Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000475909
- Subject:
- XM_024450075.1
- Aligned Length:
- 3258
- Identities:
- 3033
- Gaps:
- 225
Alignment
Query 1 ATGAGGGTCTTCCTGCTTTGTGCCTACATACTGCTGCTGATGGTTTCCCAGTTGAGGGCAGTCAGCTTTCCTGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGGGTCTTCCTGCTTTGTGCCTACATACTGCTGCTGATGGTTTCCCAGTTGAGGGCAGTCAGCTTTCCTGA 74
Query 75 AGATGATGAACCCCTTAATACTGTCGACTATCACTATTCAAGGCAATATCCGGTTTTTAGAGGACGCCCTTCAG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGATGATGAACCCCTTAATACTGTCGACTATCACTATTCAAGGCAATATCCGGTTTTTAGAGGACGCCCTTCAG 148
Query 149 GCAATGAATCGCAGCACAGGCTGGACTTTCAGCTGATGTTGAAAATTCGAGACACACTTTATATTGCTGGCAGG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCAATGAATCGCAGCACAGGCTGGACTTTCAGCTGATGTTGAAAATTCGAGACACACTTTATATTGCTGGCAGG 222
Query 223 GATCAAGTTTATACAGTAAACTTAAATGAAATGCCCAAAACAGAAGTAATACCCAACAAGAAACTGACATGGCG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GATCAAGTTTATACAGTAAACTTAAATGAAATGCCCAAAACAGAAGTAATACCCAACAAGAAACTGACATGGCG 296
Query 297 ATCAAGACAACAGGATCGAGAAAACTGTGCTATGAAAGGCAAGCATAAAGATGAATGCCACAACTTTATCAAAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ATCAAGACAACAGGATCGAGAAAACTGTGCTATGAAAGGCAAGCATAAAGATGAATGCCACAACTTTATCAAAG 370
Query 371 TATTTGTTCCAAGAAACGATGAGATGGTTTTTGTTTGTGGTACCAATGCATTCAATCCCATGTGTAGATACTAC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TATTTGTTCCAAGAAACGATGAGATGGTTTTTGTTTGTGGTACCAATGCATTCAATCCCATGTGTAGATACTAC 444
Query 445 AGGTTGAGTACCTTAGAATATGATGGGGAAGAAATTAGTGGCCTGGCAAGATGCCCATTTGATGCCAGACAAAC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AGGTTGAGTACCTTAGAATATGATGGGGAAGAAATTAGTGGCCTGGCAAGATGCCCATTTGATGCCAGACAAAC 518
Query 519 CAATGTTGCCCTCTTTGCTGATGGGAAGCTGTATTCTGCCACAGTGGCTGACTTCTTGGCCAGCGATGCCGTTA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAATGTTGCCCTCTTTGCTGATGGGAAGCTGTATTCTGCCACAGTGGCTGACTTCTTGGCCAGCGATGCCGTTA 592
Query 593 TTTATCGAAGCATGGGTGATGGATCTGCCCTTCGCACAATAAAATATGATTCCAAATGGATAAAAGAGCCACAC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TTTATCGAAGCATGGGTGATGGATCTGCCCTTCGCACAATAAAATATGATTCCAAATGGATAAAAGAGCCACAC 666
Query 667 TTTCTTCATGCCATAGAATATGGAAACTATGTCTATTTCTTCTTTCGAGAAATCGCTGTCGAACATAATAATTT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TTTCTTCATGCCATAGAATATGGAAACTATGTCTATTTCTTCTTTCGAGAAATCGCTGTCGAACATAATAATTT 740
Query 741 AGGCAAGGCTGTGTATTCCCGCGTGGCCCGCATATGTAAAAACGACATGGGTGGTTCCCAGCGGGTCCTGGAGA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGGCAAGGCTGTGTATTCCCGCGTGGCCCGCATATGTAAAAACGACATGGGTGGTTCCCAGCGGGTCCTGGAGA 814
Query 815 AACACTGGACTTCATTTCTAAAGGCTCGGCTGAACTGTTCTGTCCCTGGAGATTCGTTTTTCTACTTTGATGTT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AACACTGGACTTCATTTCTAAAGGCTCGGCTGAACTGTTCTGTCCCTGGAGATTCGTTTTTCTACTTTGATGTT 888
Query 889 CTGCAGTCTATTACAGACATAATACAAATCAATGGCATCCCCACTGTGGTCGGGGTGTTTACCACGCAGCTCAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTGCAGTCTATTACAGACATAATACAAATCAATGGCATCCCCACTGTGGTCGGGGTGTTTACCACGCAGCTCAA 962
Query 963 TAGCATCCCTGGTTCTGCTGTCTGTGCATTTAGCATGGATGACATTGAAAAAGTATTCAAAGGACGGTTTAAGG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TAGCATCCCTGGTTCTGCTGTCTGTGCATTTAGCATGGATGACATTGAAAAAGTATTCAAAGGACGGTTTAAGG 1036
Query 1037 AACAGAAAACTCCAGATTCTGTTTGGACAGCAGTTCCCGAAGACAAAGTGCCAAAGCCAAGGCCTGGCTGTTGT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AACAGAAAACTCCAGATTCTGTTTGGACAGCAGTTCCCGAAGACAAAGTGCCAAAGCCAAGGCCTGGCTGTTGT 1110
Query 1111 GCAAAACACGGCCTTGCCGAAGCTTATAAAACCTCCATCGATTTCCCGGATGAAACTCTGTCATTCATCAAATC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCAAAACACGGCCTTGCCGAAGCTTATAAAACCTCCATCGATTTCCCGGATGAAACTCTGTCATTCATCAAATC 1184
Query 1185 TCATCCCCTGATGGACTCTGCCGTTCCACCCATTGCCGATGAGCCCTGGTTCACAAAGACTCGGGTCAGGTACA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TCATCCCCTGATGGACTCTGCCGTTCCACCCATTGCCGATGAGCCCTGGTTCACAAAGACTCGGGTCAGGTACA 1258
Query 1259 GACTGACGGCCATCTCAGTGGACCATTCAGCCGGACCCTACCAGAACTACACAGTCATCTTTGTTGGCTCTGAA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GACTGACGGCCATCTCAGTGGACCATTCAGCCGGACCCTACCAGAACTACACAGTCATCTTTGTTGGCTCTGAA 1332
Query 1333 GCTGGCATGGTACTTAAAGTTCTGGCAAAGACCAGTCCTTTCTCTTTGAACGACAGCGTATTACTGGAAGAGAT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GCTGGCATGGTACTTAAAGTTCTGGCAAAGACCAGTCCTTTCTCTTTGAACGACAGCGTATTACTGGAAGAGAT 1406
Query 1407 TGAAGCCTACAACCATGCAAAGTGCAGTGCTGAGAATGAGGAAGACAAAAAGGTCATCTCATTACAGTTGGATA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGAAGCCTACAACCATGCAAAGTGCAGTGCTGAGAATGAGGAAGACAAAAAGGTCATCTCATTACAGTTGGATA 1480
Query 1481 AAGATCACCACGCTTTATATGTGGCGTTCTCTAGCTGCATTATCCGCATCCCCCTCAGTCGCTGTGAGCGTTAT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AAGATCACCACGCTTTATATGTGGCGTTCTCTAGCTGCATTATCCGCATCCCCCTCAGTCGCTGTGAGCGTTAT 1554
Query 1555 GGATCATGTAAAAAGTCTTGTATTGCATCTCGTGACCCGTATTGTGGCTGGTTAAGCCAGGGATCCTGTGGTAG 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GGATCATGTAAAAAGTCTTGTATTGCATCTCGTGACCCGTATTGTGGCTGGTTAAGCCAGGGATCCTGTGGTAG 1628
Query 1629 AGTGACCCCAGGGATGCTGCTGTTAACCGAAGACTTCTTTGCTTTCCATAACCACAGTGCTGAAGGATATGAAC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AGTGACCCCAGGGATGCTGCTGTTAACCGAAGACTTCTTTGCTTTCCATAACCACAGTGCTGAAGGATATGAAC 1702
Query 1703 AAGACACAGAATTCGGCAACACAGCTCATCTAGGGGACTGCCAT------------------------------ 1746
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AAGACACAGAATTCGGCAACACAGCTCATCTAGGGGACTGCCATGAAATTTTGCCTACTTCAACTACACCAGAT 1776
Query 1747 -------------------------------------------------------------------------- 1746
Sbjct 1777 TACAAAATATTTGGCGGTCCAACATCTGACATGGAGGTATCTTCATCTTCTGTTACCACAATGGCAAGTATCCC 1850
Query 1747 -------------------------------------------------------------------------- 1746
Sbjct 1851 AGAAATCACACCTAAAGTGATTGATACCTGGAGACCTAAACTGACAAGCTCTCGGAAATTTGTAGTTCAAGATG 1924
Query 1747 -----------------------------------------------GGTGTACGATGGGAAGTCCAGTCTGGA 1773
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 ATCCAAACACTTCTGATTTTACTGATCCTTTATCGGGTATCCCAAAGGGTGTACGATGGGAAGTCCAGTCTGGA 1998
Query 1774 GAGTCCAACCAGATGGTCCACATGAATGTCCTCATCACCTGTGTCTTTGCTGCTTTTGTTTTGGGGGCATTCAT 1847
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GAGTCCAACCAGATGGTCCACATGAATGTCCTCATCACCTGTGTCTTTGCTGCTTTTGTTTTGGGGGCATTCAT 2072
Query 1848 TGCAGGTGTGGCAGTATACTGCTATCGAGACATGTTTGTTCGGAAAAACAGAAAGATCCATAAAGATGCAGAGT 1921
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TGCAGGTGTGGCAGTATACTGCTATCGAGACATGTTTGTTCGGAAAAACAGAAAGATCCATAAAGATGCAGAGT 2146
Query 1922 CCGCCCAGTCATGCACAGACTCCAGTGGAAGTTTTGCCAAACTGAATGGTCTCTTTGACAGCCCTGTCAAGGAA 1995
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CCGCCCAGTCATGCACAGACTCCAGTGGAAGTTTTGCCAAACTGAATGGTCTCTTTGACAGCCCTGTCAAGGAA 2220
Query 1996 TACCAACAGAATATTGATTCTCCTAAACTGTATAGTAACCTGCTAACCAGTCGGAAAGAGCTACCACCCAATGG 2069
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 TACCAACAGAATATTGATTCTCCTAAACTGTATAGTAACCTGCTAACCAGTCGGAAAGAGCTACCACCCAATGG 2294
Query 2070 AGATACTAAATCCATGGTAATGGACCATCGAGGGCAACCTCCAGAGTTGGCTGCTCTTCCTACTCCTGAGTCTA 2143
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 AGATACTAAATCCATGGTAATGGACCATCGAGGGCAACCTCCAGAGTTGGCTGCTCTTCCTACTCCTGAGTCTA 2368
Query 2144 CACCCGTGCTTCACCAGAAGACCCTGCAGGCCATGAAGAGCCACTCAGAAAAGGCCCATGGCCATGGAGCTTCA 2217
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 CACCCGTGCTTCACCAGAAGACCCTGCAGGCCATGAAGAGCCACTCAGAAAAGGCCCATGGCCATGGAGCTTCA 2442
Query 2218 AGGAAAGAAACCCCTCAGTTTTTTCCGTCTAGTCCGCCACCTCATTCCCCATTAAGTCATGGGCATATCCCCAG 2291
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 AGGAAAGAAACCCCTCAGTTTTTTCCGTCTAGTCCGCCACCTCATTCCCCATTAAGTCATGGGCATATCCCCAG 2516
Query 2292 TGCCATTGTTCTTCCAAATGCTACCCATGACTACAACACGTCTTTCTCAAACTCCAATGCTCACAAAGCTGAAA 2365
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 TGCCATTGTTCTTCCAAATGCTACCCATGACTACAACACGTCTTTCTCAAACTCCAATGCTCACAAAGCTGAAA 2590
Query 2366 AGAAGCTTCAAAACATTGATCACCCTCTCACAAAGTCATCCAGTAAGAGAGATCACCGGCGTTCTGTTGATTCC 2439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 AGAAGCTTCAAAACATTGATCACCCTCTCACAAAGTCATCCAGTAAGAGAGATCACCGGCGTTCTGTTGATTCC 2664
Query 2440 AGAAATACCCTCAATGATCTCCTGAAGCATCTGAATGACCCAAATAGTAACCCCAAAGCCATCATGGGAGACAT 2513
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 AGAAATACCCTCAATGATCTCCTGAAGCATCTGAATGACCCAAATAGTAACCCCAAAGCCATCATGGGAGACAT 2738
Query 2514 CCAGATGGCACACCAGAACTTAATGCTGGATCCCATGGGATCGATGTCTGAGGTCCCACCTAAAGTCCCTAACC 2587
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 CCAGATGGCACACCAGAACTTAATGCTGGATCCCATGGGATCGATGTCTGAGGTCCCACCTAAAGTCCCTAACC 2812
Query 2588 GGGAGGCATCGCTATACTCCCCTCCTTCAACTCTCCCCAGAAATAGCCCAACCAAGCGAGTGGATGTCCCCACC 2661
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 GGGAGGCATCGCTATACTCCCCTCCTTCAACTCTCCCCAGAAATAGCCCAACCAAGCGAGTGGATGTCCCCACC 2886
Query 2662 ACTCCTGGAGTCCCAATGACTTCTCTGGAAAGACAAAGAGGTTATCACAAAAATTCCTCCCAGAGGCACTCTAT 2735
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 ACTCCTGGAGTCCCAATGACTTCTCTGGAAAGACAAAGAGGTTATCACAAAAATTCCTCCCAGAGGCACTCTAT 2960
Query 2736 ATCTGCTATGCCTAAAAACTTAAACTCACCAAATGGTGTTTTGTTATCCAGACAGCCTAGTATGAACCGTGGAG 2809
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 ATCTGCTATGCCTAAAAACTTAAACTCACCAAATGGTGTTTTGTTATCCAGACAGCCTAGTATGAACCGTGGAG 3034
Query 2810 GATATATGCCCACCCCCACTGGGGCGAAGGTGGACTATATTCAGGGAACACCAGTGAGTGTTCATCTGCAGCCT 2883
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 GATATATGCCCACCCCCACTGGGGCGAAGGTGGACTATATTCAGGGAACACCAGTGAGTGTTCATCTGCAGCCT 3108
Query 2884 TCCCTCTCCAGACAGAGCAGCTACACCAGTAATGGCACTCTTCCTAGGACGGGACTAAAGAGGACGCCGTCCTT 2957
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 TCCCTCTCCAGACAGAGCAGCTACACCAGTAATGGCACTCTTCCTAGGACGGGACTAAAGAGGACGCCGTCCTT 3182
Query 2958 AAAACCTGACGTGCCACCAAAGCCTTCCTTTGTTCCTCAAACCCCATCTGTCAGACCACTGAACAAATACACAT 3031
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 AAAACCTGACGTGCCACCAAAGCCTTCCTTTGTTCCTCAAACCCCATCTGTCAGACCACTGAACAAATACACAT 3256
Query 3032 AC 3033
||
Sbjct 3257 AC 3258