Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000475853
- Subject:
- XM_006517469.3
- Aligned Length:
- 2335
- Identities:
- 1545
- Gaps:
- 617
Alignment
Query 1 ATGCTAGACAGCTGCAAGCTGAAAAGTGCCTGCAATTTGCCATTTATTTGTAATAAGAAAATAA-TAAACACTG 73
||||||||.||||.||.||||||||||..|||||||||.|||.|..|||||.|||||||||||| | ||.|
Sbjct 1 ATGCTAGATAGCTACAGGCTGAAAAGTTTCTGCAATTTACCACTCGTTTGTCATAAGAAAATAAGT----ACAG 70
Query 74 CTGGAACCAGTAATGCAGAAGTCCCCTTGGCTGATCCCGGAATGTACCAGCTGGACATTACATTAAGAAGGGGT 147
.|||||.||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||.||||.||.|||.|||||||||||
Sbjct 71 TTGGAAACAGTAATGCAGATGTCCCTTTGGCTGATCCCGGAATGTACCAGTTGGATATCACACTAAGAAGGGGT 144
Query 148 CAAAGTTTAGCTGCTCGAGATCGAGGAGGGACGAGTGATCCATATGTGAAGTTTAAAATCGGAGGAAAAGAAGT 221
||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||.||||||||||
Sbjct 145 CAAAGTTTAGCTGCCCGTGATCGAGGAGGGACAAGCGATCCGTATGTGAAGTTTAAAATTGGAAGAAAAGAAGT 218
Query 222 TTTTAGAAGTAAGATAATACACAAGAACCTCAACCCTGTGTGGGAAGAAAAAGCTTGTATTCTGGTTGATCATC 295
|||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||..|.||..||||.||||
Sbjct 219 TTTTAGAAGCAAAATTATCCACAAGAACCTAAATCCTGTGTGGGAGGAAAAGGCTTGCGTGCTCATTGACCATC 292
Query 296 TTAGGGAGCCATTGTATATAAAGGTATTTGACTATGATTTTGGACTACAGGATGACTTTATGGGCTCAGCCTTT 369
||||.||||||.|.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 293 TTAGAGAGCCACTATATATCAAGGTATTTGACTATGATTTTGGACTGCAAGATGACTTTATGGGCTCAGCCTTT 366
Query 370 CTGGATCTGACACAATTGGAGTTAAACAGGCCCACAGATGTGACCCTTACTCTGAAAGATCCTCATTATCCTGA 443
||.|||||.||.||.|||||||||||||||.||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 367 CTTGATCTCACTCAGTTGGAGTTAAACAGGTCCACAGATGTTACCCTAACTCTGAAAGACCCCCATTATCCTGA 440
Query 444 CCATGATCTTGGAATCATTTTGCTCTCAGTCATCCTTACCCCTAAAGAAGGAGAGTCCAGGGATGTGACAATGC 517
||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||...|||||||||||||||||
Sbjct 441 CCATGACCTTGGAATCATTTTGCTGTCAGTCATCCTTACGCCTAAGGAAGGTGAACACAGGGATGTGACAATGC 514
Query 518 TAATGAGGAAGAGTTGGAAAAGATCAAGTAAGGAACTTTCAGAAAATGAAGTGGTTGGATCTTATTTCTCTGTG 591
|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||.||||||.|.|.|||||||||
Sbjct 515 TAATGAGGAAGAGTTGGAAAAGATCCAGTAAGGAACTCTCAGAAAATGAAGTGTTTGGATTTCACTTCTCTGTG 588
Query 592 AAGTCTCTCTTTTGGAGGACGTGCGGCAGGCCAGCTCTTCCTGTCCTGGGCTTCTGCAGAGCAGAGCTTCAGAA 665
.|||||.|||||||||||
Sbjct 589 CAGTCTTTCTTTTGGAGG-------------------------------------------------------- 606
Query 666 TCCTTATTGCAAAAATGTACAATTTCAGACCCAAAGTTTACGCCTATCAGACCTACACAGAAAATCGCATCTTT 739
|||||||||||||||||||||||.||.||||..|||||.|||||.||.||||
Sbjct 607 ----------------------TTTCAGACCCAAAGTTTACGCCTGTCCGACCAGCACAGGAAATCACACCTTT 658
Query 740 GGAGAGGAATAGTCAGCATCACCTTGATTGAAGGGAGAGACCTCAAGGCCATGGATTCCAACGGGTTGAGCGAT 813
|||||||||||||||||||||||||||||||.||..||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 659 GGAGAGGAATAGTCAGCATCACCTTGATTGAGGGTCGAGATCTCAAAGCAATGGATTCCAATGGGTTGAGTGAT 732
Query 814 CCCTACGTGAAGTTCCGGCTTGGGCATCAGAAGTACAAGAGCAAGATTATGCCAAAAACGTTGAATCCTCAGTG 887
||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct 733 CCATATGTGAAGTTCCGGCTTGGCCATCAGAAGTACAAGAGCAAGATTATGCCCAAAACTTTGAACCCTCAGTG 806
Query 888 GAGGGAACAATTTGATTTTCACCTTTATGAAGAAAGAGGAGGAGTCATTGATATCACTGCATGGGACAAAGATG 961
||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||.||..||||.||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 807 GAGGGAGCAATTTGATTTCCATCTCTATGAAGAAAGAGGTGGGATCATGGACATCACTGCCTGGGACAAAGATG 880
Query 962 CTGGGAAAAGGGATGATTTCATTGGCAGGTGCCAGGTCGACCTGTCAGCCCTCAGTAGGGAACAGACGCACAAG 1035
||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||..|||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 881 CTGGGAAAAGAGATGACTTTATTGGAAGGTGCCAGGTTGACCTGTCTTCCCTCAGTAGGGAGCAAACTCACAAG 954
Query 1036 CTGGAGTTGCAGCTGGAAGAGGGTGAGGGACACCTGGTGCTGCTGGTCACTCTGACAGCATCAGCCACAGTCAG 1109
||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||.|
Sbjct 955 CTGGAGTTACATCTGGAAGAGGGTGAGGGCCACCTGGTTCTGCTTGTCACTCTGACAGCCTCGGCCACAGTCTG 1028
Query 1110 CATCTCTGACCTGTCTGTCAACTCCCTGGAGGACCAGAAGGAACGAGAGGAGATATTAAAGAAATATAGCCCAT 1183
.|||||||||||.||||||||.|||.||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||.||||||||||.
Sbjct 1029 TATCTCTGACCTCTCTGTCAATTCCATGGAGGACCAGAAGGAGCGGGAAGAGATATTAAAGAGATATAGCCCAC 1102
Query 1184 TGAGGATATTTCACAACCTGAAAGATGTGGGATTTCTCCAGGTGAAAGTCATCAGAGCGGAAGGGTTAATGGCT 1257
|||||||||||.|||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||
Sbjct 1103 TGAGGATATTTAACAACCTAAAAGACGTGGGATTTCTCCAGGTGAAAGTCATCAGAGCAGAAGGTTTGATGGCT 1176
Query 1258 GCCGACGTCACTGGAAAAAGTGACCCATTTTGTGTGGTAGAACTGAACAACGATAGACTGCTAACACATACTGT 1331
||.||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1177 GCAGATGTCACAGGTAAAAGTGATCCATTTTGTGTAGTAGAACTGAACAATGATAGGCTGCTAACACACACTGT 1250
Query 1332 CTACAAAAATCTCAATCCTGAGTGGAATAAAGTCTTCACGTTCAACATTAAAGATATCCATTCAGTTCTTGAAG 1405
.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1251 GTACAAAAACCTCAATCCTGAGTGGAACAAAGTGTTCACATTTAACATTAAAGACATTCATTCAGTTCTTGAAG 1324
Query 1406 TGACAGTTTATGATGAAGATCGGGATCGAAGTGCTGACTTTCTGGGCAAAGTTGCTATACCATTGCTGTCTATT 1479
||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1325 TGACAGTTTATGATGAAGATCGTGACCGGAGTGCCGACTTTCTGGGCAGAGTCGCTATACCATTGCTGTCTATT 1398
Query 1480 CAAAATGGTGAACAGAAAGCCTACGTCTTGAAAAACAAGCAGCTGACAGGGCCAACAAAGGGGGTCATCTATCT 1553
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1399 CAAAATGGTGAACAGAAAGCCTACGTCTTGAAAAACAAGCAGCTGACAGGGCCAACAAAGGGGGTCATCTATCT 1472
Query 1554 TGAAATAGATGTGATTTTTAATGCTGTGAAAGCCAGCTTACGAACATTAATACCCAAAGAACAGAAGTACATTG 1627
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1473 TGAAATAGATGTGATTTTTAATGCTGTGAAAGCCAGCTTACGAACATTAATACCCAAAGAACGGAAGTACATTG 1546
Query 1628 AAGAGGAAAACAGACTCTCTAAACAGCTGCTACTAAGAAACTTTATCAGAATGAAACGTTGTGTCATGGTGCTG 1701
|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||..||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1547 AAGAGGAAAACAGACTCTCTAAACAGCTGCTTCTAAGAAACTTTATCAGAACAAAACGTTGTGTCATAGTGCTT 1620
Query 1702 GTAAATGCTGCATACTACGTTAATAGTTGCTTTGATTGGGATTCACCCCCAAGGAGTCTCGCTGCTTTTGTG-- 1773
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1621 GTAAACGCTGCATACTACGTTAATAGTTGCTTTGATTGGGATTCGCCCCCAAGGAGTCTTGCTGCTTTTGTGCT 1694
Query 1774 --------GCCTTGTATGGGACTTT--------CAT-----------------------TAATGTC-------- 1800
.|.||||.|||.||||| ||| ||.||.|
Sbjct 1695 CTTTCTCCTCATTGTCTGGAACTTTGAGCTCTACATGATACCACTGCTGCTGTTGTTACTATTGACATGGAACT 1768
Query 1801 -------------------------------------------------------------------------- 1800
Sbjct 1769 ACTTCCTGATAATATCCGGGAAAGACAACAGGCAACGGGACACAGTAGTGGAGGACATGCTGGAGGACGAAGAG 1842
Query 1801 -------------------------------------------------------------------------- 1800
Sbjct 1843 GAAGAAGATGACAGAGATGACAAGGATGGTGAAAAGAAAGGATTTATAAATAAAATCTATGCGATCCAGGAAGT 1916
Query 1801 -------------------------------------------------------------------------- 1800
Sbjct 1917 CTGTGTCAGTGTGCAGAACATCCTAGATGAAGTGGCTTCCCTTGGTGAAAGGATAAAGAATACTTTCAACTGGA 1990
Query 1801 -------------------------------------------------------------------------- 1800
Sbjct 1991 CTGTCCCCTTCTTAAGCTGGCTGGCCATTGTAGCCCTGTGTGTGTTCACCGCCATTCTGTACTTCATCCCACTG 2064
Query 1801 -------------------------------------------------------------------------- 1800
Sbjct 2065 AGATACATTGTTCTTGTTTGGGGAATTAATAAATTTACAAAAAAGCTTCGGAGTCCATATGCAATTGATAACAA 2138
Query 1801 -------------------------------------------------------------------------- 1800
Sbjct 2139 TGAACTACTTGACTTCCTTTCCAGAGTTCCTTCAGATGTACAAGTGGTGCAGTACCAAGAACTGAAACCAGATC 2212
Query 1801 ----------------------------------------- 1800
Sbjct 2213 ATTCTCATAGCCCATACAAAAGGAAGAAAAACAACCTTGGC 2253
