Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000475880
- Subject:
- XM_011240284.1
- Aligned Length:
- 1410
- Identities:
- 1226
- Gaps:
- 90
Alignment
Query 1 ATGAAGGAGCCGGATGCCATCAAGCTGTTTGTGGGGCAGATCCCGAGGCACCTGGAGGAGAAGGACCTGAAGCC 74
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAGGAGCCAGATGCCATCAAGCTGTTTGTGGGGCAGATCCCGAGGCATCTGGAGGAAAAGGACCTGAAGCC 74
Query 75 CATCTTCGAACAGTTTGGTCGGATCTTTGAGCTGACTGTCATCAAGGACAAGTACACCGGGCTGCACAAGGGAT 148
|||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CATCTTCGAGCAGTTTGGTCGGATCTTCGAGCTGACTGTCATCAAGGACAAGTACACCGGGCTGCACAAGGGAT 148
Query 149 GTGCCTTCCTGACATACTGTGCCCGGGATTCAGCCCTGAAGGCCCAGAGCGCCCTGCACGAACAGAAGACGCTT 222
||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 149 GTGCTTTCCTGACGTACTGTGCTCGCGATTCAGCCCTGAAGGCCCAGAGTGCCCTGCACGAACAGAAGACTCTC 222
Query 223 CCAGGGATGAACAGGCCGATCCAGGTCAAGCCAGCCGACAGCGAGAGCCGAGGAGAAGACCGGAAGCTCTTTGT 296
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 223 CCAGGGATGAACAGGCCGATCCAGGTCAAGCCAGCCGACAGCGAGAGTCGAGG---AGACCGGAAGCTCTTTGT 293
Query 297 GGGGATGCTAGGGAAGCAGCAGACAGATGAGGACGTCCGGAAGATGTTTGAGCCCTTCGGGACCATCGACGAGT 370
|||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||||
Sbjct 294 GGGCATGCTAGGAAAGCAGCAGACAGATGAGGATGTCCGGAAGATGTTTGAACCATTTGGGACTATAGACGAGT 367
Query 371 GCACTGTGCTCCGGGGGCCAGATGGCACCAGCAAAGGCTGCGCCTTCGTGAAGTTCCAGACCCACGCTGAGGCC 444
||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 368 GCACTGTGCTCCGGGGGCCAGACGGTACCAGCAAAGGCTGTGCCTTTGTGAAGTTCCAGACTCACGCTGAGGCC 441
Query 445 AAGGCGGCCATCAACACCCTTCACAGCAGCCGGACCCTGCCAGGTGCCTCGTCCAGCCTGGTGGTGAAGTTTGC 518
.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 442 CAGGCAGCCATCAACACCCTTCACAGCAGCCGGACCCTACCGGGTGCCTCATCCAGCCTGGTGGTAAAGTTTGC 515
Query 519 TGACACTGAGAAGGAGCGAGGTCTCCGCCGCATGCAGCAGGTGGCCACCCAGTTGGGCATGTTCAGCCCCATCA 592
||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||.|||.
Sbjct 516 TGACACGGAGAAGGAGCGAGGTCTCCGTCGAATGCAGCAGGTGGCTACCCAGCTGGGCATGTTCAGCCCGATCG 589
Query 593 CCCTCCAGTTTGGAGCCTACAGCGCCTACACCCAGGCCCTGATGCAGCAGCAGGCGGCCCTGGTAGCGGCTCAC 666
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 590 CCCTCCAGTTTGGAGCCTACAGCGCCTACACCCAGGCCCTGATGCAGCAGCAGGCGGCCCTGGTAGCAGCTCAC 663
Query 667 AGTGCCTACCTCAGCCCCATGGCCACCATGGCTGCCGTGCAGATGCAGCACATGGCTGCCATCAATGCCAATGG 740
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 664 AGTGCCTACCTCAGCCCTATGGCCACCATGGCTGCCGTGCAGATGCAGCACATGGCTGCCATCAGTGCCAATGG 737
Query 741 CCTCATCGCCACCCCCATCACCCCATCCTCAGGAACCAGCACCCCTCCTGCCATCGCTGCCACGCCTGTCTCTG 814
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 738 CCTCATCGCCACCCCCATCACTCCATCCTCAGGAACCAGCACCCCTCCTGCCATTGCTGCCACGCCCGTCTCTG 811
Query 815 CCATTCCGGCTGCCCTGGGCGTCAACGGCTACAGCCAGGTGCCCACCCAGCCCACTGGGCAGCCTGCCCCTGAT 888
||||.||.||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct 812 CCATCCCTGCTGCCTTGGGCGTCAACGGCTACAGCCCGGTGCCCACCCAGCCTACAGGGCAGCCTGCCCCGGAT 885
Query 889 GCTCTGTATCCCAACGGGGTTCACCCCTACCCAGCCCA-GAGCCCCGCGGCCCCCGTGGACCCCCTGC----AG 957
||||||||||||||||||||||||||.||||||| | |||.|.| || .|||| ||
Sbjct 886 GCTCTGTATCCCAACGGGGTTCACCCTTACCCAG---ATGAGGCTC----------TG-----TCTGCTGAGAG 941
Query 958 CAGGCCTACGCGGGGATGCAGCACTACACAGCCTA----CCCAGCAGCCTACAGCCTGGTTGCACCTGCGTTCC 1027
.||..|| .||||||.|.| |.|| ||||| |||.|| .|.||| |.||.|.|
Sbjct 942 AAGTGCT-GGCGGGGTTCC------------CATAATGTCCCAG--GCCCAC-TCATGG-----CTTGTGAT-- 992
Query 1028 CGCAGCCTCCAGCCCTGGTCGCCCAGCAGCCCCC----ACCACCACCTCAACAGCAGCAGC---AGCAGCA--G 1092
||...||.||||||.| .||||.||||||||| || ||||..|||||| || .||||.| |
Sbjct 993 -GCTCTCTGCAGCCCAG--AGCCCGGCAGCCCCCGTGGAC-----CCTCTCCAGCAG--GCCTATGCAGGAATG 1056
Query 1093 CAGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAAAGAGAAGGCCCTGATGGCTGCAACATCTTCATCTACCACCTGCCCCAGGA 1166
||||| |.||| .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1057 CAGCA-CTACA-----------------CAGGCCCTGATGGCTGCAACATCTTCATCTACCACCTGCCCCAGGA 1112
Query 1167 GTTCACTGACTCAGAGATCCTCCAGATGTTTGTCCCCTTTGGCCACGTCATCTCAGCCAAAGTCTTTGTTGACC 1240
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1113 GTTCACAGACTCAGAGATCCTCCAGATGTTTGTCCCTTTTGGTCATGTCATCTCAGCCAAAGTCTTTGTTGACC 1186
Query 1241 GAGCCACCAATCAAAGCAAATGTTTTGGCTTTGTGAGTTTCGACAATCCGGCCAGTGCCCAGGCTGCCATCCAG 1314
|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1187 GGGCCACCAATCAGAGCAAATGTTTTGGCTTTGTGAGTTTCGACAATCCGGCCAGTGCCCAGGCTGCCATCCAG 1260
Query 1315 GCCATGAATGGCTTCCAGATCGGCATGAAGCGCCTCAAAGTCCAGCTAAAGCGGCCTAAGGATGCCAACCGGCC 1388
||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||
Sbjct 1261 GCTATGAACGGTTTCCAGATTGGCATGAAGCGCCTCAAAGTCCAGCTAAAGCGGCCTAAGGATGCAAACAGGCC 1334
Query 1389 CTAC 1392
||||
Sbjct 1335 CTAC 1338