Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000475651
- Subject:
- XM_006511999.3
- Aligned Length:
- 2323
- Identities:
- 1909
- Gaps:
- 107
Alignment
Query 1 ATGGCAGGATTTAAGCGAGGGTATGATGGAAAGATTGCTGGGTTATATGATCTGGATAAAACCTTGGGTCGAGG 74
||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCAGGGTTCAAGCGAGGATATGATGGGAAAATTGCTGGATTATATGATCTGGATAAAACCTTGGGTCGAGG 74
Query 75 CCATTTTGCCGTGGTTAAACTTGCCAGGCATGTCTTTACGGGTGAAAAGGTGGCAGTAAAAGTTATTGACAAGA 148
.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 75 TCATTTTGCAGTGGTCAAACTTGCCAGGCATGTCTTCACAGGTGAGAAGGTGGCAGTGAAAGTCATTGACAAGA 148
Query 149 CAAAACTGGACACTCTAGCTACTGGTCATCTTTTCCAGGAAGTGAGATGCATGAAACTAGTGCAGCATCCTAAC 222
|.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 149 CGAAGCTGGACACTCTAGCCACTGGTCATCTCTTCCAGGAAGTGAGGTGCATGAAACTAGTGCAGCACCCCAAC 222
Query 223 ATCGTCCGCCTTTATGAAGTTATTGACACCCAGACCAAACTATATCTTATTCTAGAACTTGGGGATGGAGGAGA 296
||.||.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 223 ATTGTGCGTCTCTATGAAGTCATAGACACCCAGACCAAACTTTATCTCATTCTAGAACTTGGAGATGGAGGAGA 296
Query 297 TATGTTTGATTATATAATGAAACATGAGGAGGGTCTTAATGAAGACTTGGCCAAGAAGTATTTTGCTCAGATAG 370
|||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 297 TATGTTTGATTATATAATGAAGCACGAGGAGGGTCTTAATGAAGACTTGGCCAAGAAGTACTTTGCTCAGATAG 370
Query 371 TTCATGCTATATCTTATTGCCATAAACTCCATGTGGTTCACAGAGACTTAAAACCAGAGAATGTAGTCTTCTTT 444
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 371 TTCATGCTATATCTTATTGCCATAAACTCCATGTGGTCCACAGAGACTTGAAACCAGAGAATGTAGTCTTTTTT 444
Query 445 GAAAAACAAGGTCTTGTAAAGTTGACAGACTTTGGGTTCAGCAACAAATTTCAACCAGGGAAGAAGCTCACTAC 518
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||
Sbjct 445 GAAAAACAAGGTCTTGTGAAGTTGACAGACTTTGGCTTCAGCAACAAATTTCAGCCTGGAAAGAAACTCACCAC 518
Query 519 AAGCTGTGGATCTCTTGCATATTCCGCTCCAGAAATTCTGCTTGGTGATGAGTATGATGCACCTGCAGTAGATA 592
.|||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct 519 GAGCTGCGGGTCTCTTGCATACTCTGCTCCAGAAATCCTGCTTGGCGATGAGTACGATGCCCCTGCAGTAGACA 592
Query 593 TTTGGAGTCTGGGAGTGATCCTTTTCATGTTGGTGTGTGGGCAGCCGCCCTTTCAAGAAGCCAATGACAGTGAA 666
|.|||||.|||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.
Sbjct 593 TATGGAGCCTGGGCGTGATCCTTTTCATGCTGGTGTGTGGGCAGCCACCCTTCCAAGAAGCCAACGACAGCGAG 666
Query 667 ACACTGACAATGATCATGGATTGCAAATATACAGTACCATCCCATGTGTCTAAAGAGTGTAAAGACCTAATCAC 740
||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.|||.|||..||||||..||.|||.|..|||||.|||||
Sbjct 667 ACACTGACCATGATCATGGACTGCAAGTACACGGTGCCACCCCGCGTGTCTGCAGGGTGCAGGGACCTGATCAC 740
Query 741 ACGGATGCTACAGAGAGATCCCAAGAGAAGGGCTTATTTAGAAGAGATTGAAAATCATCCTTGGCTTCAGGGAG 814
|||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.|.|.|.|||||||||||||..||.||||||||.|||||||
Sbjct 741 ACGAATGCTACAGAGAGACCCCAAAAGGAGAGCCTCTCTGGAAGAGATTGAAAGCCACCCTTGGCTCCAGGGAG 814
Query 815 TGGACCCTTCACCAGCTACAAAGTATAACATTCCCCTTGTGTCATACAAAAATCTCTCGGAAGAGGAGCACAAC 888
|||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||.||.|||||||||
Sbjct 815 TGGACCCATCACCAGCCACCAAGTATAACATTCCCCTCGTGTCCTACAAGAACCTCTCCGAGGAAGAGCACAAC 888
Query 889 AGCATCATTCAGCGCATGGTGCTTGGGGACATAGCGGATCGAGACGCCATTGTAGAAGCCCTGGAAACCAACAG 962
||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AGCATCATCCAGCGCATGGTGCTCGGGGACATCGCGGACCGAGACGCCATCGTAGAAGCCCTGGAAACCAACAG 962
Query 963 GTATAACCATATCACAGCCACATACTTCCTGCTGGCTGAAAGGATCCTGAGAGAAAAGCAAGAGAAAGAAATAC 1036
|||.|||||.||.||.|||||.|||||..|.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GTACAACCACATTACCGCCACTTACTTTTTACTTGCTGAAAGGATCCTGAGAGAAAAGCAAGAGAAAGAAATAC 1036
Query 1037 AGACCAGATCTGCAAGCCCGAGCAATATCAAGGCCCAGTTTAGGCAGTCATGGCCAACCAAAATTGATGTACCC 1110
|||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGACCAGGTCTGCTAGCCCCAGCAACATCAAGGCCCAGTTTAGGCAGTCATGGCCAACCAAAATTGATGTACCC 1110
Query 1111 CAGGACCTTGAGGATGACCTCACGGCCACTCCTTTGTCCCACGCGACTGTCCCTCAGTCTCCTGCTCGGGCTGC 1184
||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||.||||.||.||.||.|||||.||||||||||||.||||||.
Sbjct 1111 CAAGACCTTGAAGATGATCTCACTGCCACCCCTCTGTCACATGCCACAGTCCCGCAGTCTCCTGCTAGGGCTGG 1184
Query 1185 TGACAGTGTCCTCAATGGCCACAGGAGCAAAGGCCTGTGTGACTCAGCTAAGAAAGATGACCTCCCTGAGTTGG 1258
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.|||||.|||.|||
Sbjct 1185 TGACAATGTCCTCAATGGCCACAGGAGCAAAGGCCTGTGTGACCCAGCCAAGAAAGATGAGCTCCCGGAGCTGG 1258
Query 1259 CTGGACCAGCACTCTCTACGGTGCCACCCGCAAGCTTAAAACCCACAGCCAGTGGGCGGAAGTGTCTGTTCAGG 1332
||||.||.|||||.||.||.||.|||||.||||||.|.||.|||.|||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 1259 CTGGGCCGGCACTGTCCACTGTTCCACCTGCAAGCATGAAGCCCGCAGCCAGTGGGCGCAAGTGTCTCTTCAGG 1332
Query 1333 GTGGAAGAAGATGAAGAGGAAGATGAGGAGGACAAGAAACCCATGTCCCTCTCAACACAAGTGGTTTTGCGCCG 1406
||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||..|||||||.||.||.||.|||||..|||||||
Sbjct 1333 GTGGAAGAAGATGAGGAGGAGGATGAGGAGGACAAGAAGCCTGTGTCCCTGTCCACGCAGGTGGTGCTGCGCCG 1406
Query 1407 GAAGCCATCTGTAACCAACCGCCTGACATCCAGGAAGAGTGCGCCCGTCGTCAACCAGATCTTTGAGGAAGGGG 1480
|||||||||.||.|||||.||||||||.||..|.||||||||.||.||..|||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 1407 GAAGCCATCGGTCACCAATCGCCTGACGTCTCGCAAGAGTGCCCCAGTGCTCAACCAGATCTTCGAGGAGGGCG 1480
Query 1481 AATCTGACGATGAGTTTGACATGGATGAGAATCTGCCTCCCAAGTTGAGCAGGTTAAAGATGAATATAGCTTCT 1554
|.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||.|||||.||.|.||||||||.||.||.||.
Sbjct 1481 AGTCAGACGACGAGTTTGACATGGACGAGAACCTGCCGCCCAAGCTGAGCCGGCTGAAGATGAACATTGCCTCA 1554
Query 1555 CCAGGTACAGTTCACAAACGCTACCACCGGAGGAAAAGTCAGGGCCGGGGCTCCAGCTGCAGTAGTTCGGAGAC 1628
|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||
Sbjct 1555 CCAGGCACAGTGCACAAGCGCTACCACCGCAGGAAAAGCCAGGGCCGGGGCTCTAGCTGCAGCAGCTCTGAGAC 1628
Query 1629 CAGTGATGATGATTCTGAAAGCCGGCGGCGGCTCGATAAAGATAGCGGGTTCACCTACTCCTGGCACCGACGGG 1702
|||.|||||.||.||.||.|||||||||.||||.||.||.||.|||||.||..|.|||||.||||||||.||.|
Sbjct 1629 CAGCGATGACGACTCCGAGAGCCGGCGGAGGCTGGACAAGGACAGCGGCTTTGCTTACTCGTGGCACCGGCGTG 1702
Query 1703 ATAGCAGCGAGGGGCCCCCTGGCAGTGAGGGGGATGGCGGGGGCCAGAGCAAGCCAAGCAATGCCAGTGGAGGG 1776
|.|||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.|||| .|.||||.||.
Sbjct 1703 ACAGCAGTGAGGGGCCACCAGGCAGCGAGGGCGATGGTGGCGGCCAGAGCAAGCCTAGCA---GCGGTGGCGGT 1773
Query 1777 GTGGACAAGGCCAGCCCCAGTGAGAA---CAATGCTGGTGGGGGCAGTCCCTCCA--GCGGCTCGGGTGGCAAC 1845
|||||||||||||||||..|||||.| || |.|||||.||||| ||| |.|||||.|||||.|.|
Sbjct 1774 GTGGACAAGGCCAGCCCGGGTGAGCAGGGCA---CGGGTGGTGGCAG-----CCAGGGAGGCTCTGGTGGGACC 1839
Query 1846 CCCACCAATACATC-GGGTACCACACGCCGCTGTGCCGGCCCAAGCAACTCCAT-------------------- 1898
||..|...||||.| |||| ||.||.|.||||||||.||||| ..||| |||
Sbjct 1840 CCGTCGGGTACAGCAGGGT-CCTCAAGGCGCTGTGCAGGCCC---TGACT-CATCCTCACCCTCCCCCGCCTCA 1908
Query 1899 GCAGCTGGCCTCTCGCA-GTGCTGGGGAGCTCGTTGAGAGCCTCAAACTCATGAGCCTCTGCCTCGGCTCCCAG 1971
||..|| |||.||| || |||.||..|||||.||..||||||||||||||.|||||||.|||||.|||||.|||
Sbjct 1909 GCCTCT-GCCGCTC-CACGTGGTGCAGAGCTTGTGCAGAGCCTCAAACTCGTGAGCCTGTGCCTAGGCTCACAG 1980
Query 1972 CTTCATGGGAGCACCAAGTACATTATTGATCCACAGAATGGCTTGTCATTTTCCAGTGTGAAAGTCCAAGAGAA 2045
||.|||| ||.|||||||||||.|.||.||.|||||.|.|||| ||.|||||.|||||.||.||.|||||
Sbjct 1981 CTGCATG---GCGCCAAGTACATTCTGGACCCGCAGAAGGCCTTG---TTCTCCAGCGTGAAGGTGCAGGAGAA 2048
Query 2046 ATCTACGTGGAAAATGTGCATTAGCTCCACAGGGAATGCAGGGCAGGTCCCTGCAGTGGGCGGCATAAAGTTTT 2119
.||.||||||||.||||||||.|||.||.|||| ||| || ||..|
Sbjct 2049 GTCCACGTGGAAGATGTGCATCAGCGCCCCAGG---------------CCC--CA----GCCCC---------- 2091
Query 2120 TCT-CTGACCACATGGCAGATACCACCACTGAATTGGAACGGATAAGGAGCAAGAACCTAAAAAATAACGTGCT 2192
||| |||||| |.||.|.|.|.||||.||||||.||.|..||.||||.|||
Sbjct 2092 TCTGCTGACC------------------------TTGACCCGGTGAGGACCAAGAAGCTGAGGAACAACGCGCT 2141
Query 2193 GCAGCTACCTCTGTGCGAAAAGACCATCTCTGTGAACATCCAGCGGAACCCTAAGGAGGGGCTGCTGTGCGCAT 2266
.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|.||..|||||.||||||||.|||||.|
Sbjct 2142 CCAGCTACCTCTGTGCGAAAAGACCATCTCCGTGAACATCCAGCGCAGCCGCAAGGAAGGGCTGCTCTGCGCCT 2215
Query 2267 CCAGCCCAGCCAGCTGTTGCCATGTCATC 2295
|||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 2216 CCAGCCCCGCCAGCTGCTGCCATGTCATC 2244