Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000475488
Subject:
XM_011509459.2
Aligned Length:
810
Identities:
750
Gaps:
60

Alignment

Query   1  ATGTGGCTCCTGGTCAGTGTAATTCTAATCTCACGGATATCCTCTGTTGGGGGAGAAGCAATGTTCTGTGATTT  74
                                                                       ||||||||||||||
Sbjct   1  ------------------------------------------------------------ATGTTCTGTGATTT  14

Query  75  TCCAAAAATAAACCATGGAATTCTATATGATGAAGAAAAATATAAGCCATTTTCCCAAGTTCCTACAGGGGAAG  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  15  TCCAAAAATAAACCATGGAATTCTATATGATGAAGAAAAATATAAGCCATTTTCCCAAGTTCCTACAGGGGAAG  88

Query 149  TTTTCTATTACTCCTGTGAATATAATTTTGTGTCTCCTTCAAAATCCTTTTGGACTCGCATAACGTGCGCAGAA  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  89  TTTTCTATTACTCCTGTGAATATAATTTTGTGTCTCCTTCAAAATCCTTTTGGACTCGCATAACGTGCGCAGAA  162

Query 223  GAAGGATGGTCACCAACACCAAAGTGTCTCAGACTGTGTTTCTTTCCTTTTGTGGAAAATGGTCATTCTGAATC  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 163  GAAGGATGGTCACCAACACCAAAGTGTCTCAGACTGTGTTTCTTTCCTTTTGTGGAAAATGGTCATTCTGAATC  236

Query 297  TTCAGGACAAACACATCTGGAAGGTGATACTGTACAAATTATTTGCAACACAGGATACAGACTTCAAAACAATG  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 237  TTCAGGACAAACACATCTGGAAGGTGATACTGTACAAATTATTTGCAACACAGGATACAGACTTCAAAACAATG  310

Query 371  AGAACAACATTTCATGTGTAGAACGGGGCTGGTCCACTCCTCCCAAATGCAGGTCCACTATTTCTGCAGAAAAA  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 311  AGAACAACATTTCATGTGTAGAACGGGGCTGGTCCACTCCTCCCAAATGCAGGTCCACTATTTCTGCAGAAAAA  384

Query 445  TGTGGGCCCCCTCCACCTATTGACAATGGAGACATTACTTCATTCCTGTTGTCAGTATATGCTCCAGGTTCATC  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 385  TGTGGGCCCCCTCCACCTATTGACAATGGAGACATTACTTCATTCCTGTTGTCAGTATATGCTCCAGGTTCATC  458

Query 519  AGTTGAGTACCAGTGCCAGAACTTGTATCAACTTGAGGGTAACAATCAAATAACATGTAGAAACGGACAATGGT  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 459  AGTTGAGTACCAGTGCCAGAACTTGTATCAACTTGAGGGTAACAATCAAATAACATGTAGAAACGGACAATGGT  532

Query 593  CAGAACCACCAAAATGCTTAGATCCATGTGTAATATCACAAGAAATTATGGAAAAATATAACATAAAATTAAAG  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 533  CAGAACCACCAAAATGCTTAGATCCATGTGTAATATCACAAGAAATTATGGAAAAATATAACATAAAATTAAAG  606

Query 667  TGGACAAACCAACAAAAGCTTTATTCAAGAACAGGTGACATAGTTGAATTTGTTTGTAAATCTGGATATCATCC  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 607  TGGACAAACCAACAAAAGCTTTATTCAAGAACAGGTGACATAGTTGAATTTGTTTGTAAATCTGGATATCATCC  680

Query 741  AACAAAATCTCATTCATTTCGAGCAATGTGTCAGAATGGGAAACTGGTATATCCCAGTTGTGAAGAAAAA  810
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 681  AACAAAATCTCATTCATTTCGAGCAATGTGTCAGAATGGGAAACTGGTATATCCCAGTTGTGAAGAAAAA  750