Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475494
• Subject: NM_144538.2
• Aligned Length: 1156
• Identities: 979
• Gaps: 16

Alignment

Query    1  ATGTGGAGCGGCCCACCCCAGCCAGACCAGGGCCTCCC----GCCGCCCCTTGCAGCTGTCCCGGTCCCCTGGA  70
            |||||||||||||.||||||.|.||||.||||||||||    |  |||.||  |.|||.||||.||||||||||
Sbjct    1  ATGTGGAGCGGCCAACCCCAACAAGACGAGGGCCTCCCTGTGG--GCCTCT--CTGCTATCCCAGTCCCCTGGA  70

Query   71  AGAGCACGGACCCCTGCCAAGGCCACAGGGAGTCCCCAGGAGCCCTGGTGGAGACCT---CTGCAGGGGAGGAG  141
            |.|.|...|.||||.||.||.|..|||||||||||.||||||.||||||.||..|||   ||.|..||||||||
Sbjct   71  AAAACCTAGGCCCCAGCAAAAGTAACAGGGAGTCCTCAGGAGGCCTGGTAGAAGCCTCCACTTCCTGGGAGGAG  144

Query  142  GCCCAAGGCCAGGAGGGCCCCGCAGCCGC-CCAGCTGGACGTGTTGCGCCTGCGCAGCTCTTCCATGGAGATCC  214
            |||||.||..||||...|||.|||.|.|| ||| |||||.||||..|||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  145  GCCCAGGGTGAGGAACACCCGGCACCTGCTCCA-CTGGATGTGTCACGCCTGCGCAGTTCCTCCATGGAGATCC  217

Query  215  GAGAGAAGGGCTCCGAGTTCCTGAAGGAGGAGCTGCACAGAGCGCAGAAGGAGCTGAAGCTAAAGGACGAGGAA  288
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||..|||.|||.|||||||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct  218  GAGAGAAGGGCTCCGAGTTCCTAAAGGAGGAGCTATACAAAGCCCAGAAGGAGCTGAAGCTAAAGGATGAAGAG  291

Query  289  TGTGAGCGGCTGTCCAAGGTGCGGGAGCAGCTAGAACAGGAGCTGGAAGAGCTGACGGCCAGCCTGTTTGAGGA  362
            |||||.|||||.|.|||.||.||.|..|||||.||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  292  TGTGAACGGCTTTGCAAAGTACGTGCACAGCTGGAGCAGGAGCTTGAGGAGCTGACAGCCAGCCTGTTTGAGGA  365

Query  363  AGCTCACAAGATGGTTCGAGAAGCCAACATGAAGCAGGCGGCATCAGAAAAGCAGCTGAAGGAGGCTCGGGGCA  436
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||.|||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  366  AGCTCACAAGATGGTTCGGGAAGCCAACATGAAGCAGGCGACATCGGAAAAGCAGTTGAAGGAGGCTTGGGGCA  439

Query  437  AGATCGACATGCTGCAGGCAGAGGTGACAGCCTTGAAGACACTGGTCATCACGTCCACACCAGCCTCTCCCAAC  510
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  440  AGATCGACATGCTACAGGCAGAGGTGACAGCCTTGAAGACATTGGTCATCACATCCACACCAGCCTCTCCCAAC  513

Query  511  CGCGAGCTTCACCCCCAGCTGCTGAGCCCCACCAAGGCCGGGCCCCGAAAGGGCCACTCTCGCCACAAGAGCAC  584
            ||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct  514  CGTGAGCTCCACCCACAGCTGCTGAGCCCCACCAAAGCTGGACCCCGAAAGGGCCACTCACGTCAAAAGAGCAC  587

Query  585  CAGCAGCACCCTCTGCCCCGCCGTGTGTCCCGCTGCGGGACACA-CCCTCACCCCAGACAGAGAGGGCAAGGAG  657
            |||||||.||||||||||.|..|||||.|||.||||.||.||.| |||| |||||.||||.|||.|||||||||
Sbjct  588  CAGCAGCTCCCTCTGCCCTGTTGTGTGCCCCACTGCAGGGCATATCCCT-ACCCCTGACAAAGAAGGCAAGGAG  660

Query  658  GTGGACACAATCCTGTTTGCAGAGTTCCAGGCCTGGAGGGAATCCCCCCACCCTGGACAAGACCTGCCCCTTCC  731
            |||||.||.|..|||||||||||||||||.||.|||||.| .|.|.||.||||||||.||||.|||||||||||
Sbjct  661  GTGGATACGACGCTGTTTGCAGAGTTCCAAGCTTGGAGAG-CTTCACCTACCCTGGATAAGAGCTGCCCCTTCC  733

Query  732  TGGAAAGGGTGTACCGAGAGGACGTGGGCCCCTGCCTGGACTTCACAATGCAGGAGCTCTCGGTGCTGGTACGG  805
            |.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||.|||||||||||||.|..|||||.|||
Sbjct  734  TAGAAAGGGTGTACCGGGAGGACGTGGGCCCTTGCCTTGACTTCACAGTGCAGGAGCTCTCAGCTCTGGTTCGG  807

Query  806  GCCGCCGTGGAGGACAACACGCTCACCATTGAGCCGGTGGCTTCGCAGACGCTGCCCACAGTGAAGGTGGCCGA  879
            .|.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||.|.|||||||||.||..
Sbjct  808  ACTGCTGTGGAGGACAACACACTCACCATTGAGCCTGTGGCTTCACAGACACTGCCCGCTGTGAAGGTGCCCAC  881

Query  880  GGTTGACTGTAGCAGCACCAACACATGTGCCCTGAGCGGGCTGACCCGCACCTGCCGCCACCGAATCCGGCTCG  953
            .|||||.||||.||.|||||||||||||||||||||.||.|||.|.||.|||||||.|||.||||||||.||.|
Sbjct  882  TGTTGAGTGTAACAACACCAACACATGTGCCCTGAGTGGCCTGGCACGTACCTGCCACCATCGAATCCGCCTGG  955

Query  954  GGGACTCCAAAAGCCATTACTACATCTCGCCATCTTCCCGGGCCAGGATCACCGCAGTGTGCAACTTCTTCACC  1027
            |||||||..|.|||||.||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  956  GGGACTCTGACAGCCACTATTACATCTCACCGTCCTCCCGGGCCAGGATCACCGCAGTATGCAACTTCTTCACC  1029

Query 1028  TACATCCGCTACATCCAGCAAGGCCTGGTGCGGCAGGACGCAGAGCCCATGTTCTGGGAGATCATGAGGTTGCG  1101
            ||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||.|.||
Sbjct 1030  TATATTCGCTACATCCAGCAAGGTCTGGTTCGGCAGGATGCTGAGCCGATGTTCTGGGAGATCATGAGGCTTCG  1103

Query 1102  GAAGGAGATGTCACTGGCCAAGCTCGGCTTCTTCCCCCAGGAGGCT  1147
            |||||..||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 1104  GAAGGGCATGTCACTAGCCAAGCTTGGCTTCTTCCCCCAGGAGGCC  1149