Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475489
• Subject: XM_005259065.4
• Aligned Length: 1041
• Identities: 872
• Gaps: 79

Alignment

Query    1  ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACAGAGCACATCAAATGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
            |||||..|||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGAACCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCAAATGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74

Query   75  AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCACCAAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|.|||||||||||||||||||
Sbjct   75  AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCGAGCCAACCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATCAGGGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACCGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGAGGGAC  222

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTCAAATAATTATATATGGGCCTGCATATAGTGGACGAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTGAAATAATTATATATGGGCCTGCATATAGTGGACGAGA  296

Query  297  AACAGCATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AACAGCATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACA  370

Query  371  TCATAAAGCGAGGTGATGGGACTAGAGGAGTAACTGGATATTTCACCTTCACCTTATACCTGGAGACT-CCCAA  443
            ||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||.|||.|.|| || |||||
Sbjct  371  TCATAAAGGGAGATGATGGGACTAGAGGAGTAACTGGACGTTTCACCTTCACCTTACACCCGAAG-CTGCCCAA  443

Query  444  GCCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAAACTG---TGATCTTAACCTGTGATCCTG  514
            |||||.||||.|||.||.|||||||||||||||||||...|.|||   ||   |.|.|||.||||||||.|||.
Sbjct  444  GCCCTACATCACCATCAACAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGA---TGTCTTAAACTTCACCTGTGAACCTA  514

Query  515  AGACTCCGGAC-ACAAGCTACCAGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGGTTTCAGCTGTC  587
            |||.|..|.|| || |.||||...||||||.|.|||||||||||||||||..|.|.||.||||.|..||| |.|
Sbjct  515  AGAGTGAGAACTAC-ACCTACATTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGC-GAC  586

Query  588  C----GAAACCAACAGGACCCTCTTTCTATTTGGTGTCAC---AAAGTATACTGCAGGACCCTATGAATGTGAA  654
            |    |||   |||||||.||||.|||||....|||||||   |||..|.|   |||||||||||.||||||||
Sbjct  587  CCATTGAA---AACAGGATCCTCATTCTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAA---CAGGACCCTATCAATGTGAA  654

Query  655  ATACGGAACTCAGGGA----GTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCATGGTCCAGACCTCC  724
            ||||||.||    .||    |||.||.|||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct  655  ATACGGGAC----CGATATGGTGGCATCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCC  724

Query  725  CCAGAATTCACCCTTCATACACCAATTACCGTTCAGGAGATAACCTCTACTTGTCTTGCTTC-GCGAACTCTAA  797
            ||||||||.|||||||||.||||.||||||||||||||||...||||||||||||.|| ||| |||.|||||||
Sbjct  725  CCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTTCAGGAGAAGTCCTCTACTTGTCCTG-TTCTGCGGACTCTAA  797

Query  798  CCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGGGAAGTTTCAGCAATCAGGACAAAATCTGTTTATCCCCCAAA  871
            ||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||.|.||||||||||.||.|||||||.|||.|
Sbjct  798  CCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGAAAAGTTTCAGCTACCAGGACAAAAGCTCTTTATCCGCCATA  871

Query  872  TTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGTTTGCTCTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCGAGGAAAGCTCCACGTCG  945
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||..||.
Sbjct  872  TTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGTTTGCTCTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCC  945

Query  946  TTGACAGTCAAAGTCTCTGCTTCTACAAG--------------------AATAGGACTTCTTCCTCTCCTTATC  999
            .||||||||.|||||||||.|     |||                    ||||||..||               
Sbjct  946  ATGACAGTCGAAGTCTCTGGT-----AAGTGGATCCCAGCATCGTTGGCAATAGGGTTT---------------  999

Query 1000  CAACA  1004
                 
Sbjct 1000  -----  999