Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475532
• Subject: XM_024453340.1
• Aligned Length: 1671
• Identities: 1332
• Gaps: 339

Alignment

Query    1  ATGAAGAAGATGAGCAACATTTATGAGTCCGCTGCCAACACACTGGGAATCTTTAACAGCCCCTGCCTGACCAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AGTTGAGCTGCGTGTGGCGTGCAAAGGCATTTCTGACAGAGATGCCCTTTCCAAACCAGACCCCTGTGTCATCC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TCAAGATGCAGTCTCATGGGCAGTGGTTTGAGGTTGACAGGACTGAGGTGATTCGCACCTGCATAAACCCAGTG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TACTCAAAACTGTTTACTGTGGACTTTTACTTTGAGGAGGTGCAGCGCCTGCGGTTTGAAGTCCATGACATCAG  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CAGCAACCACAATGGGCTGAAGGAGGCCGACTTCCTTGGTGGCATGGAGTGCACACTTGGCCAGATTGTTTCCC  370
                                                       |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------------------------ATGGAGTGCACACTTGGCCAGATTGTTTCCC  31

Query  371  AGAGAAAGCTGTCCAAATCCTTGCTGAAGCATGGGAACACAGCAGGGAAATCTTCCATCACGGTGATTGCTGAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   32  AGAGAAAGCTGTCCAAATCCTTGCTGAAGCATGGGAACACAGCAGGGAAATCTTCCATCACGGTGATTGCTGAA  105

Query  445  GAATTATCTGGCAATGACGACTATGTTGAGCTTGCATTCAATGCACGGAAATTGGATGACAAGGATTTCTTCAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  106  GAATTATCTGGCAATGACGACTATGTTGAGCTTGCATTCAATGCACGGAAATTGGATGACAAGGATTTCTTCAG  179

Query  519  TAAATCTGACCCATTTCTGGAAATTTTTCGTATGAATGATGATGCAACTCAGCAGCTGGTGCACCGAACTGAGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  180  TAAATCTGACCCATTTCTGGAAATTTTTCGTATGAATGATGATGCAACTCAGCAGCTGGTGCACCGAACTGAGG  253

Query  593  TTGTGATGAATAACTTAAGCCCAGCCTGGAAATCATTCAAAGTATCTGTAAATTCTCTATGCAGCGGAGACCCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  254  TTGTGATGAATAACTTAAGCCCAGCCTGGAAATCATTCAAAGTATCTGTAAATTCTCTATGCAGCGGAGACCCA  327

Query  667  GACCGCCGGCTAAAGTGCATAGTATGGGACTGGGACTCCAATGGCAAGCATGACTTCATTGGAGAATTCACCTC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  328  GACCGCCGGCTAAAGTGCATAGTATGGGACTGGGACTCCAATGGCAAGCATGACTTCATTGGAGAATTCACCTC  401

Query  741  GACATTCAAGGAGATGAGAGGAGCAATGGAAGGGAAACAGGTGCAGTGGGAGTGCATCAATCCCAAGTACAAAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  402  GACATTCAAGGAGATGAGAGGAGCAATGGAAGGGAAACAGGTGCAGTGGGAGTGCATCAATCCCAAGTACAAAG  475

Query  815  CCAAGAAGAAGAATTACAAGAACTCAGGCACTGTGATTCTGAATCTGTGCAAGATTCACAAGATGCATTCTTTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  476  CCAAGAAGAAGAATTACAAGAACTCAGGCACTGTGATTCTGAATCTGTGCAAGATTCACAAGATGCATTCTTTC  549

Query  889  TTGGACTACATCATGGGTGGCTGCCAAATCCAGTTTACAGTAGCTATAGATTTCACTGCCTCAAACGGGGACCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  550  TTGGACTACATCATGGGTGGCTGCCAAATCCAGTTTACAGTAGCTATAGATTTCACTGCCTCAAACGGGGACCC  623

Query  963  CAGGAACAGCTGTTCCTTGCACTACATCCACCCTTACCAACCCAATGAGTATCTGAAAGCTTTGGTAGCTGTGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  624  CAGGAACAGCTGTTCCTTGCACTACATCCACCCTTACCAACCCAATGAGTATCTGAAAGCTTTGGTAGCTGTGG  697

Query 1037  GGGAGATTTGCCAAGACTATGACAGTGACAAAATGTTCCCTGCCTTTGGGTTTGGCGCCAGGATACCTCCAGAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  698  GGGAGATTTGCCAAGACTATGACAGTGACAAAATGTTCCCTGCCTTTGGGTTTGGCGCCAGGATACCTCCAGAG  771

Query 1111  TACACGGTCTCTCATGACTTTGCAATCAACTTTAATGAAGACAACCCAGAATGTGCAGGAATTCAAGGAGTTGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  772  TACACGGTCTCTCATGACTTTGCAATCAACTTTAATGAAGACAACCCAGAATGTGCAGGAATTCAAGGAGTTGT  845

Query 1185  GGAAGCCTATCAGAGCTGTCTTCCTAAGCTCCAACTCTACGGTCCCACCAACATTGCCCCCATCATCCAGAAGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  846  GGAAGCCTATCAGAGCTGTCTTCCTAAGCTCCAACTCTACGGTCCCACCAACATTGCCCCCATCATCCAGAAGG  919

Query 1259  TTGCCAAGTCAGCGTCAGAGGAAACTAACACCAAGGAGGCATCGCAATACTTCATCCTGCTGATCCTGACAGAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  920  TTGCCAAGTCAGCGTCAGAGGAAACTAACACCAAGGAGGCATCGCAATACTTCATCCTGCTGATCCTGACAGAT  993

Query 1333  GGTGTTATCACAGACATGGCCGACACCCGGGAGGCCATTGTCCATGCCTCCCACCTCCCCATGTCAGTCATCAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  994  GGTGTTATCACAGACATGGCCGACACCCGGGAGGCCATTGTCCATGCCTCCCACCTCCCCATGTCAGTCATCAT  1067

Query 1407  CGTGGGAGTAGGGAACGCTGACTTCAGTGACATGCAGATGCTGGACGGTGATGATGGGATTCTGAGGTCACCCA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1068  CGTGGGAGTAGGGAACGCTGACTTCAGTGACATGCAGATGCTGGACGGTGATGATGGGATTCTGAGGTCACCCA  1141

Query 1481  AGGGAGAGCCTGTTCTTCGAGACATCGTCCAGTTCGTGCCCTTCAGGAACTTCAAACACGCATCTCCAGCTGCC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1142  AGGGAGAGCCTGTTCTTCGAGACATCGTCCAGTTCGTGCCCTTCAGGAACTTCAAACACGCATCTCCAGCTGCC  1215

Query 1555  CTGGCAAAGAGCGTGCTGGCTGAAGTCCCAAACCAAGTTGTGGACTATTACAATGGCAAAGGAATTAAACCAAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1216  CTGGCAAAGAGCGTGCTGGCTGAAGTCCCAAACCAAGTTGTGGACTATTACAATGGCAAAGGAATTAAACCAAA  1289

Query 1629  ATGTTCATCAGAAATGTATGAATCTTCCAGAACACTAGCACCA  1671
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1290  ATGTTCATCAGAAATGTATGAATCTTCCAGAACACTAGCACCA  1332