Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475877
• Subject: NM_001354335.1
• Aligned Length: 4056
• Identities: 3578
• Gaps: 474

Alignment

Query    1  ATGGCTCACACCACAAAGGTTAACGGCAGTGCCTCAGGAAAAGCAGGTGATATTCTCAGTGGAGACCAGGACAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGAACAGAAAGACCCTTACTTTGTGGAGACCCCCTATGGTTATCAACTAGACTTAGATTTCCTCAAATATGTGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATGACATACAGAAGGGAAATACCATCAAAAGACTGAACATCCAGAAGAGGCGGAAGCCGTCCGTGCCATGCCCA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GAACCCAGGACCACATCTGGTCAGCAAGGTATATGGACTTCCACTGAATCCCTCTCATCCTCCAACAGTGATGA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CAACAAGCAGTGCCCCAACTTCCTCATAGCCAGAAGTCAAGTTACATCAACTCCAATCTCAAAGCCACCTCCCC  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  CTCTGGAGACCTCACTCCCTTTTCTTACCATCCCAGAAAATCGACAGCTGCCACCTCCCTCACCACAACTCCCA  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  AAGCATAACCTTCATGTCACCAAGACACTGATGGAGACCCGGAGAAGACTGGAACAGGAGAGAGCCACCATGCA  518
                                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------------------------ATGGAGACCCGGAGAAGACTGGAACAGGAGAGAGCCACCATGCA  44

Query  519  GATGACACCGGGTGAGTTCAGAAGGCCCAGGCTGGCCAGTTTTGGAGGCATGGGCACCACAAGCTCCCTCCCTT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   45  GATGACACCGGGTGAGTTCAGAAGGCCCAGGCTGGCCAGTTTTGGAGGCATGGGCACCACAAGCTCCCTCCCTT  118

Query  593  CTTTTGTGGGTTCTGGAAACCACAAGCCTGCCAAGCACCAGCTTCAGAATGGATACCAAGGTAATGGGGATTAT  666
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  119  CTTTTGTGGGTTCTGGAAACCACAATCCTGCCAAGCACCAGCTTCAGAATGGATACCAAGGTAATGGGGATTAT  192

Query  667  GGTAGCTATGCCCCAGCTGCTCCCACCACTTCCTCCATGGGGAGCTCCATCCGCCACAGCCCCCTGAGCTCAGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  193  GGTAGCTATGCCCCAGCTGCTCCCACCACTTCCTCCATGGGGAGCTCCATCCGCCACAGCCCCCTGAGCTCAGG  266

Query  741  GATCTCCACCCCAGTGACCAACGTGAGCCCCATGCACCTGCAGCACATCCGCGAGCAGATGGCCATTGCTCTGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  267  GATCTCCACCCCAGTGACCAACGTGAGCCCCATGCACCTGCAGCACATCCGCGAGCAGATGGCCATTGCTCTGA  340

Query  815  AACGCCTGAAGGAGCTGGAGGAGCAGGTGCGAACCATCCCTGTGCTCCAGGTAAAGATCTCTGTCTTGCAAGAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  341  AACGCCTGAAGGAGCTGGAGGAGCAGGTGCGAACCATCCCTGTGCTCCAGGTAAAGATCTCTGTCTTGCAAGAA  414

Query  889  GAGAAAAGGCAGTTGGTCTCACAGCTGAAAAACCAAAGGGCTGCATCCCAGATCAATGTCTGTGGTGTGAGGAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  415  GAGAAAAGGCAGTTGGTCTCACAGCTGAAAAACCAAAGGGCTGCATCCCAGATCAATGTCTGTGGTGTGAGGAA  488

Query  963  GCGGTCCTATAGTGCGGGGAACGCCTCCCAGCTGGAACAGCTCTCCCGGGCCCGAAGAAGTGGCGGGGAATTAT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  489  GCGGTCCTATAGTGCGGGGAACGCCTCCCAGCTGGAACAGCTCTCCCGGGCCCGAAGAAGTGGCGGGGAATTAT  562

Query 1037  ACATTGACTATGAGGAGGAAGAAATGGAGACCGTAGAACAGAGCACGCAGAGGATAAAGGAGTTCCGGCAACTT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  563  ACATTGACTATGAGGAGGAAGAAATGGAGACCGTAGAACAGAGCACGCAGAGGATAAAGGAGTTCCGGCAACTT  636

Query 1111  ACAGCAGACATGCAAGCCCTGGAGCAGAAGATCCAGGACAGCAGCTGTGAGGCCTCCTCAGAGCTCAGGGAGAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  637  ACAGCAGACATGCAAGCCCTGGAGCAGAAGATCCAGGACAGCAGCTGTGAGGCCTCCTCAGAGCTCAGGGAGAA  710

Query 1185  TGGAGAGTGCCGGTCTGTGGCTGTGGGTGCCGAGGAGAACATGAACGACATCGTCGTGTACCACAGAGGCTCCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  711  TGGAGAGTGCCGGTCTGTGGCTGTGGGTGCCGAGGAGAACATGAACGACATCGTCGTGTACCACAGAGGCTCCA  784

Query 1259  GGTCCTGTAAGGATGCAGCTGTAGGGACACTTGTTCAGATGAGAAATTGTGGGGTCAGCGTGACAGAGGCCATG  1332
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  785  GGTCCTGTAAGGATGCAGCTGTAGGGACACTTGTTGAGATGAGAAATTGTGGGGTCAGCGTGACAGAGGCCATG  858

Query 1333  CTTGGAGTGATGACTGAAGCTGACAAAGAAATTGAGCTGCAACAGCAGACCATAGAATCCTTGAAGGAAAAGAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  859  CTTGGAGTGATGACTGAAGCTGACAAAGAAATTGAGCTGCAACAGCAGACCATAGAATCCTTGAAGGAAAAGAT  932

Query 1407  CTATCGCCTAGAAGTACAGCTTAGAGAAACCACCCATGACCGGGAGATGACTAAACTGAAACAAGAGCTGCAGG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  933  CTATCGCCTAGAAGTACAGCTTAGAGAAACCACCCATGACCGGGAGATGACTAAACTGAAACAAGAGCTGCAGG  1006

Query 1481  CTGCTGGATCGAGGAAAAAGGTTGACAAAGCCACGATGGCCCAGCCGCTTGTTTTCAGTAAGGTGGTGGAGGCA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1007  CTGCTGGATCGAGGAAAAAGGTTGACAAAGCCACGATGGCCCAGCCGCTTGTTTTCAGTAAGGTGGTGGAGGCA  1080

Query 1555  GTGGTGCAGACCAGAGACCAAATGGTCGGCAGTCACATGGACCTGGTGGACACGTGTGTTGGGACCTCCGTGGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081  GTGGTGCAGACCAGAGACCAAATGGTCGGCAGTCACATGGACCTGGTGGACACGTGTGTTGGGACCTCCGTGGA  1154

Query 1629  AACAAACAGTGTAGGCATCTCCTGCCAGCCTGAATGTAAGAATAAAGTCGTAGGGCCTGAGCTGCCTATGAATT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1155  AACAAACAGTGTAGGCATCTCCTGCCAGCCTGAATGTAAGAATAAAGTCGTAGGGCCTGAGCTGCCTATGAATT  1228

Query 1703  GGTGGATTGTTAAGGAGAGGGTGGAAATGCATGACCGATGTGCTGGGAGGTCTGTGGAAATGTGTGACAAGAGT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1229  GGTGGATTGTTAAGGAGAGGGTGGAAATGCATGACCGATGTGCTGGGAGGTCTGTGGAAATGTGTGACAAGAGT  1302

Query 1777  GTGAGTGTGGAAGTCAGCGTCTGCGAAACAGGCAGCAACACAGAGGAGTCTGTGAATGACCTCACACTCCTCAA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1303  GTGAGTGTGGAAGTCAGCGTCTGCGAAACAGGCAGCAACACAGAGGAGTCTGTGAACGACCTCACACTCCTCAA  1376

Query 1851  GACAAACTTGAATCTCAAAGAAGTGCGGTCTATCGGTTGTGGAGATTGTTCTGTTGACGTGACCGTCTGCTCTC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1377  GACAAACTTGAATCTCAAAGAAGTGCGGTCTATCGGTTGTGGAGATTGTTCTGTTGACGTGACCGTCTGCTCTC  1450

Query 1925  CAAAGGAGTGCGCCTCCCGGGGCGTGAACACTGAGGCTGTTAGCCAGGTGGAAGCTGCCGTCATGGCAGTGCCT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1451  CAAAGGAGTGCGCCTCCCGGGGCGTGAACACTGAGGCTGTTAGCCAGGTGGAAGCTGCCGTCATGGCAGTGCCT  1524

Query 1999  CGTACTGCAGACCAGGACACTAGCACAGATTTGGAACAGGTGCACCAGTTCACCAACACCGAGACGGCCACCCT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1525  CGTACTGCAGACCAGGACACTAGCACAGATTTGGAACAGGTGCACCAGTTCACCAACACCGAGACGGCCACCCT  1598

Query 2073  CATAGAGTCCTGCACCAACACTTGTCTAAGCACTTTGGACAAGCAGACCAGCACCCAGACTGTGGAGACGCGGA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1599  CATAGAGTCCTGCACCAACACTTGTCTAAGCACTTTGGACAAGCAGACCAGCACCCAGACTGTGGAGACGCGGA  1672

Query 2147  CAGTAGCTGTAGGAGAAGGCCGTGTCAAGGACATCAACTCCTCCACCAAGACGCGGTCCATTGGTGTTGGAACG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1673  CAGTAGCTGTAGGAGAAGGCCGTGTCAAGGACATCAACTCCTCCACCAAGACGCGGTCCATTGGTGTTGGAACG  1746

Query 2221  TTGCTTTCTGGCCATTCTGGGTTTGACAGGCCATCAGCTGTGAAGACCAAAGAGTCAGGTGTGGGGCAGATAAA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1747  TTGCTTTCTGGCCATTCTGGGTTTGACAGGCCATCAGCTGTGAAGACCAAAGAGTCAGGTGTGGGGCAGATAAA  1820

Query 2295  TATTAACGACAACTATCTGGTTGGTCTCAAAATGAGGACTATAGCTTGTGGGCCACCACAGTTGACTGTGGGGC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1821  TATTAACGACAACTATCTGGTTGGTCTCAAAATGAGGACTATAGCTTGTGGGCCACCACAGTTGACTGTGGGGC  1894

Query 2369  TGACAGCCAGCAGAAGGAGCGTGGGGGTTGGGGATGACCCTGTAGGGGAATCTCTGGAGAACCCCCAGCCTCAA  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1895  TGACAGCCAGCAGAAGGAGCGTGGGGGTTGGGGATGACCCTGTAGGGGAATCTCTGGAGAACCCCCAGCCTCAA  1968

Query 2443  GCTCCACTTGGAATGATGACTGGCCTGGATCACTACATTGAGCGTATCCAGAAGCTGCTGGCAGAACAGCAGAC  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1969  GCTCCACTTGGAATGATGACTGGCCTGGATCACTACATTGAGCGTATCCAGAAGCTGCTGGCAGAACAGCAGAC  2042

Query 2517  ACTGCTGGCTGAGAACTACAGTGAACTGGCAGAAGCTTTCGGGGAACCTCACTCACAGATGGGCTCCCTCAACT  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2043  ACTGCTGGCTGAGAACTACAGTGAACTGGCAGAAGCTTTCGGGGAACCTCACTCACAGATGGGCTCCCTCAACT  2116

Query 2591  CTCAGCTCATCAGCACCCTGTCGTCTATCAACTCTGTCATGAAATCTGCAAGCACTGAAGAGCTGAGGAACCCT  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2117  CTCAGCTCATCAGCACCCTGTCGTCTATCAACTCTGTCATGAAATCTGCAAGCACTGAAGAGCTGAGGAACCCT  2190

Query 2665  GACTTCCAGAAAACCAGTCTGGGTAAAATCACAGGCAATTATTTGGGATATACCTGTAAGTGTGGGGGCCTTCA  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2191  GACTTCCAGAAAACCAGTCTGGGTAAAATCACAGGCAATTATTTGGGATATACCTGTAAGTGTGGGGGCCTTCA  2264

Query 2739  GTCAGGAAGTCCCTTAAGCTCCCAGACATCCCAGCCTGAGCAAGAAGTGGGGACCTCAGAAGGAAAGCCAATCA  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2265  GTCAGGAAGTCCCTTAAGCTCCCAGACATCCCAGCCTGAGCAAGAAGTGGGGACCTCAGAAGGAAAGCCAATCA  2338

Query 2813  GCAGCCTGGATGCCTTCCCCACTCAGGAAGGTACGCTGTCTCCAGTGAACCTGACAGACGACCAGATCGCCGCT  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2339  GCAGCCTGGATGCCTTCCCCACTCAGGAAGGTACGCTGTCTCCAGTGAACCTGACAGACGACCAGATCGCCGCT  2412

Query 2887  GGCCTCTATGCATGTACAAACAATGAAAGTACACTGAAGTCCATCATGAAGAAGAAAGATGGTAACAAAGATTC  2960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2413  GGCCTCTATGCATGTACAAACAATGAAAGTACACTGAAGTCCATCATGAAGAAGAAAGATGGTAACAAAGATTC  2486

Query 2961  AAATGGCGCAAAAAAGAATCTTCAGTTTGTTGGCATTAATGGAGGGTATGAAACAACTTCAAGTGATGATTCCA  3034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2487  AAATGGCGCAAAAAAGAATCTTCAGTTTGTTGGCATTAATGGAGGGTATGAAACAACTTCAAGTGATGATTCCA  2560

Query 3035  GCTCAGATGAAAGCTCTTCTTCCGAGTCAGATGACGAGTGTGATGTCATTGAGTATCCTCTTGAAGAAGAGGAG  3108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2561  GCTCAGATGAAAGCTCTTCTTCCGAGTCAGATGACGAGTGTGATGTCATTGAGTATCCTCTTGAAGAAGAGGAG  2634

Query 3109  GAGGAGGAGGATGAAGACACTCGGGGAATGGCAGAAGGGCACCATGCAGTTAATATTGAAGGTTTGAAGTCTGC  3182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2635  GAGGAGGAGGATGAAGACACTCGGGGAATGGCAGAAGGGCACCATGCAGTTAATATTGAAGGTTTGAAGTCTGC  2708

Query 3183  CAGGGTGGAAGATGAAATGCAGGTTCAAGAATGTGAACCTGAGAAGGTGGAAATCAGAGAGAGGTATGAATTAA  3256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2709  CAGGGTGGAAGATGAAATGCAGGTTCAAGAATGTGAACCTGAGAAGGTGGAAATCAGAGAGAGGTATGAATTAA  2782

Query 3257  GTGAAAAGATGTTGTCTGCATGCAACTTACTGAAAAATACTATAAATGACCCCAAAGCTTTGACCAGCAAAGAT  3330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2783  GTGAAAAGATGTTGTCTGCATGCAACTTACTGAAAAATACTATAAATGACCCCAAAGCTTTGACCAGCAAAGAT  2856

Query 3331  ATGAGGTTCTGTCTGAACACCCTCCAGCACGAGTGGTTCCGCGTGTCCAGTCAGAAGTCAGCCATTCCAGCCAT  3404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2857  ATGAGGTTCTGTCTGAACACCCTCCAGCACGAGTGGTTCCGCGTGTCCAGTCAGAAGTCAGCCATTCCAGCCAT  2930

Query 3405  GGTGGGGGACTACATAGCTGCTTTTGAGGCCATTTCCCCAGATGTCCTCCGCTATGTCATCAACTTGGCAGACG  3478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2931  GGTGGGGGACTACATAGCTGCTTTTGAGGCCATTTCCCCAGATGTCCTCCGCTATGTCATCAACTTGGCAGACG  3004

Query 3479  GCAACGGCAACACAGCCCTCCATTACAGCGTGTCCCACTCCAACTTCGAGATTGTGAAGCTGCTGTTAGATGCC  3552
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3005  GCAACGGCAACACAGCCCTCCATTACAGCGTGTCCCACTCCAACTTCGAGATTGTGAAGCTGCTGTTAGATGCC  3078

Query 3553  GATGTGTGTAATGTGGATCACCAGAACAAGGCAGGCTACACCCCCATCATGTTGGCGGCCCTCGCCGCTGTGGA  3626
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3079  GATGTGTGTAATGTGGATCACCAGAACAAGGCAGGCTACACCCCCATCATGTTGGCGGCCCTCGCCGCTGTGGA  3152

Query 3627  AGCAGAGAAGGACATGCGGATTGTGGAAGAACTCTTTGGCTGTGGGGATGTGAATGCCAAAGCTAGTCAGGCGG  3700
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3153  AGCAGAGAAGGACATGCGGATTGTGGAAGAACTCTTCGGCTGTGGGGATGTGAATGCCAAAGCTAGTCAGGCGG  3226

Query 3701  GACAGACGGCCCTCATGCTGGCGGTCAGTCACGGACGGATAGACATGGTGAAGGGCCTTCTGGCCTGTGGGGCT  3774
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3227  GACAGACGGCCCTCATGCTGGCGGTCAGTCACGGACGGATAGACATGGTGAAGGGCCTTCTGGCCTGTGGGGCT  3300

Query 3775  GATGTCAACATCCAGGATGACGAGGGCTCCACGGCCCTCATGTGTGCCAGCGAGCACGGGCACGTGGAGATTGT  3848
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3301  GATGTCAACATCCAGGATGACGAGGGCTCCACGGCCCTCATGTGTGCCAGCGAGCACGGGCACGTGGAGATTGT  3374

Query 3849  CAAGCTGCTGCTGGCCCAGCCCGGCTGCAACGGTCACCTAGAGGACAACGATGGCAGCACTGCGCTCTCAATCG  3922
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3375  CAAGCTGCTGCTGGCCCAGCCCGGCTGCAACGGTCACCTAGAGGACAACGATGGCAGCACTGCGCTCTCAATCG  3448

Query 3923  CCCTGGAAGCAGGACACAAGGACATCGCTGTTCTTCTGTATGCCCATGTCAACTTTGCAAAAGCCCAGTCTCCG  3996
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3449  CCCTGGAAGCAGGACACAAGGACATCGCTGTTCTTCTGTATGCCCATGTCAACTTTGCAAAAGCCCAGTCTCCG  3522

Query 3997  GGCACCCCTAGGCTTGGAAGGAAGACGTCTCCTGGCCCCACCCACCGAGGTTCATTTGAT  4056
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3523  GGCACCCCTAGGCTTGGAAGGAAGACGTCTCCTGGCCCCACCCACCGAGGTTCATTTGAT  3582