Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475880
• Subject: XM_006502327.2
• Aligned Length: 1410
• Identities: 1229
• Gaps: 87

Alignment

Query    1  ATGAAGGAGCCGGATGCCATCAAGCTGTTTGTGGGGCAGATCCCGAGGCACCTGGAGGAGAAGGACCTGAAGCC  74
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGGAGCCAGATGCCATCAAGCTGTTTGTGGGGCAGATCCCGAGGCATCTGGAGGAAAAGGACCTGAAGCC  74

Query   75  CATCTTCGAACAGTTTGGTCGGATCTTTGAGCTGACTGTCATCAAGGACAAGTACACCGGGCTGCACAAGGGAT  148
            |||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CATCTTCGAGCAGTTTGGTCGGATCTTCGAGCTGACTGTCATCAAGGACAAGTACACCGGGCTGCACAAGGGAT  148

Query  149  GTGCCTTCCTGACATACTGTGCCCGGGATTCAGCCCTGAAGGCCCAGAGCGCCCTGCACGAACAGAAGACGCTT  222
            ||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.
Sbjct  149  GTGCTTTCCTGACGTACTGTGCTCGCGATTCAGCCCTGAAGGCCCAGAGTGCCCTGCACGAACAGAAGACTCTC  222

Query  223  CCAGGGATGAACAGGCCGATCCAGGTCAAGCCAGCCGACAGCGAGAGCCGAGGAGAAGACCGGAAGCTCTTTGT  296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCAGGGATGAACAGGCCGATCCAGGTCAAGCCAGCCGACAGCGAGAGTCGAGGAGAAGACCGGAAGCTCTTTGT  296

Query  297  GGGGATGCTAGGGAAGCAGCAGACAGATGAGGACGTCCGGAAGATGTTTGAGCCCTTCGGGACCATCGACGAGT  370
            |||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||||
Sbjct  297  GGGCATGCTAGGAAAGCAGCAGACAGATGAGGATGTCCGGAAGATGTTTGAACCATTTGGGACTATAGACGAGT  370

Query  371  GCACTGTGCTCCGGGGGCCAGATGGCACCAGCAAAGGCTGCGCCTTCGTGAAGTTCCAGACCCACGCTGAGGCC  444
            ||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  371  GCACTGTGCTCCGGGGGCCAGACGGTACCAGCAAAGGCTGTGCCTTTGTGAAGTTCCAGACTCACGCTGAGGCC  444

Query  445  AAGGCGGCCATCAACACCCTTCACAGCAGCCGGACCCTGCCAGGTGCCTCGTCCAGCCTGGTGGTGAAGTTTGC  518
            .||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct  445  CAGGCAGCCATCAACACCCTTCACAGCAGCCGGACCCTACCGGGTGCCTCATCCAGCCTGGTGGTAAAGTTTGC  518

Query  519  TGACACTGAGAAGGAGCGAGGTCTCCGCCGCATGCAGCAGGTGGCCACCCAGTTGGGCATGTTCAGCCCCATCA  592
            ||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||.|||.
Sbjct  519  TGACACGGAGAAGGAGCGAGGTCTCCGTCGAATGCAGCAGGTGGCTACCCAGCTGGGCATGTTCAGCCCGATCG  592

Query  593  CCCTCCAGTTTGGAGCCTACAGCGCCTACACCCAGGCCCTGATGCAGCAGCAGGCGGCCCTGGTAGCGGCTCAC  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  593  CCCTCCAGTTTGGAGCCTACAGCGCCTACACCCAGGCCCTGATGCAGCAGCAGGCGGCCCTGGTAGCAGCTCAC  666

Query  667  AGTGCCTACCTCAGCCCCATGGCCACCATGGCTGCCGTGCAGATGCAGCACATGGCTGCCATCAATGCCAATGG  740
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  667  AGTGCCTACCTCAGCCCTATGGCCACCATGGCTGCCGTGCAGATGCAGCACATGGCTGCCATCAGTGCCAATGG  740

Query  741  CCTCATCGCCACCCCCATCACCCCATCCTCAGGAACCAGCACCCCTCCTGCCATCGCTGCCACGCCTGTCTCTG  814
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  741  CCTCATCGCCACCCCCATCACTCCATCCTCAGGAACCAGCACCCCTCCTGCCATTGCTGCCACGCCCGTCTCTG  814

Query  815  CCATTCCGGCTGCCCTGGGCGTCAACGGCTACAGCCAGGTGCCCACCCAGCCCACTGGGCAGCCTGCCCCTGAT  888
            ||||.||.||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct  815  CCATCCCTGCTGCCTTGGGCGTCAACGGCTACAGCCCGGTGCCCACCCAGCCTACAGGGCAGCCTGCCCCGGAT  888

Query  889  GCTCTGTATCCCAACGGGGTTCACCCCTACCCAGCCCA-GAGCCCCGCGGCCCCCGTGGACCCCCTGC----AG  957
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||   | |||.|.|          ||     .||||    ||
Sbjct  889  GCTCTGTATCCCAACGGGGTTCACCCTTACCCAG---ATGAGGCTC----------TG-----TCTGCTGAGAG  944

Query  958  CAGGCCTACGCGGGGATGCAGCACTACACAGCCTA----CCCAGCAGCCTACAGCCTGGTTGCACCTGCGTTCC  1027
            .||..|| .||||||.|.|            |.||    |||||  |||.|| .|.|||     |.||.|.|  
Sbjct  945  AAGTGCT-GGCGGGGTTCC------------CATAATGTCCCAG--GCCCAC-TCATGG-----CTTGTGAT--  995

Query 1028  CGCAGCCTCCAGCCCTGGTCGCCCAGCAGCCCCC----ACCACCACCTCAACAGCAGCAGC---AGCAGCA--G  1092
             ||...||.||||||.|  .||||.|||||||||    ||     ||||..||||||  ||   .||||.|  |
Sbjct  996  -GCTCTCTGCAGCCCAG--AGCCCGGCAGCCCCCGTGGAC-----CCTCTCCAGCAG--GCCTATGCAGGAATG  1059

Query 1093  CAGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAAAGAGAAGGCCCTGATGGCTGCAACATCTTCATCTACCACCTGCCCCAGGA  1166
            ||||| |.|||                 .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1060  CAGCA-CTACA-----------------CAGGCCCTGATGGCTGCAACATCTTCATCTACCACCTGCCCCAGGA  1115

Query 1167  GTTCACTGACTCAGAGATCCTCCAGATGTTTGTCCCCTTTGGCCACGTCATCTCAGCCAAAGTCTTTGTTGACC  1240
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1116  GTTCACAGACTCAGAGATCCTCCAGATGTTTGTCCCTTTTGGTCATGTCATCTCAGCCAAAGTCTTTGTTGACC  1189

Query 1241  GAGCCACCAATCAAAGCAAATGTTTTGGCTTTGTGAGTTTCGACAATCCGGCCAGTGCCCAGGCTGCCATCCAG  1314
            |.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1190  GGGCCACCAATCAGAGCAAATGTTTTGGCTTTGTGAGTTTCGACAATCCGGCCAGTGCCCAGGCTGCCATCCAG  1263

Query 1315  GCCATGAATGGCTTCCAGATCGGCATGAAGCGCCTCAAAGTCCAGCTAAAGCGGCCTAAGGATGCCAACCGGCC  1388
            ||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||
Sbjct 1264  GCTATGAACGGTTTCCAGATTGGCATGAAGCGCCTCAAAGTCCAGCTAAAGCGGCCTAAGGATGCAAACAGGCC  1337

Query 1389  CTAC  1392
            ||||
Sbjct 1338  CTAC  1341