Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475879
• Subject: NM_001003795.3
• Aligned Length: 2848
• Identities: 2846
• Gaps: 1

Alignment

Query    1  ATGGCCCAGGTAGCAGTGTCCACCCTGCCTGTTGAAGAAGAGTCCTCCTCAGAGACCAGGATGGTGGTGACATT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCCAGGTAGCAGTGTCCACCCTGCCTGTTGAAGAAGAGTCCTCCTCAGAGACCAGGATGGTGGTGACATT  74

Query   75  CCTCGTGTCTGCCCTCGAATCCATGTGTAAAGAACTGGCCAAGTCCAAGGCAGAAGTGGCCTGCATCGCAGTGT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTCGTGTCTGCCCTCGAATCCATGTGTAAAGAACTGGCCAAGTCCAAGGCAGAAGTGGCCTGCATCGCAGTGT  148

Query  149  ACGAAACAGACGTGTTTGTCGTCGGAACCGAGAGAGGATGCGCTTTTGTTAATGCCAGGACGGATTTTCAGAAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACGAAACAGACGTGTTTGTCGTCGGAACCGAGAGAGGATGCGCTTTTGTTAATGCCAGGACGGATTTTCAGAAA  222

Query  223  GATTTTGCAAAATACTGCGTTGCAGAGGGACTGTGTGAGGTGAAACCTCCCTGCCCTGTGAACGGGATGCAGGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GATTTTGCAAAATACTGCGTTGCAGAGGGACTGTGTGAGGTGAAACCTCCCTGCCCTGTGAACGGGATGCAGGT  296

Query  297  CCACTCGGGCGAAACGGAAATACTCAGGAAGGCAGTGGAGGACTATTTCTGCTTTTGTTATGGTAAAGCCTTAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCACTCGGGCGAAACGGAAATACTCAGGAAGGCAGTGGAGGACTATTTCTGCTTTTGTTATGGTAAAGCCTTAG  370

Query  371  GGACAACAGTGATGGTGCCTGTTCCCTATGAGAAGATGCTGCGAGACCAGTCGGCTGTGGTAGTGCAGGGGCTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGACAACAGTGATGGTGCCTGTTCCCTATGAGAAGATGCTGCGAGACCAGTCGGCTGTGGTAGTGCAGGGGCTT  444

Query  445  CCGGAAGGCGTTGCCTTTCAACACCCTGAGAATTACGACCTTGCAACCCTGAAATGGATTTTGGAGAACAAAGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCGGAAGGCGTTGCCTTTCAACACCCTGAGAATTACGACCTTGCAACCCTGAAATGGATTTTGGAGAACAAAGC  518

Query  519  AGGGATTTCATTCATCATAAATAGACCCTTCCTAGGACCAGAGAGTCAGCTGGGTGGCCCTGGGATGGTAACAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGGGATTTCATTCATCATAAATAGACCCTTCCTAGGACCAGAGAGTCAGCTGGGTGGCCCTGGGATGGTAACAG  592

Query  593  ATGCGGAGAGATCCATAGTATCACCAAGTGAAAGCTGCGGCCCCATCAATGTGAAAACTGAACCCATGGAAGAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGCGGAGAGATCCATAGTATCACCAAGTGAAAGCTGCGGCCCCATCAATGTGAAAACTGAACCCATGGAAGAT  666

Query  667  TCTGGCATTTCACTGAAAGCAGAAGCTGTCTCAGTCAAGAAAGAATCAGAAGATCCTAATTACTATCAATATAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCTGGCATTTCACTGAAAGCAGAAGCTGTCTCAGTCAAGAAAGAATCAGAAGATCCTAATTACTATCAATATAA  740

Query  741  TATGCAAGGAAGCCACCCTTCTTCCACAAGCAATGAAGTAATAGAAATGGAATTACCAATGGAAGATTCCACTC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TATGCAAGGAAGCCACCCTTCTTCCACAAGCAATGAAGTAATAGAAATGGAATTACCAATGGAAGATTCCACTC  814

Query  815  CGCTGGTCCCTTCAGAAGAACCAAATGAGGACCCTGAAGCCGAGGTGAAAATCGAAGGAAACACAAATTCATCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CGCTGGTCCCTTCAGAAGAACCAAATGAGGACCCTGAAGCCGAGGTGAAAATCGAAGGAAACACAAATTCATCC  888

Query  889  AGTGTTACAAATTCTGCAGCAGGTGTTGAAGATCTTAACATCGTTCAAGTGACTGTTCCAGATAATGAGAAGGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGTGTTACAAATTCTGCAGCAGGTGTTGAAGATCTTAACATCGTTCAAGTGACTGTTCCAGATAATGAGAAGGA  962

Query  963  AAGATTATCAAGCATTGAAAAGATTAAACAGCTAAGAGAACAAGTTAATGACCTCTTTAGCCGAAAATTTGGTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AAGATTATCAAGCATTGAAAAGATTAAACAGCTAAGAGAACAAGTTAATGACCTCTTTAGCCGAAAATTTGGTG  1036

Query 1037  AAGCAATTGGCGTGGATTTCCCTGTGAAAGTTCCCTACAGGAAGATCACATTCAACCCTGGCTGTGTGGTGATT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AAGCAATTGGCGTGGATTTCCCTGTGAAAGTTCCCTACAGGAAGATCACATTCAACCCTGGCTGTGTGGTGATT  1110

Query 1111  GATGGCATGCCCCCGGGGGTGGTATTCAAGGCCCCCGGCTATCTGGAAATCAGTTCCATGAGGAGGATCTTGGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GATGGCATGCCCCCGGGGGTGGTATTCAAGGCCCCCGGCTATCTGGAAATCAGTTCCATGAGGAGGATCTTGGA  1184

Query 1185  GGCAGCTGAGTTTATCAAATTCACAGTCATCAGGCCGCTTCCAGGGCTTGAGCTCAGTAATGTGGGAAAACGCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGCAGCTGAGTTTATCAAATTCACAGTCATCAGGCCGCTTCCAGGGCTTGAGCTCAGTAATGTGGGAAAACGCA  1258

Query 1259  AGATAGACCAGGAGGGCCGTGTGTTTCAAGAAAAGTGGGAGAGAGCGTATTTCTTCGTGGAAGTACAGAATATT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGATAGACCAGGAGGGCCGTGTGTTTCAAGAAAAGTGGGAGAGAGCGTATTTCTTCGTGGAAGTACAGAATATT  1332

Query 1333  CCAACATGTCTCATATGCAAACAAAGCATGTCTGTGTCCAAAGAATATAACCTAAGACGCCACTATCAAACCAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCAACATGTCTCATATGCAAACAAAGCATGTCTGTGTCCAAAGAATATAACCTAAGACGCCACTATCAAACCAA  1406

Query 1407  TCACAGCAAGCATTATGACCAGTATACGGAAAGAATGCGTGACGAGAAGCTTCACGAGCTGAAAAAAGGGCTCA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TCACAGCAAGCATTATGACCAGTATACGGAAAGAATGCGTGACGAGAAGCTTCACGAGCTGAAAAAAGGGCTCA  1480

Query 1481  GGAAGTATCTCTTAGGCTCGTCAGACACCGAGTGTCCCGAGCAAAAACAAGTGTTTGCAAACCCAAGTCCAACC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GGAAGTATCTCTTAGGCTCGTCAGACACCGAGTGTCCCGAGCAAAAACAAGTGTTTGCAAACCCAAGTCCAACC  1554

Query 1555  CAGAAATCCCCCGTGCAGCCTGTAGAGGACCTAGCTGGGAACTTATGGGAGAAGTTACGTGAAAAAATCAGGTC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CAGAAATCCCCCGTGCAGCCTGTAGAGGACCTAGCTGGGAACTTATGGGAGAAGTTACGTGAAAAAATCAGGTC  1628

Query 1629  TTTTGTGGCATATTCTATCGCAATCGATGAGATCACGGATATAAATAATACCACCCAGTTGGCCATATTCATCC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TTTTGTGGCATATTCTATCGCAATCGATGAGATCACGGATATAAATAATACCACCCAGTTGGCCATATTCATCC  1702

Query 1703  GTGGTGTCGATGAGAATTTCGATGTGTCCGAAGAACTTCTGGACACGGTGCCCATGACGGGTACAAAATCTGGC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GTGGTGTCGATGAGAATTTCGATGTGTCCGAAGAACTTCTGGACACGGTGCCCATGACGGGTACAAAATCTGGC  1776

Query 1777  AACGAGATCTTTTTGCGTGTTGAGAAGAGCCTGAAAAAGTTCTGTATCAACTGGTCGAGATTAGTAAGCGTGGC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AACGAGATCTTTTTGCGTGTTGAGAAGAGCCTGAAAAAGTTCTGTATCAACTGGTCGAGATTAGTAAGCGTGGC  1850

Query 1851  CTCCACTGGCACCCCAGCGATGGTGGATGCCAATAACGGGCTTGTCACAAAACTGAAGTCCAGGGTGGCGACGT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CTCCACTGGCACCCCAGCGATGGTGGATGCCAATAACGGGCTTGTCACAAAACTGAAGTCCAGGGTGGCGACGT  1924

Query 1925  TCTGCAAGGGTGCGGAACTGAAGTCCATCTGTTGTATAATTCATCCGGAATCACTCTGTGCTCAGAAGTTGAAG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TCTGCAAGGGTGCGGAACTGAAGTCCATCTGTTGTATAATTCATCCGGAATCACTCTGTGCTCAGAAGTTGAAG  1998

Query 1999  ATGGACCACGTCATGGACGTGGTAGTGAAGTCCGTGAACTGGATATGCTCCCGGGGACTGAACCACAGCGAGTT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  ATGGACCACGTCATGGACGTGGTAGTGAAGTCCGTGAACTGGATATGCTCCCGGGGACTGAACCACAGCGAGTT  2072

Query 2073  CACAACCTTGCTCTATGAGCTGGACAGCCAGTATGGTAGCCTCCTGTACTACACGGAGATTAAGTGGCTCAGTC  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CACAACCTTGCTCTATGAGCTGGACAGCCAGTATGGTAGCCTCCTGTACTACACGGAGATTAAGTGGCTCAGTC  2146

Query 2147  GCGGGCTCGTGCTAAAGAGATTTTTCGAATCCTTGGAAGAAATCGACTCCTTCATGTCATCCAGAGGGAAACCC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  GCGGGCTCGTGCTAAAGAGATTTTTCGAATCCTTGGAAGAAATCGACTCCTTCATGTCATCCAGAGGGAAACCC  2220

Query 2221  CTGCCTCAACTGAGCTCCATAGATTGGATCCGAGACCTGGCCTTCTTGGTTGACATGACGATGCATCTGAACGC  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CTGCCTCAACTGAGCTCCATAGATTGGATCCGAGACCTGGCCTTCTTGGTTGACATGACGATGCATCTGAACGC  2294

Query 2295  TTTGAACATCTCTCTCCAAGGACACTCCCAAATCGTCACGCAGATGTATGACCTGATCCGGGCGTTCCTAGCAA  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TTTGAACATCTCTCTCCAAGGACACTCCCAAATCGTCACGCAGATGTATGACCTGATCCGGGCGTTCCTAGCAA  2368

Query 2369  AACTGTGCCTCTGGGAGACTCATTTGACGAGGAATAATCTGGCCCACTTTCCCACCCTGAAATTGGTTTCCAGA  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  AACTGTGCCTCTGGGAGACTCATTTGACGAGGAATAATCTGGCCCACTTTCCCACCCTGAAATTGGTTTCCAGA  2442

Query 2443  AATGAAAGCGATGGCCTGAACTACATTCCCAAAATCGCGGAACTCAAGACCGAATTCCAGAAAAGGCTGTCTGA  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  AATGAAAGCGATGGCCTGAACTACATTCCCAAAATCGCGGAACTCAAGACCGAATTCCAGAAAAGGCTGTCTGA  2516

Query 2517  TTTCAAACTCTACGAAAGCGAACTGACTCTGTTCAGCTCCCCGTTTTCCACGAAGATCGACAGTGTGCACGAGG  2590
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  TTTCAAACTCTACGAAAGCGAACTGACTCTGTTCAGCTCCCCGTTCTCCACGAAGATCGACAGTGTGCACGAGG  2590

Query 2591  AGCTCCAGATGGAGGTTATCGACCTGCAATGCAACACGGTCCTGAAGACGAAATACGACAAGGTGGGAATACCA  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  AGCTCCAGATGGAGGTTATCGACCTGCAATGCAACACGGTCCTGAAGACGAAATACGACAAGGTGGGAATACCA  2664

Query 2665  GAATTCTACAAGTACCTCTGGGGTAGCTACCCGAAATACAAGCACCATTGCGCAAAGATTCTTTCCATGTTCGG  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  GAATTCTACAAGTACCTCTGGGGTAGCTACCCGAAATACAAGCACCATTGCGCAAAGATTCTTTCCATGTTCGG  2738

Query 2739  GAGCACCTACATCTGCGAACAGCTGTTCTCCATTATGAAACTGAGCAAAACAAAATACTGCTCCCAGTTAAAGG  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  GAGCACCTACATCTGCGAACAGCTGTTCTCCATTATGAAACTGAGCAAAACAAAATACTGCTCCCAGTTAAAGG  2812

Query 2813  ATTCCCAGTGGGATTCTGTACTCCACCATCGCAACG  2848
            ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2813  ATTCCCAGTGGGATTCTGTACTCCA-CATCGCAACG  2847