Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000475662
- Subject:
- XM_006714322.3
- Aligned Length:
- 1146
- Identities:
- 860
- Gaps:
- 285
Alignment
Query 1 ATGCTTGATACCAACTTGATTCTTCTACCTTTGTTCCAATTTATTGTGCCTAAAGAATGGAACAGCAAATATAG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 ACCTGTATGCATTCATCTTGCTGGAACAGGAGATCATCATTACTGGAGGCGACGAACACTAATGGCCCGTCCTA 148
|||||||||||||
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------ATGGCCCGTCCTA 13
Query 149 TGATTAAAGAAGCCCGAATGGCTTCTTTATTGTTAGAAAACCCTTATTATGGCTGCAGGAAACCCAAGGACCAA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 14 TGATTAAAGAAGCCCGAATGGCTTCTTTATTGTTAGAAAACCCTTATTATGGCTGCAGGAAACCCAAGGACCAA 87
Query 223 GTAAGGTCCAGCTTAAAAAATGTGTCCGACCTTTTTGTGATGGGAGGAGCTCTTGTTTTAGAATCTGCAGCTCT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 88 GTAAGGTCCAGCTTAAAAAATGTGTCCGACCTTTTTGTGATGGGAGGAGCTCTTGTTTTAGAATCTGCAGCTCT 161
Query 297 CTTGCACTGGCTAGAGAGGGAAGGTTACGGCCCTTTAGGAATGACTGGAATATCCATGGGAGGACACATGGCTT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 162 CTTGCACTGGCTAGAGAGGGAAGGTTACGGCCCTTTAGGAATGACTGGAATATCCATGGGAGGACACATGGCTT 235
Query 371 CCTTAGCGGTATCCAACTGGCCTAAGCCCATGCCATTGATTCCATGCCTGTCTTGGTCCACAGCATCTGGGGTC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 236 CCTTAGCGGTATCCAACTGGCCTAAGCCCATGCCATTGATTCCATGCCTGTCTTGGTCCACAGCATCTGGGGTC 309
Query 445 TTCACTACG----------------------------------------------------------------- 453
|||||||||
Sbjct 310 TTCACTACGGGTGTGTTGAGTAAATCAATTAATTGGAGGGAGCTGGAAAAGCAATATTATACCCAGACAGTTTA 383
Query 454 -------------------------------------ACAGATTCTTTCAAAATGGGACAAGAGTTTGTGAAAC 490
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 384 TGAAGAAGAAATTATTCACATGCTTGAATACTGTGGAACAGATTCTTTCAAAATGGGACAAGAGTTTGTGAAAC 457
Query 491 ACTTCACTAGCAGTGCAGACAAGCTAACTAACCTTAATCTGGTTTCCAGAACTTTAAATTTAGATATATCAAAC 564
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 458 ACTTCACTAGCAGTGCAGACAAGCTAACTAACCTTAATCTGGTTTCCAGAACTTTAAATTTAGATATATCAAAC 531
Query 565 CAAGTTGTATCCCAAAAACCTGCTGACTGCCATAATTCTAGCAAAACATCTGTCAGTGCGACATCAGAAGGACT 638
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 532 CAAGTTGTATCCCAAAAACCTGCTGACTGCCATAATTCTAGCAAAACATCTGTCAGTGCGACATCAGAAGGACT 605
Query 639 CTTATTGCAAGATACCTCTAAGATGAAGCGCTTCAATCAAACACTTTCAACCAACAAAAGTGGTTATACAAGTC 712
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 606 CTTATTGCAAGATACCTCTAAGATGAAGCGCTTCAATCAAACACTTTCAACCAACAAAAGTGGTTATACAAGTC 679
Query 713 GCAACCCTCAGTCATACCACCTACTTAGTAAAGAACAAAGCAGAAACAGTCTTCGGAAAGAGTCTTTAATATTT 786
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 680 GCAACCCTCAGTCATACCACCTACTTAGTAAAGAACAAAGCAGAAACAGTCTTCGGAAAGAGTCTTTAATATTT 753
Query 787 ATGAAAGGAGTCATGGATGAATGTACTCATGTAGCAAATTTCTCAGTCCCAGTTGATCCAAGCCTCATTATAGT 860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 754 ATGAAAGGAGTCATGGATGAATGTACTCATGTAGCAAATTTCTCAGTCCCAGTTGATCCAAGCCTCATTATAGT 827
Query 861 GGTTCAAGCCAAAGAAGATGCCTATATTCCACGAACAGGAGTTCGAAGTTTACAAGAAATTTGGCCTGGTTGTG 934
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 828 GGTTCAAGCCAAAGAAGATGCCTATATTCCACGAACAGGAGTTCGAAGTTTACAAGAAATTTGGCCTGGTTGTG 901
Query 935 AAATCCGATACTTAGAAGGGGGTCATATTAGTGCTTATCTTTTTAAACAAGGACTCTTCAGG------------ 996
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 902 AAATCCGATACTTAGAAGGGGGTCATATTAGTGCTTATCTTTTTAAACAAGGACTCTTCAGACAAGCCATCTAT 975
Query 997 ------------------------------------ 996
Sbjct 976 GATGCATTTGACCGCTTCCTCCATAAATACGCTAAC 1011