Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000475752
Subject:
XM_006520848.1
Aligned Length:
1321
Identities:
1074
Gaps:
59

Alignment

Query    1  ATGCGGCGCTACCTGCGCGTCGTGGTGCTGTGTGTGGCCTGCGGCTTCTGCTCGCTCCTTTACGCTTTCAGCCA  74
            |||||||||||||||||.|||||.|.||||||..||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct    1  ATGCGGCGCTACCTGCGGGTCGTAGGGCTGTGCCTGGCCTGCGGCTTCTGCTCGCTGCTGTACGCCTTCAGCCA  74

Query   75  GCTCGCCGTGTCCCTGGAAGAAGGAACGGGC-GGCGGTGGCGGGAAGCCGCAGGCCGCGGTGGCTTCCTGGCTC  147
            ||||||.||||||.||||.||||||    || |.|||.|||.|.|.|||||||||||||||.|.|||||||||.
Sbjct   75  GCTCGCGGTGTCCTTGGAGGAAGGA----GCTGCCGGGGGCCGCAGGCCGCAGGCCGCGGTAGTTTCCTGGCTG  144

Query  148  GCGGGCGGCGGACGCGGCGCCGTGAGAGGCGCCGGCGTCGCGGGCCCCGCAGCGCATCCCGGCGTGTCGGACAG  221
            ||||.|||.|||||||||.|.|.|||||||||.|||..|||||||            ||.|||..|.|||.|||
Sbjct  145  GCGGACGGTGGACGCGGCACGGGGAGAGGCGCGGGCAGCGCGGGC------------CCGGGCCGGACGGGCAG  206

Query  222  GTGTAAAGATTTCTCTCTGTGTTACTGGAATCCCTATTGGATGCTGCCCTCTGATGTTTGTGGAATGAACTGCT  295
            |||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  207  GTGTAAAGAGTTCTCTCTGAGTTACTGGAATCCCTATTGGATGCTGCCCTCTGATGTTTGTGGAATGAACTGCT  280

Query  296  TTTGGGAAGCGGCTTTTAGGTACAGTCTGAAAATACAGCCTGTTGAGAAAATGCATCTAGCTGTAGTTGCCTGT  369
            ||||||||||||||||||||||...|.||||||.|..|||.|.||||||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct  281  TTTGGGAAGCGGCTTTTAGGTATGATATGAAAACAAGGCCCGATGAGAAAATGCACCTTGCTGTTGTTGCCTGT  354

Query  370  GGTGAAAGACTGGAAGAAACTATGACCATGTTGAAGTCAGCTATCATTTTCAGCATCAAACCTCTTCAATTCCA  443
            |||||.|||||||||||||||.||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||.||.||.||..||||
Sbjct  355  GGTGAGAGACTGGAAGAAACTGTGACTATGTTGAAGTCAGCTCTGATTTTCAGCATCAAGCCACTGCACGTCCA  428

Query  444  TATTTTTGCTGAAGATCAGCTACATCATAGCTTTAAAGGCAGACTTGACAACTGGTCATTTCTACAAACATTTA  517
            .||.|||||||||||.||.||.||..||||||||||||.||||||||.||.||||||.||.||.|..|.||||.
Sbjct  429  CATCTTTGCTGAAGACCAACTGCACGATAGCTTTAAAGACAGACTTGCCAGCTGGTCCTTCCTGCGGAGATTTG  502

Query  518  ATTATACGTTATACCCCATAACCTTTCCAAGTGAGAATGCAGCAGAGTGGAAAAAACTCTTTAAACCATGTGCT  591
            |.||.|...|.|||||.||.|||||.|||.||||.|..||.||.||.|||||.||.||||||||.||.|||||.
Sbjct  503  ACTACAGCCTGTACCCTATCACCTTCCCAGGTGACAGCGCCGCGGACTGGAAGAAGCTCTTTAAGCCCTGTGCG  576

Query  592  TCGCAGAGATTGTTCTTGCCGTTAATCCTGAAAGAAGTTAACTCACTATTGTATGTCGACACTGATATCCTTTT  665
            ||.|||||..||||||||||.|||||.||||||||||||.|||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  577  TCCCAGAGGCTGTTCTTGCCATTAATACTGAAAGAAGTTGACTCACTGTTGTATGTGGACACTGATATCCTTTT  650

Query  666  TTTACGACCAGTTGATGATATTTGGTCTTTACTAAAGAAATTTAATTCCACACAAATTGCTGCAATGGCACCAG  739
            |||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  651  TTTACGACCTGTTGATGATATTTGGTCATTACTAAAGAAATTTAATTCCACACAAATTGCTGCGATGGCACCAG  724

Query  740  AACATGAGGAACCTCGAATAGGATGGTATAATCGCTTTGCTAGGCATCCATATTATGGAAAAACTGGAGTAAAC  813
            ||||.|||||.||..||||.||||||||||||||||||||..||||.||.||.|||||.|..||.||.||.|||
Sbjct  725  AACACGAGGAGCCCAGAATTGGATGGTATAATCGCTTTGCCCGGCACCCGTACTATGGGAGGACGGGCGTGAAC  798

Query  814  TCTGGAGTTATGTTGATGAACATGACTCGAATGAGAAGGAAGTATTTCAAGAATGATATGACAACTGTACGACT  887
            ||||||||.|||.|||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||..||.||
Sbjct  799  TCTGGAGTGATGCTGATGAACATGACCCGGATGAGGAGGAAGTACTTCAAGAATGATATGACAACTGCGCGGCT  872

Query  888  ACAATGGGGAGATATACTTATGCCATTGCTTAAAAAATACAAACTAAACATCACATGGGGTGATCAAGATCTAT  961
            |||||||||.||.||||||||||||.||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|
Sbjct  873  ACAATGGGGGGACATACTTATGCCACTGCTTAAAAAGTACAAACTGAACATCACGTGGGGCGATCAGGATCTGT  946

Query  962  TGAATATCGTGTTTTTTCATAATCCAGAAAGCCTTTTTGTTTTTCCGTGTCAATGGAATTATCGACCAGATCAT  1035
            |.|||||||||||||..||.|||                                          ||||||||.
Sbjct  947  TAAATATCGTGTTTTCCCACAAT------------------------------------------CCAGATCAC  978

Query 1036  TGTATATATGGAAGCAATTGCCAAGAAGCAGAAGAAGGAGGAATCTTTATTCTTCATGGGAACAGAGGTGTTTA  1109
            |||||||||||.|||||.||||.||||||||||||||.||||.||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  979  TGTATATATGGGAGCAACTGCCGAGAAGCAGAAGAAGAAGGAGTCTTCATTCTTCATGGAAACAGAGGTGTTTA  1052

Query 1110  CCATGACGATAAGCAACCAGCATTTAGAGCTGTTTATGAAGCACTGAGAAATTGTTCTTTTGAAGATGACAACA  1183
            |||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||.||||.|||||...|.
Sbjct 1053  CCATGACGACAAGCAGCCAGCATTCAGAGCTGTGTATGAAGCACTAAGAAATTGCTCTCTTGAGGATGATTCCG  1126

Query 1184  TCCGTTCCTTATTAAAACCTTTAGAACTGGAACTACAAAAAACAGTGCATACATACTGTGGAAAAATTTACAAA  1257
            |||||||||||.|||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||..||||||
Sbjct 1127  TCCGTTCCTTACTAAAACCTTTAGAGCTGGAGCTGCAGAAGACAGTTCACACATACTGTGGAAAAACGTACAAA  1200

Query 1258  ATATTTATCAAACAACTAGCAAAAAGTGTAAGAGATCGTTATGCCAGATCACCAAAGGAAAAG  1320
            |||||||||||.||..|..|||||||..|||||.|.|||||||.||...||||.|||||||.|
Sbjct 1201  ATATTTATCAAGCAGTTGACAAAAAGCATAAGAAACCGTTATGACACGCCACCGAAGGAAAGG  1263