Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475489
• Subject: NM_001031850.4
• Aligned Length: 1294
• Identities: 912
• Gaps: 312

Alignment

Query    1  ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACAGAGCACATCAAATGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
            |||||.|||||||||||||||||||||||..|||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGACCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACTCAGCACATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74

Query   75  AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCACCAAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|..|||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct   75  AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTAATAATTGAAGCCAAGCCACCCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATCAGGGAC  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||
Sbjct  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGACGGAC  222

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTCAAATAATTATATATGGGCCTGCATATAGTGGACGAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||   ||||||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTACACGGTCA---AATTATATATGGGCCTGCCTACAGTGGACGAGA  293

Query  297  AACAGCATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACA  370
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  294  AACAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACACAGGAGGATGCAGGATCCTACACCTTACACA  367

Query  371  TCATAAAGCGAGGTGATGGGACTAGAGGAGTAACTGGATATTTCACCTTCACCTTATACCTGGAGACTCCCAAG  444
            |||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||..|||||||||||..|||||||||||||
Sbjct  368  TCATAAAGCGAGGCGATGGGACTGGAGGAGTAACTGGATATTTCACTGTCACCTTATACTCGGAGACTCCCAAG  441

Query  445  CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAAACTGTGATCTTAACCTGTGATCCTGAGAC  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||..|||||..|||||.|||||||||||||||
Sbjct  442  CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAACCCCAGGGAGGTCATGGAGGCTGTGCGCTTAATCTGTGATCCTGAGAC  515

Query  519  TCCGGACACAAGCTACCAGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGGTTTCAGCTGTCCGAAA  592
            ||||||..|||||||||.|||||.|.||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||.|||
Sbjct  516  TCCGGATGCAAGCTACCTGTGGTTGCTGAATGGTCAGAACCTCCCTATGACTCACAGGTTGCAGCTGTCCAAAA  589

Query  593  CCAACAGGACCCTCTTTCTATTTGGTGTCACAAAGTATACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACTCA  666
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  590  CCAACAGGACCCTCTATCTATTTGGTGTCACAAAGTATATTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  663

Query  667  GGGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCC-------------------------------  709
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                               
Sbjct  664  GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCATGCCTTACATCACCATCAA  737

Query  710  --------------------------------------------------------------------------  709
                                                                                      
Sbjct  738  CAACTTAAACCCCAGGGAGAAGAAGGATGTGTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTCGGAACTACACCTACA  811

Query  710  --------------------------------------------------------------------------  709
                                                                                      
Sbjct  812  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCGAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATACTCATT  885

Query  710  --------------------------------------------------------------------------  709
                                                                                      
Sbjct  886  CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG  959

Query  710  --------------------------ATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTCACCCTTCATACACCAATTACCGTT  757
                                      |||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||.|||||||||
Sbjct  960  TAACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  1033

Query  758  CAGGAGATAACCTCTACTTGTCTTGCTTCGCGAACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGGG  831
            |||||||.||||||.|||||||.|||||.|||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034  CAGGAGAAAACCTCGACTTGTCCTGCTTTGCGGACTCTAACCCACCGGCAGAGTATTCTTGGACAATTAATGGG  1107

Query  832  AAGTTTCAGCAATCAGGACAAAATCTGTTTATCCCCCAAATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGTTTGCTC  905
            ||||||||||.||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1108  AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTACAAATCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTC  1181

Query  906  TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCGAGGAAAGCTCCACGTCGTTGACAGTCAAAGTCTCTGCTTC----------T  969
            ||||||||||||||||||||||.||||||.|||||..||..|||.||||||||||||||.|.|          .
Sbjct 1182  TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAATCTCCAAATCCATGATAGTCAAAGTCTCTGGTCCCTGCCATGGAA  1255

Query  970  ACAAGA-ATAGGACTTCTTCCTCTCCTTATCCAACA  1004
            ||.||| |.||          ||||.|         
Sbjct 1256  ACCAGACAGAG----------TCTCAT---------  1272