Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475460
• Subject: XM_006521080.3
• Aligned Length: 623
• Identities: 488
• Gaps: 73

Alignment

Query   1  ATGGCTGTGGAAGCTCTCCACTGTGGTTTGAATCCACGGGGTATTGATCACCCTGCCCATGCTGAAGGTATTAA  74
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.|||||
Sbjct   1  ATGGCTGTGGAAGCTCTCCACTGTGGTTTGAATCCACGGGGTATTGATCACTCTGCCCATGCTGACGGAATTAA  74

Query  75  ACTGCAAATTGAAGGTGAAGGTGTGGAATCTCAATCCATTAAAAATAAAAATTTCCAGAAGGTGCCTGACCAGA  148
           |||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||||||||||||.|
Sbjct  75  ACTGCAAATTGAAGGCGAAGGTGTAGAATCTCAATCCATTAAAAACAGAACTTTCCAGAAGGTGCCTGACCAAA  148

Query 149  AAGGAACTCCCAAGCGACTGCAGGCAGAAGCTGAGACGGCTAAGTCAGCTACGGTGAAGCTATCTAAACCGGTG  222
           |||||||.||||||.||||.||||.||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||.
Sbjct 149  AAGGAACCCCCAAGAGACTTCAGGGAGAAGCTGAGACAGCAAAGTCAGCTACAGTGAAGCTGTCAAAACCAGTA  222

Query 223  GCTCTATGGACCCAGCAGGATGTCTGCAAGTGGTTGAAGAAACATTGTCCGAATCAGTATCAGATCTACAGTGA  296
           ||.||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||||||||.||||||||||
Sbjct 223  GCCCTGTGGACCCAGCAGGATGTCTGCAAGTGGCTGAAGAAACACTGTCCAAATCAGTATCAGCTCTACAGTGA  296

Query 297  GTCATTCAAACAGCATGACATAACTGGGCGAGCCCTGCTGAGACTTACTGACAAAAAGCTCGAGCGAATGGGGA  370
           ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct 297  GTCATTCAAACAACATGACATAACTGGGCGAGCCCTGCTGAGACTCACAGACAAGAAGCTGGAGCGCATGGGGA  370

Query 371  TTGCCCAGGAGAACCTCCGGCAGCACATCTTACAACAGGTGCTCCAGCTGAAGGTGCGAGAAGAAGTCAGAAAT  444
           |||||||||||||||..||.|||||||||.|.||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct 371  TTGCCCAGGAGAACCAGCGACAGCACATCCTGCAGCAGGTGCTCCAACTGAAAGTGCGGGAAGAAGTCAGAAAC  444

Query 445  CTACAGTTACTCACACAAGGTACCCTATTGCTTCCTGATGG----GTGGATGGATGGGGAGATTAGAAGAAAGA  514
           ||.|||||||||||||||||         |.|||    |||    |||.|  ||.|||.||.||      .||.
Sbjct 445  CTGCAGTTACTCACACAAGG---------GATTC----TGGGAACGTGCA--GAGGGGAAGCTT------CAGG  497

Query 515  CCACCTTACT-ATTAGGACAGACAGGAGTCAGGGAGAATTTGTTATTGTTTCTTCAC-AGAATTTCCATCATAG  586
           ||||   ||| |..||.||||..|||||.| |||.|                 |||| |||           ||
Sbjct 498  CCAC---ACTGAAGAGAACAGGAAGGAGGC-GGGTG-----------------TCACAAGA-----------AG  539

Query 587  AAA-ATAGTATAC-----AGATT--------  603
           ||| .||.|||.|     .||.|        
Sbjct 540  AAAGCTACTATCCTCGGTGGAGTGTTCTCCA  570