Protein Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000475877
Subject:
NM_001354336.1
Aligned Length:
1352
Identities:
1094
Gaps:
256

Alignment

Query    1  MAHTTKVNGSASGKAGDILSGDQDKEQKDPYFVETPYGYQLDLDFLKYVDDIQKGNTIKRLNIQKRRKPSVPCP  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  EPRTTSGQQGIWTSTESLSSSNSDDNKQCPNFLIARSQVTSTPISKPPPPLETSLPFLTIPENRQLPPPSPQLP  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  KHNLHVTKTLMETRRRLEQERATMQMTPGEFRRPRLASFGGMGTTSSLPSFVGSGNHKPAKHQLQNGYQGNGDY  222
                      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------METRRRLEQERATMQMTPGEFRRPRLASFGGMGTTSSLPSFVGSGNHNPAKHQLQNGYQGNGDY  64

Query  223  GSYAPAAPTTSSMGSSIRHSPLSSGISTPVTNVSPMHLQHIREQMAIALKRLKELEEQVRTIPVLQVKISVLQE  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   65  GSYAPAAPTTSSMGSSIRHSPLSSGISTPVTNVSPMHLQHIREQMAIALKRLKELEEQVRTIPVLQVKISVLQE  138

Query  297  EKRQLVSQLKNQRAASQINVCGVRKRSYSAGNASQLEQLSRARRSGGELYIDYEEEEMETVEQSTQRIKEFRQL  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  139  EKRQLVSQLKNQRAASQINVCGVRKRSYSAGNASQLEQLSRARRSGGELYIDYEEEEMETVEQSTQRIKEFRQL  212

Query  371  TADMQALEQKIQDSSCEASSELRENGECRSVAVGAEENMNDIVVYHRGSRSCKDAAVGTLVQMRNCGVSVTEAM  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  213  TADMQALEQKIQDSSCEASSELRENGECRSVAVGAEENMNDIVVYHRGSRSCKDAAVGTLVEMRNCGVSVTEAM  286

Query  445  LGVMTEADKEIELQQQTIESLKEKIYRLEVQLRETTHDREMTKLKQELQAAGSRKKVDKATMAQPLVFSKVVEA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  287  LGVMTEADKEIELQQQTIESLKEKIYRLEVQLRETTHDREMTKLKQELQAAGSRKKVDKATMAQPLVFSKVVEA  360

Query  519  VVQTRDQMVGSHMDLVDTCVGTSVETNSVGISCQPECKNKVVGPELPMNWWIVKERVEMHDRCAGRSVEMCDKS  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  VVQTRDQMVGSHMDLVDTCVGTSVETNSVGISCQPECKNKVVGPELPMNWWIVKERVEMHDRCAGRSVEMCDKS  434

Query  593  VSVEVSVCETGSNTEESVNDLTLLKTNLNLKEVRSIGCGDCSVDVTVCSPKECASRGVNTEAVSQVEAAVMAVP  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  435  VSVEVSVCETGSNTEESVNDLTLLKTNLNLKEVRSIGCGDCSVDVTVCSPKECASRGVNTEAVSQVEAAVMAVP  508

Query  667  RTADQDTSTDLEQVHQFTNTETATLIESCTNTCLSTLDKQTSTQTVETRTVAVGEGRVKDINSSTKTRSIGVGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  509  RTADQDTSTDLEQVHQFTNTETATLIESCTNTCLSTLDKQTSTQTVETRTVAVGEGRVKDINSSTKTRSIGVGT  582

Query  741  LLSGHSGFDRPSAVKTKESGVGQININDNYLVGLKMRTIACGPPQLTVGLTASRRSVGVGDDPVGESLENPQPQ  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  583  LLSGHSGFDRPSAVKTKESGVGQININDNYLVGLKMRTIACGPPQLTVGLTASRRSVGVGDDPVGESLENPQPQ  656

Query  815  APLGMMTGLDHYIERIQKLLAEQQTLLAENYSELAEAFGEPHSQMGSLNSQLISTLSSINSVMKSASTEELRNP  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  657  APLGMMTGLDHYIERIQKLLAEQQTLLAENYSELAEAFGEPHSQMGSLNSQLISTLSSINSVMKSASTEELRNP  730

Query  889  DFQKTSLGKITGNYLGYTCKCGGLQSGSPLSSQTSQPEQEVGTSEGKPISSLDAFPTQEGTLSPVNLTDDQIAA  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
Sbjct  731  DFQKTSLGKITGNYLGYTCKCGGLQSGSPLSSQTSQPEQEVGTSEGKPISSLDAFPTQE---------------  789

Query  963  GLYACTNNESTLKSIMKKKDGNKDSNGAKKNLQFVGINGGYETTSSDDSSSDESSSSESDDECDVIEYPLEEEE  1036
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                  
Sbjct  790  ---ACTNNESTLKSIMKKKDGNKDSNGAKKNLQFVGINGG----------------------------------  826

Query 1037  EEEDEDTRGMAEGHHAVNIEGLKSARVEDEMQVQECEPEKVEIRERYELSEKMLSACNLLKNTINDPKALTSKD  1110
                                                          ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  827  ----------------------------------------------YELSEKMLSACNLLKNTINDPKALTSKD  854

Query 1111  MRFCLNTLQHEWFRVSSQKSAIPAMVGDYIAAFEAISPDVLRYVINLADGNGNTALHYSVSHSNFEIVKLLLDA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  855  MRFCLNTLQHEWFRVSSQKSAIPAMVGDYIAAFEAISPDVLRYVINLADGNGNTALHYSVSHSNFEIVKLLLDA  928

Query 1185  DVCNVDHQNKAGYTPIMLAALAAVEAEKDMRIVEELFGCGDVNAKASQAGQTALMLAVSHGRIDMVKGLLACGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  929  DVCNVDHQNKAGYTPIMLAALAAVEAEKDMRIVEELFGCGDVNAKASQAGQTALMLAVSHGRIDMVKGLLACGA  1002

Query 1259  DVNIQDDEGSTALMCASEHGHVEIVKLLLAQPGCNGHLEDNDGSTALSIALEAGHKDIAVLLYAHVNFAKAQSP  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1003  DVNIQDDEGSTALMCASEHGHVEIVKLLLAQPGCNGHLEDNDGSTALSIALEAGHKDIAVLLYAHVNFAKAQSP  1076

Query 1333  GTPRLGRKTSPGPTHRGSFD  1352
            ||||||||||||||||||||
Sbjct 1077  GTPRLGRKTSPGPTHRGSFD  1096