Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475714
• Subject: NM_001308102.1
• Aligned Length: 1365
• Identities: 1056
• Gaps: 294

Alignment

Query    1  ATGAGTGTCTCTGTCCTGAGCCCCAGCAGACGCCTGGGTGGTGTCTCCGGGATCCTCCAAGTGACCTCCCTGCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGTGTCTCTGTCCTGAGCCCCAGCAGACGCCTGGGTGGTGTCTCCGGGATCCTCCAAGTGACCTCCCTGCT  74

Query   75  CATTCTGCTTCTGCTGCTGATCAAGGCAGCTCAGCTCTACCTGCATAGGCAGTGGCTGCTCAAAGCCCTCCAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CATTCTGCTTCTGCTGCTGATCAAGGCAGCTCAGCTCTACCTGCATAGGCAGTGGCTGCTCAAAGCCCTCCAGC  148

Query  149  AGTTCCCGTGCCCTCCCTCCCACTGGCTCTTCGGGCACATCCAGGAGTTCCAACACGACCAGGAGCTACAACGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGTTCCCGTGCCCTCCCTCCCACTGGCTCTTCGGGCACATCCAGGAGTTCCAACACGACCAGGAGCTACAACGG  222

Query  223  ATTCAGGAACGGGTGAAGACATTCCCAAGTGCCTGTCCTTATTGGATATGGGGAGGCAAAGTTCGTGTCCAGCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATTCAGGAACGGGTGAAGACATTCCCAAGTGCCTGTCCTTATTGGATATGGGGAGGCAAAGTTCGTGTCCAGCT  296

Query  297  CTATGACCCTGACTATATGAAGGTGATTCTGGGGAGATCAGACCCGAAATCCCATGGATCCTACAAATTCCTGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTATGACCCTGACTATATGAAGGTGATTCTGGGGAGATCAGACCCGAAATCCCATGGATCCTACAAATTCCTGG  370

Query  371  CTCCATGGATTGGGTACAGCTTGCTCCTGTTGAATGGGCAGACATGGTTCCAGCATCGACGGATGCTGACCCCA  444
            |||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTCCACGGATTGGGTACGGCTTGCTCCTGTTGAATGGGCAGACATGGTTCCAGCATCGACGGATGCTGACCCCA  444

Query  445  GCCTTCCACTATGACATCCTGAAGCCATACGTGGGGCTCATGGCAGACTCTGTACGAGTGATGCTGGACAAATG  518
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCCTTCCACAATGACATCCTGAAGCCATACGTGGGGCTCATGGCAGACTCTGTACGAGTGATGCTGGACAAATG  518

Query  519  GGAAGAGCTCCTTGGCCAGGATTCCCCTCTGGAGTTCTTTCAGCACGTCTCCTTGATGACCCTGGACACCATCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGAAGAGCTCCTTGGCCAGGATTCCCCTCTGGAGGTCTTTCAGCACGTCTCCTTGATGACCCTGGACACCATCA  592

Query  593  TGAAGAGTGCCTTCAGCCATCAGGGCAGCATCCAGGTGGACAGGAATTCTCAGTCCTACATCCAGGCCATTAGT  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                   
Sbjct  593  TGAAGAGTGCCTTCAGCCATCAGGGCAGCATCCAGGTGG-----------------------------------  631

Query  667  GACCTGAACAGCCTGGTTTTTTGCCGTATGAGGAATGCCTTTCATGAGAATGACACCATCTACAGCCTGACCTC  740
                                                                                      
Sbjct  632  --------------------------------------------------------------------------  631

Query  741  TGCTGGCCGCTGGACACACCGCGCCTGCCAGCTGGCCCATCAGCACACAGACCAAGTGATCCAACTGAGGAAGG  814
                                                          ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  632  ----------------------------------------------ACAGACCAAGTGATCCAACTGAGGAAGG  659

Query  815  CTCAACTACAGACGGAGGGGGAGCTGGAGAAGATCAAGAGGAAGAGGCACTTGGATTTTCTGGACATCCTCCTC  888
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  660  CTCAACTACAGAAGGAGGGGGAGCTGGAGAAGATCAAGAGGAAGAGGCACTTGGATTTTCTGGACATCCTCCTC  733

Query  889  TTGGCCAAAATGGAGAATGGGAGCATCTTGTCAGACAAGGACCTCCGTGCTGAGGTGGACACGTTCATGTTTGA  962
            |||||||||           |.||..||.|||.|.|.|||    ||.||||  |||      |||||       
Sbjct  734  TTGGCCAAA-----------GGGCCCCTGGTCTGCCCAGG----CCTTGCT--GGT------GTTCA-------  777

Query  963  GGGCCACGACACCACAGCCAGTGGGATCTCCTGGATCCTCTATGCTCTGGCCACACACCCCAAGCATCAGGAGA  1036
                                   |||     ||||      ||                               
Sbjct  778  -----------------------GGA-----TGGA------AT-------------------------------  786

Query 1037  GGTGCCGGGAGGAGATCCATGGCCTCCTGGGTGATGGAGCCTCCATCACCTGGAACCACCTGGACCAGATGCCC  1110
                                           ||.|          |||   |||||||||||||||||||||||
Sbjct  787  -------------------------------TGTT----------TCA---GGAACCACCTGGACCAGATGCCC  816

Query 1111  TACACCACCATGTGCATTAAGGAGGCACTGAGGCTCTACCCACCGGTGCCAGGCATTGGAAGAGAGCTCAGCAC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  817  TACACCACCATGTGCATTAAGGAGGCACTGAGGCTCTACCCACCGGTGCCAGGCATTGGAAGAGAGCTCAGCAC  890

Query 1185  TCCCGTCACCTTCCCTGATGGGCGCTCCTTGCCCAAAGGTATCATGGTCCTCCTCTCCATTTATGGCCTTCACC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  891  TCCCGTCACCTTCCCTGATGGGCGCTCCTTGCCCAAAGGTATCATGGTCCTCCTCTCCATTTATGGCCTTCACC  964

Query 1259  ACAACCCAAAAGTGTGGCCCAACCCAGAGGTGTTTGACCCTTCCCGTTTTGCACCGGGTTCTGCTCAACACAGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  965  ACAACCCAAAAGTGTGGCCCAACCTAGAGGTGTTTGACCCTTCCCGTTTTGCACCGGGTTCTGCTCAACACAGC  1038

Query 1333  CACGCTTTCCTGCCCTTCTCAGGAGGATCAAGG  1365
            |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1039  CACGCTTTCCTGCCCTTCTCAGGAGGATCAAGG  1071