Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475558
• Subject: NM_133995.4
• Aligned Length: 1188
• Identities: 974
• Gaps: 45

Alignment

Query    1  ATGGCGGGCGCTGAGTGGAAGTCGCTGGAGGAATGCTTGGAGAAGCACCTGCCGCTCCCCGACTTG---CAGGA  71
            ||||||||..|.||||||.||||.||||||.|.|||.||||.||.||.|||||||....|||.|||   |||  
Sbjct    1  ATGGCGGGACCGGAGTGGCAGTCCCTGGAGCAGTGCCTGGAAAAACATCTGCCGCCTGACGATTTGGCCCAG--  72

Query   72  AGTGAAGCGCGTTCTCTATGGCAAGGA-ACTCAGGAAGCTTGATCTGCCCAGGGAAGCTTTCGAAGCTGCCTCC  144
             ||||||||..|||||||.||||||.| ||| |||||.||.|||||||||||.||||||||..||||||||| |
Sbjct   73  -GTGAAGCGAATTCTCTACGGCAAGCAGACT-AGGAATCTCGATCTGCCCAGAGAAGCTTTAAAAGCTGCCT-C  143

Query  145  AGAGAAG--ACTTTGAACTGCAGGGATATGCCTTTGAAGCAGCGGAGGAGCAGCTGAGACGACCCCGCATTGTG  216
            ||| |||  |||||||||||.|||||||||||||.|..|||||..|||||||||.||||.|.||||..||.|||
Sbjct  144  AGA-AAGGAACTTTGAACTGAAGGGATATGCCTTCGGGGCAGCCAAGGAGCAGCAGAGATGCCCCCAGATCGTG  216

Query  217  CACGTGGGGCTGGTTCAGAACAGAATCCCCCTCCCCGCAAATGCCCCTGTGGCAGAACAGGTCTCTGCCCTTCA  290
            |.|||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|...||||||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  217  CGCGTGGGGCTCGTTCAGAACAGAATCCCGCTCCCCACTTCTGCCCCCGTGGCAGAACAGGTCTCTGCGCTCCA  290

Query  291  -TAGACGCATAAAGGCTATCGTAGAGGTGGCTGCAATGTGTGGAGTCAACATCATCTGTTTCCAGGAAGCATGG  363
             .||| |||||.|||..||.|..||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  291  CAAGA-GCATAGAGGAGATTGCTGAGGTGGCCGCAATGTGTGGAGTCAATATCATCTGTTTCCAGGAAGCATGG  363

Query  364  ACTATGCCCTTTGCCTTCTGTACGAGAGAGAAGCTTCCTTGGACAGAATTTGCTGAGTCAGCAGAGGATGGGCC  437
            |.||||||.||.||.||.|||||..|||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||.
Sbjct  364  AATATGCCGTTCGCTTTTTGTACACGAGAGAAACTTCCTTGGACAGAATTTGCTGAGTCGGCCGAGGATGGGCT  437

Query  438  CACCACCAGATTCTGTCAGAAGCTGGCGAAGAACCATGACATGGTGGTGGTGTCTCCCATCCTGGAACGAGACA  511
            |||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||..|||||||||||||||||||.|||.||||.||.||.|
Sbjct  438  CACCACCAGGTTCTGTCAGAAGCTGGCAAAGAAGCACAACATGGTGGTGGTGTCTCCAATCTTGGAGCGTGATA  511

Query  512  GCGAGCATGGGGATGTTTTGTGGAATACAGCCGTGGTGATCTCCAATTCCGGAGC-AGTCCTGGGAAAGACCAG  584
            |.||||||||||..|||.|||||||.|||||.|||||||||||||||||.|| || .|||.||||.||||||||
Sbjct  512  GAGAGCATGGGGGAGTTCTGTGGAACACAGCTGTGGTGATCTCCAATTCAGG-GCTGGTCATGGGGAAGACCAG  584

Query  585  GAAAAACCACATCCCCAGAGTGGGTGATTTCAACGAGTCAACTTACTACATGGAGGGAAACCTGGGCCACCCCG  658
            .||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  585  AAAGAACCACATCCCCAGAGTGGGAGACTTCAACGAGTCCACTTACTACATGGAGGGAAACCTGGGCCACCCCG  658

Query  659  TGTTCCAGACGCAGTTCGGAAGGATCGCGGTGAACATTTGCTACGGGCGGCACCACCCCCTCAACTGGCTTATG  732
            ||||||||||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  659  TGTTCCAGACCCAGTTTGGCAGGATTGCAGTGAACATTTGCTATGGGCGGCACCACCCCCTCAACTGGCTCATG  732

Query  733  TACAGCATCAACGGGGCTGAGATCATCTTCAACCCCTCGGCCACGATAGGAGCACTCAGCGAGTCCCTGTGGCC  806
            ||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||.||||||.||||||.|||||||
Sbjct  733  TACAGCATCAACGGAGCTGAAATCATCTTCAACCCTTCGGCCACCATTGGAGAACTCAGTGAGTCCTTGTGGCC  806

Query  807  CATCGAGGCCAGAAACGCAGCCATTGCCAATCACTGCTTCACCTGCGCCATCAATCGAGTGGG-CACCGAGCAC  879
            .|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||..||||.||.||||| || .||.|||
Sbjct  807  GATCGAAGCCAGAAATGCAGCCATTGCCAATCACTGCTTCACCTGTGCTCTCAACCGTGTGGGTCA-GGAACAC  879

Query  880  TTCCCGAACGAGTTTACCTCGGGAGATGGAAAGAAAGCTCACCAGGACTTTGGCTACTTTTATGGCTCGAGCTA  953
            |||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||.|.||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  880  TTCCCCAATGAGTTTACTTCTGGAGATGGAAAGAAAGCTCACCATGACCTCGGCTACTTCTATGGTTCGAGCTA  953

Query  954  TGTGGCAGCCCCTGACAGCAGCCGGACTCCTGGGCTGTCCCGTAGCCGGGATGGACTGCTAGTTGCTAAGCTCG  1027
            |||||||||.||.||..||||||||||.||.||.||.|||||||..|.||||||.|||||.||..|..|||||.
Sbjct  954  TGTGGCAGCTCCCGATGGCAGCCGGACCCCCGGCCTCTCCCGTAATCAGGATGGGCTGCTGGTCACGGAGCTCA  1027

Query 1028  ACCTAAACCTCTGCCAGCAGGTGAATGATGTCTGGAACTTCAAGATGACGGGCAGGTATGAGATGTACGCACGG  1101
            ||||.||.||||||||||||.|.||||||.||||||..||||||||||||||..|...|||||||||.||.|||
Sbjct 1028  ACCTCAATCTCTGCCAGCAGATCAATGATTTCTGGACTTTCAAGATGACGGGACGACTTGAGATGTATGCCCGG  1101

Query 1102  GAGCTCGCCGAAGCTGTCAAGTCCAACTACAGCCTCACCATCGTGAAAGAG-----------------------  1152
            ||.||.||||||||.|||||..||||||||||.|.||.|||.|||||.||.                       
Sbjct 1102  GAACTTGCCGAAGCGGTCAAACCCAACTACAGTCCCAACATTGTGAAGGAAGACCTGGTACTAGCCCCTAGCTC  1175

Query 1153  ----  1152
                
Sbjct 1176  GGGT  1179