Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475548
• Subject: XM_005260835.3
• Aligned Length: 1095
• Identities: 837
• Gaps: 258

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTCGAAATCATTTTTTCCATGGTTTGGACTGGATATCGGTGGAACTCTGGTCAAGCTGGTATATTTTGAACC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CAAAGACATCACTGCTGAAGAAGAAGAGGAAGAAGTGGAAAGTCTTAAAAGCATTCGGAAGTACCTGACCTCCA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  ATGTGGCTTATGGGTCTACAGGCATTCGGGACGTGCACCTCGAGCTGAAGGACCTGACTCTGTGTGGACGCAAA  222

Query    1  ------------------------------------ATGCCTGCTTTTATTCAAATGGGCAGAGATAAAAACTT  38
                                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGCAATCTGCACTTTATACGCTTTCCCACTCATGACATGCCTGCTTTTATTCAAATGGGCAGAGATAAAAACTT  296

Query   39  CTCGAGTCTCCACACTGTCTTTTGTGCCACTGGAGGTGGAGCGTACAAATTTGAGCAGGATTTTCTCACAATAG  112
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTCGAGTCTCCACACTGTCTTTTGTGCCACTGGAGGTGGAGCGTACAAATTTGAGCAGGATTTTCTCACAATAG  370

Query  113  GTGATCTTCAGCTTTGCAAACTGGATGAACTAGATTGCTTGATCAAAGGAATTTTATACATTGACTCAGTCGGA  186
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GTGATCTTCAGCTTTGCAAACTGGATGAACTAGATTGCTTGATCAAAGGAATTTTATACATTGACTCAGTCGGA  444

Query  187  TTCAATGGACGGTCACAGTGCTATTACTTTGAAAACCCTGCTGATTCTGAAAAGTGTCAGAAGTTACCATTTGA  260
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTCAATGGACGGTCACAGTGCTATTACTTTGAAAACCCTGCTGATTCTGAAAAGTGTCAGAAGTTACCATTTGA  518

Query  261  TTTGAAAAATCCGTATCCTCTGCTTCTGGTGAACATTGGCTCAGGGGTTAGCATCTTAGCAGTATATTCCAAAG  334
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTTGAAAAATCCGTATCCTCTGCTTCTGGTGAACATTGGCTCAGGGGTTAGCATCTTAGCAGTATATTCCAAAG  592

Query  335  ATAATTACAAACGGGTCACAGGTACTAGTCTTGGAGGAGGAACTTTTTTTGGTCTCTGCTGTCTTCTTACTGGC  408
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATAATTACAAACGGGTCACAGGTACTAGTCTTGGAGGAGGAACTTTTTTTGGTCTCTGCTGTCTTCTTACTGGC  666

Query  409  TGTACCACTTTTGAAGAAGCTCTTGAAATGGCATCTCGTGGAGATAGCACCAAAGTGGATAAACTAGTACGAGA  482
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TGTACCACTTTTGAAGAAGCTCTTGAAATGGCATCTCGTGGAGATAGCACCAAAGTGGATAAACTAGTACGAGA  740

Query  483  TATTTATGGAGGGGACTATGAGAGGTTTGGACTGCCAGGCTGGGCTGTGGCTTCAAGCTTTGGAAACATGATGA  556
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TATTTATGGAGGGGACTATGAGAGGTTTGGACTGCCAGGCTGGGCTGTGGCTTCAAGCTTTGGAAACATGATGA  814

Query  557  GCAAGGAGAAGCGAGAGGCTGTCAGTAAAGAGGACCTGGCCAGAGCGACTTTGATCACCATCACCAACAACATT  630
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCAAGGAGAAGCGAGAGGCTGTCAGTAAAGAGGACCTGGCCAGAGCGACTTTGATCACCATCACCAACAACATT  888

Query  631  GGCTCAATAGCAAGAATGTGTGCCCTTAATGAAAACATTAACCAGGTGGTATTTGTTGGAAATTTCTTGAGAAT  704
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGCTCAATAGCAAGAATGTGTGCCCTTAATGAAAACATTAACCAGGTGGTATTTGTTGGAAATTTCTTGAGAAT  962

Query  705  TAATACGATCGCCATGCGGCTTTTGGCATATGCTTTGGATTATTGGTCCAAGGGGCAGTTGAAAGCACTTTTTT  778
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TAATACGATCGCCATGCGGCTTTTGGCATATGCTTTGGATTATTGGTCCAAGGGGCAGTTGAAAGCACTTTTTT  1036

Query  779  CGGAACACGAGGGTTATTTTGGAGCTGTTGGAGCACTCCTTGAGCTGTTGAAGATCCCG  837
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CGGAACACGAGGGTTATTTTGGAGCTGTTGGAGCACTCCTTGAGCTGTTGAAGATCCCG  1095