Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475662
• Subject: NM_001319307.2
• Aligned Length: 1146
• Identities: 734
• Gaps: 411

Alignment

Query    1  ATGCTTGATACCAACTTGATTCTTCTACCTTTGTTCCAATTTATTGTGCCTAAAGAATGGAACAGCAAATATAG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ACCTGTATGCATTCATCTTGCTGGAACAGGAGATCATCATTACTGGAGGCGACGAACACTAATGGCCCGTCCTA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGATTAAAGAAGCCCGAATGGCTTCTTTATTGTTAGAAAACCCTTATTATGGCTGCAGGAAACCCAAGGACCAA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GTAAGGTCCAGCTTAAAAAATGTGTCCGACCTTTTTGTGATGGGAGGAGCTCTTGTTTTAGAATCTGCAGCTCT  296
                                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------------------------ATGGGAGGAGCTCTTGTTTTAGAATCTGCAGCTCT  35

Query  297  CTTGCACTGGCTAGAGAGGGAAGGTTACGGCCCTTTAGGAATGACTGGAATATCCATGGGAGGACACATGGCTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   36  CTTGCACTGGCTAGAGAGGGAAGGTTACGGCCCTTTAGGAATGACTGGAATATCCATGGGAGGACACATGGCTT  109

Query  371  CCTTAGCGGTATCCAACTGGCCTAAGCCCATGCCATTGATTCCATGCCTGTCTTGGTCCACAGCATCTGGGGTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  110  CCTTAGCGGTATCCAACTGGCCTAAGCCCATGCCATTGATTCCATGCCTGTCTTGGTCCACAGCATCTGGGGTC  183

Query  445  TTCACTACG-----------------------------------------------------------------  453
            |||||||||                                                                 
Sbjct  184  TTCACTACGGGTGTGTTGAGTAAATCAATTAATTGGAGGGAGCTGGAAAAGCAATATTATACCCAGACAGTTTA  257

Query  454  -------------------------------------ACAGATTCTTTCAAAATGGGACAAGAGTTTGTGAAAC  490
                                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  258  TGAAGAAGAAATTATTCACATGCTTGAATACTGTGGAACAGATTCTTTCAAAATGGGACAAGAGTTTGTGAAAC  331

Query  491  ACTTCACTAGCAGTGCAGACAAGCTAACTAACCTTAATCTGGTTTCCAGAACTTTAAATTTAGATATATCAAAC  564
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  332  ACTTCACTAGCAGTGCAGACAAGCTAACTAACCTTAATCTGGTTTCCAGAACTTTAAATTTAGATATATCAAAC  405

Query  565  CAAGTTGTATCCCAAAAACCTGCTGACTGCCATAATTCTAGCAAAACATCTGTCAGTGCGACATCAGAAGGACT  638
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  406  CAAGTTGTATCCCAAAAACCTGCTGACTGCCATAATTCTAGCAAAACATCTGTCAGTGCGACATCAGAAGGACT  479

Query  639  CTTATTGCAAGATACCTCTAAGATGAAGCGCTTCAATCAAACACTTTCAACCAACAAAAGTGGTTATACAAGTC  712
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  480  CTTATTGCAAGATACCTCTAAGATGAAGCGCTTCAATCAAACACTTTCAACCAACAAAAGTGGTTATACAAGTC  553

Query  713  GCAACCCTCAGTCATACCACCTACTTAGTAAAGAACAAAGCAGAAACAGTCTTCGGAAAGAGTCTTTAATATTT  786
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  554  GCAACCCTCAGTCATACCACCTACTTAGTAAAGAACAAAGCAGAAACAGTCTTCGGAAAGAGTCTTTAATATTT  627

Query  787  ATGAAAGGAGTCATGGATGAATGTACTCATGTAGCAAATTTCTCAGTCCCAGTTGATCCAAGCCTCATTATAGT  860
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  628  ATGAAAGGAGTCATGGATGAATGTACTCATGTAGCAAATTTCTCAGTCCCAGTTGATCCAAGCCTCATTATAGT  701

Query  861  GGTTCAAGCCAAAGAAGATGCCTATATTCCACGAACAGGAGTTCGAAGTTTACAAGAAATTTGGCCTGGTTGTG  934
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  702  GGTTCAAGCCAAAGAAGATGCCTATATTCCACGAACAGGAGTTCGAAGTTTACAAGAAATTTGGCCTGGTTGTG  775

Query  935  AAATCCGATACTTAGAAGGGGGTCATATTAGTGCTTATCTTTTTAAACAAGGACTCTTCAGG------------  996
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.            
Sbjct  776  AAATCCGATACTTAGAAGGGGGTCATATTAGTGCTTATCTTTTTAAACAAGGACTCTTCAGACAAGCCATCTAT  849

Query  997  ------------------------------------  996
                                                
Sbjct  850  GATGCATTTGACCGCTTCCTCCATAAATACGCTAAC  885