGGAGGAGTCCGTGCAGAAGCAGGAAGCCATGCGGCGAGCCACCGTG 666
Query 523 GAGCGGGAGATGGAGCTGCGGCACAAGAATGAGATGCTGCGAGTGGAGACCGAGGCCCGGGCGCGCGCCAAGGC 596
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Sbjct 667 GAGCGGGAGATGGAGCTGCGGCACAAGAATGAGATGCTGCGAGTGGAGACCGAGGCCCGGGCGCGCGCCAAGGC 740
Query 597 CGAGCGGGAGAATGCAGACATCATCCGCGAGCAGATCCGCCTGAAGGCGTCCGAGCACCGTCAGACCGTCTTGG 670
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Sbjct 741 CGAGCGGGAGAATGCAGACATCATCCGCGAGCAGATCCGCCTGAAGGCGTCCGAGCACCGTCAGACCGTCTTGG 814
Query 671 AGTCCATCAGGACGGCTGGCACCTTGTTTGGGGAAGGATTCCGTGCCTTTGTGACAGACCGGGACAAAGTGACA 744
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Sbjct 815 AGTCCATCAGGACGGCTGGCACCTTGTTTGGGGAAGGATTCCGTGCCTTTGTGACAGACCGGGACAAAGTGACA 888
Query 745 GCCACGGTGGCTGGGCTGACGCTGCTGGCTGTCGGGGTCTACTCAGCCAAGAATGCGACAGCCGTCACTGGCCG 818
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Sbjct 889 GCCACGGTGGCTGGGCTGACGCTGCTGGCTGTCGGGGTCTACTCAGCCAAGAATGCGACAGCCGTCACTGGCCG 962
Query 819 CTTCATCGAGGCTCGGCTGGGGAAGCCGTCCCTAGTGAGGGAGACGTCCCGCATCACGGTGCTGGAGGCGCTGC 892
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Sbjct 963 CTTCATCGAGGCTCGGCTGGGGAAGCCGTCCCTAGTGAGGGAGACGTCCCGCATCACGGTGCTGGAGGCGCTGC 1036
Query 893 GGCACCCCATCCAGGTCAGCCGGCGGCTCCTCAGTCGACCCCAGGACGTGCTGGAGGGTGTTGTGCTTAGTCCC 966
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Sbjct 1037 GGCACCCCATCCAGGTCAGCCGGCGGCTCCTCAGTCGACCCCAGGACGTGCTGGAGGGTGTTGTGCTTAGTCCC 1110
Query 967 AGCCTGGAAGCACGGGTGCGCGACATCGCCATAGCAACCAGGAACACCAAGAAGAACCGGGGCCTGTACAGGCA 1040
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Sbjct 1111 AGCCTGGAAGCACGGGTGCGCGACATCGCCATAGCAACCAGGAACACCAAGAAGAACCGGGGCCTGTACAGGCA 1184
Query 1041 CATCCTGCTGTATGGGCCACCAGGCACCGGGAAGACGCTGTTTGCCAAGAAACTCGCCCTGCACTCAGGCATGG 1114
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Sbjct 1185 CATCCTGCTGTATGGGCCACCAGGCACCGGGAAGACGCTGTTTGCCAAGAAACTCGCCCTGCACTCAGGCATGG 1258
Query 1115 ACTACGCCATCATGACAGGCGGGGACGTGGCCCCCATGGGGCGGGAAGGCGTGACCGCCATGCACAAGCTCTTT 1188
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Sbjct 1259 ACTACGCCATCATGACAGGCGGGGACGTGGCCCCCATGGGGCGGGAAGGCGTGACCGCCATGCACAAGCTCTTT 1332
Query 1189 GACTGGGCCAATACCAGCCGGCGCGGCCTCCTGCTCTTCATGGATGAAGCAGACGCCTTCCTTCGGAAGCGAGC 1262
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Sbjct 1333 GACTGGGCCAATACCAGCCGGCGCGGCCTCCTGCTCTTCATGGATGAAGCAGACGCCTTCCTTCGGAAGCGAGC 1406
Query 1263 CACTGAGGAGATAAGCAAGGACCTCAGAGCCACACTGAACGCCTTCCTGTACCACATGGGCCAACACAGCAACA 1336
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Sbjct 1407 CACTGAGGAGATAAGCAAGGACCTCAGAGCCACACTGAACGCCTTCCTGTACCACATGGGCCAACACAGCAACA 1480
Query 1337 AATTCATGCTGGTCCTGGCCAGCAATCTGCCTGAGCAGTTCGACTGTGCCATCAACAGCCGCATTGACGTGATG 1410
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Sbjct 1481 AATTCATGCTGGTCCTGGCCAGCAATCTGCCTGAGCAGTTCGACTGTGCCATCAACAGCCGCATTGACGTGATG 1554
Query 1411 GTCCACTTCGACCTGCCGCAGCAGGAGGAGCGGGAGCGCCTGGTGAGACTGCATTTTGACAACTGTGTTCTTAA 1484
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Sbjct 1555 GTCCACTTCGACCTGCCGCAGCAGGAGGAGCGGGAGCGCCTGGTGAGACTGCATTTTGACAACTGTGTTCTTAA 1628
Query 1485 GCCGGCCACAGAAGGAAAACGGCGCCTGAAGCTGGCCCAGTTTGACTACGGGAGGAAGTGCTCGGAGGTCGCTC 1558
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Sbjct 1629 GCCGGCCACAGAAGGAAAACGGCGCCTGAAGCTGGCCCAGTTTGACTACGGGAGGAAGTGCTCGGAGGTCGCTC 1702
Query 1559 GGCTGACGGAGGGCATGTCGGGCCGGGAGATCGCTCAGCTGGCCGTGTCCTGGCAGGCCACGGCATATGCCTCC 1632
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Sbjct 1703 GGCTGACGGAGGGCATGTCGGGCCGGGAGATCGCTCAGCTGGCCGTGTCCTGGCAGGCCACGGCATATGCCTCC 1776
Query 1633 AAGGACGGGGTCCTCACTGAGGCCATGATGGACGCCTGTGTGCAAGATGCTGTCCAGCAGTACCGACAGAAGAT 1706
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Sbjct 1777 AAGGACGGGGTCCTCACTGAGGCCATGATGGACGCCTGTGTGCAAGATGCTGTCCAGCAGTACCGACAGAAGAT 1850
Query 1707 GCGCTGGCTGAAGGCGGAGGGGCCTGGGCGCGGGGTCGAGCACCCCCTATCCGGAGTCCAAGGCGAGACCCTCA 1780
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Sbjct 1851 GCGCTGGCTGAAGGCGGAGGGGCCTGGGCGCGGGGTCGAGCACCCCCTATCCGGAGTCCAAGGCGAGACCCTCA 1924
Query 1781 CCTCATGGAGCCTGGCCACGGACCCCTCCTACCCCTGCCTTGCCGGCCCCTGCACATTTAGGATATGCTCCTGG 1854
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Sbjct 1925 CCTCATGGAGCCTGGCCACGGACCCCTCCTACCCCTGCCTTGCCGGCCCCTGCACATTTAGGATATGCTCCTGG 1998
Query 1855 ATGGGGACTGGGCTGTGCCCAGGGCCTCTGTCCCCCAGGATGTCTTGTGGTGGCGGTCGGCCGTTCTGCCCCCC 1928
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Sbjct 1999 ATGGGGACTGGGCTGTGCCCAGGGCCTCTGTCCCCCAGGATGTCTTGTGGTGGCGGTCGGCCGTTCTGCCCCCC 2072
Query 1929 AGGGCACCCCCTGTTG 1944
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Sbjct 2073 AGGGCACCCCCTGTTG 2088