Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475492
• Subject: XM_011512000.2
• Aligned Length: 1430
• Identities: 1327
• Gaps: 88

Alignment

Query    1  ---------------------------------ATGCTTTTCGGAATATTCGCTTGGGGGCTCCTCTTTTTGCT  41
                                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAACCACACTTGAAGCAATGGAGACAACGAATGCTTTTCGGAATATTCGCTTGGGGGCTCCTCTTTTTGCT  74

Query   42  GATTTTCATCTACTTCACCGACAGCAACCCCGCTGAGCCTGTACCCAGCTCCCTCTCCTTCCTGGAGACCAGGA  115
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GATTTTCATCTACTTCACCGACAGCAACCCCGCTGAGCCTGTACCCAGCTCCCTCTCCTTCCTGGAGACCAGGA  148

Query  116  GGCTCCTGCCGGTGCAGGGGAAGCAGCGGGCCATCATGGGCGCCGCACATGAGCCCTCCCCGCCTGGGGGCCTG  189
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGCTCCTGCCGGTGCAGGGGAAGCAGCGGGCCATCATGGGCGCCGCACATGAGCCCTCCCCGCCTGGGGGCCTG  222

Query  190  GACGCACGCCAGGCGCTGCCCCGCGCCCACCCAGCCGGTTCCTTTCATGCGGGGCCTGGAGACCTGCAGAAATG  263
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACGCACGCCAGGCGCTGCCCCGCGCCCACCCAGCCGGTTCCTTTCATGCGGGGCCTGGAGACCTGCAGAAATG  296

Query  264  GGCCCAGTCCCAAGATGGGTTTGAACATAAAGAGTTTTTTTCATCCCAGGTGGGGAGAAAATCTCAAAGTGCTT  337
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGCCCAGTCCCAAGATGGGTTTGAACATAAAGAGTTTTTTTCATCCCAGGTGGGGAGAAAATCTCAAAGTGCTT  370

Query  338  TCTACCCGGAGGATGACGACTACTTTTTTGCTGCTGGTCAGCCAGGGTGGCACAGCCACACTCAGGGGACATTG  411
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCTACCCGGAGGATGACGACTACTTTTTTGCTGCTGGTCAGCCAGGGTGGCACAGCCACACTCAGGGGACATTG  444

Query  412  GGATTCCCTTCCCCCGGGGAGCCAGGCCCACGGGAGGGGGCTTTTCCGGCTGCACAGGTCCAGAGGAGGCGGGT  485
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGATTCCCTTCCCCCGGGGAGCCAGGCCCACGGGAGGGGGCTTTTCCGGCTGCACAGGTCCAGAGGAGGCGGGT  518

Query  486  GAAGAAGAGGCACCGGAGGCAGAGAAGGAGCCACGTGTTGGAGGAGGGCGACGACGGCGACAGGCTGTACTCCT  559
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAAGAAGAGGCACCGGAGGCAGAGAAGGAGCCACGTGTTGGAGGAGGGCGACGACGGCGACAGGCTGTACTCCT  592

Query  560  CCATGTCCAGGGCCTTCCTGTACCGGCTCTGGAAGGGGAACGTCTCTTCCAAAATGCTGAACCCGCGCCTGCAG  633
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCATGTCCAGGGCCTTCCTGTACCGGCTCTGGAAGGGGAACGTCTCTTCCAAAATGCTGAACCCGCGCCTGCAG  666

Query  634  AAGGCGATGAAGGATTACCTGACCGCCAACAAGCACGGGGTGCGCTTCCGCGGGAAGCGGGAGGCCGGGCTGAG  707
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGGCGATGAAGGATTACCTGACCGCCAACAAGCACGGGGTGCGCTTCCGCGGGAAGCGGGAGGCCGGGCTGAG  740

Query  708  CAGGGCACAGCTGCTGTGCCAGCTGCGGAGCCGCGCGCGCGTGCGGACGCTGGACGGCACCGAGGCGCCCTTTT  781
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAGGGCACAGCTGCTGTGCCAGCTGCGGAGCCGCGCGCGCGTGCGGACGCTGGACGGCACCGAGGCGCCCTTTT  814

Query  782  CTGCGCTGGGCTGGCGGCGCCTGGTGCCCGCCGTGCCCCTGAGCCAGCTGCACCCCCGCGGCCTGCGCAGCTGC  855
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTGCGCTGGGCTGGCGGCGCCTGGTGCCCGCCGTGCCCCTGAGCCAGCTGCACCCCCGCGGCCTGCGCAGCTGC  888

Query  856  GCTGTCGTCATGTCTGCAGGCGCAATCCTCAACTCTTCCTTGGGCGAGGAAATAGATTCTCATGATGCGGTTTT  929
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCTGTCGTCATGTCTGCAGGCGCAATCCTCAACTCTTCCTTGGGCGAGGAAATAGATTCTCATGATGCGGTTTT  962

Query  930  GAGATTTAACTCTGCTCCTACACGTGGTTATGAGAAAGATGTTGGGAATAAAACCACCATACGCATCATTAATT  1003
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAGATTTAACTCTGCTCCTACACGTGGTTATGAGAAAGATGTTGGGAATAAAACCACCATACGCATCATTAATT  1036

Query 1004  CGCAGATTCTGACCAACCCCAGCCATCACTTCATTGACAGTTCACTGTATAAAGACGTCATTTTGGTGGCCTGG  1077
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CGCAGATTCTGACCAACCCCAGCCATCACTTCATTGACAGTTCACTGTATAAAGACGTCATTTTGGTGGCCTGG  1110

Query 1078  GACCCTGCCCCATATTCCGCAAATCTTAACCTGTGGTACAAAAAACCGGATTACAACCTGTTCACTCCATATAT  1151
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GACCCTGCCCCATATTCCGCAAATCTTAACCTGTGGTACAAAAAACCGGATTACAACCTGTTCACTCCATATAT  1184

Query 1152  TCAGCATCGTCAGAGAAACCCAAATCAGCCATTTTACATTCTTCATCCTAAATTTATATGGCAGCTCTGGGATA  1225
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCAGCATCGTCAGAGAAACCCAAATCAGCCATTTTACATTCTTCATCCTAAATTTATATGGCAGCTCTGGGATA  1258

Query 1226  TTATCCAGGAGAACACTAAAGAGAAGATTCAACCAAACCCACCATCTTCTGGTTTCATTG----GCTCATTTGT  1295
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||        
Sbjct 1259  TTATCCAGGAGAACACTAAAGAGAAGATTCAACCAAACCCACCATCTTCTGGTTTCATTGCACTGC--------  1324

Query 1296  AAAAATTGGCCAT-ATCAGA------------GCTTGCAGTGAGC-CGAGATCACGCGACTGCACTCCAGCCTG  1355
                 ||||.||| .|||.|            ||||.|||.||.| .|.|||| .|.||..|      |||..|
Sbjct 1325  -----TTGGGCATCCTCACAACATGGCAGCTGGCTTCCAGAGAACGGGGGATC-TGAGAAAG------AGCAAG  1386

Query 1356  GACGACAGAG--------------  1365
            ||.||   ||              
Sbjct 1387  GAGGA---AGGCCCAATGTTTTTA  1407