Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000475378
Subject:
XM_011542244.1
Aligned Length:
2088
Identities:
1943
Gaps:
144

Alignment

Query    1  ATGTCGTGGCTCTTCGGCGTTAACAAGGGCCCCAAGGGTGAAGGCGCGGGGCCGCCGCCGCCTTTGCCGCCCGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCGTGGCTCTTCGGCGTTAACAAGGGCCCCAAGGGTGAAGGCGCGGGGCCGCCGCCGCCTTTGCCGCCCGC  74

Query   75  GCAGCCCGGGGCCGAGGGCGGCGGGGACCGCGGTTTGGGAGACCGGCCGGCGCCCAAGGACAAATGGAGCAACT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCAGCCCGGGGCCGAGGGCGGCGGGGACCGCGGTTTGGGAGACCGGCCGGCGCCCAAGGACAAATGGAGCAACT  148

Query  149  TCGACCCCACCGGCCTGGAGCGCGCCGCCAAGGCGGCGCGCGAGCTGGAGCACTCGCGTTACGCCAAGGAGGCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCGACCCCACCGGCCTGGAGCGCGCCGCCAAGGCGGCGCGCGAGCTGGAGCACTCGCGTTACGCCAAGGAGGCC  222

Query  223  CTGAATCTGGCGCAGATGCAGGAGCAGACGCTGCAGTTGGAGCAACAGTCCAAGCTCAAA--------------  282
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
Sbjct  223  CTGAATCTGGCGCAGATGCAGGAGCAGACGCTGCAGTTGGAGCAACAGTCCAAGCTCAAAATGCAGCTGGAAGC  296

Query  283  --------------------------------------------------------------------------  282
                                                                                      
Sbjct  297  CCTGAACCTGCTGCACACACTAGTCTGGGCACGGAGTCTCTGCCGTGCCGGAGCTGTGCAGACACAGGAGCGGC  370

Query  283  --------------------------------------------------------GAGTATGAGGCCGCCGTG  300
                                                                    ||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGTCAGGCAGTGCCAGCCCTGAGCAAGTGCCAGCTGGTGAGTGCTGTGCTCTGCAGGAGTATGAGGCCGCCGTG  444

Query  301  GAGCAGCTCAAGAGCGAGCAGATCCGGGCGCAGGCTGAGGAGAGGAGGAAGACCCTGAGCGAGGAGACCCGGCA  374
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGCAGCTCAAGAGCGAGCAGATCCGGGCGCAGGCTGAGGAGAGGAGGAAGACCCTGAGCGAGGAGACCCGGCA  518

Query  375  GCACCAGGCCAGGGCCCAGTATCAAGACAAGCTGGCCCGGCAGCGCTACGAGGACCAACTGAAGCAGCAGCGAC  448
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  519  GCACCAGGCCAGGGCCCAGTATCAAGACAAGCTGGCCCGGCAGCGCTACGAGGACCAACTGAAGCAGCAGCAAC  592

Query  449  TTCTCAATGAGGAGAATTTACGGAAGCAGGAGGAGTCCGTGCAGAAGCAGGAAGCCATGCGGCGAGCCACCGTG  522
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTCTCAATGAGGAGAATTTACGGAAGCAGGAGGAGTCCGTGCAGAAGCAGGAAGCCATGCGGCGAGCCACCGTG  666

Query  523  GAGCGGGAGATGGAGCTGCGGCACAAGAATGAGATGCTGCGAGTGGAGACCGAGGCCCGGGCGCGCGCCAAGGC  596
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGCGGGAGATGGAGCTGCGGCACAAGAATGAGATGCTGCGAGTGGAGACCGAGGCCCGGGCGCGCGCCAAGGC  740

Query  597  CGAGCGGGAGAATGCAGACATCATCCGCGAGCAGATCCGCCTGAAGGCGTCCGAGCACCGTCAGACCGTCTTGG  670
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CGAGCGGGAGAATGCAGACATCATCCGCGAGCAGATCCGCCTGAAGGCGTCCGAGCACCGTCAGACCGTCTTGG  814

Query  671  AGTCCATCAGGACGGCTGGCACCTTGTTTGGGGAAGGATTCCGTGCCTTTGTGACAGACCGGGACAAAGTGACA  744
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGTCCATCAGGACGGCTGGCACCTTGTTTGGGGAAGGATTCCGTGCCTTTGTGACAGACCGGGACAAAGTGACA  888

Query  745  GCCACGGTGGCTGGGCTGACGCTGCTGGCTGTCGGGGTCTACTCAGCCAAGAATGCGACAGCCGTCACTGGCCG  818
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCCACGGTGGCTGGGCTGACGCTGCTGGCTGTCGGGGTCTACTCAGCCAAGAATGCGACAGCCGTCACTGGCCG  962

Query  819  CTTCATCGAGGCTCGGCTGGGGAAGCCGTCCCTAGTGAGGGAGACGTCCCGCATCACGGTGCTGGAGGCGCTGC  892
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTTCATCGAGGCTCGGCTGGGGAAGCCGTCCCTAGTGAGGGAGACGTCCCGCATCACGGTGCTGGAGGCGCTGC  1036

Query  893  GGCACCCCATCCAGGTCAGCCGGCGGCTCCTCAGTCGACCCCAGGACGTGCTGGAGGGTGTTGTGCTTAGTCCC  966
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGCACCCCATCCAGGTCAGCCGGCGGCTCCTCAGTCGACCCCAGGACGTGCTGGAGGGTGTTGTGCTTAGTCCC  1110

Query  967  AGCCTGGAAGCACGGGTGCGCGACATCGCCATAGCAACCAGGAACACCAAGAAGAACCGGGGCCTGTACAGGCA  1040
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGCCTGGAAGCACGGGTGCGCGACATCGCCATAGCAACCAGGAACACCAAGAAGAACCGGGGCCTGTACAGGCA  1184

Query 1041  CATCCTGCTGTATGGGCCACCAGGCACCGGGAAGACGCTGTTTGCCAAGAAACTCGCCCTGCACTCAGGCATGG  1114
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CATCCTGCTGTATGGGCCACCAGGCACCGGGAAGACGCTGTTTGCCAAGAAACTCGCCCTGCACTCAGGCATGG  1258

Query 1115  ACTACGCCATCATGACAGGCGGGGACGTGGCCCCCATGGGGCGGGAAGGCGTGACCGCCATGCACAAGCTCTTT  1188
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACTACGCCATCATGACAGGCGGGGACGTGGCCCCCATGGGGCGGGAAGGCGTGACCGCCATGCACAAGCTCTTT  1332

Query 1189  GACTGGGCCAATACCAGCCGGCGCGGCCTCCTGCTCTTCATGGATGAAGCAGACGCCTTCCTTCGGAAGCGAGC  1262
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GACTGGGCCAATACCAGCCGGCGCGGCCTCCTGCTCTTCATGGATGAAGCAGACGCCTTCCTTCGGAAGCGAGC  1406

Query 1263  CACTGAGGAGATAAGCAAGGACCTCAGAGCCACACTGAACGCCTTCCTGTACCACATGGGCCAACACAGCAACA  1336
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CACTGAGGAGATAAGCAAGGACCTCAGAGCCACACTGAACGCCTTCCTGTACCACATGGGCCAACACAGCAACA  1480

Query 1337  AATTCATGCTGGTCCTGGCCAGCAATCTGCCTGAGCAGTTCGACTGTGCCATCAACAGCCGCATTGACGTGATG  1410
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AATTCATGCTGGTCCTGGCCAGCAATCTGCCTGAGCAGTTCGACTGTGCCATCAACAGCCGCATTGACGTGATG  1554

Query 1411  GTCCACTTCGACCTGCCGCAGCAGGAGGAGCGGGAGCGCCTGGTGAGACTGCATTTTGACAACTGTGTTCTTAA  1484
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GTCCACTTCGACCTGCCGCAGCAGGAGGAGCGGGAGCGCCTGGTGAGACTGCATTTTGACAACTGTGTTCTTAA  1628

Query 1485  GCCGGCCACAGAAGGAAAACGGCGCCTGAAGCTGGCCCAGTTTGACTACGGGAGGAAGTGCTCGGAGGTCGCTC  1558
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GCCGGCCACAGAAGGAAAACGGCGCCTGAAGCTGGCCCAGTTTGACTACGGGAGGAAGTGCTCGGAGGTCGCTC  1702

Query 1559  GGCTGACGGAGGGCATGTCGGGCCGGGAGATCGCTCAGCTGGCCGTGTCCTGGCAGGCCACGGCATATGCCTCC  1632
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GGCTGACGGAGGGCATGTCGGGCCGGGAGATCGCTCAGCTGGCCGTGTCCTGGCAGGCCACGGCATATGCCTCC  1776

Query 1633  AAGGACGGGGTCCTCACTGAGGCCATGATGGACGCCTGTGTGCAAGATGCTGTCCAGCAGTACCGACAGAAGAT  1706
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AAGGACGGGGTCCTCACTGAGGCCATGATGGACGCCTGTGTGCAAGATGCTGTCCAGCAGTACCGACAGAAGAT  1850

Query 1707  GCGCTGGCTGAAGGCGGAGGGGCCTGGGCGCGGGGTCGAGCACCCCCTATCCGGAGTCCAAGGCGAGACCCTCA  1780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GCGCTGGCTGAAGGCGGAGGGGCCTGGGCGCGGGGTCGAGCACCCCCTATCCGGAGTCCAAGGCGAGACCCTCA  1924

Query 1781  CCTCATGGAGCCTGGCCACGGACCCCTCCTACCCCTGCCTTGCCGGCCCCTGCACATTTAGGATATGCTCCTGG  1854
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CCTCATGGAGCCTGGCCACGGACCCCTCCTACCCCTGCCTTGCCGGCCCCTGCACATTTAGGATATGCTCCTGG  1998

Query 1855  ATGGGGACTGGGCTGTGCCCAGGGCCTCTGTCCCCCAGGATGTCTTGTGGTGGCGGTCGGCCGTTCTGCCCCCC  1928
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  ATGGGGACTGGGCTGTGCCCAGGGCCTCTGTCCCCCAGGATGTCTTGTGGTGGCGGTCGGCCGTTCTGCCCCCC  2072

Query 1929  AGGGCACCCCCTGTTG  1944
            ||||||||||||||||
Sbjct 2073  AGGGCACCCCCTGTTG  2088