Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475880
• Subject: XM_006502332.2
• Aligned Length: 1482
• Identities: 1094
• Gaps: 321

Alignment

Query    1  ATGAAGGAGCCGGATGCCATCAAGCTGTTTGTGGGGCAGATCCCGAGGCACCTGGAGGAGAAGGACCTGAAGCC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CATCTTCGAACAGTTTGGTCGGATCTTTGAGCTGACTGTCATCAAGGACAAGTACACCGGGCTGCACAAGGGAT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GTGCCTTCCTGACATACTGTGCCCGGGATTCAGCCCTGAAGGCCCAGAGCGCCCTGCACGAACAGAAGACGCTT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CCAGGGATGAACAGGCCGATCCAGGTCAAGCCAGCCGACAGCGAGAGCCGAGGAGAAGACCGGAAGCTCTTTGT  296
                  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||   ||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------ATGAACAGGCCGATCCAGGTCAAGCCAGCCGACAGCGAGAGTCGAGG---AGACCGGAAGCTCTTTGT  65

Query  297  GGGGATGCTAGGGAAGCAGCAGACAGATGAGGACGTCCGGAAGATGTTTGAGCCCTTCGGGACCATCGACGAGT  370
            |||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||||
Sbjct   66  GGGCATGCTAGGAAAGCAGCAGACAGATGAGGATGTCCGGAAGATGTTTGAACCATTTGGGACTATAGACGAGT  139

Query  371  GCACTGTGCTCCGGGGGCCAGATGGCACCAGCAAAGGCTGCGCCTTCGTGAAGTTCCAGACCCACGCTGAGGCC  444
            ||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  140  GCACTGTGCTCCGGGGGCCAGACGGTACCAGCAAAGGCTGTGCCTTTGTGAAGTTCCAGACTCACGCTGAGGCC  213

Query  445  AAGGCGGCCATCAACACCCTTCACAGCAGCCGGACCCTGCCAGGTGCCTCGTCCAGCCTGGTGGTGAAGTTTGC  518
            .||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct  214  CAGGCAGCCATCAACACCCTTCACAGCAGCCGGACCCTACCGGGTGCCTCATCCAGCCTGGTGGTAAAGTTTGC  287

Query  519  TGACACTGAGAAGGAGCGAGGTCTCCGCCGCATGCAGCAGGTGGCCACCCAGTTGGGCATGTTCAGCCCCATCA  592
            ||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||.|||.
Sbjct  288  TGACACGGAGAAGGAGCGAGGTCTCCGTCGAATGCAGCAGGTGGCTACCCAGCTGGGCATGTTCAGCCCGATCG  361

Query  593  CCCTCCAGTTTGGAGCCTACAGCGCCTACACCCAGGCCCTGATGCAGCAGCAGGCGGCCCTGGTAGCGGCTCAC  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  362  CCCTCCAGTTTGGAGCCTACAGCGCCTACACCCAGGCCCTGATGCAGCAGCAGGCGGCCCTGGTAGCAGCTCAC  435

Query  667  AGTGCCTACCTCAGCCCCATGGCCACCATGGCTGCCGTGCAGATGCAGCACATGGCTGCCATCAATGCCAATGG  740
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  436  AGTGCCTACCTCAGCCCTATGGCCACCATGGCTGCCGTGCAGATGCAGCACATGGCTGCCATCAGTGCCAATGG  509

Query  741  CCTCATCGCCACCCCCATCACCCCATCCTCAGGAACCAGCACCCCTCCTGCCATCGCTGCCACGCCTGTCTCTG  814
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  510  CCTCATCGCCACCCCCATCACTCCATCCTCAGGAACCAGCACCCCTCCTGCCATTGCTGCCACGCCCGTCTCTG  583

Query  815  CCATTCCGGCTGCCCTGGGCGTCAACGGCTACAGCCAGGTGCCCACCCAGCCCACTGGGCAGCCTGCCCCTGAT  888
            ||||.||.||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct  584  CCATCCCTGCTGCCTTGGGCGTCAACGGCTACAGCCCGGTGCCCACCCAGCCTACAGGGCAGCCTGCCCCGGAT  657

Query  889  GCTCTGTATCCCAACGGGGTTCACCCCTACC-------------------------------------------  919
            ||||||||||||||||||||||||||.||||                                           
Sbjct  658  GCTCTGTATCCCAACGGGGTTCACCCTTACCCAGATGAGGCTCTGTCTGCTGAGAGAAGTGCTGGCGGGGTTCC  731

Query  920  -----------------------------------------CAGCCCAGAGCCCCGCGGCCCCCGTGGACCCCC  952
                                                     |||||||||||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct  732  CATAATGTCCCAGGCCCACTCATGGCTTGTGATGCTCTCTGCAGCCCAGAGCCCGGCAGCCCCCGTGGACCCTC  805

Query  953  TGCAGCAGGCCTACGCGGGGATGCAGCACTACA---CAGCCTACCCAGCAGCCTACAGCCTGGTTGCACCTGCG  1023
            |.|||||||||||.||.||.|||||||||||||   ||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  806  TCCAGCAGGCCTATGCAGGAATGCAGCACTACACAGCAGCGTACCCCGCAGCCTACAGCCTGGTTGCACCTGCG  879

Query 1024  TTCCCGCAGCCTCCAGCCCTGGTCGCCCAGCAGCCCCCACCACCACCTCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCA  1097
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct  880  TTCCCGCAGCCTCCAGCCCTGGTTGCCCAGCAGCCCCCACCACCACCTCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCA  953

Query 1098  GCAACAG---CAGCAGCAGCAAAGAGAAGGCCCTGATGGCTGCAACATCTTCATCTACCACCTGCCCCAGGAGT  1168
            |||||||   ||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  954  GCAACAGCAACAGCAGCAGCAACGGGAAGGCCCTGATGGCTGCAACATCTTCATCTACCACCTGCCCCAGGAGT  1027

Query 1169  TCACTGACTCAGAGATCCTCCAGATGTTTGTCCCCTTTGGCCACGTCATCTCAGCCAAAGTCTTTGTTGACCGA  1242
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1028  TCACAGACTCAGAGATCCTCCAGATGTTTGTCCCTTTTGGTCATGTCATCTCAGCCAAAGTCTTTGTTGACCGG  1101

Query 1243  GCCACCAATCAAAGCAAATGTTTTGGCTTTGTGAGTTTCGACAATCCGGCCAGTGCCCAGGCTGCCATCCAGGC  1316
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1102  GCCACCAATCAGAGCAAATGTTTTGGCTTTGTGAGTTTCGACAATCCGGCCAGTGCCCAGGCTGCCATCCAGGC  1175

Query 1317  CATGAATGGCTTCCAGATCGGCATGAAGCGCCTCAAAGTCCAGCTAAAGCGGCCTAAGGATGCCAACCGGCCCT  1390
            .|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||
Sbjct 1176  TATGAACGGTTTCCAGATTGGCATGAAGCGCCTCAAAGTCCAGCTAAAGCGGCCTAAGGATGCAAACAGGCCCT  1249

Query 1391  AC  1392
            ||
Sbjct 1250  AC  1251