Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000475541
- Subject:
- XM_011250978.2
- Aligned Length:
- 1677
- Identities:
- 1379
- Gaps:
- 159
Alignment
Query 1 ATGGCACGGTTCGGCTTGCCCGCGCTTCTCTGCACCCTGGCAGTGCTCAGCGCCGCGCTGCTGGCTGCCGAGCT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CAAGTCGAAAAGTTGCTCGGAAGTGCGACGTCTTTACGTGTCCAAAGGCTTCAACAAGAACGATGCCCCCCTCC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 ACGAGATC-----AACGGTGATCATTTGAAGATCTGTCCCCAGGGTTCTACCTGCTGCTCTCAAGAGATGGAGG 217
|.|| ||| ||.|||||.||||||||||||||||||||||.||.|||.|||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1 ATGA-ATCATTTAAAAGGTGACCATTTGAAGATCTGTCCCCAGGATTATACATGCTGTTCTCAAGAGATGGAAG 73
Query 218 AGAAGTACAGCCTGCAAAGTAAAGATGATTTCAAAAGTGTGGTCAGCGAACAGTGCAATCATTTGCAAGCTGTC 291
||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||.|||||||||||..||
Sbjct 74 AGAAGTACAGCCTGCAAAGTAAAGATGATTTCAAAACCGTGGTCAGCGAACAGTGCAACCATTTGCAAGCCATC 147
Query 292 TTTGCTTCACGTTACAAGAAGTTTGATGAATTCTTCAAAGAACTACTTGAAAATGCAGAGAAATCCCTGAATGA 365
|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 148 TTTGCATCCCGTTACAAGAAGTTTGATGAATTCTTCAAAGAACTTCTTGAAAATGCAGAGAAATCCCTGAATGA 221
Query 366 TATGTTTGTGAAGACATATGGCCATTTATACATGCAAAATTCTGAGCTATTTAAAGATCTCTTCGTAGAGTTGA 439
||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 222 TATGTTCGTGAAGACATATGGCCACTTATACATGCAAAATTCAGAGCTATTTAAAGATCTCTTCGTTGAGTTGA 295
Query 440 AACGTTACTACGTGGTGGGAAATGTGAACCTGGAAGAAATGCTAAATGACTTCTGGGCTCGCCTCCTGGAGCGG 513
|.||.|||||.||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 296 AGCGCTACTATGTGGCGGGAAATGTGAACCTGGAAGAAATGTTAAATGACTTCTGGGCTCGCCTTCTGGAGCGC 369
Query 514 ATGTTCCGCCTGGTGAACTCCCAGTACCACTTTACAGATGAGTATCTGGAATGTGTGAGCAAGTATACGGAGCA 587
|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||..||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 370 ATGTTTCGCCTGGTGAACTCCCAGTACCATTTTACAGATGAGTACTTGGAATGTGTGAGCAAATATACAGAGCA 443
Query 588 GCTGAAGCCCTTCGGAGATGTCCCTCGCAAATTGAAGCTCCAGGTTACTCGTGCTTTTGTAGCAGCCCGTACTT 661
|||||||||.||.||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||.|.||.|
Sbjct 444 GCTGAAGCCTTTTGGAGATGTCCCTCGGAAACTGAAGCTCCAGGTTACCCGCGCATTTGTTGCAGCCAGGACCT 517
Query 662 TCGCTCAAGGCTTAGCGGTTGCGGGAGATGTCGTGAGCAAGGTCTCCGTGGTAAACCCCACAGCCCAGTGTACC 735
||||||||||||||||.|||||..|.|||||.||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct 518 TCGCTCAAGGCTTAGCAGTTGCAAGGGATGTAGTAAGCAAAGTGTCCGTGGTGAACCCCACAGCTCAGTGCACC 591
Query 736 CATGCCCTGTTGAAGATGATCTACTGCTCCCACTGCCGGGGTCTCGTGACTGTGAAGCCATGTTACAACTACTG 809
|||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 592 CATGCACTGCTGAAGATGATCTACTGCTCCCACTGCCGGGGCCTGGTGACTGTGAAGCCCTGTTACAACTATTG 665
Query 810 CTCAAACATCATGAGAGGCTGTTTGGCCAACCAAGGGGATCTCGATTTTGAATGGAACAATTTCATAGATGCTA 883
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 666 CTCAAACATCATGCGAGGCTGTTTGGCCAACCAAGGAGACCTTGATTTTGAGTGGAACAATTTCATAGATGCTA 739
Query 884 TGCTGATGGTGGCAGAGAGGCTAGAGGGTCCTTTCAACATTGAATCGGTCATGGATCCCATCGATGTGAAGATT 957
||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 740 TGCTGATGGTGGCAGAGAGGCTGGAGGGTCCTTTCAACATTGAGTCCGTTATGGATCCCATCGATGTGAAGATT 813
Query 958 TCTGATGCTATTATGAACATGCAGGATAATAGTGTTCAAGTGTCTCAGAAGGTTTTCCAGGGATGTGGACCCCC 1031
|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||
Sbjct 814 TCTGATGCTATCATGAATATGCAGGATAATAGTGTTCAAGTGTCTCAGAAGGTTTTCCAAGGCTGTGGCCCTCC 887
Query 1032 CAAGCCCCTCCCAGCTGGACGAATTTCTCGTTCCATCTCTGAAAGTGCCTTCAGTGCTCGCTTCAGACCACATC 1105
.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||..|||
Sbjct 888 GAAGCCTCTCCCAGCTGGACGAATTTCTCGCTCCATCTCTGAAAGTGCCTTCAGTGCTCGATTCAGACCTTATC 961
Query 1106 ACCCCGAGGAACGCCCAACCACAGCAGCTGGCACTAGTTTGGACCGACTGGTTACTGATGTCAAGGAGAAACTG 1179
|.||.|||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 ATCCAGAGCAACGCCCAACCACGGCAGCTGGCACTAGTTTGGACCGACTGGTTACTGATGTCAAGGAGAAACTG 1035
Query 1180 AAACAGGCCAAGAAATTCTGGTCCTCCCTTCCGAGCAACGTTTGCAACGATGAGAGGATGGCTGCAGGAAACGG 1253
|||||.||.|||||.|||||||||||.||.||.||||.|||||||||.||||||||||||||.||||||||.|.
Sbjct 1036 AAACAAGCTAAGAAGTTCTGGTCCTCTCTCCCAAGCACCGTTTGCAATGATGAGAGGATGGCAGCAGGAAATGA 1109
Query 1254 CAATGAGGATGACTGTTGGAATGGGAAAGGCAAAAGCAGGTACCTGTTTGCAGTGACAGGAAATGGATTAGCCA 1327
.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1110 AAATGAGGATGACTGCTGGAATGGCAAAGGCAAAAGCAGGTACCTGTTTGCAGTGACAGGAAATGGATTGGCCA 1183
Query 1328 ACCAGGGCAACAACCCAGAGGTCCAGGTTGACACCAGCAAACCAGACATACTGATCCTTCGTCAAATCATGGCT 1401
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1184 ACCAGGGCAACAACCCAGAAGTCCAGGTTGACACCAGCAAGCCAGACATACTGATCCTTCGTCAGATCATGGCC 1257
Query 1402 CTTCGAGTGATGACCAGCAAGATGAAGAATGCATACAATGGGAACGACGTGGACTTCTTTGATATCAGTGATGA 1475
|||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1258 CTTCGGGTTATGACCAGTAAAATGAAGAATGCTTACAATGGAAATGACGTGGACTTCTTTGACATCAGTGATGA 1331
Query 1476 AAGTAGTGGAGAAGGAAGTGGAAGTGGCTGTGAGTATCAGCAGTGCCCTTCAGAGTTTGACTACAATGCCACTG 1549
.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||
Sbjct 1332 GAGTAGTGGAGAGGGAAGTGGAAGCGGATGTGAATATCAGCAGTGCCCTTCGGAGTTCGAGTACAACGCCACTG 1405
Query 1550 ACCATGCTGGGAAGAGTGCCAATGAGAAAGCCGACAGTGC---TGGTGTCCGTCCTGGGGCACAGGCCTACCTC 1620
|||||.||||||||||||||||.||||||||.|||||||| |||||.||.|.|.|.||||.||.||||||||
Sbjct 1406 ACCATTCTGGGAAGAGTGCCAACGAGAAAGCTGACAGTGCCGGTGGTGCCCATGCAGAGGCAAAGCCCTACCTC 1479
Query 1621 CTCACTGTCT-TCTGCATCTTGTTCCTGGTTATGCAGAGAGAGTGGAGA 1668
|||.||| || ||||||||.||||.||.|.|.|||||.|||||||||||
Sbjct 1480 CTCGCTG-CTCTCTGCATCCTGTTTCTCGCTGTGCAGGGAGAGTGGAGA 1527