Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000475853
- Subject:
- XM_006517468.3
- Aligned Length:
- 2383
- Identities:
- 1545
- Gaps:
- 665
Alignment
Query 1 ATGCTAGACAGCTGCAAGCTGAAAAGTGCCTGCAATTTGCCATTTATTTGTAATAAGAAAATAA-TAAACACTG 73
||||||||.||||.||.||||||||||..|||||||||.|||.|..|||||.|||||||||||| | ||.|
Sbjct 1 ATGCTAGATAGCTACAGGCTGAAAAGTTTCTGCAATTTACCACTCGTTTGTCATAAGAAAATAAGT----ACAG 70
Query 74 CTGGAACCAGTAATGCAGAAGTCCCCTTGGCTGATCCCGGAATGTACCAGCTGGACATTACATTAAGAAGGGGT 147
.|||||.||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||.||||.||.|||.|||||||||||
Sbjct 71 TTGGAAACAGTAATGCAGATGTCCCTTTGGCTGATCCCGGAATGTACCAGTTGGATATCACACTAAGAAGGGGT 144
Query 148 CAAAGTTTAGCTGCTCGAGATCGAGGAGGGACGAGTGATCCATATGTGAAGTTTAAAATCGGAGGAAAAGAAGT 221
||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||.||||||||||
Sbjct 145 CAAAGTTTAGCTGCCCGTGATCGAGGAGGGACAAGCGATCCGTATGTGAAGTTTAAAATTGGAAGAAAAGAAGT 218
Query 222 TTTTAGAAGTAAGATAATACACAAGAACCTCAACCCTGTGTGGGAAGAAAAAGCTTGTATTCTGGTTGATCATC 295
|||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||..|.||..||||.||||
Sbjct 219 TTTTAGAAGCAAAATTATCCACAAGAACCTAAATCCTGTGTGGGAGGAAAAGGCTTGCGTGCTCATTGACCATC 292
Query 296 TTAGGGAGCCATTGTATATAAAGGTATTTGACTATGATTTTGGACTACAGGATGACTTTATGGGCTCAGCCTTT 369
||||.||||||.|.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 293 TTAGAGAGCCACTATATATCAAGGTATTTGACTATGATTTTGGACTGCAAGATGACTTTATGGGCTCAGCCTTT 366
Query 370 CTGGATCTGACACAATTGGAGTTAAACAGGCCCACAGATGTGACCCTTACTCTGAAAGATCCTCATTATCCTGA 443
||.|||||.||.||.|||||||||||||||.||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 367 CTTGATCTCACTCAGTTGGAGTTAAACAGGTCCACAGATGTTACCCTAACTCTGAAAGACCCCCATTATCCTGA 440
Query 444 CCATGATCTTGGAATCATTTTGCTCTCAGTCATCCTTACCCCTAAAGAAGGAGAGTCCAGGGATGTG------- 510
||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||...||||||||||
Sbjct 441 CCATGACCTTGGAATCATTTTGCTGTCAGTCATCCTTACGCCTAAGGAAGGTGAACACAGGGATGTGCAGAGTT 514
Query 511 -----------------------------------------ACAATGCTAATGAGGAAGAGTTGGAAAAGATCA 543
||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 515 CAATACACAGCTTTCTTCCTTGGAGAATTTGTGACATAAAAACAATGCTAATGAGGAAGAGTTGGAAAAGATCC 588
Query 544 AGTAAGGAACTTTCAGAAAATGAAGTGGTTGGATCTTATTTCTCTGTGAAGTCTCTCTTTTGGAGGACGTGCGG 617
|||||||||||.|||||||||||||||.||||||.|.|.|||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 589 AGTAAGGAACTCTCAGAAAATGAAGTGTTTGGATTTCACTTCTCTGTGCAGTCTTTCTTTTGGAGG-------- 654
Query 618 CAGGCCAGCTCTTCCTGTCCTGGGCTTCTGCAGAGCAGAGCTTCAGAATCCTTATTGCAAAAATGTACAATTTC 691
||||
Sbjct 655 ----------------------------------------------------------------------TTTC 658
Query 692 AGACCCAAAGTTTACGCCTATCAGACCTACACAGAAAATCGCATCTTTGGAGAGGAATAGTCAGCATCACCTTG 765
|||||||||||||||||||.||.||||..|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 659 AGACCCAAAGTTTACGCCTGTCCGACCAGCACAGGAAATCACACCTTTGGAGAGGAATAGTCAGCATCACCTTG 732
Query 766 ATTGAAGGGAGAGACCTCAAGGCCATGGATTCCAACGGGTTGAGCGATCCCTACGTGAAGTTCCGGCTTGGGCA 839
|||||.||..||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 733 ATTGAGGGTCGAGATCTCAAAGCAATGGATTCCAATGGGTTGAGTGATCCATATGTGAAGTTCCGGCTTGGCCA 806
Query 840 TCAGAAGTACAAGAGCAAGATTATGCCAAAAACGTTGAATCCTCAGTGGAGGGAACAATTTGATTTTCACCTTT 913
|||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|
Sbjct 807 TCAGAAGTACAAGAGCAAGATTATGCCCAAAACTTTGAACCCTCAGTGGAGGGAGCAATTTGATTTCCATCTCT 880
Query 914 ATGAAGAAAGAGGAGGAGTCATTGATATCACTGCATGGGACAAAGATGCTGGGAAAAGGGATGATTTCATTGGC 987
|||||||||||||.||..||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.
Sbjct 881 ATGAAGAAAGAGGTGGGATCATGGACATCACTGCCTGGGACAAAGATGCTGGGAAAAGAGATGACTTTATTGGA 954
Query 988 AGGTGCCAGGTCGACCTGTCAGCCCTCAGTAGGGAACAGACGCACAAGCTGGAGTTGCAGCTGGAAGAGGGTGA 1061
|||||||||||.||||||||..|||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 955 AGGTGCCAGGTTGACCTGTCTTCCCTCAGTAGGGAGCAAACTCACAAGCTGGAGTTACATCTGGAAGAGGGTGA 1028
Query 1062 GGGACACCTGGTGCTGCTGGTCACTCTGACAGCATCAGCCACAGTCAGCATCTCTGACCTGTCTGTCAACTCCC 1135
|||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||.|.|||||||||||.||||||||.|||.
Sbjct 1029 GGGCCACCTGGTTCTGCTTGTCACTCTGACAGCCTCGGCCACAGTCTGTATCTCTGACCTCTCTGTCAATTCCA 1102
Query 1136 TGGAGGACCAGAAGGAACGAGAGGAGATATTAAAGAAATATAGCCCATTGAGGATATTTCACAACCTGAAAGAT 1209
||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||.||||||||||.|||||||||||.|||||||.|||||.
Sbjct 1103 TGGAGGACCAGAAGGAGCGGGAAGAGATATTAAAGAGATATAGCCCACTGAGGATATTTAACAACCTAAAAGAC 1176
Query 1210 GTGGGATTTCTCCAGGTGAAAGTCATCAGAGCGGAAGGGTTAATGGCTGCCGACGTCACTGGAAAAAGTGACCC 1283
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||.||.||||||||.||
Sbjct 1177 GTGGGATTTCTCCAGGTGAAAGTCATCAGAGCAGAAGGTTTGATGGCTGCAGATGTCACAGGTAAAAGTGATCC 1250
Query 1284 ATTTTGTGTGGTAGAACTGAACAACGATAGACTGCTAACACATACTGTCTACAAAAATCTCAATCCTGAGTGGA 1357
|||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1251 ATTTTGTGTAGTAGAACTGAACAATGATAGGCTGCTAACACACACTGTGTACAAAAACCTCAATCCTGAGTGGA 1324
Query 1358 ATAAAGTCTTCACGTTCAACATTAAAGATATCCATTCAGTTCTTGAAGTGACAGTTTATGATGAAGATCGGGAT 1431
|.|||||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1325 ACAAAGTGTTCACATTTAACATTAAAGACATTCATTCAGTTCTTGAAGTGACAGTTTATGATGAAGATCGTGAC 1398
Query 1432 CGAAGTGCTGACTTTCTGGGCAAAGTTGCTATACCATTGCTGTCTATTCAAAATGGTGAACAGAAAGCCTACGT 1505
||.|||||.|||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1399 CGGAGTGCCGACTTTCTGGGCAGAGTCGCTATACCATTGCTGTCTATTCAAAATGGTGAACAGAAAGCCTACGT 1472
Query 1506 CTTGAAAAACAAGCAGCTGACAGGGCCAACAAAGGGGGTCATCTATCTTGAAATAGATGTGATTTTTAATGCTG 1579
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1473 CTTGAAAAACAAGCAGCTGACAGGGCCAACAAAGGGGGTCATCTATCTTGAAATAGATGTGATTTTTAATGCTG 1546
Query 1580 TGAAAGCCAGCTTACGAACATTAATACCCAAAGAACAGAAGTACATTGAAGAGGAAAACAGACTCTCTAAACAG 1653
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1547 TGAAAGCCAGCTTACGAACATTAATACCCAAAGAACGGAAGTACATTGAAGAGGAAAACAGACTCTCTAAACAG 1620
Query 1654 CTGCTACTAAGAAACTTTATCAGAATGAAACGTTGTGTCATGGTGCTGGTAAATGCTGCATACTACGTTAATAG 1727
|||||.|||||||||||||||||||..||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1621 CTGCTTCTAAGAAACTTTATCAGAACAAAACGTTGTGTCATAGTGCTTGTAAACGCTGCATACTACGTTAATAG 1694
Query 1728 TTGCTTTGATTGGGATTCACCCCCAAGGAGTCTCGCTGCTTTTGTG----------GCCTTGTATGGGACTTT- 1790
||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||| .|.||||.|||.|||||
Sbjct 1695 TTGCTTTGATTGGGATTCGCCCCCAAGGAGTCTTGCTGCTTTTGTGCTCTTTCTCCTCATTGTCTGGAACTTTG 1768
Query 1791 -------CAT-----------------------TAATGTC---------------------------------- 1800
||| ||.||.|
Sbjct 1769 AGCTCTACATGATACCACTGCTGCTGTTGTTACTATTGACATGGAACTACTTCCTGATAATATCCGGGAAAGAC 1842
Query 1801 -------------------------------------------------------------------------- 1800
Sbjct 1843 AACAGGCAACGGGACACAGTAGTGGAGGACATGCTGGAGGACGAAGAGGAAGAAGATGACAGAGATGACAAGGA 1916
Query 1801 -------------------------------------------------------------------------- 1800
Sbjct 1917 TGGTGAAAAGAAAGGATTTATAAATAAAATCTATGCGATCCAGGAAGTCTGTGTCAGTGTGCAGAACATCCTAG 1990
Query 1801 -------------------------------------------------------------------------- 1800
Sbjct 1991 ATGAAGTGGCTTCCCTTGGTGAAAGGATAAAGAATACTTTCAACTGGACTGTCCCCTTCTTAAGCTGGCTGGCC 2064
Query 1801 -------------------------------------------------------------------------- 1800
Sbjct 2065 ATTGTAGCCCTGTGTGTGTTCACCGCCATTCTGTACTTCATCCCACTGAGATACATTGTTCTTGTTTGGGGAAT 2138
Query 1801 -------------------------------------------------------------------------- 1800
Sbjct 2139 TAATAAATTTACAAAAAAGCTTCGGAGTCCATATGCAATTGATAACAATGAACTACTTGACTTCCTTTCCAGAG 2212
Query 1801 -------------------------------------------------------------------------- 1800
Sbjct 2213 TTCCTTCAGATGTACAAGTGGTGCAGTACCAAGAACTGAAACCAGATCATTCTCATAGCCCATACAAAAGGAAG 2286
Query 1801 --------------- 1800
Sbjct 2287 AAAAACAACCTTGGC 2301
